使用基于jp170三维结构的蛋白质建模修饰枯草杆菌酶的制作方法

专利名称：使用基于jp170三维结构的蛋白质建模修饰枯草杆菌酶的制作方法
技术领域：
本发明涉及JP170和BPN’样枯草杆菌酶(subtilase)以及构建这些具有改变特性的变体的方法，所述特性包括如稳定性(例如热稳定性或储藏稳定性)、Ca2+依赖性、pH依赖的活性，在洗涤和清洁应用中更好的性能。
背景技术：
酶已在在洗涤剂工业中作为洗涤制剂的一部分使用了30年以上。从商业观点看蛋白酶是这些制剂中最相关的酶，但也经常使用其他酶包括脂肪酶、淀粉酶、纤维素酶或酶混合物。
为改进蛋白酶的成本和/或性能，正在寻找具有改变特性的蛋白酶，这些特性如更高的低温活性、更高的热稳定性、在给定pH下更高的比活性、改变的Ca2+依赖性、在其他洗涤剂成份(例如漂白剂、表面活性剂等)存在下更高的稳定性等。
寻找具有改变特性的蛋白酶包括发现天然存在的蛋白酶(即所谓野生型蛋白酶)和改造已熟知的蛋白酶(如通过对编码所述蛋白酶的核酸序列的基因操作)。对蛋白质三维结构和功能之间关系的认识提高了评估改变蛋白质的哪一区域来影响蛋白质特定性状的能力。
经常在洗涤剂中使用的一个蛋白酶家族是枯草杆菌酶。Siezen RJ和Leunissen(JAM，1997，Protein Science，6，501-523.)先前把该家族进一步分为6个亚组。其中一个亚组为枯草菌素家族，包括枯草杆菌酶，如BPN’、枯草菌素309(SAVINASE_、NOVOZYMES A/S)、枯草菌素Carlsberg(ALCALASE_、NOVOZYMES A/S)、枯草菌素S41(来源于嗜冷南极芽孢杆菌(psychrophilic Antarctic Bacillus)TA41的枯草杆菌酶，Davail S等，1994，The Journal of Biological Chemistry，269(26)，99.17448-17453)、枯草菌素S39(来源于嗜冷南极芽孢杆菌TA39的枯草杆菌酶，Narinx E等，1997，Protein Engineering，10(11)，1271-1279页)和TY145(来自描述于WO 92/17577的芽孢杆菌属(Bacillus sp.)TY145菌株NCIMB 40339的枯草杆菌酶)。
前文指出的分组是基于一级氨基酸序列的比对作出的，很少考虑三维结构。然而，尽管属于枯草杆菌酶中枯草菌素亚组的枯草杆菌酶间有序列同源性，由于结构差异，基于一种枯草杆菌酶(如Siezen和Leunissen使用的枯草菌素BPN’)的三维结构模拟另一枯草杆菌酶的三维结构模型可能导致不正确的三维结构。
近来枯草杆菌酶TY145的三维结构已被阐明，并发现它与同属于枯草杆菌酶中枯草菌素亚组的BPN’的三维结构之间存在若干差别(PCT/DK2003/000066)。
TY145和BPN’三维结构的差别被最近发表的球形芽孢杆菌(Bacillus sphaericus)来源的枯草杆菌酶“球形酶”(PDB NO1EA7，Protein Data Bank)的三维结构所证实。该枯草杆菌酶的总体结构和许多细节与枯草杆菌酶TY145的结构高度同源。
枯草杆菌酶JP170和类似JP170的枯草杆菌酶为本领域已知，但没有公开这些枯草杆菌酶的三维结构。
JP70枯草杆菌酶作为蛋白酶A描述于Novozymes的WO 88/01293中。其后Novozymes Biotech的专利申请WO 98/56927公开了JP170的氨基酸(多肽)序列及编码JP170的DNA序列。EP 204 342公开了蛋白酶Ya，Lion Corp.的JP7-62152和JP 4197182公开了编码芽孢杆菌属Y菌株产生的与JP170同源的枯草杆菌酶Ya的DNA序列。另外KaoCorp.的US 6,376,227公开了同样与JP170同源的碱性蛋白酶KP43、KP1790和KP9860的物理特性和DNA及多肽序列。最近在EP 1209233中公开了KP43、KP9860、SD-521和Ya等蛋白酶的变体。这些蛋白酶高度同源，KP43、KP9860、SD-521、Y与JP170的比对显示出至少90％的同源性。因此在本说明书

图1的比对中JP170、Ya和SD-521代表这些蛋白酶。
附图简述图1显示三种JP170型蛋白酶的比对(a)SD-521(EP1 209 233)，(b)蛋白酶Ya(WO 99/67370)，(c)JP170(WO 98/56927，来自附录1的成熟序列)。
图2显示蛋白酶JP170和Savinase(BLSAVI)3D结构的叠合，并显示钙结合位点。图中JP170标记为亮灰色，具有3个离子结合位点，而Savinase为暗色结构，具有两个离子结合位点。
图3显示属于不同枯草杆菌酶亚组的枯草杆菌酶的氨基酸序列的同源性矩阵。序列通过序列数据库登录号及其来源确定。
1aam50084；芽孢杆菌属菌株SD-521来源的枯草杆菌酶2aaw89547；芽孢杆菌JP170来源的枯草杆菌酶3q45681；枯草芽孢杆菌(B.Subtilis)(BSTA41)来源的枯草杆菌酶4p28842；南极芽孢杆菌(Antarcitic Bacillus)菌株(BSTA39)来源的嗜冷枯草菌素5abb77095；芽孢杆菌(TY145)来源的枯草杆菌酶6p00783；枯草芽孢杆菌var.amylosacchariticus(BSAMY)来源的枯草杆菌酶7p29142；嗜热脂肪芽孢杆菌(Bacillus stearothermophilus)(BSSJ)来源的枯草杆菌酶。
8p35835；枯草芽孢杆菌var.natto.(BSNAT)来源的枯草杆菌酶。
9p07518；短小芽孢杆菌(Bacillus pumilus)(B.mesentericus)(BPMES)来源的枯草杆菌酶。
10p00782；解淀粉芽孢杆菌(Bacillus amyloliquefaciens)(BPN’)来源的枯草杆菌酶。
11p00780；地衣芽孢杆菌(Bacillus licheniformis)(BLSCAR)来源的枯草杆菌酶
12p41363；耐盐芽孢杆菌(Bacillus halodurans)(BHSAH)来源的枯草杆菌酶。
13aaw62222；迟缓芽孢杆菌(Bacillus lentus)(BLS147)来源的枯草杆菌酶。
14p29600；迟缓芽孢杆菌(BLSAVI，BLS309)来源的枯草杆菌酶。
15p27693；嗜碱芽胞杆菌(Bacillus alcalophilus)(BAALKP)来源的枯草杆菌酶。
16q99405；枯草杆菌菌株KSM-K16(BSKSMK)来源的枯草杆菌酶。
17p29599；迟缓芽孢杆菌(BLSUBL)来源的枯草杆菌酶。
序列1和2属于JP170型，序列3到5属于TY145型，序列6到11属于“真枯草菌素”或I-S1型，序列12到17属于“高度碱性蛋白酶”枯草菌素或I-S2型。从图3中可清楚的看出，这些类型存在显著的区别。
图4显示以下枯草杆菌酶的三维比对(1)Ty145；(2)BPN’；(3)Savinase；和(4)JP170。
通过3D序列是指通过3D结构的叠合选择同源残基的位置，随后基于这些同源位置进行氨基酸序列比对。
附录简述附录1显示解出的JP170晶体结构的结构坐标。
序列表在附加的序列表中提供了以下氨基酸序列枯草杆菌酶JP170(SEQ ID NO1)枯草杆菌酶Y(SEQ ID NO2)枯草杆菌酶SD-521(SEQ ID NO3)枯草杆菌酶BPN’(SEQ ID NO4)部分序列(SEQ ID NO5)部分序列(SEQ ID NO6)枯草杆菌酶TY145(SEQ ID NO7)
发明概述现在本发明的发明人公开枯草杆菌酶JP70的三维结构。该枯草杆菌酶与枯草菌素BPN’和TY145存在巨大的结构差异。
基于这些差异本发明人已修饰了具有JP170型结构和BPN’型结构的枯草杆菌酶的氨基酸序列，以获得具有改进特性的变体。其变体具有改变的特性，如更高的低温活性、更高的热稳定性、在给定pH下更高的比活性、改变的Ca2+依赖性、在其他洗涤剂成份(例如漂白剂、表面活性剂等)存在下更高的稳定性等。
因此，本发明的目的在于提供构建具有改变特性的枯草杆菌酶的方法，尤其是提供构建具有上述改变特性的枯草杆菌酶的方法。
因此，本发明涉及构建亲本枯草杆菌酶变体的方法，其中变体与所述亲本枯草杆菌酶相比具有至少一项改变的特性，其方法包括a)在评估与JP170三维结构相关的结构因素的基础上分析枯草杆菌酶的三维结构，以鉴定出该枯草杆菌酶中与改变所述特性相关的至少一个氨基酸残基或至少一个结构区域；b)修饰编码亲本的DNA多核苷酸，以构建编码变体枯草杆菌酶的多核苷酸，该变体与亲本枯草杆菌酶相比已通过缺失、替换或插入修饰了a)中鉴定的氨基酸残基或结构部分，以改变所述特性；c)在适当的宿主中表达变体枯草杆菌酶；并d)测试所得枯草杆菌酶变体的所述特性。
更具体的，本发明涉及产生枯草杆菌酶变体的方法，其中变体与亲本枯草杆菌酶相比具有至少一项改变的特性，其方法包括a)在BPN’、TY145或JP170三维结构上产生亲本枯草杆菌酶的模型结构，或产生亲本枯草杆菌酶实际测定出的三维结构；b)通过使活性位点的CA、CB、C、O和N原子匹配的结构叠合，将亲本枯草杆菌酶的模型或实际三维结构与JP170结构进行比较；c)基于步骤b)的比较鉴定出亲本枯草杆菌酶的至少一个结构部分，其中预计该结构部分的改变将导致改变的特性；
d)修饰编码亲本枯草杆菌酶的核酸序列以产生编码在相应于所述结构部分的位置至少一处缺失或替换一个或多个氨基酸或在该结构部分至少一处插入一个或多个氨基酸残基的核酸序列；e)反复进行步骤c)和d)N次，其中N是值为1或更大的整数；f)制备步骤a)-e)中得到的变体；g)测试所述变体的特性；并h)任选地循环重复a)-g)；并i)选择与亲本枯草杆菌酶相比具有至少一项改变特性的枯草杆菌酶变体。
j)在宿主细胞中表达修饰的核酸序列以产生变体枯草杆菌酶；k)分离产生的枯草杆菌酶变体；l)纯化分离的枯草杆菌酶变体；并m)回收纯化的枯草杆菌酶变体。
尽管下文已有所说明，在某一区域和/或位置对亲本枯草杆菌酶的修饰是为了给产生的枯草杆菌酶变体以特定的影响，应该注意在任何这样的区域和/或位点对亲本枯草杆菌酶进行修饰可能还会引起前述的任何其他效果。例如，任何被提到对如提高热稳定性有特殊影响的区域和/或位点，也可能引起例如在较低pH下更高的活性、改变最佳pH、或更高的比活性(如更高的肽酶活性)。
本发明还有的方面涉及枯草杆菌酶的变体、编码这类变体的DNA和制备变体的方法。本发明还有的方面还涉及变体在多种工业目的中的用途，特别是作为洗涤剂组合物中的添加物。本发明的其他方面在下面的描述和附加的权利要求书中是显而易见的。
定义在更详细地讨论本发明之前，首先定义以下的术语和约定。
对氨基酸和核酸命名法的详细描述，我们参照WO 00/71691的第5页，此处引用作为参考。对于通过基因操作向多肽中引入的修饰，其命名法的说明见WO 00/71691的7-12页，此处引用作为参考。
术语“枯草杆菌酶”指根据Siezen等，《Protein Engng.4》(1991)719-737和Siezen等，《Protein Science 6》(1997)501-523的丝氨酸蛋白酶亚组。丝氨酸蛋白酶或丝氨酸肽酶是蛋白酶的一个亚组，其特征在于活性位点有一个丝氨酸，与底物形成共价加合物。另外枯草杆菌酶(和丝氨酸蛋白酶)特征还在于除了丝氨酸外有两个活性位点氨基酸残基，即组氨酸和天冬氨酸残基。
枯草杆菌酶是通过对170多个先前称为枯草菌素样蛋白酶的丝氨酸蛋白酶的氨基酸序列进行同源性分析而定义的。枯草杆菌酶可以分为六个亚组，即枯草菌素家族、Thermitase家族、蛋白酶K家族、Lantibiotic肽酶家族、Kexin家族和Pyrolysin家族。
枯草菌素家族(EC 3.4.21.62)可被进一步分为三个亚组，即I-S1(“真”枯草菌素)、I-S2(高度碱性蛋白酶)和细胞内枯草菌素。酶的定义和分组可以不同或改变，然而，在本发明的上下文中，上述将枯草菌素划分为亚类或亚组的分类法应按照Siezen等，《Protein Engng.4》(1991)719-737和Siezen等，《Protein Science 6》(1997)501-523的描述来理解。
术语“亲本”在本发明的上下文中应理解为被修饰以产生蛋白质变体的蛋白质。亲本蛋白质可以是天然存在(野生型)的多肽或是通过任何适当手段制备的天然多肽的变体。例如，亲本蛋白质可以是对天然存在蛋白质进行修饰得到的天然存在蛋白质的变体，其中修饰可以是替换、化学修饰、缺失或截短一个或多个氨基酸残基，或在氨基酸序列中添加或插入一个或多个氨基酸残基。因此，术语“亲本枯草杆菌酶”指被修饰以产生枯草杆菌酶变体的枯草杆菌酶。
术语“变体”在本发明的上下文中应理解为与亲本蛋白质比较在一个或多个氨基酸残基上被修饰的蛋白质。
术语“修饰”或“修饰的”在本发明的上下文中应理解为包括对蛋白质的化学修饰和对编码蛋白质的DNA的基因操作。修饰可以是氨基酸侧链的取代、目标氨基酸处的替换、缺失和/或插入。因此术语“修饰的蛋白质”(如“修饰的枯草杆菌酶”)应理解为与亲本蛋白质(如枯草杆菌酶)相比含有修饰的蛋白质。
在本发明的上下文中“同源”或“与......同源”应理解为其常规含义，并且两氨基酸序列间的“同源性”应使用威斯康辛大学遗传学计算组(University of Wisconsin Genetic Computer Group)(UWGCG)的软件包中的GAP程序所定义的“相似性”来测定，对于比对参数、比较矩阵、缺口和缺口罚分均使用默认设置。GAP罚分的默认值，例如缺口创建罚分为3.0而缺口延伸罚分为0.1(Program Manual for theWisconsin Package，第8版，1994年8月，Genetics Computer Group，575 Science Drive，Madison，Wisconsin，USA 53711)。该方法在S.B.Needleman和C.D.Wunsch，Journal of Molecular Biology，48，443-445(1970)中也有描述。同一性可由相同的计算得到。两氨基酸序列间的同源性还可以用由UWGCG软件包9.1版的GAP程序计算出的“同一性”或“相似性”测定，使用默认序列比对参数、比较矩阵、缺口和缺口罚分，也可应用下列参数实施缺口创建罚分＝8而缺口延伸罚分＝8，所有其他参数保持为其默认值。程序的输出除了氨基酸序列比对外还有“同一性百分比”和“相似性”的计算结果。用UWGCG软件包9.1版计算出的数字与8.0版略有差别。
术语“位置”在本发明的上下文中应理解为在蛋白质或多肽中从N-末端开始计算的氨基酸编号。本发明中使用的关于不同枯草杆菌酶的位置编号取决于该枯草杆菌酶属于哪一亚组。
如上文所述，碱性枯草杆菌酶KP43、KP1790、KP9860、Y、SD-521和E1基于序列同源性属于JP170亚组。由于其广泛的同源性图1中只将枯草杆菌酶Ya和SD-521与JP170进行了比对。JP170枯草杆菌酶、Y枯草杆菌酶和SD-521枯草杆菌酶分别根据SEQ ID NO1、SEQ IDNO2、SEQ ID NO3编号。
然而，本发明并不仅限于这些特定的枯草杆菌酶的变体，而是扩展到含有位于与JP170枯草杆菌酶中具体鉴定的残基“等效”位置的氨基酸残基的亲本枯草杆菌酶，特别是JP170型。
如果JP170型枯草杆菌酶的残基与JP170枯草杆菌酶中的特定残基或该残基的位置同源(即在一级或三级结构中的位置相对应)或类似，则该残基(氨基酸)位置等效于JP170枯草杆菌酶的该残基(位置)(即具有相同或相似的结合、反应或化学相互作用的能力)。
为建立一级结构的同源性，通过将分离的或亲本野生型枯草杆菌酶的氨基酸序列与同组或类的酶中适当的已知(标准)酶进行比对来限定参照框，将前体蛋白酶的氨基酸序列与JP170枯草杆菌酶的一级结构直接进行比较。在涉及以枯草菌素BPN’作为标准枯草菌素的I-S1和I-S2亚组枯草菌素的大量专利申请中都使用了这种编号方式。
本文中未另外指出时，本实例选择JP170枯草杆菌酶为标准。
为建立与JP170三级结构(3D结构)的同源性，提供了图1中基于3D结构的比对。通过使用该比对，前体JP170型枯草杆菌酶的氨基酸序列可以与JP170一级直接序列相关联。对于新的JP170型枯草杆菌酶，与JP170中位置相应的(基于3D的)位置可通过以下发现i)从图1的比对中鉴定出与新序列最同源的JP170型枯草杆菌酶，ii)将新序列与鉴定出的序列进行比对以从图1中找出JP170型枯草杆菌酶中的相应位置，并iii)从图1中确立JP170中的相应位置。
为了比较和找出最同源的序列，使用如下文所述来自GCG包的GAP程序。
如上文指出，可以通过GCG包第8版中的GAP程序使用以下参数得到比对以编号变体缺口创建罚分＝3、缺口延伸罚分＝0.1且所有其他参数保持为其默认值。
比对可以定义许多与JP170序列相关的缺失和插入。在比对中，缺失以参照序列中的星号(*)标记，认为参照酶在所述位置具有缺口。插入以JP170序列中的星号(*)标记，参照酶中的位置以标准酶中存在相应氨基酸残基的最后一个氨基酸残基的位置编号及按字母表顺序附加的小写字母一起给出，例如82a、82b、82c、82d。
在参照酶与JP170相比含有N-或C-末端延伸的情况下，N-末端延伸在N-末端方向赋予位置编号0a、0b等；C-末端延伸可以用JP170 C-末端氨基酸残基的位置编号加上按字母表顺序附加的小写字母编号，或者简单地继续连续的编号。
因此为了比较，JP170型枯草杆菌酶参考图1提供的JP170枯草杆菌酶(SEQ ID NO1)的位置编号。位置指示“对应于JP170”。
属于BPN’亚组的枯草杆菌酶参照来源于解淀粉芽孢杆菌的枯草菌素Novo(BPN’)(SEQ ID NO4)的位置。
属于TY145亚组的枯草杆菌酶参照TY145枯草杆菌酶(SEQ IDNO7)的位置，也可参阅PCT/DK2004/000066。
发明详述尽管上文所述枯草杆菌酶有很高的同源性，本发明的发明人通过X射线衍射晶体分析法阐明了JP170，SEQ ID NO1的三维结构并发现它与BPN’的三维结构之间存在若干差异。本发明的发明人进一步比较了属于枯草菌素亚组的枯草杆菌酶的序列同源性。示于本发明图3。
基于该比较本发明的发明人建议划分枯草菌素亚组以使JP170型枯草杆菌酶成为除BPN’枯草杆菌酶亚组和TY145枯草杆菌酶PCT/DK2004/000066亚组之外的独立亚组。
JP170型枯草杆菌酶术语“JP170枯草杆菌酶”或“JP170型枯草杆菌酶”在本发明上下文中应理解为属于根据Siezen等，《Protein Science 6》(1997)501-523的枯草菌素组，并与JP170，SEQ ID NO1具有至少58％的同源性的枯草杆菌酶。具体而言，JP170型枯草杆菌酶可以与JP170即SEQ ID NO1有至少60％，例如至少65％、至少70％、至少75％、至少80％、至少85％、至少90％、至少91％、至少92％、至少93％、至少94％、至少95％、至少96％、至少97％、至少98％或至少99％的同源性。因此除其他以外，碱性蛋白酶KP43、KP1790、KP9860、蛋白酶Ya、蛋白酶E-1和SD-521等是属于枯草杆菌酶JP170亚组的枯草杆菌酶。
适合本文所述目的的JP170枯草杆菌酶可以是与JP170三维结构同源的枯草杆菌酶，即它可以与附录1中的结构坐标定义的三维结构同源。
如本领域技术人员所熟知，蛋白质或其部分的结构坐标集就是在三维空间定义了形状的点的相对集合，完全不同的坐标集可能定义相同或者相似的形状。此外，单个坐标的轻微改变可能对总体形状没有或几乎没有影响。
这些坐标的改变可能是由于结构坐标的数学处理而产生。例如，可以通过结构坐标的结晶学变换、结构坐标的分段、结构坐标集的整体添加或消减、结构坐标的翻转或任何前述的组合来处理JP170(附录1)的结构坐标。另外，所述改变也可能是由于一级氨基酸序列的不同。
如果这些变体与附录1的结构坐标相比在可接受的标准差(如0.8_)范围内，则该三维结构在本发明上下文中应理解为与附录1的结构同源。标准差一般可以通过例如保守的主链残基的均方根偏差来衡量，其中术语“均方根偏差”(RMS)意为偏离平均值的平方的算术平均值的平方根。
如本领域技术人员所熟知，在一组具有同源结构的蛋白质中也可能在其结构的某些部分或区域(例如环)存在三维结构上的不同，所述部分或区域并非(或至少不仅仅)对结构的功能结构域具有次重要性，而是可能导致所述结构中保守残基主链原子间巨大的均方根偏差。
因此，众所周知结构坐标集是与结晶蛋白质唯一对应的。其他三维结构，即使是同源结构甚至是以不同方式结晶的同一蛋白质都不具有完全相同的坐标集。坐标中存在着自然波动。可以发现总体结构和原子间的关系是相似的。这种相似性可以就一个结构中的每个原子与另一结构中每个“同源的”原子间的均方根偏差来讨论。然而，只有完全一致的蛋白质具有完全相同的原子数。所以，相似性低于100％的蛋白质通常具有不同的原子数，因此无法计算所有原子的均方根偏差，而只能计算那些认为是“同源”的。因此基于座标的相似性的精确描述对于同源蛋白质来说难以说明和计算。关于本发明，不同枯草杆菌酶3D结构间的相似性可通过同源结构元件的含量和/或氨基酸或DNA序列的相似性来说明。对于没有缺失或插入的序列，可以计算钙原子的RMS。
任选地，JP170型枯草杆菌酶其特征还在于包含如下结构特征a)具有7条链的扭曲的β片层，b)6个α螺旋c)至少3个离子结合位点，且不含有BPN’样枯草杆菌酶的强和弱离子结合位点。
另外编码本发明TY145枯草杆菌酶的分离的核酸序列与编码SEQ IDNO1的氨基酸序列的核酸序列的互补链优选在低严格条件下杂交，至少在中度严格条件下，至少在中/高严格条件下，至少在高严格条件下，至少在极高严格条件下杂交。
鉴定核苷酸探针与同源DNA或RNA序列在低、中或高严格条件下杂交的适当的实验条件包括将含有用于杂交的DNA片段或RNA的滤器在5×SSC(氯化钠/柠檬酸钠，Sambrook等，1989)中预浸泡10分钟、在含5×SSC、5×Denhardt’s液(Sambrook等，1989)、0.5％SDS及100μg/ml变性的超声处理鲑精DNA(Sambrook等，1989)的溶液中预杂交滤器，随后在含有浓度为10ng/ml随机引发的(Feinberg，A.P.和Vogelstein，B.(1983)Anal.Biochem.1326-13)、32P-dCTP标记(比活性＞1×109Ocpm/μg)探针的相同溶液中在45℃下杂交12小时，然后以2×SSC、0.5％SDS在至少*55℃(低严格)下洗涤两遍30分钟，优选至少60℃(中度严格)，更优选至少65℃(中/高严格)，甚至更优选至少70℃(高严格)，甚至更优选至少75℃(极高严格)。
