一种应用多重pcr快速检测致病性溶藻弧菌的方法

文档序号:442805阅读:268来源:国知局
专利名称:一种应用多重pcr快速检测致病性溶藻弧菌的方法
技术领域
本发明属于一种应用多重PCR快速检测致病性溶藻弧菌的方法。
背景技术
随着网箱养殖规模的扩大,病害发生也日益频繁,严重制约了水产养 殖业的健康发展。面对不断增多的病原种类,单靠传统的微生物培养方法 已经不能满足病害防治的需要。因此,建立灵敏、快速、准确的病原检测 技术是及时有效地控制与预防致病菌传播的前提。目前对致病菌的检测,
主要依赖于常规微生物学方法, 一般需5 7d时间,比较费时费力;另外
应用免疫酶试验、免疫荧光试验、基因探针等方法,其灵敏度相对较低、
特异性较差,难以推广。自从PCR技术建立,以其敏感度高、特异性强、 操作简便、快速而被广泛应用于致病菌的检测,但常规PCR易受环境因素 的影响,检测结果易出现假阳性,从而导致错误的诊断。

发明内容
本发明的目的是为了克服上述现有技术存在的不足,提供一种应用多 重PCR快速检测致病性溶藻弧菌的方法。
为实现上述目的本发明采取的技术方案是按以下步骤-(l)DNA模板提取-
(D取具有弧菌病症状的水产养殖动物病灶组织心、肝、脾、肾和溃疡 部位等,匀浆,取匀浆液1.5mL, 10000 g离心10 min,沉淀用双蒸水悬 浮,再10000 g离心10 mhi,将沉淀悬浮于l mL双蒸水中,在沸水中煮 8 10min, 10000 g离心10 min,其上清液即为DNA模板。
②取未具有弧菌病症状的水产养殖动物组织心、肝、脾、肾和肌肉等,
匀浆,加入TSB培养基在28。C 140 r/min摇床上培养18 h,取匀浆液1.5 mL, 10000 g离心10 min,沉淀用双蒸水悬浮,再10000 g离心10 min,将沉淀 悬浮于lmL双蒸水中,在沸水中煮8 10min, 10000 g离心10 mm,其上 清液即为DNA模板。
(2)多重PCR三对引物分别为 A: 5'-TGGTGAACAGCCAGTAAA-3', 5,-CAAACCCATCATAAGTAGTC-3' B: 5'-GGCGGTCGCTCTGGTATT-3', 5'-TTGCCATCGTAAGTGCTGTA-3' C: 5'-CAGAAGAATCGGAAGAACA-3', 5'-TAGAATGACGCACAAAGG-3';
设计A、 B和C上下游引物各20D,引物A上、下游引物分别用1040^L 和980pL双蒸水稀释,引物B上、下游引物分别用1240pL和l060pL双蒸水 稀释,引物C上、下游引物分别用920pL和10(X)nL双蒸水稀释。
(3)多重PCR反应体系为
10xPCR缓冲液 2.5 mL(已加Mg2+,终浓度为1.5 mmol/L)
dNTP混合液 2 nL (终浓度0.25 mmol/L)
引物A、 B、 C 上下游各2ML(终浓度0.5fimol/L)
DNA模板 lML(约0.1吗)
ExTaq 1 nL(终浓度2U)
ddH20 14.5 nL
总体积 25 fiL
(4) 多重PCR反应条件为94。C5min: 94。C 1 mm' 65。C lmin, 72。C 1.5min,共30个循环72°C 10 min 。
(5) 取10pL多重PCR反应液,按常规DNA琼脂糖凝胶电泳方法检测 反应液中扩增的条件,在凝胶成像系统中照像,如出现图l的反应条带则致 病菌为溶藻弧菌。
为了尽量克服PCR检测溶藻弧菌带来的假阳性,三对引物同时放入到 PCR体系中同时扩增,构成多重PCR检测法。引物A、 B、 C分别是根据溶 藻弧菌的三种外毒素基因序列即咬原蛋白酶、外膜蛋白K和ToxR的保守区 设计的,对溶藻弧菌有较强的特异性。与普通PCR检测方法相比,本实验 采用的多重PCR有更高的灵敏度和准确性;与采用免疫学ELISA检测方法 相比,多重PCR花费小、检测时间短、实验条件要求相对也不太严格。


