用于产生诱导的多能干细胞的组合化学遗传方法_3

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所述文库的特定试剂相关联,由此鉴定刺激细胞去 分化成为多能干细胞的试剂。
[0191] 28.权利要求27的方法,其中步骤a)包括将一个或多个用于表达Oct多肽、Klf 多肽、Myc多肽、和Sox多肽中的至少一种,但非全部的表达盒引入至所述非多能细胞中。
[0192] 29.权利要求27的方法,其中步骤a)包括将外源Oct多肽、外源Klf多肽、外源 Myc多肽、和外源Sox多肽中的至少一种,但非全部引入至所述非多能细胞中。
[0193] 30.权利要求27-29中任一项的方法,其中所述特定试剂在50-1500道尔顿之间。
[0194] 31.权利要求27的方法,其中步骤a)包括将两个表达盒引入所述细胞,其中每个 表达盒包括编码不同蛋白的多核苷酸,其中所述蛋白选自由Oct多肽、Klf多肽、Myc多肽、 和Sox多肽组成的组,且所述组的其余成员不引入至所述细胞内。
[0195] 32.权利要求27的方法,其中步骤a)包括将三个表达盒引入所述细胞,其中每个 表达盒包括编码不同蛋白的多核苷酸,其中所述蛋白选自由Oct多肽、Klf多肽、Myc多肽、 和Sox多肽组成的组,且所述组的其余成员不引入至所述细胞内。
[0196] 33.权利要求27-32中任一项的方法,其中所述细胞是人细胞。
[0197] 34.权利要求27-33中任一项的方法,其中所述细胞是非人哺乳动物细胞。
[0198] 35.权利要求27-34中任一项的方法,其中所述非多能细胞是祖细胞。
[0199] 36.权利要求35的方法,其中所述祖细胞是神经祖细胞、皮肤祖细胞或毛囊祖细 胞。
[0200] 37.权利要求27-36中任一项的方法,其中所述Oct多肽是0ct4,所述Klf多肽是 Klf4,所述Myc多肽是c-Myc,且所述Sox多肽是Sox2。
[0201] 38. -种筛选具有多能干细胞特征的哺乳动物细胞的方法,所述方法包括:
[0202] a)使细胞与MAPK/ERK激酶(MEK)抑制剂相接触,从而抑制非多能细胞生长并促进 多能干细胞生长;和
[0203] b)针对多能干细胞特征筛选所接触的细胞。
[0204] 39.权利要求38的方法,其包括:
[0205] 在步骤a)之前,使所述细胞与试剂文库相接触;
[0206] 和,在步骤b)之后,基于步骤b)的结果筛选诱导多能干细胞的试剂。
[0207]40.权利要求38-39中任一项的方法,其中所述细胞是人细胞。
[0208] 41.权利要求38-39中任一项的方法,其中所述细胞是小鼠、狗、牛、猪、大鼠和非 人灵长类动物细胞。
[0209] 42.权利要求38-41中任一项的方法,其中所述MEK抑制剂是ro〇325901。
[0210]43.-种包括哺乳动物细胞和抑制H3K9甲基化或促进H3K9去甲基化的试剂的混 合物,其中所述细胞:
[0211] 表达Oct多肽、Klf多肽、Sox多肽、和Myc多肽中的至少一种或多种;和/或
[0212] 与外源Oct多肽、外源Klf多肽、外源Sox多肽、和外源Myc多肽中的至少一种或 多种相接触。
[0213] 44.权利要求43的混合物,其中所述细胞包括第一、第二和第三重组表达盒,
[0214] 所述第一表达盒包括与编码Klf?多肽的多核苷酸可操作相连的启动子,
[0215] 所述第二表达盒包括与编码Sox多肽的多核苷酸可操作相连的启动子;和
[0216] 所述第三表达盒包括与编码Myc多肽的多核苷酸可操作相连的启动子。
[0217] 45.权利要求43-44中任一项的混合物,其中所述试剂抑制H3K9甲基化。
[0218] 46.权利要求45的混合物,其中抑制H3K9甲基化的试剂是BIX01294。
[0219] 47.权利要求43-46中任一项的混合物,其中所述细胞包括一种或多种反转录病 毒质粒、慢病毒质粒、腺病毒质粒、非病毒质粒、或附加型表达载体,所述一种或多种反转录 病毒质粒、慢病毒质粒、腺病毒质粒、非病毒质粒、或附加型表达载体包括所述第一、第二和 第三表达盒。
[0220] 48.权利要求47的混合物,所述混合物包括第一、第二和第三反转录病毒质粒、慢 病毒质粒、腺病毒质粒、非病毒质粒、或附加型表达载体,
[0221] 所述第一反转录病毒质粒、慢病毒质粒、腺病毒质粒、非病毒质粒、或附加型表达 载体包括所述第一表达盒;