BPN’枯草杆菌酶本发明上下文中BPN’枯草杆菌酶或BPN’型枯草杆菌酶应理解为属于根据Siezen等，《Protein Science 6》(1997)501-523的枯草菌素组，并与SEQ ID NO4具有至少61％的同源性的枯草杆菌酶。具体而言，BPN’枯草杆菌酶可以与BPN’(即SEQ ID NO4)有至少65％，例如至少70％、至少75％、至少80％、至少85％、至少90％、至少91％、至少92％、至少93％、至少94％、至少95％、至少96％、至少97％、至少98％或至少99％的同源性。
另外编码本发明BPN’枯草杆菌酶的分离的核酸序列与编码SEQ IDNO4的氨基酸序列的核酸序列的互补链优选在低严格条件下杂交，但至少在中度严格条件下、至少在中/高严格条件下、至少在高严格条件下、至少在极高严格条件下杂交。
本发明的一个实施方案中，适合本文所述目的的BPN’枯草杆菌酶可以是与如PDB No.1SBT和1GNS(Proteim Data Bank)中给出的结构坐标所定义的BPN’三维结构同源的枯草杆菌酶，或是与在Protein DataBank中可查询的其他几个BPN’结构之一同源的枯草杆菌酶。同源结构间的变化可由于前述若干原因而产生。因此本发明上下文中的BPN’枯草杆菌酶应理解为具有属于前述BPN’枯草杆菌酶结构特征的任何枯草杆菌酶，另外，该枯草杆菌酶优选不含有在前述BPN’枯草杆菌酶中不存在的其他结构特征。本发明上下文中BPN’型枯草杆菌酶具有两个离子结合位点。在本发明的上下文中BPN’样枯草杆菌酶可以属于枯草菌素的I-S分支，即属于I-S1(“真”枯草菌素)或I-S2(高度碱性枯草菌素)分支(Siezen等，《Protein Engng.4》(1991)719-737)。
BPN’样枯草杆菌酶的实例除其他以外，还包括枯草菌素309(PDBNO1SVN SAVINASE_，NOVOZYMES A/S)和枯草菌素Carlsberg(ALCALASE_，NOVOZYMES A/S)等等。
联系R.J.Siezen和J.A.M Leunissen(Protein science，第6卷6(3)，501-523页，1997)502页中的图1，枯草杆菌酶的结构被描述为枯草杆菌酶由6-8个螺旋、11条链组成，其中7条位链于扭曲的β片层的中心。提到了两个离子结合位点，所谓的“强”和“弱”钙结合位点。后来发现在某些结构中(枯草菌素DY PDB no.1BH6，1998)，当结晶介质中钙浓度低时，弱钙结合位点表现为Na(钠)结合位点。因此，我们以下称为离子结合位点而不是钙结合位点。
TY145枯草杆菌酶TY145枯草杆菌酶或TY145样枯草杆菌酶在本发明上下文中应理解为与SEQ ID NO7有至少63％同源性的枯草杆菌酶。具体而言，所述TY145枯草杆菌酶可以与TY145(即SEQ ID NO7)有至少65％，例如至少70％、至少74％、至少80％、至少83％、至少90％、至少91％、至少92％、至少93％、至少94％、至少95％、至少96％、至少97％、至少98％或至少99％的同源性。
在本发明的一个实施方案中，适合本文所述目的的TY145枯草杆菌酶可以是与PCT/DK2004/000066中给出的结构坐标定义的TY145的三维结构同源的枯草杆菌酶。同源结构间的变化可由于前述若干原因而产生。因此本发明上下文中的TY145枯草杆菌酶应理解为具有属于前述TY145枯草杆菌酶结构特征的任何枯草杆菌酶，另外，该枯草杆菌酶优选不含有在前述TY145枯草杆菌酶中不存在的其他结构特征。
通常TY145枯草杆菌酶还具有如下结构特征a)有7条链的扭曲的β片层，b)6个α螺旋c)至少3个离子结合位点，其中不存在BPN’型枯草杆菌酶的强离子结合位点。
TY145型枯草杆菌酶的实例包括TY145枯草杆菌酶、来源于南极芽孢杆菌(Antarctic Bacillus)TA41的嗜冷枯草菌素蛋白酶S41，本文中也称为TA41枯草杆菌酶(Davail S等，1994，The Journal of BiologicalChemistry，269(26)，99.17448-17453)、以及来源于南极芽孢杆菌TA39的嗜冷枯草菌素蛋白酶S39，本文中也称为TA39枯草杆菌酶(Narinx E等，1997，Protein Engineering，10(11)，1271-1279)。
JP170枯草杆菌酶的三维结构JP170枯草杆菌酶用来说明构成本发明基础的三维结构。
按照x射线结晶学方法的原则(例如《X-Ray StructureDetermination》，Stout，G.K.和Jensen，L.H.，John Wiley & Sons，Inc.NY，1989中所给出的原则)解出了JP170的结构。
解出的JP170晶体结构的结构坐标以如附录1中列出的标准PDB格式(Protein Data Bank，Brookhaven National Laboratory，Brookhaven，CT)给出。应该理解附录1构成了本申请的一部分。在附录1上下文中使用了如下缩写CA指c-α(碳原子)或钙离子(然而为了避免误解我们在本说明书中使用全名“c-α原子”和“钙”或“离子”)。氨基酸残基以标准三字母代码给出。附带的结构坐标包含蛋白酶结构、抑制剂结构CI2以及水分子。蛋白酶坐标的链标识称为A，而CI2抑制剂称为B，钙离子称为C，水为W。下文提及残基的位置参照SEQ ID NO1公开的JP170序列。
JP170结构由两个结构域(催化结构域和C-末端结构域)组成。
催化结构域的结构显示出与在枯草菌素S8家族中发现的相同的总体折叠方式。其结构包括7条链按照S2、S3、S1、S4、S5、S6、S7顺序排列形成的扭曲β片层。
催化结构域的结构中有6个α螺旋，其编号H1含有残基9-17，H2含有残基68-76，H3含有残基110-119，H4含有残基139-150，H5含有残基253-273，H6含有残基281-291。
C-末端结构域包含链基序——由片层a和b组成的所谓“β夹层”。该结构域的片层由链以反向平行的方式组合而成，而催化结构域中的链则以平行方式组合。链的前后顺序可以表示为S1a-S1b-S3a-S3b-S4b-S4a-S2b-S2a，具有组织成S1a、S3a、S4a、S2a和S1b、S3b、S4b、S2b两个片层的β夹层。
已经发现JP170枯草杆菌酶缺乏BPN’枯草杆菌酶众所周知的强和弱离子结合位点。然而JP170枯草杆菌酶具有BPN’枯草菌素结构中不存在的3个离子结合位点。这可以在图2显示的结构比对中看到。这3个离子结合位点在下文中称为位点1(位于催化结构域)和位点2和3(位于非催化C-末端结构域)。
因此相对于附录1中公开的原子坐标相关的，JP170的离子结合位点在PDB表(附录1)中定位于位点1-命名为A601 CA的钙原子位点2-命名为A603 CA的钙原子，和位点3-命名为A602 CA的钙原子。
离子结合位点的位置可以通过与核心结构中4个特定原子的距离来定义。已经选定了离子结合位点到三个活性位点残基中c-α原子的距离。在全部枯草杆菌酶中活性位点的丝氨酸、组氨酸、天冬氨酸残基是高度保守的。在JP170中它们是天冬氨酸30、组氨酸68和丝氨酸254。选定的第四个距离是与序列中活性位点丝氨酸残基后第一个氨基酸残基c-α原子的距离(下文称为“紧靠丝氨酸”)；在JP170的3D结构中它是甲硫氨酸255。
在本发明的一个优选的实施方案中a)离子结合位点1与i)天冬氨酸c-α原子间的距离为26.70-28.70_，ii)组氨酸c-α原子间的距离为22.10-24.10_，iii)丝氨酸c-α原子间的距离为16.95-18.95_，iv)紧靠丝氨酸c-α原子间的距离为15.30-17.30_，b)离子结合位点2与i)天冬氨酸c-α原子间的距离为33.50-35.50_，ii)组氨酸c-α原子间为37-39_，iii)丝氨酸c-α原子间为29.40-31.40_，iv)紧靠丝氨酸c-α原子间为30.70-32.70_，c)离子结合位点3与
i)天冬氨酸c-α原子间为41.50-43.50_，ii)组氨酸c-α原子间的距离为42.90-44.90_，iii)丝氨酸c-α原子间的距离为34.50-36.50_，iv)紧靠丝氨酸c-α原子间的距离为35-37_。
以下为JP170枯草杆菌酶中选定的4个c-α原子与3个离子结合位点间的特定距离，离子结合位点间的距离以_为单位位点1 位点2位点3天冬氨酸30 27.69 34.4942.48组氨酸68 23.12 38.0343.87丝氨酸25417.95 30.4135.51甲硫氨酸255 16.34 31.6836.02位点10 35.2932.92位点235.29 014.08位点332.92 14.080然而，这些距离在不同枯草杆菌酶中可能有所变化。本距离以结构中为钙离子而给出。如果与钠离子结合，距离会略有迁移。通常距离可能变化±0.8_，优选±0.7_、±0.6_、±0.5_、±0.4_，或最优选±0.3_。
另外，JP170样枯草杆菌酶中，划定与金属离子距离上至10_的离子结合位点1范围的肽结构由位于183-189、191-204和224-225的氨基酸残基组成。
划定与金属离子距离上至10_的离子结合位点2范围的肽结构由378-393残基组成。
划定与金属离子距离上至10_的离子结合位点3范围的肽结构由348、350、352、363-370、380-383、391-400和414-420残基组成。
I-S1和I-S2亚组(BPN’样枯草杆菌酶)的比较与BPN’样枯草杆菌酶结构相比，JP170样枯草杆菌酶的结构可分为“核心枯草杆菌酶样”区、“居间”区和“非同源”区。
可以在结构上与BPN’结构密切相关的核心枯草杆菌酶样区发现活性位点。核心枯草杆菌酶样区由17-34、197-209和216-232残基组成，包含H3α螺旋和H5中心α螺旋，其中活性位点丝氨酸残基位于N端部分。共有枯草杆菌酶样区的RMS低于1.2。
核心枯草杆菌酶样区外，JP170样枯草杆菌酶与BPN’的结构存在更大程度的差异。
居间区由42-46、150-186、245-272和278-296残基组成。居间区的RMS高于1.2而低于1.8。JP170样枯草杆菌酶该区域的三维结构和功能性之间的关系可能难以预测。
非同源区由1-16、35-41、47-179、187-196、210-215、233-244、273-277和297-316残基组成。非同源区的RMS高于1.8。JP170样枯草杆菌酶该区域三维结构和功能性之间的关系很难预测。
JP170样枯草杆菌酶3D结构中的很多环在长度和氨基酸残基内容上与BPN’型结构有显著差异。以下JP170的环或蛋白质序列片段与Savinase(BPN’的编号在圆括号中)相比较(见图4)。
G32-H43(G34-H39)E44-Y54(P40-A48)G57-G67(V51-G63)N79-N82(I75-V81)I96-P107(V95-S105)A108-S119(106-N117)A131-Y137(S128-S132)T138-D152(A133-G146)E162-I169(S156-I165)G173-T180(A169-A176)E185-N199(D181-N184)G208-D218(G193-D197)S232-K246(G211-T213)
D294-N303(S256-L262)在Savinase中，环N79-N82(I75-V81)和G208-D218(G193-D197)与离子结合位点接触，但在JP170中则不是。相似地，在JP170中，环E185-N199(D181-N184)与离子结合位点接触，但在Savinase中则不是。这一认识开启了在JP170和BPN’样类型的枯草杆菌酶中加入或去除离子结合位点的可能性。
该差异的很好的实例是，与相应的只含有3个残基的BPN’型环G211-T213(Savinase中)相比，JP170中的环S232-K246含有15个残基。在JP170样枯草杆菌酶中，环折回到底物结合位点，特别是底物结合位点的P’部分。如结合附带的3D结构(附录1)的CI2抑制剂所说明的，环位于靠近底物处。
JP170中环S232-K246的定位可通过与前述的四个特定残基的关系描述。环中W240残基的CA原子与活性位点残基CA原子的距离为残基 H68 D30 S254 M255距离(_) 11.4518.5113.06 11.94如上文所述，这些距离可能变化±0.8_，优选±0.7_、±0.6_、±0.5_、±0.4_，或最优选±0.3_。
另外，可以计算JP170中环S232-K246的残基与CI2抑制剂CA原子间的距离。这些距离为从W240的CA原子到CI2中R62的CA原子为7.49_，从F239的CA原子到CI2中R62的CA原子为8.39_，从S238的CA原子到CI2中R62的CA原子为8.42_，从S237的CA原子到CI2中R62的CA原子为9.44_，从S238的CA原子到CI2中E60的CA原子为9.42_。
如附录1中的3D坐标所示，JP170活性位点残基S254与CI2抑制剂的原子间的距离为从S254的CA原子到CI2中E60的CA原子为5.25_，从S254的CA原子到CI2中R62的CA原子为11.55_，从S254的CA原子到CI2中T58的CA原子为7.06_，从S254的CA原子到CI2中M59的CA原子为4.71_。
这些距离可能变化±0.8_，优选±0.7_、±0.6_、±0.5_、±0.4_，或最优选±0.3_。
优选的JP170样枯草杆菌酶变体缺失了S232-K246区域并随后插入了一个或多个残基以将环部分或完全去除。优选的变体含有L233-S245缺失+天冬酰胺插入、L233-D244缺失+甘氨酸插入或S232-D244缺失+甘氨酸插入。
可对与TY145结构的差异做类似的考察。
JP170、BPN’和TY145枯草杆菌酶同源性的建立JP170型枯草杆菌酶、BPN’型枯草杆菌酶或TY145型枯草杆菌酶的结构模型可以使用Homology程序或与之相当的程序如Modeller(都来自于Molecular Simulations，Inc.，San Diego，CA)来建立。原理为将3D结构已知的蛋白质的氨基酸序列与需要构建3D结构模型的蛋白质的氨基酸序列进行比对。可以基于共有序列建立结构保守区。在缺乏同源性的区域，可以通过例如Homology程序插入环结构或是删除序列，以使必要残基的顺次连接。随后应使用Homology或其他分子模拟程序(如Molecular Simulations的CHARMm)完成结构的松弛和优化。
设计JP170、BPN’和TY枯草杆菌酶变体的方法不同蛋白质的分子动力学比较可以提示哪些结构域对于每种蛋白质具有的某些特性是重要的或与之相关。
因此本发明涉及构建亲本枯草杆菌酶变体的方法，其中变体与亲本枯草杆菌酶相比具有至少一项改变的特性，其方法包括
a)在评估与JP170三维结构相关的结构因素的基础上分析枯草杆菌酶的三维结构，以鉴定出该枯草杆菌酶中与改变所述特性相关的至少一个氨基酸残基或至少一个结构区域；b)修饰编码亲本的多核苷酸的DNA，以构建编码变体枯草杆菌酶的多核苷酸，所述变体与亲本枯草杆菌酶相比通过缺失、替换或插入a)中鉴定的氨基酸残基或结构部分而进行了修饰以改变所述特性；c)在适当的宿主中表达变体枯草杆菌酶；并d)测试产生的枯草杆菌酶变体的所述特性。
更具体地，本发明涉及产生枯草杆菌酶变体的方法，其中变体与亲本枯草杆菌酶相比具有至少一项改变的特性，其方法包括a)在BPN’、TY145或JP170三维结构上产生亲本枯草杆菌酶的模型结构，或产生亲本枯草杆菌酶实际测定出的三维结构；b)通过使活性位点的CA、CB、C、O和N原子匹配的结构叠合，将亲本枯草杆菌酶的模型或实际三维结构与JP170结构进行比较；c)基于步骤b)的比较鉴定出亲本枯草杆菌酶的至少一个结构部分，其中预计该结构部分的改变将导致改变的特性；d)修饰编码亲本枯草杆菌酶的核酸序列以产生编码在相应于所述结构部分的位置至少一处缺失或替换一个或多个氨基酸或在该结构部分至少一处插入一个或多个氨基酸残基的核酸序列；e)反复进行步骤c)和d)N次，其中N是值为1或更大的整数；f)制备步骤a)-e)中得到的变体；g)测试所述变体的特性；并h)任选地循环重复a)-g)；并i)选择与亲本枯草杆菌酶相比具有至少一项改变特性的枯草杆菌酶变体。
j)在宿主细胞中表达修饰的核酸序列以产生变体枯草杆菌酶；k)分离产生的枯草杆菌酶变体；l)纯化分离的枯草杆菌酶变体；并
m)回收纯化的枯草杆菌酶变体。
因此本发明一般性涉及本文提供的JP170结构在BPN’型(I-S1和I-S2亚组)、TY145型和JP170型三种枯草杆菌素类型中的任一枯草杆菌酶中鉴定需要的修饰的用途，所述鉴定通过建立亲本枯草杆菌酶的3-D结构模型并随后与JP170 3-D结构进行比较，或在亲本枯草杆菌酶的3-D结构实际已知的情况下通过与JP170 3-D结构进行比较。
基于该比较，选出亲本枯草杆菌酶中至少一个残基进行替换、缺失和插入的修饰，以提供与亲本枯草杆菌酶相比具有改变特性的枯草杆菌酶变体。
在一个实施方案中，亲本枯草杆菌酶因而可以属于I-S1亚组，优选选自ABSS168、BASBPN、BSSDY和BLSCAR或它们保留了I-S1亚组特征的功能变体。
在另一实施方案中，亲本枯草杆菌酶属于I-S2亚组，优选选自BSL147、BLS309、BAPB92和BYSYAB或它们保留了I-S2亚组特征的功能变体。
在另一实施方案中，亲本枯草杆菌酶属于TY145型亚组，优选选自TY145、又称为TA41的蛋白酶S41、又称为TA39枯草杆菌酶的蛋白酶S39等。
特别的，亲本枯草杆菌酶属于JP170型亚组，优选选自JP170、KP43、KP9860、蛋白酶E-1、蛋白酶Ya、蛋白酶SD-521等。
本发明另一实施方案涉及产生JP170型枯草杆菌酶变体的方法，其变体与亲本枯草杆菌酶相比具有至少一项改变的特性，其方法包括a)在JP170三维结构上产生亲本JP170型枯草杆菌酶的模型结构，或产生亲本枯草杆菌酶实际测定出的三维结构；b)通过使活性位点的CA、CB、C、O和N原子匹配的结构叠合，将亲本JP170型枯草杆菌酶的模型或实际三维结构与BPN’或TY145结构进行比较；c)基于步骤b)的比较鉴定出亲本JP170型枯草杆菌酶的至少一个结构部分，其中预计该结构部分的改变将导致改变的特性；d)修饰编码亲本JP170型枯草杆菌酶的核酸序列以产生编码在相应于所述结构部分的位置至少一处缺失或替换一个或多个氨基酸或在该结构部分至少一处插入一个或多个氨基酸残基的核酸序列；e)反复进行步骤c)和d)N次，其中N是值为1或更大的整数；f)制备步骤a)-e)中得到的JP170型枯草杆菌酶变体；g)测试所述变体的特性；并h)任选地，循环重复a)-g)；并i)选择与亲本枯草杆菌酶相比具有至少一项改变特性的JP170型枯草杆菌酶变体。
j)在宿主细胞中表达修饰的核酸序列以产生变体枯草杆菌酶；k)分离产生的JP170型枯草杆菌酶变体；l)纯化分离的枯草杆菌酶变体；并m)回收纯化的枯草杆菌酶变体。
本发明还包括通过以上方法产生的蛋白酶变体。
稳定性-离子结合位点的改变如上文所述，如附录1所提供的JP170枯草杆菌酶三维结构表明该酶具有BPN’枯草杆菌素结构中不存在的3个离子结合位点，因此缺乏BPN’枯草杆菌酶的强和弱离子结合位点。离子结合位点的稳定性对于酶的功能是重要的。因此，离子结合位点的改变可能导致酶稳定性的改变。
更高的稳定性通过离子结合位点附近位置上的改变可能获得JP170的稳定。因此在本发明方法的一个实施方案中，前述步骤c)鉴定出与位于JP170离子结合位点10_或更短距离内的氨基酸残基位置，优选位于6_或更短距离内的位置。
因此本发明优选的变体修饰了一个或多个位于JP170(SEQ IDNO1)离子结合位点10_距离的位置。这些位置为位点1183-189(即位置183、184、185、186、187、188、189)，191-204(即位置191、192、193、194、195、196、197、198、199、200、201、202、203、204)，224-225；位点2378-393(即位置378、379、380、381、382、383、384、385、386、387、388、389、390、391、392、393)；位点3348、350、352，363-370(即位置363、364、365、366、367、368、369、370)，380-383(即位置380、381、382、383)，391-400(即位置391、392、393、394、395、396、397、398、399、400)，414-420(即位置414、415、416、417、418、419、420)。
其他JP170型枯草杆菌酶的相应位置可以如前文公开的或通过使用本文的图1鉴定。
在洗涤剂组合物中，钙螯合剂促成钙从枯草杆菌酶中离去，结果导致酶随后的失活。为降低例如由钙螯合剂引起的钙离去所导致的失活，可以构建具有更高的钙稳定性的变体。
稳定了离子结合位点1的优选变体为S193Q、Y；H200D、N和H200D、N+D196N。
稳定了离子结合位点2的优选变体为N390D和N391D，稳定了离子结合位点3的优选变体为G394N、Q、F、Y、S和W392S、N、Q。
热稳定性的改变可以通过使用脯氨酸替换、引入二硫键、改变氢键触点、改变电荷分布、引入盐桥、用一个或多个具有更大侧链基团填充内部结构的空腔(如在结构可变区域)、用其他氨基酸替换组氨酸残基、去除脱酰胺作用位点、或螺旋加帽来获得具有更高稳定性的变体(通常是更高的热稳定性)。
提高活动性的区域JP170的如下区域在酶的晶体结构中具有提高的活动性，现在认为这些区域与JP170的稳定性或活性有关。特别是可以通过改变高活动区域获得热稳定性。可以通过以下区域和位置的突变改良酶。在侧链引入例如更大的残基或具有更多原子的残基可以提高稳定性，或例如在侧链引入具有更少原子的残基可能对活动性重要并因此对酶活性分布重要。
使用了两种方法从3D结构中选出高活动区域。一种是通过使用MSI(Molecular Simulations Inc.)的CHARMm程序进行均向波动(isotropic fluctuation)的分子动力学计算，另一种是B-因子分析。B因子在附录1中列出，并给出了结构中多种原子的定位测定中的不确定度的值。不确定度与晶体点阵中分子的原子的活动性有关。活动性反映了原子的热运动，因此指示了酶的热稳定作用的可能位点。
