检测hbv病毒扩增的引物组和荧光探针及试剂盒的制作方法

文档序号:9284628阅读:630来源:国知局
检测hbv病毒扩增的引物组和荧光探针及试剂盒的制作方法
【技术领域】
[0001]本发明设及基因检测技术领域,具体设及检测皿V病毒扩增的引物组和巧光探针 及试剂盒。
【背景技术】
[0002] 乙型肝炎是由乙型肝炎病毒化BV)感染引起的一种疾病,主要通过血和血制品、 母婴传播及性接触传播。乙型肝炎病毒感染者临床表现多样化,潜伏期较长,最常见的临床 表现有食欲减退、恶屯、、呕吐、腹胀、乏力等症状,部分患者有低热等症状。乙型肝炎患者可 发展为慢性肝炎,导致肝硬化或肝癌。
[0003] 皿V-DNA常规检测方法主要有斑点杂交法和巧光定量PCR法。斑点杂交法是较传 统的方法,成本较低,灵敏度W及精准度都较低,假阳性几率较高,不适合做皿V定量检测。
[0004] 巧光定量PCR法是一种集PCR技术、巧光信号检测和数据分析于一体的核酸定量 检测技术。巧光定量PCR使用了特异性的探针,能够对祀序列进行特异性的识别,具有引物 探针双重控制,且综合了巧光标记技术、激光检测技术、数码显像技术,在扩增指数期进行 定量,具有很高的特异性、灵敏性,准确性及假阳性率低等特点。 阳00引国内外临床应用皿V-DNA巧光定量PCR法存在W下缺陷:
[0006] 1.常用的核酸提取方法有:a、磁珠法;b、层析柱法;C、碱裂解法。^上;种方法需 要繁琐的离屯、、换管等步骤,易导致核酸污染与丢失,且操作过程繁杂,操作人员易疲劳操 作。
[0007] 2.定量标准品操作:大多标准品由于不参与核酸提取,不能全面真实反映核酸提 取和扩增。
[0008] 3. PCR反应体系:传统的PCR反应体系多为无色,容易导致视觉疲劳。
[0009]有鉴于此,特提出本发明。