[0222] 所述第二反转录病毒质粒、慢病毒质粒、腺病毒质粒、非病毒质粒、或附加型表达 载体包括所述第二表达盒;和
[0223] 所述第三反转录病毒质粒、慢病毒质粒、腺病毒质粒、非病毒质粒、或附加型表达 载体包括所述第三表达盒。
[0224] 49.权利要求43-48中任一项的混合物,其中所述细胞是人细胞。
[0225] 50.权利要求43-48中任一项的混合物,其中所述细胞是小鼠、狗、牛、猪、大鼠和 非人灵长类动物细胞。
[0226] 51.权利要求43-50中任一项的混合物,其中所述细胞包括祖细胞。
[0227] 52.权利要求51的混合物,其中所述祖细胞是神经祖细胞、皮肤祖细胞或毛囊祖 细胞。
[0228] 53.权利要求43-52中任一项的混合物,其中所述Klf多肽是Klf4,所述Myc多肽 是c-Myc,且所述Sox多肽是Sox2。
[0229] 54. -种内源性表达选自由Oct多肽、Klf多肽、Myc多肽、和Sox多肽组成的组的 至少一种蛋白的哺乳动物细胞,
[0230]其中:
[0231] 所述细胞不内源性表达所述组中的至少一种蛋白,其中不内源性表达的所述蛋白 由所述细胞内存在的异源重组表达盒编码的RNA来表达,
[0232] 所述细胞内源性或异源性表达Oct多肽、Klf多肽、Myc多肽、和Sox多肽的每一 种;和
[0233] 经由所述异源表达盒的蛋白表达导致所述细胞由非多能细胞重编程或去分化成 为多能干细胞。
[0234] 55.权利要求54的细胞,其中所述Oct多肽是Oct 4,所述Klf多肽是Klf4,所述 Myc多肽是c-Myc,且所述Sox多肽是Sox2。
[0235] 56.权利要求54-55中任一项的细胞,其中所述细胞内源性表达Sox多肽和Myc多 肽且异源性表达Oct多肽和Klf多肽。
[0236] 57.权利要求56的细胞,其中所述Oct多肽是0ct4,所述Klf多肽是Klf4,所述 Myc多肽是c-Myc,且所述Sox多肽是Sox2。
[0237]58.-种诱导细胞中0ct4表达的方法,所述方法包括:
[0238] 使所述细胞与抑制H3K9甲基化或促进H3K9去甲基化的试剂相接触,由此诱导细 胞中的0ct4表达。
[0239] 59.权利要求58的方法,其中所述细胞在即将进行所述接触步骤前不表达0ct4。
[0240]60.权利要求58-59中任一项的方法,其中相接触的所述细胞不是多能细胞。
[0241] 61.权利要求58-59中任一项的方法,其中所述细胞在所述接触步骤后诱导为多 能性。
[0242] 62. -种将非多能细胞诱导为多能细胞的方法,所述方法包括:
[0243] 使所述非多能细胞与一种或多种诱导多能性的试剂相接触和/或将表达盒引入 所述细胞以表达诱导多能性的蛋白,其中所述细胞不在饲养细胞上培养且所述细胞附着于 固体培养物表面。
[0244] 63.权利要求62的方法,其中所述细胞通过分子粘连附着于固体培养表面,所述 分子粘连选自由基质胶、细胞外基质(ECM)或ECM类似物、层粘连蛋白、纤连蛋白、和胶原蛋 白组成的组。
[0245] 64.权利要求62的方法,其中所述接触步骤包括权利要求1或引用权利要求1的 权利要求的步骤。
[0246] 65. -种由哺乳动物非多能细胞生成诱导的多能干细胞的方法,所述方法包括:
[0247] a)使所述细胞与以下至少两种相接触:
[0248] 抑制H3K9甲基化或促进H3K9去甲基化的试剂;
[0249] L-型Ca通道激动剂;
[0250] cAMP途径活化剂;
[0251] DNA甲基转移酶(DNMT)抑制剂;
[0252] 核受体配体;
[0253] GSK3 抑制剂;
[0254] MEK 抑制剂;
[0255] TGF0 受体/ALK5 抑制剂;
[0256] HDAC抑制剂;和
[0257] erk 抑制剂,
[0258] 由此生成诱导的多能干细胞。
[0259] 66.权利要求65的方法,其中所述接触步骤包括:
[0260] 使所述细胞与以下至少两种相接触:
[0261] i.抑制H3K9甲基化或促进H3K9去甲基化的试剂,和
[0262]ii选自由以下组成的组的试剂:
[0263] L-型Ca通道激动剂;
[0264]cAM/P途径活化剂;
[0265] DNA甲基转移酶(DNMT)抑制剂;
[0266] 核受体配体;
[0267] GSK3 抑制剂;
[0268] MEK 抑制剂,
[0269] TGF0 受体/ALK5 抑制剂,