因此，通过分析取自附录1的坐标文件中的B-因子(参阅《in X-RayStructure Determination》，Stout，G.K.和Jensen，L.H.，John Wiley &Sons，Inc.NY，1989)确定了JP170结构中的如下活动区13-18(即位置13、14、15、16、17、18)，37-43(即位置37、38、39、40、41、42、43)，47-50(即位置47、48、49、50)，57-59(即位置57、58、59)，96-103(即位置96、97、98、99、100、101、102、103)，131-134(即位置131、132、133、134)，152-153，162-166(即位置162、163、164、165、166)，188-195(即位置188、189、190、191、192、193、194、195)，210，
234-246(即位置234、235、236、237、238、239、240、241、242、243、244、245、246)，372-378(即位置372、373、374、375、376、377、378)，387-392(即位置387、388、389、390、391、392)，406-407，419。
JP170在300K和400K的分子动态模拟提供了如下的高活动区37-42(即位置37、38、39、40、41、42)，57-60(即位置57、58、59、60)，66-67，98-103(即位置98、99、100、101、102、103)，107-111(即位置107、108、109、110、111)，188-193(即位置188、189、190、191、192、193)，236-240(即位置236、237、238、239、240)，326-332(即位置326、327、328、329、330、331、332)，337-342(即位置337、338、339、340、341、342)，355-360(即位置355、356、357、358、359、360)，372-377(即位置372、373、374、375、376、377)，384-388(即位置384、385、386、387、388)，404-411(即位置404、405、406、407、408、409、410、411)。
因此本发明优选的JP170枯草杆菌酶变体修饰了SEQ ID NO1中一个或多个上述位置。另外优选的变体含有区域57-60、66-67、107-111、236-240、326-332、355-360、372-377、384-388、404-411中的一个或多个改变。特别优选变体W240H、Y和在区域355-360中有修饰的变体，如含有以下一个或多个修饰的变体G355A、S；S356T、N；T357N、Q、D、E、P；T358S；A359S、T、N、Q和S360T、N。
可以如本文所述通过使用DOPE程序进行随机诱变的方法产生修饰了区域355-360的变体。为获得在区域355-360含有1-3个修饰的变体，可以引入以下频率的替换野生型 修饰95％ 5％G355A、S90％ 10％S356T、N80％ 20％T357N、Q、D、E、P90％ 10％T358S80％ 20％A359S、T、N、Q80％ 20％S360T、N。
二硫键可以通过在结构域内或结构域间引入新的键获得与亲本JP170相比具有更高稳定性(例如热稳定性)的本发明JP170变体，如通过建立结构域内或结构域间的二硫键。
因此，本发明另一方面涉及产生亲本JP170变体的方法，其中步骤c)鉴定出亲本JP170型枯草杆菌酶中的氨基酸残基位置，通过至少一个半胱氨酸残基的插入或替代，该位置的修饰可产生至少一个二硫键。
下文提到的在SEQ ID NO1的氨基酸序列中鉴定出的氨基酸残基被认为适于半胱氨酸取代。进行一个或多个半胱氨酸替换后，JP170的变体中可能形成二硫键。这些替换是G21C+A86C、V26C+A265C、G57C+G105C、G74C+A229C、Q111C+N143C、G160C+S170C、A286C+V349C、A27C+A122C、A45C+G78C、V72C+P258C、G78C+A229C、D98C+G104C、Q111C+Y147C、G135C+G167C、R142C+P354C、V144C+A178C、G182C+P217C、A183C+G223C、A195C+Y225C、F271C+P279C、A287C+A430C、A293C+T310C、E322C+S428C、S324C+A332C、S327C+P424C、D352C+N397C、G355C+T362C、G291C+S314C。
优选的变体含有一个或多个以下替换G21C+A86C、V26C+A265C、G57C+G105C、G74C+A229C、Q111C+Y143C、G160C+S170C、A286C+V349C、A4C+P222C和A27C+A117C。
通过寻找图1比对中的同源位置可以阐明与JP170同源的枯草杆菌酶中适于半胱氨酸取代的类似残基。对于其他JP170样序列，可以使用如前述的GAP分析法将所述JP170样序列与图1中全部序列进行比对来选择适于半胱氨酸取代的同源位置。然后，可以根据与图1中比对的枯草杆菌酶序列SEQ ID NO1、2和3中最同源的同源位置选择合适的残基。
表面电荷分布可以通过改变枯草杆菌酶的表面电荷分布获得与亲本枯草杆菌酶相比具有更高稳定性(通常为更高的热稳定性)的变体。例如，当pH低至约5或更低时，组氨酸残基通常带正电，因此，可能在蛋白质表面出现不利的静电相互作用。通过改变枯草杆菌酶的表面电荷可以避免这种不利的静电相互作用并继而导致枯草杆菌酶的更高的稳定性。
带电的氨基酸残基为(a)带正电的赖氨酸、精氨酸、组氨酸(pH＜5)、酪氨酸(pH＞9)和半胱氨酸(pH＞10)以及(b)带负电的天冬氨酸和谷氨酸。
因此，本发明另外一方面涉及构建亲本枯草杆菌酶的变体的方法，其方法包括a)在亲本枯草杆菌酶表面，优选为JP170样或BPN’样枯草杆菌酶表面，鉴定出选自天冬氨酸、谷氨酸、精氨酸、赖氨酸和组氨酸的至少一个氨基酸残基；b)在亲本枯草杆菌酶表面将选自天冬氨酸、谷氨酸、精氨酸、赖氨酸和组氨酸的至少一个氨基酸残基替换为不带电的氨基酸残基；c)任选地循环重复步骤a)和b)；d)任选地，改变b)以外的一个或多个位置的氨基酸残基，改变可以分别为插入、缺失或替代；
e)制备从步骤a)到d)得到的变体；f)测试所述变体的稳定性；并g)任选地循环重复步骤a)到f)；并h)选择与亲本枯草杆菌酶相比具有更高稳定性的变体。
技术人员也会理解，在某些情况下，把不带电的氨基酸残基替换为带电的氨基酸残基也可能是有利的，或另选地，在某些情况下将带电的氨基酸残基替换为带相反电荷的氨基酸残基也可能是有利的。因此，技术人员也可以为了这些目的方便的使用前文提到的方法。在使用前述方法将不带电的氨基酸残基替换为带电的氨基酸残基时，唯一的区别是步骤a)和b)改变如下a)在亲本枯草杆菌酶表面鉴定出至少一个不带电的氨基酸残基；b)在亲本枯草杆菌酶表面将至少一个不带电的氨基酸残基替换为选自天冬氨酸、谷氨酸、精氨酸、赖氨酸和组氨酸的带电的氨基酸残基。
也可以使用前文提到的方法改变枯草杆菌酶表面氨基酸残基的电荷符号。与前述方法相比，唯一的区别仍然是步骤a)和b)，在此情况下，应为a)在亲本枯草杆菌酶表面鉴定出至少一个选自天冬氨酸、谷氨酸、精氨酸、赖氨酸和组氨酸的带电氨基酸残基；b)在亲本枯草杆菌酶表面将至少一个步骤a)中鉴定出的带电氨基酸残基替换为带相反电荷的氨基酸残基。
因此，天冬氨酸可以替换为精氨酸、赖氨酸或组氨酸；谷氨酸可以替换为精氨酸、赖氨酸或组氨酸；精氨酸可以替换为天冬氨酸或谷氨酸；赖氨酸可以替换为天冬氨酸或谷氨酸；组氨酸可以替换为天冬氨酸或谷氨酸。
为检测存在于枯草杆菌酶表面的氨基酸残基，使用DSSP程序(Kabsch和Sander，Biopolymers(1983)，22，2577-2637)测量表面可接近区。所有表面可接近性大于0.0、0.10、0.20、0.30、0.35、0.40、0.45、0.50、0.55或0.60的残基都认为是表面残基。
使用前述方法在JP170表面发现的氨基酸残基为N79、N316、L381、K246、K9、K313和K83。我们认为N79D、N316D和L381D的替换对于引入盐桥的稳定性特别具有意义，而K246R、K9R、K313R和K83R的替换对于高pH下的稳定性特别具有意义。
类似的替换可以在其他JP170样枯草杆菌酶的等效位置引入。
用脯氨酸残基替换可以通过如下手段提高枯草杆菌酶的热稳定性对所述枯草杆菌酶进行二级结构的分析、鉴定二面角Φ(phi)和Ψ(psi)限定于区间[-90°＜Φ＜-40°和-180°＜Ψ＜180°]的残基，优选区间[-90°＜Φ＜-40°和120°＜Ψ＜180°]或[-90°＜Φ＜-40°和-50°＜Ψ＜10°]并排除位于枯草杆菌酶特征性α螺旋或β片层区域的残基。
基于结晶枯草杆菌酶的原子结构计算出氨基酸的二面角Φ(phi)和Ψ(psi)之后，可能选择出具有适于脯氨酸残基替换的二面角phi和psi的位置。脯氨酸残基的脂肪侧链与肽基团的氮原子共价结合。形成的五员环因此对肽主链的N-Cα键的旋转施加了刚性约束，同时阻止了与主链N原子氢键的形成。由于这些结构上的原因，脯氨酸残基通常与α螺旋和β片层二级构象不相容。
如果在鉴定的位置没有脯氨酸，就以脯氨酸残基代替天然存在的氨基酸残基，优选通过在编码所述枯草杆菌酶的基因上应用位点定向诱变。
JP170样枯草杆菌酶组中脯氨酸残基可以有利的引入到位置22、44、110、139、140、166、198、201、203、231、282、356、357和378。因此，优选的JP170变体具有一个或多个以下替换Q22P、E44P、L110P、T139P、D140P、S166P、I198P、V201P、Q203P、S231P、S282P、S356P、T357P和K378P。特别优选含有E44P、Q203P和S356P中一个或多个的变体。
JP170枯草杆菌酶更高的活性如所述，JP170枯草杆菌酶显著区别于BPN’样枯草杆菌酶的是具有明显非催化性的长C-末端。JP170可能的截短是去除包括两个离子结合位点的约115个残基，该截短可通过缺失非催化C-末端的区域311-433或在该区域中缺失得到。优选的缺失包含区域317-433或315-433。优选新的C-末端在区域311-325中。另外，缺失可以通过额外的替换(如L283N、Q；A290S、N和W306H、Y、K中的一个或多个)进行优化。
优选的截短包括a)区域317-433的缺失和替换L283N+A290S+W306H，b)区域315-433的缺失和替换L283N+A290S+W306H，底物结合位点底物结合位点通过与底物模型(如CI2抑制剂)接触的残基鉴定。附录1中提供了CI2结合于活性位点的JP170枯草杆菌酶的3D结构坐标。不限于其他理论，现认为在距底物分子10_范围内发现的有利的相互作用支持了底物与酶的结合。这些有利键的实例为氢键、强静电作用和/或疏水相互作用。
JP170枯草杆菌酶(SEQ ID NO1)的以下残基与同底物结合位点结合的CI2抑制剂距离在10_以内。因此因此相信这些残基涉及所述底物的相互作用29-32，(即残基29、30、31、32)64-72，(即残基64、65、66、67、68、69、70、71、72)93，96-98，(即残基96、97、98)100-110，(即残基100、101、102、103、104、105、106、107、108、109、110)113-114，127-136，(即残基127、128、129、130、131、132、133、134、135、136)138-141，(即残基138、139、140、141)
144，157，174，180-183，(即残基180、181、182、183)191，193-194，202-207，(即残基202、203、204、205、206、207)211，223-226，(即残基223、224、225、226)234-241，(即残基234、235、236、237、238、239、240、241)249-258(即残基249、250、251、252、253、254、255、256、257、258)。
在本发明的实施方案中，变体在一个或多个上述位置含有修饰。优选的变体为W129L。
具有额外离子结合位点的JP170可以通过缺失N79-N82并继而插入LNNSIGV(SEQ ID NO5)，再随之进行A45D、N替换和任选的E44P、T和/或R47Q替换，将来源于BPN’枯草杆菌酶的强离子结合位点移植到JP170(或JP170亚组中的其他枯草杆菌酶)中。
JP170离子结合位点的去除通过去除离子结合位点可能降低酶对介质中钙的依赖性。其他相关枯草杆菌酶的三维结构信息，如BPN’型枯草杆菌酶(如Savinase或BPN’)和TY145型枯草杆菌酶的三维结构信息可以指导去除JP170或其它JP170型枯草杆菌酶的离子结合位点。
离子结合位点1的去除可以通过缺失N186-N199区域并继而插入至少三个氨基酸残基-或另外表述为在186-199位置用含有3-6个氨基酸残基的区域替换含有14个氨基酸残基的区域，优选的替换区域为SSN(SEQ ID NO6)。优选的(但不是必须的)还进行I7Q和V3Y替换中的一个或两个。
可以从野生型JP170枯草杆菌酶或如前述截短的JP170枯草杆菌酶中去除离子结合位点1。
不含离子结合位点的枯草杆菌酶类似地，JP170型枯草杆菌酶和TY145型枯草杆菌酶的三维结构信息可用于去除BPN’型枯草杆菌酶中的强和弱离子结合位点，或者可以基于JP170和BPN’型枯草杆菌酶的结构信息去除TY145中的离子结合位点。
以Savinase为例，可以通过a)在环中插入或缺失大量氨基酸残基或者b)缺失整个环或环的一部分并继而插入来源于JP170或TY145样枯草杆菌酶的相应环的大量氨基酸残基以改变环A194-L196(弱离子结合位点)和L75-L82(强离子结合位点)来去除离子结合位点。Savinase的离子结合位点的去除优选通过i)全部或部分缺失区域A194-L196(BPN’编号)并插入从JP170的位置P209-P217选出的三个或多个残基，且ii)全部或部分缺失区域L75-L82(BPN’编号)并插入从TY145的位置H83-Y92选出的至少一个残基或i)全部或部分缺失区域A194-L196(BPN’编号)并插入从JP170的位置P209-P217选出的三个或更多的残基，且ii)全部或部分缺失区域L75-L82(BPN’编号)并插入从JP170的位置N79-K83选出的至少一个残基。
关键氧化位点的去除为提高JP170型枯草杆菌酶蛋白酶的稳定性，用不发生氧化作用的其他氨基酸残基替换或缺失关键氧化位点(如甲硫氨酸)可能是有利的。
因此，本发明的另一个实施方案涉及RP-II蛋白酶变体，其中缺失或用其他不易氧化的氨基酸残基替换了一个或多个易被氧化的氨基酸，特别是暴露于分子表面的甲硫氨酸残基。不易氧化的氨基酸残基可以选自例如A、E、N、Q、I、L、S和K。
这些特定的变体含有JP170蛋白酶的至少一个以下缺失或替换M42{*、S、A、N、Q、K}；M85{*、S、A、N、Q、K}；M97{*、S、A、N、Q、K}；M153{*、S、A、N、Q、K}；M220{*、S、A、N、Q、K}；M250{*、S、A、N、Q、K}和M255{*、S、A、N、Q、K}；含有SD-521和Ya蛋白酶的至少一个以下缺失或替换M42{*、S、A、N、Q、K}；M85{*、S、A、N、Q、K}；M97{*、S、A、N、Q、K}；M153{*、S、A、N、Q、K}；M250{*、S、A、N、Q、K}和M255{*、S、A、N、Q、K}。
通过修饰天冬酰胺-甘氨酸对的稳定已知在碱性pH下，天冬酰胺的侧链可以与其后续相邻氨基酸的NH基团相互作用形成异天冬氨酸残基，其主链经过天冬氨酸侧链。这使主链对蛋白酶解作用更加脆弱。如果其后的氨基酸为甘氨酸则更容易发生脱酰胺作用。改变甘氨酸或它前面的天冬氨酸可以避免这种情况的发生从而提高稳定性，特别是所关心的热和贮存稳定性。
因此本发明另外还涉及枯草杆菌酶，其中上述修饰是指亲本RP-II蛋白酶氨基酸序列中出现的任一天冬酰胺-甘氨酸序列的二残基之一或二者被全部缺失或被不同的氨基酸残基替换。
例如，天冬酰胺和/或甘氨酸残基可被选自A、Q、S、P、T和Y的氨基酸残基替换。
更具体地，SD-521和Ya蛋白酶中占据位置66-67、134-135和/或375-376，以及JP170蛋白酶的位置66-67、134-135、301-302和/或375-376的天冬酰胺-甘氨酸中天冬酰胺或甘氨酸残基中的任一个可以被缺失或用选自A、Q、S、P、T和Y的残基替换。(位置按照图1所示的JP170蛋白酶表示)。
JP170的特定变体为N66{*、A、Q、S、P、T、Y}；G67{*、A、Q、S、P、T、Y}；N134{*、A、Q、S、P、T、Y}；G135{*、A、Q、S、P、T、Y}；N301{*、A、Q、S、P、T、Y}；G302{*、A、Q、S、P、T、Y}；N375{*、A、Q、S、P、T、Y}和G376{*、A、Q、S、P、T、Y}，以及它们的组合，如N66{*、A、Q、S、P、T、Y}+N134{*、A、Q、S、P、T、Y}、N66{*、A、Q、S、P、T、Y}+N301{*、A、Q、S、P、T、Y}和N66{*、A、Q、S、P、T、Y}+N375{*、A、Q、S、P、T、Y}等。
SD-521和Ya蛋白酶的特定变体为N66{*、A、Q、S、P、T、Y}；G67{*、A、Q、S、P、T、Y}；N134{*、A、Q、S、P、T、Y}；G135{*、A、Q、S、P、T、Y}和N375{*、A、Q、S、P、T、Y}；G376{*、A、Q、S、P、T、Y}；以及如前述它们的组合。
酪氨酸残基的修饰就洗涤性能而言，已经发现将某些酪氨酸残基修饰为苯丙氨酸提供了更好的洗涤性能。不限于任何具体的理论，据认为碱性洗涤液中这些酪氨酸残基的滴定具有负效果，通过用其他残基替换酪氨酸残基可减弱其负效果，特别是用苯丙氨酸或色氨酸，尤其是用苯丙氨酸。
JP170中可被修饰的酪氨酸残基位于20、54、118、137、147、194、225、247、249、334、379、388、411和418。
SD-521和Ya蛋白酶中可被修饰的酪氨酸残基位于17、20、54、137、147、187、243、247、249、299、319、334、361、379、386、388、411和418。
因此对于JP170本发明涉及变体Y17{F、W}、Y20{F、W}、Y54{F、W}、Y137{F、W}、Y147{F、W}、Y187{F、W}、Y243{F、W}、Y247{F、W}、Y249{F、W}、Y299{F、W}、Y319{F、W}、Y334{F、W}、Y361{F、W}、Y379{F、W}、Y386{F、W}、Y388{F、W}、Y411{F、W}和Y418{F、W}。容易鉴定其他JP170型枯草杆菌酶中相应的修饰。
色氨酸残基的修饰为了稳定蛋白质，例如US5,118,623所述，取代或缺失蛋白质表面的色氨酸可能是有利的。色氨酸残基可以有利的替换为F、T、Q或G。因此，本发明另一个实施方案涉及含有一个或多个以下替换的JP170型枯草杆菌酶变体SD-521和Ya蛋白酶的位置118、129、240、306、350和392；以及JP170蛋白酶的位置129、240、306、350和392。
因此，本发明涉及含有一个或多个以下替换的JP170变体W129{F、T、Q、G}、W240{F、T、Q、G}、W306{F、T、Q、G}、W350{F、T、Q、G}和W392{F、T、Q、G}。
组合修饰本发明还包括与其氨基酸序列的任一其他修饰组合的任何前述枯草杆菌酶变体。特别是设想了为提供酶的改进特性而与本领域其他已知修饰组合。
JP170样或BPN’样枯草杆菌酶变体的制备方法本发明枯草杆菌酶变体，即JP170和BPN’变体可通过本领域中任何已知方法产生，本发明还涉及编码本发明枯草杆菌酶变体的核酸、包含所述核酸序列的DNA构建体以及含有所述核酸序列的宿主细胞。
通常天然存在蛋白质可通过培养表达该蛋白质的生物然后纯化蛋白质来生产，也可以通过将编码该蛋白质的核酸(如基因组DNA或cDNA)克隆进表达载体，将所述表达载体引入宿主细胞，培养宿主细胞并纯化表达的蛋白质来生产。
一般可通过亲本蛋白质的位点定向诱变、引入表达载体、宿主细胞等产生蛋白质变体。亲本蛋白质可从产生该多肽的菌株中或从表达文库中克隆，即，可从基因组DNA中分离或从cDNA中制备，或从它们的组合中产生。
通常可以使用标准操作克隆基因和/或将(随机和/或位点定向)突变引入所述基因以获得亲本枯草杆菌酶，或获得本发明枯草杆菌酶或枯草杆菌酶变体。适用技术的进一步描述可参考《Molecular cloningAlaboratory manual》(Sambrook等，(1989)，Cold Spring Harbor lab，Cold Spring Harbor，NY；Ausubel，E.M.等)；《Current protocols inMolecular Biology》(John Wiley和Sons，1995；Harwood，C.R.和Cutting，S.M.)；《Molecular Biological Methods for Bacillus》(JohnWiley和Sons，1990)；《DNA CloningA Practical Approach》卷I和II(D.N.Glover编，1985)；《Oligonucleotide Synthesis》(M.J.Gait编，1984)；《Nucleic Acid Hybridization》(B.D.Hames & S.J.Higgins编，(1985))；《Transcription And Translation》(B.D.Hames & S.J.Higgins编，(1984))《Animal Cell Culture》(R.I.Freshney编，(1986))；《Immobilized Cells And Enzymes》(IRL Press，(1986))；《A PracticalGuide To Molecular Cloning》(B.Perbal，(1984))和WO 96/34946。
另外，变体构建可通过随机诱变随机诱变适合在翻译成所探讨氨基酸序列的基因中至少3个部分或在整个基因中进行，随机诱变既可以是局部也可以是区域专一的。
使用寡核苷酸进行诱变时，在寡核苷酸合成中寡核苷酸可在需要改变的位置搀杂或混入三种非亲本核苷酸。可以通过该搀杂或混入避免不需要的氨基酸的密码子。可通过任何公开的技术将搀杂或混入的寡核苷酸整合入编码枯草杆菌酶的DNA中，例如使用PCR、LCR或认为合适的任何DNA聚合酶和连接酶。