【发明内容】

[0010]本发明的目的有;个:提供一种检测皿V病毒扩增的引物组和巧光探针;提供一 种检测皿V病毒的试剂盒;提供一种检测皿V病毒的方法。
[0011] 为解决上述技术问题,本发明采用技术方案的基本构思是:
[0012]检测皿V病毒扩增的引物组和巧光探针,包括
[0013] 上游引物皿V-F:如沈Q ID NO: 1所示的核巧酸序列;
[0014] 下游引物HBV-R :如SEQ ID N0:2所示的核巧酸序列;
[0015]化qman巧光探针皿V-FP:如SEQ ID NO:3所示的核巧酸序列,在5'端标记巧光报 告基团,除5'端标记巧光泽灭基团。
[0016]作为本发明的优选方案,在3'端标记有泽灭基团;
[0017]本发明在PCR扩增时在加入一对引物的同时加入一个特异性的巧光探针,该探针 为一寡核巧酸,两端分别标记一个报告巧光基团和一个泽灭巧光基团。探针完整时,报告基 团发射的巧光信号被泽灭基团吸收;PCR扩增时Taq酶的5' -3'外切酶活性将探针酶切降 解,使报告巧光基团和泽灭巧光基团分离,从而巧光监测系统可接收到巧光信号,即每扩增 一条DNA链,就有一个巧光分子形成,实现了巧光信号的累积与PCR产物形成完全同步。 [001引作为本发明的优选方案,所述巧光报告基团为6-簇基巧光素化-FAM);
[0019] 作为本发明的优选方案,所述巧光泽灭基团为黑桐泽灭剂1度册1);
[0020] 所述巧光报告基团和巧光泽灭基团均为市售。
[0021] 本发明所述的试剂盒包括上述所述的引物组和巧光探针,W及促巧光剂;
[0022] 作为本发明的优选技术方案,还包括皿V病毒定量标准品I~IV组、阴性质控品 和皿V临界阳性质控品。
[0023] 作为本发明的优选技术方案,所述阴性质控品为灭活皿V阴性血清;所述皿V临界 阳性质控品为浓度介于1. 0X 102~2. 0X 10 3IU/mL的皿V阳性血清;所述皿V病毒定量标 准品I浓度为2. 0 X l〇3lU/mL、皿V病毒定量标准品II浓度为1. 0 X l〇5lU/mL、皿V病毒定量 标准品III浓度为5. 0X 106IU/mL、皿V病毒定量标准品IV浓度为2. 5X 108IU/mL。
[0024] 作为本发明的优选技术方案,所述促巧光剂是终质量百分浓度为0. 01%的孔雀石 绿水溶液。
[00巧]作为本发明的优选技术方案,还包括酶混合物。 阳0%] 作为本发明的优选技术方案,所述酶混合物为化q DNA酶和UNG酶。
[0027] 上述试剂盒的使用方法,包括如下步骤: 阳0測 1)提取核酸DNA ;
[0029] 2)采用W上任意所述的试剂盒进行巧光定量PCR扩增反应,PCR扩增时化q DNA 酶的5'-3'外切酶活性将探针酶切降解,使巧光报告基团和泽灭基团分离,从而巧光监测系 统可接收到巧光信号,即每扩增一条DNA链,就有一个巧光分子形成,实现了巧光信号的累 积与PCR产物形成完全同步;
[0030] PCR扩增反应包括:PCR反应液30 y L酶混合物1. 5 y L促巧光剂1. 5 y L所述 PCR 反应液的组成为:皿V-F (10 y M) 1. 5 y L,皿V-R (10 y M) 1. 5 y L,皿V-P (10 y M) 0. 4 y L, DNA Mix 19. 5 yL最后用无菌超纯水将反应体系补至30 yL。
[0031] 3)通过巧光定量PCR仪检测反应结果,巧光信号收集时设定为60°C、FAM巧光 素,如果检测通道没有出现S型扩增曲线,判为皿V病毒阴性;如果检测通道出现S型扩增 曲线,则判定为阳性,并利用皿V定量标准品检测所生成的标准曲线计算待测样本的浓度 师/血)。
[0032] 作为本发明的优选方案,所述步骤2)中PCR扩增反应的条件为:37°C条件下反应 2分钟;95°C,3分钟;然后,95°C,10秒,60°C,35秒,共45个循环。
[0033] 采用上述技术方案后,本发明与现有技术相比具有W下有益效果:
[0034] 1)利用本发明的试剂盒可W快速、简便的对皿V病毒相关性肝炎进行筛查; 阳03引。本发明的检测方法敏感性高,最低检出可达到500IU/mL ;
[0036] 3)本发明的检测方法的特异性很好,不和其他的病毒发生交叉反应,例如JC病毒 (JCV),丙肝病毒(HCV),邸病毒巧BV),人巨细胞病毒(HCMV),人类细小病毒B19 (HPV B19) 和服病毒度KV)等;
[0037]4)本发明的检测方法反应快速,一般1. 5到2小时即可得到反应结果;
[0038]5)本发明的检测方法成本低、无假阳性,适合于大规模临床开展,从而实现对皿V 病毒的快速、有效且准确的定量检测,因而能保证及时的病例诊治及治疗效果监测。
【附图说明】
[0039]图1为采用巧光定量PCR仪检测待测样本得到的曲线; W40]图2为采用巧光定量PCR仪检测皿V病毒定量标准品得到的曲线;
[0041] 图3为采用巧光定量PCR仪通过皿V病毒定量标准品对皿V阳性样本进行定量得 到的曲线。
【具体实施方式】
[0042] W下结合具体实施例和附图对本发明做进一步解释说明。
[0043] 1、对本发明中用到的试剂进行一下解释: W44] 1)核酸释放剂:
[0045]核酸释放剂紫红色,具体组成成分为0.0015%的孔雀石绿、0.015%的明胶、 Tris-肥1、0.01% TritonX-100、5. Omg/L蛋白酶K、0.5M化0H,分装量为leOyLXl管/48 份;
[0046]2) PCR反应液:
[0047] PCR反应液具体组成成分为:皿V-F(10y M)1.5y L皿¥-3(10y M)1.5y L 皿V-FP(10yM)0.4yL DM Mix19.5^以水7.1^以分装量为1500yLXl管/48份;
[0048]扣hq DM酶/UNG酶:80y L X1管/48份; W例4)促巧光剂:
[0050] 促巧光剂具体组成成分为1.5y L水、终质量百分浓度0.01%的孔雀石绿,呈浅蓝 色,分装量为SOiiLXl管/48份;
[(K)川 f5)定量标准品:HBV定量标准品I (2.0X103IU/血)、皿V定量标准品 II (1.0X l05lU/mL)、皿V定量标准品III巧.0X l06lU/mL)、皿V定量标准品IV (2.5X l0SlU/血)、皿V阴性质控品、皿V临界阳性质控品各30y L。 阳化引2、皿V标准血清质控品的制备如下: W53] 收集皿V DNA强阳性混合灭活血清,使用已灭活阴性血清进行稀释,制备 2.5Xl〇SlU/mL5. OXl〇6lU/mLl. OXl〇5lU/mL2. OXl〇3lU/ml皿V标准血清质控品,采用 卫生部标准质控品血清(国家一级标准),进行10X10实验内及实验间重复,最终确定皿V 标准血清质控品的DNA含量,并进行保存条件的稳定性实验。实现原病毒血清质控品与标 本同时进行核酸提取与扩增的全程监控。
[0054]3、皿¥0臟提取 阳化5] 取3y L核酸释放剂,加入PCR反应管中,取待测血清各3y L加入对应的PCR反应 管中,并用移液器在管底吹打混匀15~20次,各PCR反应管中分别加入30y L无菌石蜡油, 然后在PCR反应管口贴上封口膜;将PCR反应管放置在巧光定量PCR仪中进行95°C,lOmin 高溫裂解反应。将经过裂解处理后的PCR反应管从巧光定量PCR仪中取出,撕弃封口膜,悬 空加入PCR-mix (PCR反应液、酶混合物、促巧光剂),瞬时离屯、,备用。
[0056] 4、PCR反应液的配制与加样
[0057] 按W下比例进行PCR反应液配制与加样:PCR反应液30 y LX (n+4管定量标准品 和一管阴性对照W及一管临界阳性质控品),每管加化q DM酶/UNG酶1. 5 y ^促巧光剂 1. 5 y L ;震荡混匀,每份33 y L加入皿V DNA提取管中,直接进行PCR扩增。
[0058] 5、PCR扩增条件
[0059] 37°C,2 分钟;95°C,3 分钟;(95°C,10 秒;60°C,35 秒)X 45 个循环;25°C,30 秒
[0060] 采用MX3000P巧光定量PCR仪,巧光信号收集时设定为FAM巧光素,巧光信号收集 设在60°C。 阳OW] 6、结果判读
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