与类风湿关节炎相关的单个基因单核苷酸多态性位点及其应用
【技术领域】
[0001] 本发明设及生物医学领域中与类风湿关节炎相关的单个基因单核巧酸多态性位 点及其应用。
【背景技术】
[0002] 类风湿关节炎是一种病因尚未确定的慢性全身性炎症性疾病，W多滑膜关节炎和 关节外病变为主要临床表现，属于自身免疫炎性疾病，与环境、细胞、病毒、遗传、性激素及 神经精神状态等因素密切相关，若不及时治疗易造成不可逆转的关节崎形和强直，致残率 较高。类风湿关节炎已成为世界范围关注的主要健康问题之一，在世界范围内发病率约为 0. 5% -1%，在我国发病率约为0.4%。
[0003] 类风湿关节炎的发病机制尚未明确，大量研究证实其发病与遗传因素W及环境因 素存在密切关系。因此鉴定出与类风湿关节炎发病相关的易感基因或致病基因，并在人群 中筛选出增加疾病风险的易感基因W确定易感个体，将有助于类风湿关节炎的发病风险预 测、新药开发W及针对类风湿关节炎的诊断和个体化治疗。早期识别类风湿关节炎易感人 群，采取针对性的生活方式干预，是减少类风湿关节炎发生，减缓医疗费用增长的关键，同 时也可W为临床治疗提供可参考的信息。
[0004] 在过去的研究中，人们已发现了多种与类风湿关节炎发病相关的易感基因，比较 重要的有人类白细胞抗原化LA)的DR区W及肿瘤坏死因子a (TNF-a)基因等，该些基因 上的某些单核巧酸多态性位点显著性地增加了类风湿关节炎的发病风险。由于类风湿关节 炎属于自身免疫疾病，免疫细胞中表达的基因与类风湿关节炎发病及病程的相关性一直受 到人们的关注。编码B细胞、单核细胞、粒细胞等免疫细胞表面的抑制型受体分子化丫 RIIB 的FCGR2B基因被发现是一些自身免疫疾病的易感基因，FCGR2B基因中存在单核巧酸多态 性位点rsl050501，rsl050501位点的风险等位基因为C，野生型等位基因为T。rsl050501 位点被发现与系统性红斑狼疮的发病风险存在显著相关性。对于类风湿关节炎，过去的= 项研究显不，在荷兰（Arthritis&Rheumatism, 2004, 54(12) : 3828-3837)、日本（Genes and immunity, 2002, 3 巧）：488-493) W及中国台湾（Genes and immunity, 2008, 9(8) : 680-688) 的人群中，rsl050501与类风湿关节炎的发病并无显著相关性。
【发明内容】
[0005] 本发明所要解决的技术问题是如何在中国大陆人群中筛查类风湿关节炎患者和 如何预测类风湿关节炎患者的病情严重程度。
[0006] 为解决上述技术问题，本发明首先提供了下述AD-A7)中的任一种用途：
[0007] A1)检测人基因组中rsl050501的多态性（即等位基因）或基因型的物质在制备 筛查类风湿关节炎患者产品中的应用；
[000引 A2)检测人基因组中rsl050501的多态性（即等位基因）或基因型的物质在制备 预测类风湿关节炎患者病情的产品中的应用；
[0009] A3)检测人基因组中rsl050501的多态性（即等位基因）或基因型的物质在制备 检测类风湿关节炎易感性产品中的应用；
[0010] A4)检测人基因组中rsl050501的多态性（即等位基因）或基因型的物质在制备 检测与类风湿关节炎相关的单核巧酸多态性的产品中的应用；
[0011] A5)检测人基因组中rsl050501的多态性（即等位基因）或基因型的物质在制备 鉴定或辅助鉴定与类风湿关节炎相关的单核巧酸多态性的产品中的应用；
[0012] A6)人基因组中rsl050501的多态性（即等位基因）或基因型在制备筛查类风湿 关节炎患者的产品或预测类风湿关节炎患者病情的产品中的应用；
[0013] A7)人基因组中rsl050501的多态性（即等位基因）或基因型在制备检测类风湿 关节炎易感性产品中的应用。