优选使用“恒量随机掺杂(constant random doping)”进行搀杂，其中每一位置野生型和修饰的百分比是预先确定的。另外，可以指导掺杂，以优选引入某核苷酸并从而优选引入一个或多个特定氨基酸残基。可以为了例如在每一位置引入90％野生型和10％修饰而进行搀杂。选择搀杂方案另外需要的考虑是基于遗传的及蛋白质结构的限制。搀杂方案可以使用DOPE程序制作，它特别保证了避免引入终止密码子(L.J.Jensen等，Nucleic Acid Research，26，697-702(1998)。
使用PCR产生的诱变时，经化学处理或未经化学处理的编码亲本枯草杆菌酶的基因在可增加核苷酸错误掺入条件下进行PCR(Deshler1992；Leung等，Technique，1，1989，pp.11-15)。
用于诱变的DNA序列可以便利地存在于从表达亲本枯草杆菌酶的生物中制备的基因组或cDNA文库。另外，DNA序列可以存在于合适的载体(如质粒或噬菌体)中，并可这样与诱变剂孵育或暴露于诱变剂。用于诱变的DNA也可以通过整合入宿主细胞的基因组或存在于停靠在宿主细胞内的载体上而存在于宿主细胞中。最后，用于诱变的DNA可以为分离的形式。应该理解用于随机诱变的DNA序列优选为cDNA或基因组DNA序列。
在某些情况下可以方便地在实施表达步骤b)或筛选步骤c)之前扩增突变DNA序列。可以按照本领域已知方法进行这类扩增，目前优选的方法为使用基于亲本酶DNA或氨基酸序列制备的寡核苷酸引物的PCR产生的扩增。
突变DNA序列另外还可以含有编码允许突变DNA序列表达的功能的DNA序列。
局部随机诱变将随机诱变限制在目的亲本枯草杆菌酶中的一部分可能是有利的。例如当已鉴定出酶的某一区域对酶的给定特性具有特别的重要性，并期望修饰后导致变体具有改进特性时，它可能是有利的。这些区域通常可在亲本酶的三级结构已被阐明并与酶的功能相联系后鉴定出来。
局部或区域特异性的随机诱变可以使用如前述PCR产生的诱变技术或任何其他本领域的已知技术方便的实现。另外，可分离编码欲修饰的DNA序列部分的DNA序列(例如通过插入适当的载体)，并继而将所述部分通过使用任一前文讨论的诱变方法实施诱变。
使用DOPE程序随机诱变的一般方法可以通过以下步骤进行随机诱变1.选择亲本酶中用于修饰的目的区域；2.确定选定区域中的突变和非突变位点；3.根据要构建的变体需要的稳定性和/或性能决定进行哪种突变；4.选择结构上合理的突变；5.根据步骤4调整步骤3中选出的残基；6.使用适当的掺入算法(dope algorithm)分析核苷酸分布；7.如果必要的话，根据遗传密码的实际情况调整需要的残基，例如考虑由遗传密码产生的限制(例如为避免引入终止密码子)；技术人员应意识到某些密码子组合实际上不能使用而需要调整；8.制备引物；9.使用引物进行随机诱变；10.通过筛选需要的改进特性选择得到的枯草杆菌酶变体。
步骤6中使用的适当的掺入算法为本领域所熟知。Tomandl，D等在1997，Journal of Computer-Aided Molecular Design 1129-38中描述了一个这样的算法，另一个算法是DOPE(Jensen，LJ、Andersen，KV、Svendsen，A和Kretzschmar，T(1998)Nucleic Acids Research26697-702)。
表达载体含有编码本发明枯草杆菌酶变体的核酸序列的重组表达载体可以是任何便于进行重组DNA操作并引起该核酸序列表达的载体。
载体的选择通常取决于它将被引入的宿主细胞。适宜载体的实例包括线性或闭合的环状质粒或病毒。载体可以是自主复制载体，即载体作为染色体外的实体存在，其复制不依赖于染色体复制，例如质粒、染色体外元件、微染色体或人工染色体。载体可以含有保证自我复制的任何手段。细菌复制起点的实例为质粒pBR322、pUC19、pACYC177、pACYC184、pUB110、pE194、pTA1060和pAMβ1的复制起点。酵母宿主细胞中使用的复制起点的实例为2μ复制起点、CEN6和ARS6的组合、以及CEN3和ARS1的组合。复制起点可以包含使其在宿主细胞中以温度敏感的方式行使功能的突变(参见如Ehrlich，1978，Proceedings of the National Academy of Sciences USA 751433)。
或者，载体可以在引入宿主细胞后整合入基因组，并与其整合的染色体一起复制。整合入宿主细胞基因组的载体可以包含任何使其能整合入基因组的核酸序列，特别是可以包含便于通过同源或非同源重组整合的核酸序列。载体系统可以是单个载体(例如质粒或病毒)，或者是一起包含需引入宿主基因组的全部DNA的两个或多个载体(例如质粒或病毒)，或转座子。
具体而言，载体可以是表达载体，其中编码本发明枯草杆菌酶变体的DNA序列与DNA转录需要的附加片段或控制序列有效连接。术语“有效连接”表示以使片段以与预期目的一致的方式发挥功能的排列，例如转录在启动子处起始并通过编码枯草杆菌酶变体的DNA序列延伸。附加的片段或控制序列包括启动子、前导序列、多腺苷酸化序列、前肽序列、信号序列和转录终止子。控制序列最少包括启动子和转录及翻译终止信号。
启动子可以是在选择的宿主细胞中表现转录活性的任何DNA序列，它可来自编码与宿主细胞同源或异源的蛋白质的基因。
适宜在细菌宿主细胞中使用的启动子的实例为以下基因的启动子枯草芽孢杆菌果聚糖蔗糖酶基因(sacB)、嗜热脂肪芽孢杆菌麦芽糖淀粉酶基因(amyM)、地衣芽孢杆菌α-淀粉酶基因(amyL)、解淀粉芽孢杆菌α-淀粉酶基因(amyQ)、枯草芽孢杆菌碱性蛋白酶基因，或短小芽孢杆菌木糖苷酶基因、解淀粉芽孢杆菌BAN淀粉酶基因、地衣芽孢杆菌青霉素酶基因(penP)、枯草芽孢杆菌xylA和xylB基因，以及原核β-内酰胺酶基因(Villa-Kamaroff等，1978，Proceedings of the NationalAcademy of Sciences USA 753727-3731)。其他实例包括λ噬菌体PR或PL启动子或大肠杆菌lac、trp或tac启动子或天蓝色链霉菌(Streptomyces coelicolor)琼脂糖基因(dagA)。其他启动子描述于“Useful proteins from recombinant bacteria”，Scientific American，1980，24274-94及Sambrook等，1989，见前文。
适宜在丝状真菌宿主细胞中使用的启动子实例为从以下基因中得到的启动子米曲霉(Aspergillus oryzae)TAKA淀粉酶、米赫根毛霉(Rhizomucor miehei)天冬氨酸蛋白酶、黑曲霉(Aspergillus niger)中性α淀粉酶、黑曲霉酸稳定α淀粉酶、黑曲霉或泡盛曲霉(Aspergillusawamori)葡糖淀粉酶(glaA)、米赫根毛霉脂肪酶、米曲霉(Aspergillusoryzae)碱性蛋白酶、米曲霉丙糖磷酸异构酶、构巢曲霉(Aspergillusnidulans)乙酰胺酶和尖孢镰孢(Fusarium oxysporum)胰蛋白酶样蛋白酶(如此处引为参考的U.S.Patent No.4,288,627中所述)，及这些启动子的杂合体。在丝状真菌宿主细胞中使用的特别优选的启动子为TAKA淀粉酶、NA2-tpi(来自编码黑曲霉中性α-淀粉酶和米曲霉丙糖磷酸异构酶的基因的启动子的杂合体)和glaA启动子。另外的适宜在丝状霉菌宿主细胞中使用的启动子为ADH3(McKnight等，The EMBO J.4(1985)，2093-2099)启动子或tpiA启动子。
适宜在酵母宿主细胞中使用的启动子实例包括以下基因的启动子酵母糖酵解基因(Hitzeman等，J.Biol.Chem.255(1980)，12073-12080；Alber and Kawasaki，J.Mol.Appl.Gen.1(1982)，419-434)或醇脱氢酶基因(Young等，in Genetic Engineering of Microorganismsfor Chemicals(Hollaender等编)，Plenum Press，New York，1982)，或TP11(US 4,599,311)或ADH2-4c(Russell等，Nature 304(1983)，652-654)启动子。
其他有用的启动子可得自酿酒酵母烯醇化酶(ENO-1)基因、酿酒酵母半乳糖激酶基因(GAL1)、酿酒酵母醇脱氢酶/甘油醛-3-磷酸脱氢酶(ADH2/GAP)和酿酒酵母3-磷酸甘油酸激酶基因。用于酵母宿主细胞的其它有用的启动子如Romanos等，1992，Yeast 8423-488所述。在哺乳动物宿主细胞中，有用的启动子包括得自猿猴病毒40(SV40)、劳氏肉瘤病毒(RSV)、腺病毒和牛乳头状瘤病毒(BPV)的启动子。
适宜在哺乳动物细胞中使用的启动子实例为SV40启动子(Subramani等，Mol.Cell Biol.1(1981)，854-864)，MT-1(金属硫蛋白基因)启动子(Palmiter等，Science 222(1983)，809-814)或腺病毒2主要晚期启动子。
适宜在昆虫细胞中使用的启动子实例为多角体蛋白启动子(US4,745,051；Vasuvedan等，FEBS Lett.311，(1992)7-11)、P10启动子(J.M.Vlak等，J.Gen.Virology 69，988，765-776页)、苜蓿银纹夜蛾多角体病毒碱性蛋白启动子(EP 397485)、杆状病毒立即早期基因1启动子(US5,155,037；US5,162,222)或杆状病毒39K延迟早期基因启动子(US5,155,037；US5,162,222)。
必要时，编码本发明枯草杆菌酶变体的DNA序列也可以与适当的终止子有效连接。
本发明重组载体另外还可以含有使载体在目的宿主细胞中复制的DNA序列。
载体还可以含有选择标记，例如，其产物互补了宿主细胞中缺陷的基因，或者编码抗性的基因，如抗氨卡青霉素、卡那霉素、氯霉素、红霉素、四环素、壮观霉素、新霉素、潮霉素、氨甲蝶呤等抗生素的抗性基因，或者抗重金属、病毒或除草剂的抗性基因，或其产物造成原养型或营养缺陷型的基因。细菌选择标记的实例是来自枯草杆菌或地衣芽孢杆菌的dal抗性基因。常常使用的哺乳动物标记是二氢叶酸还原酶基因(DHFR)。适用于酵母宿主细胞的标记是ADE2、HIS3、LEU2、LYS2、MET3、TRP1和URA3。用于丝状真菌宿主细胞的选择性标记可选自(但不限于)以下基因amdS(乙酰胺酶)、argB(鸟氨酸氨甲酰基转移酶)、bar(膦丝菌素乙酰转移酶)、hygB(潮霉素磷酸转移酶)、niaD(硝酸还原酶)、pyrG(乳清酸核苷-5’-磷酸脱羧酶)、sC(硫酸腺苷酰转移酶)、trpC(氨基苯甲酸合酶)和glufosinate抗性标记，以及来自其它物种的等价物。具体而言，用于曲霉细胞中的是构巢曲霉或米曲霉的amdS和pyrG标记以及吸水链霉菌(Streptomyces hygroscopicus)的bar标记。此外，可以通过共转化完成选择，如WO91/17243所述，其中选择性标记在分开的载体上。
为了指导本发明枯草杆菌酶变体进入宿主细胞的分泌途径，可在重组载体中提供分泌信号序列(也称为前导序列、前原序列或前序列)。分泌信号序列在正确的阅读框中与编码所述酶的DNA序列连接。分泌信号序列通常置于编码该酶的DNA序列的5’端。分泌信号序列可以是正常与该酶关联的序列，或者可以来自编码另一分泌蛋白质的基因。
用于分别连接编码本发明酶的DNA序列、启动子以及任选的终止子和/或分泌信号序列，或者通过适当的PCR扩增方案装配这些序列并将它们插入含复制或整合所必需信息的合适载体的技术都是本领域技术人员所熟知的(例如，见Sambrook等)。
可以将一个以上拷贝的编码本发明酶的核酸序列插入宿主细胞中以扩大核酸序列的表达。用本领域所熟知的方法将至少一个额外拷贝的序列整合入宿主细胞中并对转化体进行选择可以实现核酸序列的稳定扩增。
本发明的核酸构建体还可包含编码一种或多种有利于多肽表达的因子的一个或多个核酸序列，例如，激活子(如反式作用因子)、陪伴分子和加工蛋白酶。在所选宿主细胞内起作用的任何因子都可用于本发明中。编码一个或多个这样因子的核酸不一定与编码本发明多肽的核酸串联。
宿主细胞编码本发明枯草杆菌酶变体的DNA序列对于其所引入的宿主细胞可以是同源或异源的。如果与宿主细胞同源，即，由宿主细胞天然产生，它通常有效连接于非其天然环境中的另一启动子序列，或者，如果适当的话，另一分泌信号序列和/或终止序列。术语“同源的”旨在包括所编码酶对于所述宿主生物体是天然酶的DNA序列。术语“异源的”旨在包括不是由宿主细胞天然表达的DNA序列。从而，DNA序列可以来自另一生物，或者可以是合成的序列。
本发明的DNA构建体或重组载体所引入的宿主细胞可以是能生产本发明枯草杆菌酶变体的任何细胞，诸如原核生物(如细菌等)或真核生物，如酵母或丝状真菌等真菌细胞、昆虫细胞、植物细胞或哺乳动物细胞。
培养时能产生本发明枯草杆菌酶变体的细菌宿主细胞的实例为革兰氏阳性菌，如芽孢杆菌，如枯草杆菌、地衣芽孢杆菌、迟缓芽孢杆菌(B.lentus)、短芽孢杆菌(B.brevis)、嗜热脂肪芽胞杆菌、嗜碱芽孢杆菌(B.alkalophilus)、解淀粉芽孢杆菌、凝结芽胞杆菌(B.coagulans)、环状芽胞杆菌(B.cirulans)、灿烂芽孢杆菌(B.lautus)、巨大芽孢杆菌(B.megaterium)或苏云金芽孢杆菌(B.thuringiensis)等菌株，或变铅青链霉菌(S.lividans)或鼠灰链霉菌(S.murinus)等链霉菌(streptomyces)菌株，或者是大肠杆菌(E.cdi)或假单胞菌(Pseudomonas sp.)等革兰氏阴性细菌。
可通过原生质体转化、电穿孔、接合或通过用感受态细胞以本质已知的方式完成细菌的转化(参见，Sambrook等，见上文)。
当枯草杆菌酶变体在大肠杆菌等细菌内表达时，所说的酶可以保留在细胞质内，通常作为不溶性颗粒(称作包涵体)，或者可以在细菌分泌序列的引导下进入周质间隙。在前一种情况下，裂解细胞，回收颗粒并进行变性，然后通过稀释变性剂使酶重折叠。在后一种情况下，可以通过用超声波或渗压休克法等方法破坏细胞，释放周质间隙内容物并回收所述酶，从而从周质间隙中回收到所述酶。
当在芽孢杆菌或链霉菌菌株等革兰氏阳性菌中表达枯草杆菌酶变体时，所说的酶可以保留在细胞质中，或者可以在细菌分泌序列的指引下到达细胞外培养基。在后一种情况下，按下文所述从培养基中回所述酶。
宿主酵母细胞的例子包括假丝酵母属(candida)、克鲁维酵母属(kluyveromyces)、酵母属(saccharomyces)、裂殖酵母属(schizosaccharomyces)、假丝酵母(candida)、毕赤氏酵母(Pichia)、汉逊酵母(Hansenula)或Yarrowia属种的细胞。在一个具体的实施方案中，酵母宿主细胞是卡尔酵母(S.carlsbergensis)、酿酒酵母(S.cerevisiae)、糖化酵母(S.diastaticus)、saccharomyces douglasii、克鲁弗酵母(S.kluyveri)、诺地酵母(saccharomyces norbensis)或卵形酵母(S.oviformis)细胞。其它有用的酵母宿主细胞是乳酸克鲁维酵母(kluyveromyces lactis)、脆壁克鲁维酵母(Kluyveromyces fragilis)、多形汉逊酵母(Hansenula polymorpha)、巴斯德毕赤酵母(Pichiapastoris)、Yarrowia lipolytica、粟酒裂殖酵母(Schizosaccharomycespombe)、玉蜀黍黑粉菌(Ustilgo maylis)、Candida maltose、季尔蒙氏毕赤酵母(Pichia guillermondii)和Pichia methanolio细胞(参阅，Gleeson等，J.Gen.Microbiol.132，1986，3459-3465页；US4882279和US4879231)。因为酵母的分类在未来有可能会改变，就本发明的目的而言，应按如下文献所述定义酵母《Biology and Activities of Yeast》(Skinner，F.A.，Passmore，S.M.，和Davenport，R.R.编，Soc.App.Bacteriol.Symposium Series No.9，1980)。酵母的生物学和酵母遗传操作是本领域所熟知的(参阅，如，《Biochemistry and Geneticsof Yeast，Bacil》，M.，Horecker，B.J.，和Stopani，A.O.M.编，第二版，1987；《The Yeasts》，Rose，A.H.，和Harrison，J.S.编，第二版，1987；和《The Molecular Biology of the Yeast Saccharomyces》，Strathem等编，1981)。可以用以下文献所述的方法转化酵母Becker和Guarente，In Abelson，J.N.和Simon，M.I.编，Guide to Yeast Genetics andMolecular Biology，Methods in Enzymology，第194卷，第182-187页，Academic Press Inc.，New York；Ito等，1983，Journal of Bacteriology153163；和Hinnen等，1978，Proceeding of the National Academy ofSciences USA 751920。
丝状真菌细胞的实例包括丝状形式的真菌亚门(Eumycota)和卵菌亚门(Oomycota)(按如下定义Hawksworth等，1995，同上引文)，尤其是它可以是以下菌属的细胞枝顶孢属(Acremonium)，如A.chrysogenum等；曲霉属(Aspergillus)，如泡盛曲霉(A.awamori)、臭曲霉(A.foetidus)、日本曲霉(A.japonicus)、黑曲霉(A.niger)、构巢曲霉(A.nidulans)或米曲霉(A.oryzae)；镰孢霉(Fusarium)，如杆孢状镰孢(F.bactridioides)、F.cerealis、F.crookwellense、大刀镰孢(F.culmorum)、禾本科镰孢(E.graminerarum)、禾赤镰孢(F.graminum)、异孢镰孢(F.heterosporum)、合欢木镰孢(F.negundi)、多枝镰孢(F.reticulatum)、粉红镰孢(F.roseum)、接骨木镰孢(F.sambucinum)、肤色镰孢(F.sarcochroum)、硫色镰孢(F.sulphureum)、F.trichothecioides或尖镰孢(F.oxysporum)；腐质霉属(Humicola)，如H.insolens或H.lanuginose；毛霉属(Mucor)，如米黑毛霉(M.miehei)；毁丝霉属(Myceliophthora)，如M.thermophilum；脉孢霉属(Neurospora)，如粗糙脉孢霉(N.crassa)；青霉属(Penicillium)，如产紫青霉(P.purpurogenum)；梭孢壳属(Thielavia)，如T.terrestris；Tolypocladium；或木霉属(Trichoderma)，如T.harzianum、康宁木霉(T.koningii)、T.longibrachiatum、T.reesei或绿色木霉(T.viride)，或者其有性型或同物异名。利用曲霉属菌种表达蛋白质可参见如文献EP272277、EP230023所述。
昆虫细胞的实例包括鳞翅目(Lepidoptera)细胞系，如秋粘虫(spodoptera frugiperda)细胞或粉纹夜蛾(Trichoplusiani)细胞(参阅US5,077,214)。培养条件可适宜地如WO89/01029或WO89/01028所述。可按如下文献所述进行昆虫细胞的转化和异源多肽的生产US4745051；US 4775624；US4879236；US 5155037；US 5162222；EP397485。
哺乳动物细胞的实例包括中国仓鼠卵巢(CHO)细胞、HeLa细胞、幼仓鼠肾(BHK)细胞、COS细胞或可获得自如美国典型培养物保藏中心等机构的其它永生化细胞系。转染哺乳动物细胞并表达引入该细胞的DNA序列的方法参阅以下文献Kaufman和Sharp，J.Mol.Biol.159(1982)，601-621；Southern和Berg，J.Mol.Appl.Genet.1(1982)，327-341；Loyter等，Proc.Natl.Acad.Sci.USA 79(1982)，422-426；Wigler等，Cell 14(1978)，725；Corsaro和Pearson，Somatic CellGenetics 7(1981)，603；Ausubel等，Current Protocols in MolecularBiology，John Wiley and Sons，Inc.，New York，1987，Hawley-Nelson等，Focus 15(1993)，73；Ciccarone等，Focus 15(1993)，80；Graham和van der Eb，Virology 52(1973)，456；和Neumann等，EMBO J.1(1982)，841-845。可以用Graham和Van der Eb的磷酸钙沉淀法(1978，Virology 52546)通过直接摄取转染哺乳动物细胞。
表达和分离蛋白质的方法为了表达本发明的酶，通常在允许所需分子产生的条件下将用含有编码本发明酶的核酸序列的载体所转化或转染的上述宿主细胞培养于适当的营养培养基中，然后从细胞或培养液中回收这些分子。
用于培养宿主细胞的培养基可以是适于宿主细胞生长的任何常规培养基，如含适当补充物的基本或复杂培养基。适当的培养基可获自供应商或可以按已公布的配方制备(如，参阅美国典型培养物保藏中心的目录)。培养基也可以用本领域已知的方法制备(参阅，如，有关细菌和酵母的文献；Bennett，J.W.和LaSure，L.编辑，《More GeneManipulations in Fungi》，Academic Press，CA，1991)。
如果本发明的酶分泌至营养培养基中，它们可以直接从培养基中回收。如果它们不被分泌，则可以从细胞裂解物中回收。本发明的酶可以用常规方法回收自培养基，包括通过离心或过滤从培养基中分离宿主细胞，用硫酸铵等盐沉淀上清液或滤液中的蛋白质性组分，用各种层析方法进行纯化，如，离子交换层析法、凝胶过滤层析法、亲和层析等等，具体方法取决于目的酶。