图1是多重检测溶藻弧菌电泳结果图。
具体实施例方式
本发明用下列实施例来进 一 步说明。 实施例1
取具有弧菌病症状的红笛鲷(£"^/2船eo^o/^nw)溃烂的肌肉组织5 g, 用匀浆器匀浆。取部分匀浆液装入1.5 ml离心管中10000 g离心10 min,取 沉淀用1.5 ml双蒸水重悬,再10000 g离心10 mm;取沉淀用1 ml双蒸水重 悬,盖上离心管盖,放入沸水中煮8mm, 10000 g离心10 mm,将上清液倒 入另一离心管中,作为多重PCR的DNA模板。
取200 mL离心管,在分别加入10xPCR缓冲液2.5 jxL, dNTP混合液终 浓度0.25 mmol/L、引物A、 B、 C上下游各2 pL、 DNA模板1〖iL、 ExTaq2 U,加入双蒸水至总体积为25 ^L。将离心管放入MJ PTC200 PCR仪中,以 94。C 5 mm; 94。C 1 min, 65。C lmin, 72。C 1.5mm,共30个循环;72。C 10 min 扩增,取反应液10pL进行DNA琼脂糖凝胶电泳(胶浓度为1%),在凝胶成 像系统中能看到如图l的三条清晰带,证明引起这次红笛鲷弧菌病病原为溶 藻弧菌。
实施例2
取已发有部分奸死亡养殖池中并未有弧菌病症状斑节虾(尸ewae^ j'"/w&aw)肌肉组织5 g,用匀浆器匀浆。加入TSB培养基在28。C i40r/min 摇床上培养18 h,取部分已培养的匀浆液装入1.5mi离心管中10000 g离心 10 min,取沉淀用1.5 ml双蒸水重悬,再10000 g离心10 mm;取沉淀用1 ml 双蒸水重悬,盖上离心管盖,放入沸水中煮8mm, 10000 g离心10 mm,将 上清液倒入另一离心管中,作为多重PCR的DNA模板。 取200 离心管,在分别加入10xPCR缓冲液2.5 pL、 dNTP混合液终浓度 0.25mmol/L、引物A、 B、 C上下游各2^iL、 DNA模板1 pL、 ExTaq2U, 加入双蒸水至总体积为25 pL。将离心管放入ABI 9700 PCR仪中,以94°C 5 mm; 94。C 1 min, 65。C lmin, 72。C 1,5min,共30个循环:72。C 10 mm扩 增,取反应液lOpL进行DNA琼脂糖凝胶电泳(胶浓度为1%),在凝胶成像 系统中能看到如图1的三条清晰带,证明虾池中的斑节虾已感染致病性溶藻 弧菌,过一段时间会发病,需及早进行治疗。
权利要求
1. 一种应用多重PCR快速检测致病性溶藻弧菌的方法,其特征是按以下步骤;(1)DNA模板提取①取具有弧菌病症状的水产养殖动物病灶组织心、肝、脾、肾和溃疡部位等,匀浆,取匀浆液1.5mL,10000g离心10min,沉淀用双蒸水悬浮,再10000g离心10min,将沉淀悬浮于1mL双蒸水中,在沸水中煮8~10min,10000g离心10min,其上清液即为DNA模板;②取未具有弧菌病症状水产养殖动物组织心、肝、脾、肾和肌肉等,匀浆,加入TSB培养基在28℃140r/min摇床上培养18h,取匀浆液1.5mL,10000g离心10min,沉淀用双蒸水悬浮,再10000g离心10min,将沉淀悬浮于1mL双蒸水中,在沸水中煮8~10min,10000g离心10min,其上清液即为DNA模板;(2)多重PCR三对引物分别为A5′-TGGTGAACAGCCAGTAAA-3′,5′-CAAACCCATCATAAGTAGTC-3′B5′-GGCGGTCGCTCTGGTATT-3′,5′-TTGCCATCGTAAGTGCTGTA-3′C5′-CAGAAGAATCGGAAGAACA-3′,5′-TAGAATGACGCACAAAGG-3′;(3)多重PCR反应体系为10×PCR buffer 2.5μl(已加Mg2+,终浓度为1.5mmol/L)dNTP mixture2μL(终浓度0.25mmol/L)引物上下游各2μL(终浓度0.5μmol/L)DNA模板 1μL(约0.1μg)ExTaq 1μL(终浓度2U)ddH2O 14.5μL总体积 25μL(4)多重PCR反应条件为94℃ 5min;65℃ 1min;72℃ 1.5min,共30个循环,72℃ 10min;(5)取10μL多重PCR反应液进行DNA琼脂糖凝胶电泳,其中凝胶胶浓度为0.8-1.2%。
全文摘要
一种应用多重PCR快速检测致病性溶藻弧菌的方法,利用致病性溶藻弧菌外毒素基因保守区设计三对引物,建立多重PCR的快速准确的检测方法,取被感染致病性溶藻弧菌的水产养殖动物病灶组织匀浆,将匀浆的病灶组织加入TSB培养基在28℃140r/min摇床上培养18h,水煮法提取DNA作模板,应用三对引物组成的多重PCR方法进行检测,电泳结果出现三个片段,大小分别为424、319、173bp,而应用该法检测非溶藻弧菌感染的水产养殖动物结果则呈阴性。该方法特异性高,操作方便,检测成本低,检测时间短,可以标准化为产品,能够进行大批量样品检测,可以满足有关质检部门、养殖企业、研究单位等批量检测水产养殖动物体内致病性溶藻弧菌的需要。
文档编号C12Q1/68GK101205557SQ20061012433
公开日2008年6月25日 申请日期2006年12月22日 优先权日2006年12月22日
发明者吴灶和, 简纪常, 蔡双虎, 鲁义善 申请人:广东海洋大学
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