[0014] rsl050501是人染色体lq23. 3上的一个二等位多态性的SNP位点，该变异是转换 (T/C，在其互补链上则为A/G)。所述rsl050501基因型是CC、TC或TT。所述CC是rsl050501 位点为C的纯合型，所述TT是rsl050501位点为T的纯合型，所述TC是rsl050501位点为 T和C的杂合型。所述检测人基因组中rsl050501的多态性（即等位基因）或基因型具体 可为检测rsl050501的核巧酸种类。
[0015] 上述用途中，所述检测人基因组中rsl050501的多态性（即等位基因）或基因型 的物质可包括扩增包括rsl050501在内的基因组DNA片段的PCR引物对和成套探针。
[0016] 上述用途中，所述CC和所述TC基因型的个体在类风湿关节炎患者群体中的比例 分别高于对应的基因型在正常人群体中的比例。
[0017] 上述用途中，所述类风湿关节炎具体为中国大陆人群类风湿关节炎。
[0018] 上述用途中，所述类风湿关节炎患者病情可为W关节痛、疾病活动度评分值A巧、 隐性类风湿因子（HRFIgG)、发病年龄和抗核周因子抗体（AP巧为指标诊断得出的类风湿关 节炎患者的类风湿关节炎病情，具体可为严重类风湿关节炎和轻度类风湿关节炎。所述严 重类风湿关节炎的指标可为关节痛〉=10、和/或DAS〉= 5、和/或HRFIgG阳性、和/或发 病年龄巧5、和/或APF阳性；所述轻度类风湿关节炎的指标可为关节痛<10、和/或DAS<5、 和/或HRFIgG阴性、和/或发病年龄〉=55、和/或APF阴性。
[0019] 为解决上述技术问题，本发明还提供了含有检测人基因组中rsl050501的多态性 (即等位基因）或基因型的物质的产品。
[0020] 本发明所提供的含有检测人基因组中rsl050501的多态性（即等位基因）或基因 型的物质的产品，为a)-e)中的任一种：
[0021] a)检测与类风湿关节炎相关的单核巧酸多态性（即等位基因）或基因型的产品；
[0022] b)鉴定或辅助鉴定与类风湿关节炎相关的单核巧酸多态性（即等位基因）或基因 型的产品；
[0023] C)筛查类风湿关节炎患者产品；
[0024] d)检测类风湿关节炎易感性产品；
[0025] e)预测类风湿关节炎患者病情的产品。
[0026] 上述产品中，所述检测人基因组中rsl050501的多态性（即等位基因）或基因型 的物质可包括扩增包括rsl050501在内的基因组DNA片段的PCR引物对和成套探针。
[0027] 本发明中，所述扩增包括rsl050501在内的基因组DM片段的PCR引物对可由序 列表中SEQ ID No. 1所示的单链DNA和序列表中SEQ ID No. 2所示的单链DNA组成；所述 成套探针可由化qMan探针C和化qMan探针T组成，所述化qMan探针C的核巧酸序列如序 列表中SEQ ID No. 3所示，所述化qMan探针T的核巧酸序列如序列表中SEQ ID No. 4所 示。所述化qMan探针C为在序列表中SEQ ID No. 3所示的单链DM的5'端标记报告巧光 染料VIC、在3'端标记泽灭巧光染料NFQ得到的化qMan探针，所述化qMan探针T为在SEQ ID No. 4中所示的单链DNA的5'端标记报告巧光染料FAM、在3'端标记泽灭巧光染料NFQ 得到的"TagMan探针。
[002引实验证明，在由404个中国大陆类风湿关节炎患者组成的病例组和由778个中国 大陆正常健康人组成的对照组中，rsl050501的风险等位基因为C，该等位基因在病例组 类风湿关节炎患者群体中的比例比该等位基因在正常人群体中的比例高21. 66%。携带 rsl050501位点风险等位基因C的纯合子（CC基因型），相比于携带rsl050501位点野生型 等位基因T的纯合子（TT基因型）W及rsl050501位点的杂合子（TC基因型），类风湿关节 炎发病的相对危险度为2. 523, P值是6. 84X 1(T4,说明rsl050501是与类风湿关节炎相关 的单核巧酸多态性。rsl050501的S个基因型中，CC基因型和TC基因型的个体在病例组类 风湿关节炎患者群体中的比例分别高于对应基因型的个体在对照组正常健康人群体中的 比例；TT基因型的个体在病例组类风湿关节炎患者群体中的比例低于TT基因型的个体在 对照组正常健康人群体中的比例。
[0029] 携带rsl050501位