本发明的酶可以用本领域已知对这些蛋白质特异的方法进行检测。这些检测方法包括特异抗体的使用、产物的形成或底物的消失。例如，酶测定法可以用于测定分子的活性。用于测定各种活性的方法为本领域所公知。
本发明的酶可以用本领域已知的多种方法进行纯化，包括(但不限于)层析法(如离子交换、亲和、疏水、层析聚焦和大小排阻)、电泳方法(如制备型等电聚焦(IEF))、差异溶解性(如硫酸铵沉淀)或提取(参阅如，《Protein Purification》，J-C Janson和Lars Ryden编，VCH Publishers，New York，1989)。
当含有编码本发明酶的DNA序列的表达载体被转化/转染入异源宿主细胞后，可以实现该酶的异源重组生产。使用异源宿主细胞的优点是，可以产生高度纯化的酶组合物，其特征是不含有同源杂质(当蛋白质或肽表达于同源宿主细胞中时常常存在这些同源杂质)。在本文中，同源杂质指来源于本发明酶最初来自的同源细胞的任何杂质(如，除了本发明酶之外的其它多肽)。
洗涤剂应用本发明的酶可以添加到洗涤剂组合物中并成为其组分。
例如，本发明的洗涤剂组合物可以制成用于手洗或机洗的洗涤剂组合物，包括适用于预处理污染织物的洗涤添加剂组合物和漂洗添加的纤维软化剂组合物，或制成用于清洁普通家具硬表面的洗涤剂组合物，或被制成用于手洗或机器洗盘操作，特别是用于自动洗盘机(ADW)。
在具体的方面，本发明提供包含本发明的枯草杆菌酶的洗涤添加剂。所述的洗涤添加剂和洗涤剂组合物可以包含一种或多种其它的酶如蛋白酶、脂肪酶、角质酶、淀粉酶、糖酶、纤维素酶、果胶酶、甘露聚糖酶、阿拉伯糖酶、半乳糖酶、木聚糖酶、氧化酶(例如漆酶和/或过氧化物酶)。
一般来说，所选择的酶的特性应当与所选择的洗涤剂相容(即最适pH、与其它酶或非酶成分具相容性等)，且所述的酶应以有效剂量存在。
蛋白酶合适的蛋白酶包括动物、植物、微生物来源的蛋白酶。优选来源于微生物的蛋白酶。也包括经化学修饰或蛋白质改造的突变体。所述的蛋白酶可以是丝氨酸蛋白酶或金属蛋白酶，优选碱性微生物蛋白酶或胰蛋白酶样蛋白酶。碱性蛋白酶的实例为枯草菌素，特别是来自芽孢杆菌的枯草菌素，例如，枯草菌素Novo、枯草菌素Carlsberg、枯草菌素309、枯草菌素147和枯草菌素168(描述于WO 89/06279)。胰蛋白酶样蛋白酶的实例为胰蛋白酶(例如来自猪或牛的)和如WO89/06270和WO 94/25583中所述的镰孢霉属的蛋白酶。
有用的蛋白酶的实例是如WO 92/19729、WO 98/20115、WO98/20116和WO 98/34946所描述的变体，特别是在一个或多个以下位置发生替换的变体27、36、57、76、87、97、101、104、120、123、167、170、194、206、218、222、224、235和274。
优选的市售的蛋白酶包括AlcalaseTM、SavinaseTM、PrimaseTM、DuralaseTM、EsperaseTM、OvozymeTM和KannaseTM(Novozymes A/S)、MaxataseTM、MaxacalTM、MaxapemTM、ProperaseTM、PurafectTM、PurafectOxPTM、FN2TMFN3TM和FN4TM(Genencor International Inc.)。
脂肪酶合适的脂肪酶包括那些来源于细菌或真菌的脂肪酶。也包括经化学修饰或蛋白质改造的突变体。有用的脂肪酶的实例包括如EP258 068和EP 305 216中所公开的来自腐质霉(Humicola)属(与Thermomyces同物异名)，例如来自如EP258068和EP305216中所述的H.lanuginosa(T.lanuginosus)的脂肪酶或如WO 96/13580中所公开的来自H.Insolens的脂肪酶，假单胞菌脂肪酶，例如来自产碱假单胞菌(P.Alcaligenes)或类产碱假单胞菌(P.Pseudoalcaligenes)(EP 218272)，洋葱假单胞菌(P.Cepacia)(EP 331 376)，施氏假单胞菌(P.stutzeri)(GB 1,372,034)，荧光假单胞菌(P.Fluorescens)，假单胞菌菌株SD 705(WO 95/06720和WO 96/27002)，P.wisconsinensis(WO96/12012)的脂肪酶；芽孢杆菌脂肪酶，例如来自枯草芽孢杆菌(Dartois等(1993)，Biochemica et Biophysica Acta，1131，253-360)，嗜热脂肪芽孢杆菌(JP 64/744992)或短小芽孢杆菌(WO 91/16422)。
其它的实例为如WO 92/05249、WO 94/01541、EP 407225、EP 260105、WO 95/35381、WO 96/00292、WO 95/30744、WO 94/25578、WO95/14783、WO 95/22615、WO 97/04079和WO 97/07202中所公开的脂肪酶变体。
优选的市售的脂肪酶包括LipolaseTM和Lipolase UltraTM(Novozymes A/S)。
淀粉酶合适的淀粉酶(α和/或β)包括那些来源于细菌或真菌的淀粉酶。也包括经化学修饰或蛋白质改造的突变体。淀粉酶包括例如来源于芽孢杆菌的α-淀粉酶，例如来自地衣芽孢杆菌的特定菌株，详细描述参见GB 1,296,839。
有用的淀粉酶的实例是如WO 94/02597、WO 94/18314、WO96/23873和WO 97/43424中所描述的变体，尤其是那些在一个或多个下列位置发生替换的变体15、23、105、106、124、128、133、154、156、181、188、190、197、202、208、209、243、264、304、305、391、408和444。
市售的淀粉酶是DuramylTM、TermamylTM，FungamylTM和BANTM(Novozymes A/S)，RapidaseTM和PurastarTM(来自GenencorInternational Inc.)。
纤维素酶合适的纤维素酶包括来源于细菌或真菌的纤维素酶。也包括经化学修饰或蛋白质改造的突变体。合适的纤维素酶包括来自芽孢杆菌属、假单胞菌属、腐质霉属、镰孢霉属、草根霉属(Thielavia)、枝项孢霉属(Acremonium)的纤维素酶，例如在US 4,435,307、US5,648,263、US 5,691,178、US 5,776,757和WO 89/09259中公开的Humicola insolens、嗜热毁丝霉(Myceliophthora thermophila)和尖孢镰孢(Fusarium oxysporum)产生的真菌纤维素酶。
特别合适的纤维素酶是具有颜色保护优点的碱性或中性纤维素酶。这样的纤维素酶的实例为如EP 0 495 257、EP 0 531 372、WO 96/11262、WO 96/29397、WO 98/08940中所公开的纤维素酶。其它的实例为如那些在WO 94/07998、EP 0 531 315、US 5,457,046、US 5,686,593、US5,763,254、WO 95/24471、WO 98/12307和PCT/DK98/00299中所公开的纤维素酶变体。
市售的纤维素酶包括CelluzymeTM和CarezymeTM(NovozymesA/S)，ClazinaseTM和Puradax HATM(Genencor International Inc.)和KAC-500(B)TM(Kao Corporation)。
过氧化物酶/氧化酶合适的过氧化物酶/氧化酶包括那些来源于植物、细菌或真菌的过氧化物酶/氧化酶。也包括化学修饰或蛋白质改造的突变体。有用的过氧化物酶的实例包括如WO 93/24618、WO 95/10602和WO 98/15257中所述的来自鬼伞属(Coprinus)(例如来自灰盖鬼伞(C.cinereus))的过氧化物酶及其变体。
市售的过氧化物酶包括GuardzymeTM(Novozymes A/S)。
可以通过添加含一种或多种酶的独立添加剂，或通过添加含所有这些酶的组合添加剂而使洗涤剂酶包含于洗涤剂组合物中。本发明的洗涤剂添加剂(即独立添加剂或组合添加剂)可以制成例如颗粒状、液体、浆状等等。优选的洗涤剂添加剂形式为颗粒状(特别是无粉尘颗粒)、液体(特别是稳定的液体)或浆。
无粉尘颗粒可依照例如US 4,106,991和4,661,452所述进行生产并可任选地用本领域已知的方法加包衣。蜡状包衣材料的实例是平均分子量为1000到20000的聚(环氧乙烷)产物(聚乙二醇，PEG)、含有16到50个环氧乙烷单位的乙氧基化的壬基酚、乙氧基脂肪醇(其中醇含12到20个碳原子且其中存在15到80个环氧乙烷单位)脂肪醇；脂肪酸；和脂肪酸的单、二和三甘油酯。GB 1483591中给出了适合于通过流化床技术应用的成膜包衣材料的实例。液体酶制剂可以依照现成的方法通过例如添加多元醇如丙二醇、糖或糖醇、乳酸或硼酸得以稳定。受保护的酶可依照EP 238,216中所公开的方法进行制备。
本发明的洗涤剂组合物可以是任何便利的形式，例如棒状、片状、粉末、颗粒、粘团或液体。液体洗涤剂可以是含水的，一般含高达70％的水和0-30％的有机溶剂，或不含水的。
所述的洗涤剂组合物包含一种或多种表面活性剂，它们可以是非离子(包括半极性的)和/或阴离子和/或阳离子和/或两性离子表面活性剂。所述的表面活性剂一般占到0.1％到60％的重量水平。
当包含在所述洗涤剂中时，通常包含约1％到约40％的阴离子表面活性剂，如直链烷基苯磺酸盐、α-烯属磺酸盐、硫酸烷基酯(硫酸脂肪醇酯)、乙氧基硫酸醇酯、仲链烷磺酸酯、α-磺基脂肪酸甲酯、烷基-或链烯基琥珀酸或肥皂。
当包含在所述洗涤剂中时，通常含有约0.2％到约40％的非离子表面活性剂，例如乙氧基化醇、乙氧基化壬基酚、烷基多苷、烷基二甲基胺氧化物、乙氧基化脂肪酸单乙醇酰胺、脂肪酸单乙醇酰胺、多羟基烷基脂肪酸酰胺或葡糖胺的N-酰基N-烷基衍生物(“葡糖酰胺”)。
所述的洗涤剂可以包含0-65％的洗涤剂增洁剂或络合剂，例如沸石、二磷酸盐、三磷酸盐、磷酸盐、碳酸盐、柠檬酸盐、次氮基三乙酸、乙二胺四乙酸、二亚乙基三胺五乙酸、烷基-或链烯基琥珀酸、可溶性硅酸盐或层状硅酸盐(例如购自Hoechst的SKS-6)。
所述的洗涤剂还可以包含一种或多种聚合物。实例为羧甲基纤维素、聚(乙烯吡咯烷酮)、聚(乙二醇)、聚(乙烯醇)、聚(乙烯基吡啶-N-氧化物)、聚(乙烯基咪唑)、聚羧酸如聚丙烯酸、马来酸/丙烯酸共聚物和甲基丙烯酸月桂醇酯/丙烯酸共聚物。
所述的洗涤剂还可以含有可以包含H2O2来源的漂白体系，如可以与四乙酰基乙二胺或壬酰氧基苯磺酸盐之类的形成过酸的漂白活化剂结合的过硼酸盐或过碳酸盐。另外，所述的漂白体系可以包含例如酰胺、二酰亚胺或砜类的过氧酸。
本发明的洗涤剂组合物中的酶可以通过诸如以下的常规稳定剂稳定多元醇(如丙二醇或丙三醇)、糖或糖醇、乳酸、硼酸或硼酸衍生物(如芳香硼酸酯或苯基硼酸衍生物，如4-甲酰基苯基硼酸)，且所述的组合物也可以按如WO 92/19709和WO 92/19708中所述配制。
所述的洗涤剂还可以包含其它的常规洗涤剂成分，例如织物调理剂，包括黏土、增泡剂、泡沫抑制剂、抗腐蚀剂、尘粒悬浮剂、抗尘粒再沉淀剂、染料、杀菌剂、荧光增白剂、助溶剂、失泽抑制剂(tarnishinhibitor)或香料。
目前认为在所述洗涤剂组合物中任何酶，特别是本发明的酶可以以相当于每升洗涤液中具有0.01-100mg酶蛋白质，优选每升洗涤液0.05-5mg酶蛋白质，特别优选每升洗涤液中具有0.1-1mg酶蛋白质的量加入。
此外，本发明的酶可以添加到WO 97/07202所公开的洗涤剂制剂中，该文献引入本文作为参考。
材料和方法织物标准织物片得自瑞士EMPA St.Gallen，Lerchfeldstrasse 5，CH-9014 St.Gallen。尤其是类型EMPA116(具有血液、乳液和墨水污渍的棉织物)和EMPA117(具有血液、乳液和墨水污渍的聚酯/棉织物)。其他标准织物片得自德国wfk-Cleaning Technology ResearchInstitute，Christenfeld 10，D-41379 Brüggen-Brancht。特别是类型wfk10N(具有卵/颜料污渍的棉织物)、wfk10eggEG(具有卵黄污渍的棉织物)。Wfk10N的变性在高压灭菌器中进行。
产生枯草杆菌酶变体的方法本发明提供了产生符合本发明的分离酶的方法，其中在允许酶产生的条件下培养转化了编码该酶DNA序列的合适的宿主细胞，并从培养物中回收产生的酶。
当将含有编码酶的DNA序列的表达载体转化入异源宿主细胞中时，即可使本发明的酶异源重组产生。由此可以产生以不含同源杂质为特征的高度纯化的枯草杆菌酶组合物。
用于培养转化的宿主细胞的培养基可以是任何适合于目的宿主细胞生长的常规培养基。所表达的枯草杆菌酶可便利地分泌到培养基中并可以通过已知的方法回收，所述方法包括通过离心或过滤从培养基中分离细胞，再利用盐(如硫酸铵)沉淀培养基中的蛋白质组分，随后进行层析，如离子交换层析、亲和层析等。
实施例1BPN’样枯草杆菌酶中离子结合位点的去除已经选择将下文提到的JP170和TY145中的区域从JP170和TY145转移到Savinse中。通过使用本文所述的制备枯草杆菌酶变体的分子方法缺失了Savinase区域(BPN’编号)并插入了JP170和TY145区域代替。由于Savinase区域与离子结合位点接触，该修饰的目的在于从Savinase中去除离子结合位点。
Savinase 区域A194-L196JP170区域P209-P217和Savinase 区域L75-L82TY145区域H83-Y92，或者修饰可以为Savinase 区域A194-L196JP170区域P209-P217和Savinase 区域L75-L82JP170区域N79-K83，酶变体的构建和表达位点定向诱变通过DNA片段的传统克隆(Sambrook等，《Molecular CloningALaboratory Manual》，第二版，Cold Spring Harbor，1989)产生含有特定插入/缺失/替换的本发明JP170枯草杆菌酶位点定向变体，所述DNA片段通过使用含有所需要突变的寡核苷酸的PCR产生。
模板质粒DNA可以是pSX222，或含有枯草菌素JP170变体的此类似物。通过构建变体的寡核苷酸定向诱变引入突变。
枯草菌素JP170变体转化进大肠杆菌中。从这些转化体的过夜培养物中纯化的DNA通过限制性核酸内切酶消化、纯化DNA片段、连接、转化枯草芽胞杆菌转化到枯草芽孢杆菌中。如Dubnau等1971，J.Mol.Biol.56，209-221页所述进行枯草芽孢杆菌的转化。
在特定区域中引入突变的位点定向诱变用于进行位点定向诱变的总体策略是合成对应于突变位点侧翼DNA序列的诱变引物(寡核苷酸)，通过限定插入/缺失/替换的DNA碱基对分开。
随后，使用得到的诱变引物与修饰的质粒pSX222用于PCR反应。纯化得到的PCR片段，并在第二次PCR中延伸，纯化所得的PCR产物并在第三次PCR反应中延伸，然后用内切酶消化并克隆进大肠杆菌-枯草芽孢杆菌穿梭载体pSX222。PCR反应在通常条件下进行。通过熟知的技术将质粒DNA转化入大肠杆菌，并对一个大肠杆菌菌落测序以证实所设计的突变。
为纯化本发明的枯草杆菌酶变体，如前述将包含本发明变体的pSX222表达质粒转化进感受态枯草芽孢杆菌菌株并发酵。
实施例2纯化及酶浓度的评估发酵后使用疏水电荷感应层析(HCIC)和接下来使用真空过滤来纯化枯草菌素变体。为了捕获酶，HCIC使用的纤维素基质结合有4-巯基-乙基-吡啶(4-MEP)。
将大小为80-100μm的纤维素基质珠与含酵母提取物的培养基和可分泌枯草菌素变体的经转化的枯草芽孢杆菌混合，并在Unifilter_微孔板中于pH 9.5孵育。
由于4-MEP在pH＞7时疏水，且枯草菌素变体在pH 9.5时疏水，所以所分泌的酶和在珠上的4-MEP之间存在疏水相互作用。孵育后，通过真空过滤除去培养基和细胞碎片，而珠子和酶位于滤器上。
为了将酶自珠子上洗脱，通过用洗脱缓冲液(pH 5)洗涤滤器而降低pH。由此将酶与珠子分离，并可从缓冲液中回收。
经纯化的枯草菌素变体的浓度通过活性部位滴定(AST)评估。
将经纯化酶与不同浓度的高亲和力抑制剂CI-2A孵育，以抑制不同量的活性位点。所述蛋白酶与抑制剂以1∶1的比例相互结合，因此酶浓度可直接与抑制剂浓度相关，在抑制剂浓度下，所有的蛋白酶是失活的。为了测定残余蛋白酶活性，在与抑制剂孵育后加入底物(Tris/HCl缓冲液中的0.6mM Suc-Ala-Ala-Pro-Phe-pNA)，接下来的4分钟降解产物pNA(对硝基酚)的显色使用酶标仪于405nm定时测定。
如上描述构建下列各变体H243K、S238K、L233T、L233S、L233D、Y247R、H200D、H200A、H200G、E185D、S193Q、S193Y、N390D、G394N、G394F、W240H、G355A、G355S、N316D、N79D、K246R、K83R、H200D+D196N、H243E。
实施例3自动机械应力测定(AMSA)AMSA测定方法描述为评估选出的JP170枯草杆菌酶变体在洗涤剂组合物中的洗涤性能，实施洗涤实验。使用自动机械应力测定(AMSA)测试本申请的枯草杆菌酶。使用AMSA测定可检查大量的小体积酶洗涤剂溶液的洗涤性能。所述AMSA板具有许多装受试溶液的槽和将织物样本紧紧挤压以使之在槽穴中洗涤的盖子。在洗涤期间，将板、受试溶液、织物和盖子剧烈摇动，以使受试溶液与织物接触并以规律的周期振荡的方式施加机械应力。进一步的描述参阅WO 02/42740，特别是23-24页“特定方法的实施方案”段落。
实验在以下指定的实验条件下进行

通过向测试系统中添加CaCl2、MgCl2和NaHCO3(Ca2+∶Mg2+＝4∶1)将水硬度调节到9°dH。洗涤后织物片用自来水冲洗并于空气中干燥。
以用特定蛋白酶洗涤的织物样本颜色的亮度来测定酶变体的洗涤性能。亮度可表示为当用白色光照射时自织物样本反射的光强度。当织物有污渍时，反射光的强度较干净的织物低。因此可用反射光的强度测定酶变体的洗涤性能。
颜色测量用专门的平台扫描仪(PFU DL2400pro，从J.M.Thomsen，Dorfgade 2，Dorf，Dronninglund，DK-9330获得)进行，该仪器用于捕捉经洗涤织物样本的图像。使用分辨率200dpi和24位输出色深(color dept)进行扫描。为了获得准确的结果，常用Kodak reflective IT8 target校正扫描仪。
为了从扫描图像获得光强度的值，使用了专门设计的应用软件(Novozymes Color Vector Analyzer)。该程序自图像获取24位象素值，并将它们转化为红、绿和兰的值(RGB)。通过将RGB值作为向量相加而得到向量长度来计算强度值(Int)
Int=r2+g2+b2]]>洗涤剂可通过在市场中购买完全配方市售洗涤剂并随后进行热处理(85℃的水溶液中5分钟)使酶组分失活而得到用于本发明枯草杆菌酶洗涤性能测试的洗涤剂。此外，可以直接从制造商购买不含酶的市售洗涤剂基础。另外可以购买合适的模式洗涤剂并用于洗涤性能测试。
也可以在含有如下成分的模式洗涤剂组合物中测试蛋白酶三磷酸钠 23.0％二水合柠檬酸钠 22.3％一水合过硼酸钠 6.0％四乙酰乙二胺 2.0％硅酸钠(非结晶的) 5.0％线性脂肪醇乙氧基化物 2.0％(非离子表面活性剂，低泡)马来酸/丙稀酸共聚物4.0％(钠盐、碳酸钠50％活性)无水碳酸钠 添加至100％使用上文的测试方法结合市售洗涤剂得到下文所示结果。如所呈现的，本发明的枯草杆菌酶与SEQ ID NO1的野生型JP170枯草杆菌酶相比，对于卵污渍表现出更好的洗涤性能。


附录1
REMARKJP170和CI2A抑制剂复合物REMARK不对称单位枯草菌素的含量2x(433a.a.x2)REMARKCI2A抑制剂2x(a.a.16-83和21-83)REMARK小肽(自身消化产物，a.a.KPSLL，280-284)REMARK钙离子6x，水1115xREMARKREMARK结晶条件(AMB)悬滴蒸汽扩散REMARK15-20mg.ml-1的2μl组成的滴的方法REMARK蛋白质浓度，10nM二甲砷酸钠-盐酸缓冲液，pH 6.5REMARK和1μl孔溶液20％w/v PEG 4000，0.1M HepesREMARK缓冲液，pH 7.5，10％v/v异丙醇HEADER----COMPND----REMARK3优化REMARK3程序REFMAC 5.1.24REMARK3作者MURSHUDOV、VAGIN、DODSONREMARK3REMARK3优化目标最大相似度REMARK3REMARK3优化中使用的数据REMARK3分辨率范围高(埃)1.90REMARK3分辨率范围低(埃)19.96REMARK3数据截断(SIGMA(F))无REMARK3范围完整性(％76.65REMARK3反射数59444REMARK3REMARK3优化使用数据的FITREMARK3交叉验证方法无REMARK3自由R值测试集选择无REMARK3R值(工作+测试集)0.12256REMARK3R值(工作集)0.12256REMARK3自由R值无REMARK3自由R值测试集尺寸(％)无REMARK3自由R值测试集数无REMARK3REMARK3最高分辨率面元中的FITREMARK3使用的面元总数20REMARK3面元分辨率范围高1.901REMARK3面元分辨率范围低1.950REMARK3面元反射(工作集)940REMARK3面元R值(工作集)0.149REMARK3面元自由R值集合数0REMARK3面元自由R值-999.000REMARK3REMARK3优化中使用的非氢原子数.
REMARK3全部原子8694REMARK3REMARK3B值.
REMARK3从WILSON曲线(A**2)无REMARK3平均B值(总体，A**2)16.479REMARK3总体各向异性B值.
REMARK3B11(A**2)0.05REMARK3B22(A**2)0.06
REMARK3B33(A**2)-0.11REMARK3B12(A**2)0.00REMARK3B13(A**2)0.00REMARK3B23(A**2)0.00REMARK3REMARK3估计总体坐标误差.
REMARK3基于R值的ESU(A)0.151REMARK3基于自由R值的ESU(A)无REMARK3基于最大相似性的ESU (A)0.052REMARK3基于最大相似性的B值ESU (A**2)1.828REMARK3REMARK3相关系数.