[0270] HDAC抑制剂;和
[0271] erk 抑制剂。
[0272] 67.权利要求65或66的方法,其还包括:
[0273] b)将一种或多种用于表达Klf多肽、Oct多肽、Myc多肽、和/或Sox多肽的表达 盒引入所述非多能细胞。
[0274] 68.权利要求65-67中任一项的方法,其中将Klf4和Oct 4引入所述细胞。
[0275] 69. -种哺乳动物和以下至少两种的混合物:
[0276] 抑制H3K9甲基化或促进H3K9去甲基化的试剂,
[0277]L-型Ca通道激动剂;
[0278] cAMP途径活化剂;
[0279] DNA甲基转移酶(DNMT)抑制剂;
[0280] 核受体配体;
[0281] GSK3 抑制剂;
[0282] MEK 抑制剂,
[0283] TGF0 受体/ALK5 抑制剂,
[0284] HDAC抑制剂;和
[0285] erk 抑制剂。
[0286] 70.权利要求69的混合物,其中所述混合物包括:
[0287] i.抑制H3K9甲基化或促进H3K9去甲基化的试剂,和
[0288] i i选自由以下组成的组的试剂:
[0289] L-型Ca通道激动剂;
[0290] cAMP途径活化剂;
[0291] DNA甲基转移酶(DNMT)抑制剂;
[0292] 核受体配体;
[0293] GSK3 抑制剂;
[0294] MEK 抑制剂,
[0295] TGF0 受体/ALK5 抑制剂,
[0296] HDAC抑制剂;和
[0297] erk 抑制剂。
[0298] 71.权利要求69-70中任一项的混合物,其中所述细胞包括用于表达Oct多肽的异 源表达盒和用于表达Sox多肽的异源表达盒。
[0299] 72.权利要求69-71中任一项的混合物,其中所述细胞是非多能细胞。
[0300] 73.权利要求69-72中任一项的混合物,其中所述细胞是成纤维细胞。
[0301] 74.权利要求69-73中任一项的混合物,其中用于表达Myc多肽的表达盒和用于表 达Klf?多肽的表达盒均不引入至所述非多能细胞中。
[0302] 75. -种组合物,其包括以下至少两种:
[0303] 抑制H3K9甲基化的试剂;
[0304] L-型Ca通道激动剂;
[0305] cAMP途径活化剂;
[0306] DNA甲基转移酶(DNMT)抑制剂;
[0307] 核受体配体;
[0308] GSK3 抑制剂;
[0309] MEK 抑制剂,
[0310] TGF0 受体/ALK5 抑制剂,
[0311] HDAC抑制剂;和
[0312] erk 抑制剂。
[0313] 76?权利要求75的组合物,其包括:
[0314] i.抑制H3K9甲基化的试剂,和
[0315] ii选自由以下组成的组的试剂:
[0316] L-型Ca通道激动剂;
[0317] cAMP途径活化剂;
[0318] DNA甲基转移酶(DNMT)抑制剂;
[0319] 核受体配体;
[0320] GSK3 抑制剂;
[0321] MEK 抑制剂,
[0322] TGF0 受体/ALK5 抑制剂,
[0323] HDAC抑制剂;和
[0324] erk 抑制剂。
[0325] 77.试剂盒,其包括以下至少两种:
[0326] 抑制H3K9甲基化的试剂;
[0327] L-型Ca通道激动剂;
[0328] cAMP途径活化剂;
[0329] DNA甲基转移酶(DNMT)抑制剂;
[0330] 核受体配体;
[0331] GSK3 抑制剂;
[0332] MEK 抑制剂,
[0333] TGF0 受体/ALK5 抑制剂,
[0334]HDAC抑制剂;和
[0335] erk 抑制剂。
[0336]78.权利要求77的试剂盒,其包括:
[0337] i.抑制H3K9甲基化的试剂,和
[0338]ii选自由以下组成的组的试剂:
[0339] L-型Ca通道激动剂;
[0340] cAMP途径活化剂;
[0341] DNA甲基转移酶(DNMT)抑制剂;
[0342] 核受体配体;
[0343] GSK3 抑制剂;
[0344] MEK 抑制剂,
[0345] TGF0 受体/ALK5 抑制剂,
[0346]HDAC抑制剂;和
[0347] erk 抑制剂。
[0348] 79.权利要求77或78的试剂盒,其还包括哺乳动物细胞。
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