REMARK3相关系数FO-FC0.969REMARK3相关系数FO-FC释放无REMARK3REMARK3RMS与理想值的偏差 计数 RMS权重REMARK3优化原子的键长 (A)7733；0.014；0.021REMARK3其他键长 (A)6857；0.001；0.020REMARK3优化原子的键角 (度)10540；1.487；1.936REMARK3其他键角 (度)15972；0.815；3.000REMARK3扭转角，周期1 (度)997；15.784；5.000REMARK3手性中心抑制 (A**3)1197；0.106；0.200REMARK3优化原子一般平面 (A)8819；0.007；0.020REMARK3其他一般平面 (A)1500；0.008；0.020REMARK3优化原子的非键接触 (A)1552；0.221；0.300REMARK3其他非键接触 (A)8282；0.265；0.300REMARK3其他非键扭转 (A)4417；0.089；0.500REMARK3优化原子的氢键(X...Y) (A)1391；0.198；0.500REMARK3优化原子的潜在金属离子 (A)25；0.145；0.500REMARK3优化原子的对称性VDW(A)10；0.129；0.300REMARK3其他对称性VDW (A)57；0.268；0.300REMARK3优化原子氢键对称性 (A)87；0.272；0.500REMARK3REMARK3各向同性热因子限制 计数 RMS权重REMARK3优化原子主链键 (A**2)4985；0.697；1.500REMARK3优化原子主链角 (A**2)8031；1.205；2.000REMARK3优化原子侧链键 (A**2)2746；1.963；3.000REMARK3优化原子侧链角 (A**2)2509；3.180；4.500REMARK3REMARK3NCS限制统计REMARK3NCS组的数目无REMARK3REMARK3REMARK3TLS细节REMARK3TLS组的数目无REMARK3REMARK3REMARK3大量溶剂构型REMARK3使用方法有掩码的BABINET模型REMARK3计算掩码的参数REMARK3VDW探针半径1.40REMARK3离子探针半径0.80REMARK3收缩半径0.80
REMARK3REMARK3 其他优化注意事项REMARK3 氢加入到骑乘位置中REMARK3REMARK3 OTHER REFINEMENT REMARKSREMARK3 HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONSREMARK3CISPEP1 GLY A 163PRO A 164 0.00CISPEP2 ALA A 171PRO A 172 0.00CISPEP3 PHE A 191GLY A 192 0.00CISPEP4 ASN A 199HIS A 200 0.00CISPEP5 GLY A 208PRO A 209 0.00CISPEP6 LYS A 216PRO A 217 0.00CISPEP7 ASP A 236SER A 237 0.00CISPEP8 ASP A 244SER A 245 0.00CISPEP9 PHE A 299PRO A 300 0.00CISPEP10 SER A 327THR A 328 0.00CISPEP11 ALA A 386PRO A 387 0.00CISPEP12 GLU A 414VAL A 415 0.00CISPEP13 GLY A 423PRO A 424 0.00LINK ASN B 316 LYS B 318gapLINK GLU B 330 ALA B 332gapLINK LEU B 337 LYS B 340gapLINK GLU D 330 ALA D 332gapLINK LEU D 337 LYS D 340gapCISPEP14 GLY C 163PRO C 164 0.00CISPEP15 ALA C 171PRO C 172 0.00CISPEP16 PHE C 191GLY C 192 0.00CISPEP17 ASN C 199HIS C 200 0.00CISPEP18 GLY C 208PRO C 209 0.00CISPEP19 LYS C 216PRO C 217 0.00CISPEP20 ASP C 236SER C 237 0.00CISPEP21 ASP C 244SER C 245 0.00CISPEP22 PHE C 299PRO C 300 0.00CISPEP23 SER C 327THR C 328 0.00CISPEP24 ALA C 386PRO C 387 0.00CISPEP25 GLU C 414VAL C 415 0.00CISPEP26 GLY C 423PRO C 424 0.00CRYST158.387 151.411 64.054 90.00 117.11 90.00 P 1 21 1SCALE10.017127 0.000000 0.008768 0.00000SCALE20.000000 0.006605 0.000000 0.00000SCALE30.000000 0.000000 0.017539 0.00000HETATM1 NASN A 118.06620.808 -3.996 1.00 14.87 ANHETATM2 C9 ASN A 118.46122.053 -3.689 1.00 14.47 ACHETATM3 O10 ASN A 119.16822.251 -2.661 1.00 13.33 AOHETATM4 O11 ASN A 118.10823.029 -4.423 1.00 14.69 AOHETATM5 CA ASN A 118.49919.635 -3.189 1.00 14.35 ACHETATM6 CB ASN A 118.16418.329 -3.883 1.00 14.69 ACHETATM7 CG ASN A 116.67018.063 -4.031 1.00 14.08 ACHETATM8 ND2 ASN A 116.27117.100 -5.019 1.00 12.20 ANHETATM9 OD1 ASN A 115.76818.701 -3.206 1.00 14.76 AOHETATM10 CASN A 119.99019.659 -2.890 1.00 14.84 ACHETATM11 OASN A 120.35319.313 -1.601 1.00 14.20 AOATOM 12 NASP A 220.88119.935 -3.834 1.00 15.84 ANATOM 13 CA ASP A 222.30619.835 -3.520 1.00 16.82 ACATOM 14 CB ASP A 223.17820.088 -4.763 1.00 17.53 ACATOM 15 CG ASP A 223.12118.947 -5.783 1.00 18.18 ACATOM 16 OD1 ASP A 222.65217.811 -5.493 1.00 20.58 AO
ATOM17 OD2 ASP A 223.544 19.106 -6.931 1.00 22.02AOATOM18 CASP A 222.712 20.816 -2.413 1.00 17.23ACATOM19 OASP A 223.671 20.562 -1.703 1.00 18.17AOATOM20 NVAL A 322.018 21.952 -2.304 1.00 17.05ANATOM21 CA VAL A 322.374 22.945 -1.311 1.00 16.07ACATOM22 CB VAL A 321.974 24.356 -1.701 1.00 16.60ACATOM23 CG1 VAL A 322.327 25.323 -0.560 1.00 16.25ACATOM24 CG2 VAL A 322.676 24.770 -3.003 1.00 18.81ACATOM25 CVAL A 321.749 22.565 0.033 1.00 15.65ACATOM26 OVAL A 322.431 22.603 1.090 1.00 14.41AOATOM27 NALA A 420.497 22.119 -0.012 1.00 13.75ANATOM28 CA ALA A 419.824 21.664 1.196 1.00 14.03ACATOM29 CB ALA A 418.388 21.260 0.881 1.00 13.78ACATOM30 CALA A 420.544 20.512 1.876 1.00 14.28ACATOM31 OALA A 420.548 20.406 3.110 1.00 14.07AOATOM32 NARG A 521.093 19.617 1.064 1.00 13.74ANATOM33 CA ARG A 521.807 18.445 1.553 1.00 14.95ACATOM34 CB ARG A 522.395 17.709 0.349 1.00 15.61ACATOM35 CG ARG A 523.452 16.639 0.631 1.00 17.28ACATOM36 CD ARG A 523.873 15.945 -0.672 1.00 20.73ACATOM37 NE ARG A 524.802 14.852 -0.459 1.00 21.95ANATOM38 CZ ARG A 526.128 14.986 -0.513 1.00 24.69ACATOM39 NH1 ARG A 526.687 16.173 -0.793 1.00 25.62ANATOM40 NH2 ARG A 526.898 13.933 -0.290 1.00 22.96ANATOM41 CARG A 522.918 18.840 2.515 1.00 14.83ACATOM42 OARG A 523.135 18.195 3.546 1.00 14.86AOATOM43 NGLY A 623.641 19.897 2.166 1.00 15.33ANATOM44 CA GLY A 624.677 20.416 3.044 1.00 15.34ACATOM45 CGLY A 624.094 21.124 4.257 1.00 15.01ACATOM46 OGLY A 624.609 20.980 5.362 1.00 14.62AOATOM47 NILE A 723.018 21.879 4.062 1.00 14.44ANATOM48 CA ILE A 722.411 22.613 5.168 1.00 13.98ACATOM49 CB ILE A 721.266 23.505 4.698 1.00 13.68ACATOM50 CG1 ILE A 721.813 24.676 3.864 1.00 13.35ACATOM51 CD1 ILE A 720.794 25.294 2.972 1.00 14.08ACATOM52 CG2 ILE A 720.511 24.072 5.873 1.00 12.51ACATOM53 CILE A 721.970 21.664 6.305 1.00 15.04ACATOM54 OILE A 722.273 21.906 7.469 1.00 13.35AOATOM55 NVAL A 821.320 20.558 5.952 1.00 15.03ANATOM56 CA VAL A 820.795 19.628 6.969 1.00 14.89ACATOM57 CB VAL A 819.419 19.047 6.545 1.00 14.63ACATOM58 CG1 VAL A 818.472 20.135 6.246 1.00 14.63ACATOM59 CG2 VAL A 819.526 18.151 5.333 1.00 15.54ACATOM60 CVAL A 821.770 18.511 7.356 1.00 14.75ACATOM61 OVAL A 821.438 17.645 8.168 1.00 15.23AOATOM62 NLYS A 922.983 18.568 6.804 1.00 14.02ANATOM63 CA LYS A 924.061 17.627 7.118 1.00 14.55ACATOM64 CB LYS A 924.374 17.560 8.621 1.00 15.28ACATOM65 CG LYS A 924.553 18.888 9.299 1.00 18.34ACATOM66 CD LYS A 925.757 19.608 8.810 1.00 23.66ACATOM67 CE LYS A 926.025 20.904 9.618 1.00 28.33ACATOM68 NZ LYS A 927.283 21.559 9.079 1.00 31.91ANATOM69 CLYS A 923.798 16.226 6.616 1.00 13.77ACATOM70 OLYS A 924.391 15.256 7.132 1.00 13.96AOATOM71 NALA A 1022.979 16.109 5.569 1.00 13.98ANATOM72 CA ALA A 1022.816 14.830 4.886 1.00 14.34ACATOM73 CB ALA A 1021.649 14.866 3.848 1.00 14.47ACATOM74 CALA A 1024.141 14.437 4.205 1.00 14.55ACATOM75 OALA A 1024.409 13.264 4.015 1.00 13.73AO
ATOM76 N ASP A 1124.96715.423 3.860 1.00 16.04ANATOM77 CA ASP A 1126.27815.153 3.265 1.00 17.11ACATOM78 CB ASP A 1126.89916.419 2.667 1.00 17.53ACATOM79 CG ASP A 1127.05917.547 3.680 1.00 19.89ACATOM80 OD1 ASP A 1127.84518.461 3.375 1.00 23.81AOATOM81 OD2 ASP A 1126.43417.635 4.773 1.00 20.19AOATOM82 C ASP A 1127.21914.489 4.285 1.00 17.57ACATOM83 O ASP A 1127.94113.540 3.947 1.00 17.08AOATOM84 N VAL A 1227.15314.945 5.528 1.00 17.31ANATOM85 CA VAL A 1227.92614.338 6.607 1.00 17.86ACATOM86 CB VAL A 1227.85015.193 7.893 1.00 18.12ACATOM87 CG1 VAL A 1228.57714.533 9.081 1.00 18.00ACATOM88 CG2 VAL A 1228.38516.633 7.631 1.00 19.36ACATOM89 C VAL A 1227.42812.898 6.835 1.00 18.14ACATOM90 O VAL A 1228.23311.956 6.925 1.00 18.38AOATOM91 N ALA A 1326.11712.696 6.870 1.00 17.13ANATOM92 CA ALA A 1325.57211.353 7.076 1.00 17.08ACATOM93 CB ALA A 1324.07011.400 7.101 1.00 17.00ACATOM94 C ALA A 1326.04410.394 5.981 1.00 17.57ACATOM95 O ALA A 1326.4729.2376.254 1.00 16.79AOATOM96 N GLN A 1425.93410.862 4.740 1.00 17.24ANATOM97 CA GLN A 1426.42010.107 3.582 1.00 17.55ACATOM98 CB GLN A 1425.97210.825 2.309 1.00 17.74ACATOM99 CG GLN A 1424.48510.673 2.031 1.00 17.61ACATOM100 CD GLN A 1423.99511.535 0.887 1.00 20.02ACATOM101 OE1 GLN A 1424.78811.949 0.028 1.00 19.60AOATOM102 NE2 GLN A 1422.67911.789 0.850 1.00 19.07ANATOM103 C GLN A 1427.9499.8763.576 1.00 18.95ACATOM104 O GLN A 1428.4138.7293.489 1.00 18.61AOATOM105 N ASN A 1528.73010.950 3.658 1.00 19.73ANATOM106 CA ASN A 1530.18510.847 3.469 1.00 20.71ACATOM107 CB ASN A 1530.82812.222 3.244 1.00 20.45ACATOM108 CG ASN A 1530.40412.869 1.959 1.00 22.21ACATOM109 OD1 ASN A 1530.09812.201 0.976 1.00 25.39AOATOM110 ND2 ASN A 1530.39014.182 1.953 1.00 23.97ANATOM111 C ASN A 1530.86510.185 4.653 1.00 20.49ACATOM112 O ASN A 1531.7059.3624.469 1.00 21.06AOATOM113 N ASN A 1630.49510.559 5.869 1.00 21.00ANATOM114 CA ASN A 1631.14810.056 7.073 1.00 21.90ACATOM115 CB ASN A 1631.20511.146 8.136 1.00 22.29ACATOM116 CG ASN A 1632.10012.313 7.751 1.00 26.21ACATOM117 OD1 ASN A 1632.26113.260 8.533 1.00 32.71AOATOM118 ND2 ASN A 1632.67212.268 6.567 1.00 28.57ANATOM119 C ASN A 1630.4918.8117.692 1.00 21.95ACATOM120 O ASN A 1631.1528.0658.404 1.00 22.21AOATOM121 N PHE A 1729.2038.5787.438 1.00 20.66ANATOM122 CA PHE A 1728.5507.3928.003 1.00 20.24ACATOM123 CB PHE A 1727.4157.8158.938 1.00 21.09ACATOM124 CG PHE A 1727.8908.59110.134 1.00 19.81ACATOM125 CD1 PHE A 1728.1107.95311.348 1.00 24.93ACATOM126 CE1 PHE A 1728.5568.67912.459 1.00 25.33ACATOM127 CZ PHE A 1728.77910.016 12.344 1.00 23.90ACATOM128 CE2 PHE A 1728.56410.651 11.155 1.00 22.65ACATOM129 CD2 PHE A 1728.1119.93610.052 1.00 20.02ACATOM130 C PHE A 1728.0616.3856.977 1.00 19.13ACATOM131 O PHE A 1727.6075.3367.337 1.00 20.18AOATOM132 N GLY A 1828.2056.6855.692 1.00 17.84ANATOM133 CA GLY A 1827.7405.7904.640 1.00 17.25ACATOM134 C GLY A 1826.2205.6544.496 1.00 16.27AC
ATOM135 O GLY A 1825.7554.6673.948 1.00 14.47AOATOM136 N LEU A 1925.4536.6514.955 1.00 15.24ANATOM137 CA LEU A 1923.9806.5505.007 1.00 14.35ACATOM138 CB LEU A 1923.4567.2226.270 1.00 14.71ACATOM139 CG LEU A 1924.0136.6807.569 1.00 15.58ACATOM140 CD1 LEU A 1923.6917.6338.721 1.00 16.09ACATOM141 CD2 LEU A 1923.4175.2947.793 1.00 15.86ACATOM142 C LEU A 1923.3057.2033.820 1.00 13.82ACATOM143 O LEU A 1923.1838.4273.775 1.00 13.96AOATOM144 N TYR A 2022.8746.4002.854 1.00 13.81ANATOM145 CA TYR A 2022.1566.9171.714 1.00 14.22ACATOM146 CB TYR A 2022.8416.4990.386 1.00 14.36ACATOM147 CG TYR A 2024.2547.0340.241 1.00 14.09ACATOM148 CD1 TYR A 2025.3516.3530.792 1.00 16.48ACATOM149 CE1 TYR A 2026.6616.8580.663 1.00 16.91ACATOM150 CZ TYR A 2026.8598.041-0.034 1.00 18.57ACATOM151 OH TYR A 2028.1268.567-0.171 1.00 21.21AOATOM152 CE2 TYR A 2025.7888.735-0.575 1.00 17.45ACATOM153 CD2 TYR A 2024.4958.217-0.461 1.00 16.03ACATOM154 C TYR A 2020.7156.4331.702 1.00 14.55ACATOM155 O TYR A 2019.9946.6880.723 1.00 14.48AOATOM156 N GLY A 2120.2975.7102.746 1.00 14.18ANATOM157 CA GLY A 2118.9475.1722.802 1.00 14.23ACATOM158 C GLY A 2118.7493.7752.207 1.00 14.56ACATOM159 O GLY A 2117.6113.3152.054 1.00 13.53AOATOM160 N GLN A 2219.8383.0841.883 1.00 14.57ANATOM161 CA GLN A 2219.7221.7261.334 1.00 14.82ACATOM162 CB GLN A 2221.0951.1300.978 1.00 15.45ACATOM163 CG GLN A 2221.054-0.151 0.150 1.00 17.91ACATOM164 CD GLN A 2220.669-1.376 0.976 1.00 21.79ACATOM165 OE1 GLN A 2220.892-1.414 2.185 1.00 22.42AOATOM166 NE2 GLN A 2220.091-2.379 0.317 1.00 23.11ANATOM167 C GLN A 2219.0110.8312.331 1.00 14.04ACATOM168 O GLN A 2219.3410.8243.516 1.00 14.39AOATOM169 N GLY A 2318.0190.1101.836 1.00 14.26ANATOM170 CA GLY A 2317.236-0.859 2.628 1.00 14.81ACATOM171 C GLY A 2315.957-0.245 3.176 1.00 14.12ACATOM172 O GLY A 2315.086-0.948 3.718 1.00 14.17AOATOM173 N GLN A 2415.8361.0773.057 1.00 13.54ANATOM174 CA GLN A 2414.6201.7733.500 1.00 13.27ACATOM175 CB GLN A 2414.9633.0904.182 1.00 12.64ACATOM176 CG GLN A 2415.8062.9455.450 1.00 13.46ACATOM177 CD GLN A 2415.1502.1006.505 1.00 15.72ACATOM178 OE1 GLN A 2414.0152.3876.921 1.00 14.73AOATOM179 NE2 GLN A 2415.8391.0266.927 1.00 13.89ANATOM180 C GLN A 2413.6192.0222.352 1.00 13.19ACATOM181 O GLN A 2414.0052.1261.184 1.00 13.48AOATOM182 N ILE A 2512.3242.0662.692 1.00 13.28ANATOM183 CA ILE A 2511.2802.3191.720 1.00 13.25ACATOM184 CB ILE A 2510.4041.0771.507 1.00 13.64ACATOM185 CG1 ILE A 2511.267-0.108 1.030 1.00 15.44ACATOM186 CD1 ILE A 2510.508-1.518 0.962 1.00 14.73ACATOM187 CG2 ILE A 259.303 1.3870.503 1.00 13.37ACATOM188 C ILE A 2510.4473.4912.209 1.00 13.24ACATOM189 O ILE A 259.884 3.4303.285 1.00 12.93AOATOM190 N VAL A 2610.4384.5731.432 1.00 12.43ANATOM191 CA VAL A 269.656 5.7541.737 1.00 12.49ACATOM192 CB VAL A 2610.4807.0341.585 1.00 12.90ACATOM193 CG1 VAL A 269.671 8.2312.059 1.00 11.57AC
ATOM194 CG2 VAL A 2611.796 6.9282.3951.00 15.53ACATOM195 C VAL A 268.4655.8230.8041.00 12.34ACATOM196 O VAL A 268.6015.646-0.418 1.00 11.99AOATOM197 N ALA A 277.2976.0441.3871.00 12.40ANATOM198 CA ALA A 276.0806.2890.6241.00 12.49ACATOM199 CB ALA A 274.8465.6501.2841.00 11.39ACATOM200 C ALA A 275.8927.7900.5461.00 12.17ACATOM201 O ALA A 276.0778.5011.5261.00 11.39AOATOM202 N VAL A 285.5408.243-0.643 1.00 11.79ANATOM203 CA VAL A 285.1689.612-0.910 1.00 11.63ACATOM204 CB VAL A 286.05410.176 -2.003 1.00 11.56ACATOM205 CG1 VAL A 285.62911.625 -2.440 1.00 12.77ACATOM206 CG2 VAL A 287.51410.079 -1.594 1.00 11.95ACATOM207 C VAL A 283.7299.580-1.458 1.00 11.23ACATOM208 O VAL A 283.4708.936-2.459 1.00 10.72AOATOM209 N ALA A 292.81710.294 -0.831 1.00 10.64ANATOM210 CA ALA A 291.46810.435 -1.365 1.00 11.32ACATOM211 CB ALA A 290.44110.151 -0.298 1.00 11.33ACATOM212 C ALA A 291.32611.842 -1.909 1.00 11.35ACATOM213 O ALA A 291.40412.826 -1.161 1.00 11.19AOATOM214 N ASP A 301.18611.937 -3.229 1.00 11.71ANATOM215 CA ASP A 301.26613.221 -3.917 1.00 11.52ACATOM216 CB ASP A 302.71813.715 -3.958 1.00 11.37ACATOM217 CG ASP A 302.80215.221 -3.852 1.00 12.40ACATOM218 OD1 ASP A 303.38515.726 -2.871 1.00 12.15AOATOM219 OD2 ASP A 302.22615.973 -4.682 1.00 14.39AOATOM220 C ASP A 300.66513.113 -5.327 1.00 12.41ACATOM221 O ASP A 300.06812.086 -5.671 1.00 12.89AOATOM222 N THR A 310.81114.162 -6.151 1.00 12.52ANATOM223 CA THR A 31-0.004 14.263 -7.353 1.00 11.62ACATOM224 CB THR A 310.30215.554 -8.182 1.00 11.72ACATOM225 OG1 THR A 311.70915.702 -8.423 1.00 11.44AOATOM226 CG2 THR A 31-0.099 16.789 -7.424 1.00 11.85ACATOM227 C THR A 310.12613.041 -8.225 1.00 12.59ACATOM228 O THR A 31-0.868 12.341 -8.494 1.00 12.63AOATOM229 N GLY A 321.36012.810 -8.665 1.00 12.03ANATOM230 CA GLY A 321.69411.788 -9.617 1.00 12.81ACATOM231 C GLY A 323.20211.763 -9.729 1.00 13.22ACATOM232 O GLY A 323.88512.607 -9.135 1.00 12.83AOATOM233 N LEU A 333.71110.813 -10.501 1.00 13.41ANATOM234 CA LEU A 335.13910.622 -10.678 1.00 13.86ACATOM235 CB LEU A 335.6259.397-9.899 1.00 13.74ACATOM236 CG LEU A 337.1489.234-9.900 1.00 14.12ACATOM237 CD1 LEU A 337.76810.273 -8.964 1.00 13.99ACATOM238 CD2 LEU A 337.4977.818-9.437 1.00 15.42ACATOM239 C LEU A 335.51710.505 -12.151 1.00 13.89ACATOM240 O LEU A 335.3749.444-12.765 1.00 14.14AOATOM241 N ASP A 346.00911.612 -12.696 1.00 14.55ANATOM242 CA ASP A 346.45511.701 -14.087 1.00 14.62ACATOM243 CB ASP A 347.89911.201 -14.224 1.00 14.72ACATOM244 CG ASP A 348.51611.532 -15.598 1.00 15.30ACATOM245 OD1 ASP A 349.26010.694 -16.148 1.00 14.31AOATOM246 OD2 ASP A 348.26812.602 -16.207 1.00 17.33AOATOM247 C ASP A 345.47011.016 -15.060 1.00 14.94ACATOM248 O ASP A 344.29711.415 -15.124 1.00 15.39AOATOM249 N THR A 355.92710.013 -15.816 1.00 16.25ANATOM250 CA THR A 355.0839.340-16.813 1.00 16.50ACATOM251 CB THR A 355.9128.471-17.786 1.00 17.03ACATOM252 OG1 THR A 356.7007.514-17.051 1.00 17.34AO
ATOM253 CG2 THR A 356.9229.300 -18.593 1.00 17.53ACATOM254 CTHR A 354.0058.437 -16.229 1.00 17.26ACATOM255 OTHR A 353.1117.992 -16.946 1.00 15.49AOATOM256 NGLY A 364.1048.104 -14.948 1.00 16.59ANATOM257 CA GLY A 363.0947.259 -14.360 1.00 16.76ACATOM258 CGLY A 363.3085.802 -14.660 1.00 17.58ACATOM259 OGLY A 362.4324.984 -14.383 1.00 17.55AOATOM260 NARG A 374.4735.465 -15.200 1.00 18.31ANATOM261 CA APG A 374.7484.091 -15.575 1.00 19.42ACATOM262 CB ARG A 374.7633.940 -17.088 1.00 20.37ACATOM263 CG ARG A 373.4364.298 -17.742 1.00 23.71ACATOM264 CD ARG A 373.2833.740 -19.140 1.00 31.29ACATOM265 NE ARG A 374.3244.233 -20.024 1.00 34.29ANATOM266 CZ ARG A 374.3225.434 -20.575 1.00 38.63ACATOM267 NH1 APG A 375.3315.792 -21.361 1.00 39.90ANATOM268 NH2 ARG A 373.3056.273 -20.362 1.00 40.23ANATOM269 CAPG A 376.0723.661 -14.998 1.00 19.41ACATOM270 OAPG A 377.0654.354 -15.150 1.00 18.12AOATOM271 NASN A 386.0672.506 -14.334 1.00 19.47ANATOM272 CA ASN A 387.2541.998 -13.703 1.00 20.37ACATOM273 CB ASN A 386.9171.215 -12.431 1.00 20.71ACATOM274 CG ASN A 388.1610.841 -11.658 1.00 21.12ACATOM275 OD1 ASN A 389.2481.337 -11.968 1.00 18.41AOATOM276 ND2 ASN A 388.023-0.072 -10.684 1.00 20.60ANATOM277 CASN A 387.9841.134 -14.700 1.00 21.21ACATOM278 OASN A 387.918-0.099 -14.638 1.00 21.03AOATOM279 NASP A 398.6591.806 -15.625 1.00 21.69ANATOM280 CA ASP A 399.3631.158 -16.718 1.00 23.22ACATOM281 CB ASP A 398.4050.839 -17.882 1.00 23.19ACATOM282 CG ASP A 397.8062.082 -18.526 1.00 24.66ACATOM283 OD1 ASP A 396.7961.945 -19.248 1.00 26.50AOATOM284 OD2 ASP A 398.2463.239 -18.372 1.00 27.03AOATOM285 CASP A 3910.480 2.075 -17.156 1.00 24.00ACATOM286 OASP A 3910.843 3.004 -16.434 1.00 23.68AOATOM287 NSER A 4011.003 1.832 -18.355 1.00 24.67ANATOM288 CA SER A 4012.166 2.539 -18.847 1.00 24.80ACATOM289 CB SER A 4012.777 1.766 -20.041 1.00 25.30ACATOM290 OG SER A 4011.925 1.881 -21.163 1.00 25.60AOATOM291 CSER A 4011.815 3.984 -19.228 1.00 23.51ACATOM292 OSER A 4012.687 4.805 -19.375 1.00 24.41AOATOM293 NSER A 4110.532 4.308 -19.317 1.00 23.14ANATOM294 CA SER A 4110.097 5.670 -19.621 1.00 21.75ACATOM295 CB SER A 418.6205.679 -20.037 1.00 22.84ACATOM296 OG SER A 417.7255.739 -18.919 1.00 21.43AOATOM297 CSER A 4110.262 6.639 -18.427 1.00 21.13ACATOM298 OSER A 4110.299 7.863 -18.603 1.00 19.88AOATOM299 NMET A 4210.359 6.079 -17.223 1.00 19.68ANATOM300 CA MET A 4210.381 6.882 -15.996 1.00 18.70ACATOM301 CB MET A 4210.295 5.949 -14.782 1.00 18.20ACATOM302 CG MET A 4210.451 6.626 -13.423 1.00 17.87ACATOM303 SD MET A 429.1907.804 -13.030 1.00 16.31ASATOM304 CE MET A 427.6586.844 -13.134 1.00 15.38ACATOM305 CMET A 4211.607 7.779 -15.897 1.00 17.89ACATOM306 OMET A 4212.728 7.390 -16.223 1.00 17.28AOATOM307 NHIS A 4311.381 8.998 -15.421 1.00 17.69ANATOM308 CA HIS A 4312.479 9.903 -15.081 1.00 17.38ACATOM309 CB HIS A 4311.942 11.020 -14.196 1.00 17.29ACATOM310 CG HIS A 4312.896 12.155 -13.981 1.00 16.73ACATOM311 ND1 HIS A 4312.576 13.456 -14.321 1.00 16.98AN
ATOM312 CE1 HIS A 4313.56614.257 -13.971 1.00 13.61ACATOM313 NE2 HIS A 4314.52113.523 -13.426 1.00 17.49ANATOM314 CD2 HIS A 4314.11312.207 -13.397 1.00 13.70ACATOM315 CHIS A 4313.6479.209 -14.381 1.00 16.64ACATOM316 OHIS A 4313.4538.389 -13.479 1.00 15.82AOATOM317 NGLU A 4414.8589.559 -14.818 1.00 16.35ANATOM318 CA GLU A 4416.1128.985 -14.358 1.00 16.74ACATOM319 CB GLU A 4417.2939.763 -14.988 1.00 17.71ACATOM320 CG GLU A 4417.26811.270 -14.753 1.00 18.20ACATOM321 CD GLU A 4418.44512.004 -15.418 1.00 22.20ACATOM322 OE1 GLU A 4418.99711.455 -16.397 1.00 20.94AOATOM323 OE2 GLU A 4418.84313.110 -14.933 1.00 20.93AOATOM324 CGLU A 4416.2808.982 -12.823 1.00 17.11ACATOM325 OGLU A 4416.9448.104 -12.259 1.00 17.08AOATOM326 NALA A 4515.6659.954 -12.152 1.00 16.39ANATOM327 CA ALA A 4515.77410.061 -10.696 1.00 16.01ACATOM328 CB ALA A 4515.12211.354 -10.198 1.00 15.44ACATOM329 CALA A 4515.1558.864 -9.971 1.00 16.39ACATOM330 OALA A 4515.5388.564 -8.857 1.00 14.42AOATOM331 NPHE A 4614.1848.218 -10.595 1.00 16.01ANATOM332 CA PHE A 4613.4117.139 -9.971 1.00 16.28ACATOM333 CB PHE A 4611.9587.562 -9.882 1.00 16.14ACATOM334 CG PHE A 4611.7808.959 -9.396 1.00 14.90ACATOM335 CD1 PHE A 4612.0369.275 -8.078 1.00 14.17ACATOM336 CE1 PHE A 4611.89710.586 -7.628 1.00 13.19ACATOM337 CZ PHE A 4611.52511.592 -8.504 1.00 14.92ACATOM338 CE2 PHE A 4611.29111.299 -9.809 1.00 16.01ACATOM339 CD2 PHE A 4611.4169.971 -10.261 1.00 15.93ACATOM340 CPHE A 4613.4665.791 -10.697 1.00 17.23ACATOM341 OPHE A 4613.0174.764 -10.172 1.00 16.06AOATOM342 NARG A 4713.9865.781 -11.917 1.00 18.87ANATOM343 CA ARG A 4713.9634.566 -12.723 1.00 20.32ACATOM344 CB ARG A 4714.6594.833 -14.062 1.00 21.00ACATOM345 CG ARG A 4714.3093.871 -15.173 1.00 24.13ACATOM346 CD ARG A 4714.4684.517 -16.570 1.00 28.53ACATOM347 NE ARG A 4715.8035.031 -16.813 1.00 32.22ANATOM348 CZ ARG A 4716.1056.229 -17.359 1.00 34.45ACATOM349 NH1 ARG A 4715.1717.109 -17.703 1.00 33.97ANATOM350 NH2 ARG A 4717.3846.558 -17.527 1.00 33.82ANATOM351 CARG A 4714.6743.437 -12.000 1.00 20.49ACATOM352 OARG A 4715.7843.619 -11.523 1.00 21.38AOATOM353 NGLY A 4814.0322.280 -11.898 1.00 21.45ANATOM354 CA GLY A 4814.6421.105 -11.274 1.00 21.59ACATOM355 CGLY A 4814.5831.091 -9.741 1.00 21.98ACATOM356 OGLY A 4815.0720.145 -9.102 1.00 21.74AOATOM357 NLYS A 4913.9842.117 -9.136 1.00 21.05ANATOM358 CA LYS A 4913.9502.197 -7.662 1.00 20.90ACATOM359 CB LYS A 4914.9153.305 -7.180 1.00 22.03ACATOM360 CG LYS A 4914.3664.713 -7.161 1.00 24.83ACATOM361 CD LYS A 4915.4475.815 -6.761 1.00 27.45ACATOM362 CE LYS A 4915.9575.680 -5.358 1.00 27.82ACATOM363 NZ LYS A 4917.0244.667 -5.220 1.00 28.25ANATOM364 CLYS A 4912.5232.329 -7.077 1.00 19.90ACATOM365 OLYS A 4912.3392.667 -5.890 1.00 19.91AOATOM366 NILE A 5011.5231.999 -7.900 1.00 18.63ANATOM367 CA ILE A 5010.1212.078 -7.533 1.00 17.48ACATOM368 CB ILE A 509.284 2.650 -8.695 1.00 17.67ACATOM369 CG1 ILE A 509.738 4.076 -9.050 1.00 17.24ACATOM370 CD1 ILE A 509.083 4.630 -10.302 1.00 17.34AC
ATOM371 CG2 ILE A 507.807 2.723 -8.319 1.00 17.29ACATOM372 CILE A 509.562 0.730 -7.090 1.00 17.96ACATOM373 OILE A 509.339 -0.161 -7.909 1.00 18.69AOATOM374 NTHR A 519.355 0.583 -5.784 1.00 17.09ANATOM375 CA THR A 518.731 -0.601 -5.218 1.00 17.60ACATOM376 CB THR A 518.700 -0.423 -3.690 1.00 18.38ACATOM377 OG1 THR A 5110.033-0.380 -3.205 1.00 17.39AOATOM378 CG2 THR A 518.054 -1.617 -3.014 1.00 17.34ACATOM379 CTHR A 517.301 -0.746 -5.646 1.00 17.50ACATOM380 OTHR A 516.827 -1.834 -5.903 1.00 18.10AOATOM381 NALA A 526.578 0.369 -5.670 1.00 16.93ANATOM382 CA ALA A 525.179 0.338 -6.052 1.00 17.34ACATOM383 CB ALA A 524.314 -0.132 -4.884 1.00 17.41ACATOM384 CALA A 524.753 1.725 -6.501 1.00 17.46ACATOM385 OALA A 525.187 2.730 -5.928 1.00 16.50AOATOM386 NLEU A 533.921 1.760 -7.539 1.00 17.19ANATOM387 CA LEU A 533.369 2.987 -8.081 1.00 16.89ACATOM388 CB LEU A 534.004 3.309 -9.430 1.00 16.66ACATOM389 CG LEU A 533.490 4.525 -10.224 1.00 16.83ACATOM390 CD1 LEU A 533.523 5.796 -9.401 1.00 15.83ACATOM391 CD2 LEU A 534.303 4.720 -11.476 1.00 17.71ACATOM392 CLEU A 531.868 2.779 -8.212 1.00 17.28ACATOM393 OLEU A 531.421 2.057 -9.097 1.00 17.43AOATOM394 NTYR A 541.101 3.393 -7.303 1.00 17.28ANATOM395 CA TYR A 54-0.3503.200 -7.230 1.00 16.87ACATOM396 CB TYR A 54-0.7742.944 -5.789 1.00 16.88ACATOM397 CG TYR A 54-0.2681.679 -5.144 1.00 15.63ACATOM398 CD1 TYR A 54-0.4110.448 -5.770 1.00 15.86ACATOM399 CE1 TYR A 540.037 -0.698 -5.192 1.00 15.12ACATOM400 CZ TYR A 540.666 -0.647 -3.946 1.00 15.32ACATOM401 OH TYR A 541.093 -1.815 -3.374 1.00 14.97AOATOM402 CE2 TYR A 540.856 0.558 -3.312 1.00 15.70ACATOM403 CD2 TYR A 540.384 1.718 -3.908 1.00 15.59ACATOM404 CTYR A 54-1.0984.411 -7.712 1.00 17.11ACATOM405 OTYR A 54-0.7335.546 -7.387 1.00 16.78AOATOM406 NALA A 55-2.1614.184 -8.483 1.00 17.01ANATOM407 CA ALA A 55-3.0325.260 -8.926 1.00 17.49ACATOM408 CB ALA A 55-3.3555.094 -10.437 1.00 17.43ACATOM409 CALA A 55-4.3235.272 -8.100 1.00 18.26ACATOM410 OALA A 55-5.1744.400 -8.269 1.00 19.60AOATOM411 NLEU A 56-4.4816.267 -7.230 1.00 17.69ANATOM412 CA LEU A 56-5.6416.353 -6.368 1.00 17.32ACATOM413 CB LEU A 56-5.2246.779 -4.965 1.00 16.99ACATOM414 CG LEU A 56-4.4525.752 -4.129 1.00 17.97ACATOM415 CD1 LEU A 56-3.1205.532 -4.719 1.00 20.33ACATOM416 CD2 LEU A 56-4.3296.225 -2.662 1.00 19.18ACATOM417 CLEU A 56-6.6627.360 -6.867 1.00 17.28ACATOM418 OLEU A 56-7.8397.192 -6.653 1.00 17.95AOATOM419 NGLY A 57-6.2048.430 -7.485 1.00 17.26ANATOM420 CA GLY A 57-7.0689.541 -7.802 1.00 17.53ACATOM421 CGLY A 57-7.6629.430 -9.199 1.00 17.74ACATOM422 OGLY A 57-8.7589.905 -9.446 1.00 17.69AOATOM423 NARG A 58-6.9218.825 -10.109 1.00 18.54ANATOM424 CA ARG A 58-7.3618.659 -11.502 1.00 19.44ACATOM425 CB ARG A 58-6.5729.555 -12.466 1.00 18.56ACATOM426 CG ARG A 58-6.87311.036 -12.371 1.00 18.16ACATOM427 CD ARG A 58-5.68511.912 -12.787 1.00 17.99ACATOM428 NE ARG A 58-4.50511.593 -11.990 1.00 17.16ANATOM429 CZ ARG A 58-3.24811.716 -12.392 1.00 18.78AC
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ATOM489 OD1 ASN A 661.942 20.281 -9.721 1.00 23.54AOATOM490 ND2 ASN A 66-0.287 20.591 -9.566 1.00 25.20ANATOM491 C ASN A 662.806 19.457 -12.153 1.00 18.71ACATOM492 O ASN A 663.314 20.549 -12.353 1.00 18.84AOATOM493 N GLY A 673.500 18.426 -11.698 1.00 17.55ANATOM494 CA GLY A 674.917 18.503 -11.406 1.00 16.38ACATOM495 C GLY A 675.234 18.455 -9.916 1.00 15.32ACATOM496 O GLY A 676.383 18.167 -9.542 1.00 15.11AOATOM497 N HIS A 684.230 18.722 -9.075 1.00 13.44ANATOM498 CA HIS A 684.406 18.776 -7.608 1.00 12.51ACATOM499 CB BHIS A 683.109 19.121 -6.891 0.50 12.22ACATOM500 CB AHIS A 683.048 19.078 -6.930 0.50 12.48ACATOM501 CG BHIS A 683.266 19.371 -5.417 0.50 10.61ACATOM502 CG AHIS A 683.140 19.398 -5.464 0.50 10.86ACATOM503 ND1 BHIS A 682.741 18.522 -4.453 0.50 5.34 ANATOM504 ND1 AHIS A 683.742 18.559 -4.548 0.50 7.56 ANATOM505 CE1 BHIS A 683.009 19.016 -3.254 0.50 6.59 ACATOM506 CE1 AHIS A 683.674 19.102 -3.341 0.50 2.00 ACATOM507 NE2 BHIS A 683.678 20.158 -3.403 0.50 7.98 ANATOM508 NE2 AHIS A 683.061 20.277 -3.442 0.50 6.21 ANATOM509 CD2 BHIS A 683.845 20.405 -4.745 0.50 5.10 ACATOM510 CD2 AHIS A 682.697 20.471 -4.756 0.50 8.79 ACATOM511 C HIS A 684.986 17.474 -7.064 1.00 12.70ACATOM512 O HIS A 686.025 17.471 -6.401 1.00 12.91AOATOM513 N GLY A 694.315 16.374 -7.317 1.00 13.22ANATOM514 CA GLY A 694.709 15.094 -6.739 1.00 13.52ACATOM515 C GLY A 696.039 14.574 -7.181 1.00 13.01ACATOM516 O GLY A 696.751 13.894 -6.418 1.00 13.80AOATOM517 N THR A 706.391 14.865 -8.432 1.00 13.25ANATOM518 CA THR A 707.651 14.425 -8.970 1.00 12.89ACATOM519 CB THR A 707.688 14.638 -10.507 1.00 13.93ACATOM520 OG1 THR A 706.592 13.940 -11.116 1.00 14.34AOATOM521 CG2 THR A 708.895 13.977 -11.110 1.00 13.50ACATOM522 C THR A 708.769 15.192 -8.309 1.00 12.86ACATOM523 O THR A 709.816 14.622 -8.013 1.00 13.63AOATOM524 N HIS A 718.560 16.498 -8.093 1.00 12.19ANATOM525 CA HIS A 719.580 17.341 -7.486 1.00 11.80ACATOM526 CB HIS A 719.125 18.796 -7.555 1.00 11.41ACATOM527 CG BHIS A 7110.185 19.784 -7.212 0.50 11.89ACATOM528 CG AHIS A 7110.189 19.775 -7.181 0.50 9.73 ACATOM529 ND1 BHIS A 7110.926 19.709 -6.050 0.50 12.60ANATOM530 ND1 AHIS A 7110.236 20.388 -5.942 0.50 5.89 ANATOM531 CE1 BHIS A 7111.791 20.706 -6.025 0.50 13.16ACATOM532 CE1 AHIS A 7111.281 21.192 -5.898 0.50 7.95 ACATOM533 NE2 BHIS A 7111.618 21.438 -7.114 0.50 14.18ANATOM534 NE2 AHIS A 7111.923 21.107 -7.054 0.50 10.14ANATOM535 CD2 BHIS A 7110.617 20.883 -7.869 0.50 10.25ACATOM536 CD2 AHIS A 7111.258 20.231 -7.874 0.50 6.22 ACATOM537 C HIS A 719.806 16.875 -6.018 1.00 12.35ACATOM538 O HIS A 7110.935 16.698 -5.538 1.00 12.45AOATOM539 N VAL A 728.697 16.657 -5.331 1.00 12.33ANATOM540 CA VAL A 728.704 16.204 -3.960 1.00 12.62ACATOM541 CB VAL A 727.279 16.056 -3.469 1.00 12.75ACATOM542 CG1 VAL A 727.248 15.256 -2.202 1.00 12.50ACATOM543 CG2 VAL A 726.647 17.430 -3.262 1.00 12.97ACATOM544 C VAL A 729.431 14.864 -3.799 1.00 13.01ACATOM545 O VAL A 7210.333 14.707 -2.947 1.00 12.02AOATOM546 N ALA A 739.054 13.888 -4.615 1.00 12.23ANATOM547 CA ALA A 739.664 12.572 -4.521 1.00 12.29AC
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ATOM607 O ASN A 8218.325 15.985 -6.772 1.00 16.88AOATOM608 N LYS A 8320.310 15.022 -6.366 1.00 15.41ANATOM609 CA LYS A 8319.767 13.853 -5.710 1.00 15.60ACATOM610 CB LYS A 8320.907 12.919 -5.287 1.00 15.95ACATOM611 CG LYS A 8321.665 12.168 -6.415 1.00 16.19ACATOM612 CD LYS A 8322.815 11.339 -5.811 1.00 19.24ACATOM613 CE LYS A 8323.806 10.791 -6.833 1.00 21.12ACATOM614 NZ LYS A 8323.076 9.941 -7.791 1.00 20.88ANATOM615 C LYS A 8318.966 14.243 -4.453 1.00 14.74ACATOM616 O LYS A 8319.243 15.248 -3.801 1.00 13.71AOATOM617 N GLY A 8418.000 13.402 -4.117 1.00 14.66ANATOM618 CA GLY A 8417.337 13.439 -2.833 1.00 14.40ACATOM619 C GLY A 8418.240 13.078 -1.664 1.00 14.38ACATOM620 O GLY A 8419.372 12.683 -1.853 1.00 14.68AOATOM621 N MET A 8517.734 13.231 -0.439 1.00 13.41ANATOM622 CA MET A 8518.586 13.079 0.753 1.00 13.39ACATOM623 CB MET A 8517.865 13.660 1.970 1.00 13.62ACATOM624 CG MET A 8517.446 15.132 1.799 1.00 14.10ACATOM625 SD MET A 8518.823 16.235 1.480 1.00 15.77ASATOM626 CE MET A 8518.801 16.373 -0.341 1.00 16.54ACATOM627 C MET A 8518.946 11.600 1.022 1.00 13.55ACATOM628 O MET A 8519.975 11.302 1.623 1.00 13.91AOATOM629 N ALA A 8618.078 10.685 0.586 1.00 13.51ANATOM630 CA ALA A 8618.290 9.250 0.774 1.00 13.69ACATOM631 CB ALA A 8617.223 8.682 1.717 1.00 13.63ACATOM632 C ALA A 8618.200 8.571 -0.589 1.00 13.59ACATOM633 O ALA A 8617.258 7.821 -0.868 1.00 14.50AOATOM634 N PRO A 8719.175 8.818 -1.445 1.00 14.33ANATOM635 CA PRO A 8719.068 8.409 -2.859 1.00 14.18ACATOM636 CB PRO A 8720.236 9.152 -3.515 1.00 14.93ACATOM637 CG PRO A 8721.263 9.267 -2.393 1.00 14.56ACATOM638 CD PRO A 8720.446 9.524 -1.148 1.00 13.97ACATOM639 C PRO A 8719.146 6.901 -3.123 1.00 14.68ACATOM640 O PRO A 8718.943 6.474 -4.260 1.00 15.65AOATOM641 N GLN A 8819.424 6.099 -2.109 1.00 15.11ANATOM642 CA GLN A 8819.436 4.639 -2.266 1.00 16.35ACATOM643 CB GLN A 8820.748 4.050 -1.733 1.00 16.73ACATOM644 CG GLN A 8821.900 4.262 -2.703 1.00 19.50ACATOM645 CD GLN A 8823.267 3.916 -2.161 1.00 21.39ACATOM646 OE1 GLN A 8823.427 2.933 -1.439 1.00 22.79AOATOM647 NE2 GLN A 8824.272 4.709 -2.547 1.00 22.41ANATOM648 C GLN A 8818.228 3.976 -1.621 1.00 16.49ACATOM649 O GLN A 8818.080 2.754 -1.644 1.00 16.50AOATOM650 N ALA A 8917.347 4.786 -1.044 1.00 16.72ANATOM651 CA ALA A 8916.056 4.279 -0.599 1.00 16.78ACATOM652 CB ALA A 8915.380 5.277 0.375 1.00 17.28ACATOM653 C ALA A 8915.139 3.996 -1.792 1.00 16.32ACATOM654 O ALA A 8915.212 4.648 -2.826 1.00 16.81AOATOM655 N ASN A 9014.248 3.037 -1.634 1.00 15.45ANATOM656 CA ASN A 9013.264 2.756 -2.658 1.00 15.40ACATOM657 CB ASN A 9013.036 1.247 -2.756 1.00 16.05ACATOM658 CG ASN A 9014.076 0.549 -3.658 1.00 19.92ACATOM659 OD1 ASN A 9015.039 1.155 -4.106 1.00 25.00AOATOM660 ND2 ASN A 9013.892 -0.736 -3.873 1.00 28.28ANATOM661 C ASN A 9011.942 3.486 -2.367 1.00 14.01ACATOM662 O ASN A 9011.668 3.834 -1.234 1.00 12.81AOATOM663 N LEU A 9111.150 3.705 -3.410 1.00 13.02ANATOM664 CA LEU A 919.964 4.542 -3.381 1.00 13.78ACATOM665 CB LEU A 9110.022 5.524 -4.540 1.00 13.95AC
ATOM666 CG LEU A 918.8616.472 -4.765 1.00 12.85ACATOM667 CD1 LEU A 918.6697.375 -3.571 1.00 15.80ACATOM668 CD2 LEU A 919.0777.287 -6.026 1.00 13.13ACATOM669 C LEU A 918.6613.762 -3.524 1.00 14.15ACATOM670 O LEU A 918.5032.953 -4.437 1.00 15.63AOATOM671 N VAL A 927.7164.055 -2.649 1.00 13.69ANATOM672 CA VAL A 926.3273.692 -2.872 1.00 14.00ACATOM673 CB VAL A 925.7373.031 -1.662 1.00 13.15ACATOM674 CG1 VAL A 924.1973.018 -1.767 1.00 15.32ACATOM675 CG2 VAL A 926.2601.621 -1.546 1.00 13.02ACATOM676 C VAL A 925.6155.001 -3.175 1.00 13.45ACATOM677 O VAL A 925.6875.942 -2.376 1.00 13.53AOATOM678 N PHE A 934.9845.107 -4.346 1.00 13.19ANATOM679 CA PHE A 934.2936.351 -4.714 1.00 13.05ACATOM680 CB PHE A 934.8996.964 -5.985 1.00 13.57ACATOM681 CG PHE A 934.4848.388 -6.206 1.00 13.50ACATOM682 CD1 PHE A 935.3319.439 -5.861 1.00 13.00ACATOM683 CE1 PHE A 934.94110.748 -6.023 1.00 12.71ACATOM684 CZ PHE A 933.68011.030 -6.515 1.00 11.77ACATOM685 CE2 PHE A 932.8329.998 -6.881 1.00 12.22ACATOM686 CD2 PHE A 933.2268.679 -6.710 1.00 12.44ACATOM687 C PHE A 932.7936.150 -4.872 1.00 13.51ACATOM688 O PHE A 932.3505.285 -5.632 1.00 13.61AOATOM689 N GLN A 942.0216.949 -4.150 1.00 13.35ANATOM690 CA GLN A 940.5676.903 -4.197 1.00 13.55ACATOM691 CB GLN A 94-0.034 6.775 -2.786 1.00 12.95ACATOM692 CG GLN A 940.3835.493 -2.078 1.00 13.25ACATOM693 CD GLN A 940.0655.494 -0.589 1.00 14.07ACATOM694 OE1 GLN A 940.5986.311 0.157 1.00 16.83AOATOM695 NE2 GLN A 94-0.813 4.578 -0.158 1.00 13.83ANATOM696 C GLN A 940.1188.195 -4.841 1.00 13.81ACATOM697 O GLN A 940.1979.289 -4.236 1.00 12.11AOATOM698 N SER A 95-0.266 8.072 -6.110 1.00 14.33ANATOM699 CA SER A 95-0.793 9.190 -6.893 1.00 14.08ACATOM700 CB SER A 95-0.743 8.850 -8.380 1.00 13.95ACATOM701 OG SER A 95-1.337 9.864 -9.152 1.00 11.92AOATOM702 C SER A 95-2.221 9.519 -6.494 1.00 14.82ACATOM703 O SER A 95-3.150 8.743 -6.780 1.00 14.73AOATOM704 N ILE A 96-2.404 10.681 -5.852 1.00 15.21ANATOM705 CA ILE A 96-3.699 11.049 -5.277 1.00 15.55ACATOM706 CB ILE A 96-3.560 11.482 -3.782 1.00 15.92ACATOM707 CG1 ILE A 96-2.466 12.548 -3.597 1.00 16.08ACATOM708 CD1 ILE A 96-2.367 13.122 -2.196 1.00 17.02ACATOM709 CG2 ILE A 96-3.257 10.273 -2.915 1.00 16.70ACATOM710 C ILE A 96-4.398 12.158 -6.043 1.00 15.93ACATOM711 O ILE A 96-5.475 12.590 -5.660 1.00 14.84AOATOM712 N MET A 97-3.797 12.640 -7.119 1.00 16.32ANATOM713 CA MET A 97-4.440 13.700 -7.889 1.00 18.17ACATOM714 CB MET A 97-3.471 14.346 -8.884 1.00 18.20ACATOM715 CG MET A 97-4.107 15.480 -9.688 1.00 21.58ACATOM716 SD MET A 97-2.949 16.297 -10.814 1.00 25.41ASATOM717 CE MET A 97-3.900 16.196 -12.225 1.00 31.75ACATOM718 C MET A 97-5.647 13.114 -8.641 1.00 18.32ACATOM719 O MET A 97-5.537 12.054 -9.249 1.00 18.26AOATOM720 N ASP A 98-6.780 13.807 -8.568 1.00 19.35ANATOM721 CA ASP A 98-8.020 13.369 -9.217 1.00 20.45ACATOM722 CB ASP A 98-9.268 13.714 -8.375 1.00 20.39ACATOM723 CG ASP A 98-9.367 15.170 -8.021 1.00 21.41ACATOM724 OD1 ASP A 98-9.234 16.024 -8.928 1.00 22.52AO
ATOM725 OD2 ASP A 98 -9.599 15.575 -6.847 1.00 20.32AOATOM726 CASP A 98 -8.093 14.004 -10.592 1.00 20.49ACATOM727 OASP A 98 -7.168 14.690 -10.996 1.00 19.61AOATOM728 NSER A 99 -9.170 13.747 -11.321 1.00 21.70ANATOM729 CA SER A 99 -9.252 14.202 -12.703 1.00 23.74ACATOM730 CB SER A 99 -10.202 13.301 -13.510 1.00 24.07ACATOM731 OG SER A 99 -11.497 13.436 -12.986 1.00 25.19AOATOM732 CSER A 99 -9.727 15.660 -12.749 1.00 24.80ACATOM733 OSER A 99 -9.696 16.286 -13.812 1.00 27.46AOATOM734 NGLY A 100-10.152 16.203 -11.611 1.00 24.38ANATOM735 CA GLY A 100-10.425 17.621 -11.488 1.00 25.17ACATOM736 CGLY A 100-9.262 18.470 -10.968 1.00 25.36ACATOM737 OGLY A 100-9.475 19.606 -10.557 1.00 26.29AOATOM738 NGLY A 101-8.047 17.933 -10.964 1.00 25.13ANATOM739 CA GLY A 101-6.873 18.715 -10.573 1.00 24.90ACATOM740 CGLY A 101-6.541 18.760 -9.076 1.00 24.55ACATOM741 OGLY A 101-5.425 19.133 -8.713 1.00 26.15AOATOM742 NGLY A 102-7.490 18.406 -8.221 1.00 22.32ANATOM743 CA GLY A 102-7.258 18.339 -6.783 1.00 21.84ACATOM744 CGLY A 102-6.703 17.008 -6.267 1.00 20.73ACATOM745 OGLY A 102-6.172 16.204 -7.021 1.00 19.11AOATOM746 NLEU A 103-6.814 16.794 -4.959 1.00 19.97ANATOM747 CA LEU A 103-6.225 15.634 -4.294 1.00 19.19ACATOM748 CB LEU A 103-5.346 16.094 -3.131 1.00 18.87ACATOM749 CG LEU A 103-4.169 16.986 -3.552 1.00 18.31ACATOM750 CD1 LEU A 103-3.298 17.397 -2.354 1.00 17.54ACATCM751 CD2 LEU A 103-3.341 16.297 -4.607 1.00 19.64ACATOM752 CLEU A 103-7.307 14.676 -3.809 1.00 19.31ACATOM753 OLEU A 103-7.179 14.018 -2.750 1.00 18.44AOATOM754 NGLY A 104-8.371 14.586 -4.604 1.00 18.93ANATOM755 CA GLY A 104-9.537 13.780 -4.260 1.00 18.78ACATOM756 CGLY A 104-9.259 12.298 -4.234 1.00 18.26ACATOM757 OGLY A 104-10.078 11.506 -3.780 1.00 19.17AOATOM758 NGLY A 105-8.094 11.886 -4.703 1.00 17.54ANATOM759 CA GLY A 105-7.698 10.500 -4.520 1.00 17.23ACATOM760 CGLY A 105-7.395 10.091 -3.075 1.00 16.85ACATOM761 OGLY A 105-7.319 8.895-2.731 1.00 15.88AOATOM762 NLEU A 106-7.263 11.067 -2.194 1.00 16.62ANATOM763 CA LEU A 106-7.137 10.729 -0.777 1.00 16.79ACATOM764 CB LEU A 106-6.892 11.975 0.0481.00 16.05ACATOM765 CG LEU A 106-5.519 12.560 -0.204 1.00 14.68ACATOM766 CD1 LEU A 106-5.479 13.986 0.2741.00 16.20ACATOM767 CD2 LEU A 106-4.425 11.707 0.5071.00 13.15ACATOM768 CLEU A 106-8.423 10.056 -0.304 1.00 17.90ACATOM769 OLEU A 106-9.513 10.553 -0.587 1.00 18.63AOATOM770 NPRO A 107-8.318 8.9320.3871.00 18.42ANATOM771 CA PRO A 107-9.506 8.2800.9771.00 19.35ACATOM772 CB PRO A 107-8.963 6.9321.4301.00 19.15ACATOM773 CG PRO A 107-7.537 7.2861.7741.00 19.19ACATOM774 CD PRO A 107-7.089 8.1620.6401.00 18.63ACATOM775 CPRO A 107-10.070 9.0362.1781.00 18.88ACATOM776 OPRO A 107-9.340 9.7242.8861.00 19.33AOATOM777 NALA A 108-11.367 8.9102.4081.00 19.46ANATOM778 CA ALA A 108-12.022 9.5623.5301.00 19.50ACATOM779 CB ALA A 108-13.514 9.1683.5851.00 20.76ACATOM780 CALA A 108-11.359 9.2294.8751.00 18.72ACATOM781 OALA A 108-11.229 10.093 5.7271.00 19.17AOATOM782 NASN A 109-11.007 7.9645.0691.00 18.94ANATOM783 CA ASN A 109-10.193 7.5356.2091.00 19.10AC
ATOM784 CB ASN A 109-10.691 6.2066.773 1.00 19.41ACATOM785 CG ASN A 109-9.9905.8348.073 1.00 22.66ACATOM786 OD1 ASN A 109-8.8726.2958.349 1.00 19.31AOATOM787 ND2 ASN A 109-10.665 5.0188.908 1.00 25.73ANATOM788 C ASN A 109-8.7317.3925.804 1.00 17.97ACATOM789 O ASN A 109-8.3536.4465.088 1.00 17.31AOATOM790 N LEU A 110-7.8958.3256.245 1.00 16.66ANATOM791 CA LEU A 110-6.4898.2775.862 1.00 15.50ACATOM792 CB LEU A 110-5.7389.5026.406 1.00 15.65ACATOM793 CG LEU A 110-6.09610.831 5.749 1.00 13.74ACATOM794 CD1 LEU A 110-5.29411.932 6.373 1.00 16.06ACATOM795 CD2 LEU A 110-5.87310.768 4.256 1.00 13.53ACATOM796 C LEU A 110-5.7847.0066.285 1.00 15.96ACATOM797 O LEU A 110-4.7506.6605.719 1.00 16.04AOATOM798 N GLN A 111-6.2976.2837.276 1.00 16.18ANATOM799 CA GLN A 111-5.6355.0347.655 1.00 16.61ACATOM800 CB GLN A 111-6.3174.3778.871 1.00 17.82ACATOM801 CG GLN A 111-6.3375.32010.077 1.00 17.25ACATOM802 CD GLN A 111-6.5844.62511.399 1.00 20.40ACATOM803 OE1 GLN A 111-5.9343.63511.699 1.00 21.99AOATOM804 NE2 GLN A 111-7.5135.16312.202 1.00 19.23ANATOM805 C GLN A 111-5.5604.0866.461 1.00 17.45ACATOM806 O GLN A 111-4.6013.3236.312 1.00 17.74AOATOM807 N THR A 112-6.5224.1955.548 1.00 16.47ANATOM808 CA THR A 112-6.4833.4184.309 1.00 16.12ACATOM809 CB THR A 112-7.7563.7333.510 1.00 16.21ACATOM810 OG1 THR A 112-8.9003.4804.333 1.00 17.07AOATOM811 CG2 THR A 112-7.9092.8382.305 1.00 16.70ACATOM812 C THR A 112-5.2523.7113.442 1.00 15.86ACATOM813 O THR A 112-4.6232.7892.869 1.00 15.50AOATOM814 N LEU A 113-4.9334.9953.303 1.00 14.75ANATOM815 CA LEU A 113-3.7425.4132.558 1.00 14.05ACATOM816 CB LEU A 113-3.6776.9412.557 1.00 14.27ACATOM817 CG LEU A 113-2.5497.5971.807 1.00 14.53ACATOM818 CD1 LEU A 113-2.8407.4730.297 1.00 16.65ACATOM819 CD2 LEU A 113-2.4129.0392.212 1.00 13.95ACATOM820 C LEU A 113-2.4784.8363.212 1.00 13.77ACATOM821 O LEU A 113-1.6254.2382.550 1.00 13.55AOATOM822 N PHE A 114-2.3615.0164.523 1.00 12.95ANATOM823 CA PHE A 114-1.1824.5285.223 1.00 13.04ACATOM824 CB PHE A 114-1.1545.0496.645 1.00 12.56ACATOM825 CG PHE A 114-1.3316.5516.743 1.00 11.79ACATOM826 CD1 PHE A 114-0.6397.4025.902 1.00 12.07ACATOM827 CE1 PHE A 114-0.7858.7815.986 1.00 12.47ACATOM828 CZ PHE A 114-1.6629.3236.921 1.00 13.57ACATOM829 CE2 PHE A 114-2.3658.4707.754 1.00 11.94ACATOM830 CD2 PHE A 114-2.1867.1007.663 1.00 9.85ACATOM831 C PHE A 114-1.0603.0035.171 1.00 13.86ACATOM832 O PHE A 1140.063 2.4615.004 1.00 12.73AOATOM833 N SER A 115-2.1962.3065.277 1.00 14.04ANATOM834 CA SER A 115-2.1480.8485.292 1.00 14.17ACATOM835 CB BSER A 115-3.5270.2525.640 0.50 13.81ACATOM836 CB ASER A 115-3.4570.2155.769 0.50 14.55ACATOM837 OG BSER A 115-3.9700.5666.958 0.50 10.51AOATOM838 OG ASER A 115-4.5440.6084.978 0.50 18.03AOATOM839 C SER A 115-1.6770.2963.943 1.00 14.11ACATOM840 O SER A 115-0.932-0.663 3.909 1.00 13.43AOATOM841 N GLN A 116-2.1080.8902.832 1.00 14.73ANATOM842 CA GLN A 116-1.6560.4421.513 1.00 14.53AC
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ATOM1138 C MET A 1535.443 5.482 10.871 1.00 14.80ACATOM1139 O MET A 1534.684 6.058 11.646 1.00 13.50AOATOM1140 N THR A 1546.525 6.059 10.368 1.00 13.34ANATOM1141 CA THR A 1546.813 7.482 10.638 1.00 13.08ACATOM1142 CB THR A 1548.324 7.699 10.652 1.00 13.02ACATOM1143 OG1 THR A 1548.886 6.949 11.724 1.00 11.51AOATOM1144 CG2 THR A 1548.693 9.145 10.963 1.00 14.36ACATOM1145 C THR A 1546.153 8.310 9.573 1.00 12.50ACATOM1146 O THR A 1546.396 8.108 8.371 1.00 12.64AOATOM1147 N ILE A 1555.290 9.227 9.987 1.00 12.34ANATOM1148 CA ILE A 1554.492 10.0029.037 1.00 13.00ACATOM1149 CB ILE A 1552.983 9.799 9.346 1.00 13.05ACATOM1150 CG1 ILE A 1552.637 8.307 9.279 1.00 13.73ACATOM1151 CD1 ILE A 1551.121 8.017 9.274 1.00 12.93ACATOM1152 CG2 ILE A 1552.121 10.5788.371 1.00 13.58ACATOM1153 C ILE A 1554.861 11.4809.137 1.00 13.01ACATOM1154 O ILE A 1554.894 12.03810.233 1.00 12.79AOATOM1155 N LEU A 1565.125 12.1178.001 1.00 12.16ANATOM1156 CA LEU A 1565.509 13.5287.982 1.00 12.88ACATOM1157 CB LEU A 1566.903 13.6927.354 1.00 12.18ACATOM1158 CG LEU A 1568.089 12.9608.007 1.00 13.25ACATOM1159 CD1 LEU A 1568.365 11.6077.326 1.00 11.24ACATOM1160 CD2 LEU A 1569.339 13.7967.910 1.00 13.01ACATOM1161 C LEU A 1564.485 14.3287.192 1.00 13.49ACATOM1162 O LEU A 1563.982 13.8506.160 1.00 14.76AOATOM1163 N PHE A 1574.197 15.5407.659 1.00 12.79ANATOM1164 CA PHE A 1573.282 16.4517.003 1.00 13.07ACATOM1165 CB PHE A 1571.938 16.5647.772 1.00 13.62ACATOM1166 CG PHE A 1570.957 15.5047.401 1.00 13.90ACATOM1167 CD1 PHE A 1570.191 15.6366.272 1.00 11.22ACATOM1168 CE1 PHE A 157-0.678 14.6325.896 1.00 14.22ACATOM1169 CZ PHE A 157-0.743 13.4416.630 1.00 14.61ACATOM1170 CE2 PHE A 1570.013 13.2967.743 1.00 15.64ACATOM1171 CD2 PHE A 1570.891 14.3128.122 1.00 14.56ACATOM1172 C PHE A 1573.899 17.8526.928 1.00 13.18ACATOM1173 O PHE A 1574.527 18.3187.867 1.00 12.04AOATOM1174 N ALA A 1583.700 18.5005.793 1.00 13.46ANATOM1175 CA ALA A 1583.958 19.9215.623 1.00 13.31ACATOM1176 CB ALA A 1583.509 20.3344.235 1.00 14.02ACATOM1177 C ALA A 1583.181 20.7036.672 1.00 13.75ACATOM1178 O ALA A 1582.031 20.3806.965 1.00 13.75AOATOM1179 N ALA A 1593.787 21.7527.215 1.00 13.45ANATOM1180 CA ALA A 1593.122 22.5828.210 1.00 13.81ACATOM1181 CB ALA A 1594.151 23.4958.944 1.00 13.64ACATOM1182 C ALA A 1592.043 23.4737.628 1.00 14.14ACATOM1183 O ALA A 1591.175 23.9248.364 1.00 14.00AOATOM1184 N GLY A 1602.131 23.7536.330 1.00 15.19ANATOM1185 CA GLY A 1601.230 24.6805.652 1.00 15.34ACATOM1186 C GLY A 1601.957 25.9415.236 1.00 14.93ACATOM1187 O GLY A 1603.041 26.2385.736 1.00 14.62AOATOM1188 N ASN A 1611.371 26.6864.307 1.00 15.04ANATOM1189 CA ASN A 1611.983 27.9023.789 1.00 15.84ACATOM1190 CB ASN A 1612.072 27.8722.261 1.00 15.91ACATOM1191 CG ASN A 1613.048 26.8511.712 1.00 17.40ACATOM1192 OD1 ASN A 1613.001 26.5500.490 1.00 21.70AOATOM1193 ND2 ASN A 1613.888 26.2672.569 1.00 11.15ANATOM1194 C ASN A 1611.131 29.1144.123 1.00 16.84ACATOM1195 O ASN A 1610.956 29.9653.286 1.00 17.07AOATOM1196 N GLU A 1620.575 29.1795.324 1.00 18.36AN
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ATOM3674 CD1 LEU B 68-11.745 34.523-4.508 1.00 22.82BCATOM3675 CD2 LEU B 68-10.187 34.785-2.595 1.00 22.44BCATOM3676 C LEU B 68-11.132 30.493-1.648 1.00 21.12BCATOM3677 O LEU B 68-11.663 29.709-2.432 1.00 21.87BOATOM3678 N PHE B 69-11.209 30.345-0.345 1.00 21.61BNATOM3679 CA PHE B 69-11.937 29.2260.233 1.00 21.97BCATOM3680 CB PHE B 69-11.151 28.6471.422 1.00 22.17BCATOM3681 CG PHE B 69-9.896 27.9051.028 1.00 19.89BCATOM3682 CD1 PHE B 69-9.938 26.5570.737 1.00 21.41BCATOM3683 CE1 PHE B 69-8.788 25.8620.370 1.00 20.29BCATOM3684 CZ PHE B 69-7.598 26.5250.290 1.00 21.78BCATOM3685 CE2 PHE B 69-7.542 27.8790.575 1.00 21.52BCATOM3686 CD2 PHE B 69-8.691 28.5570.950 1.00 19.33BCATOM3687 C PHE B 69-13.321 29.7250.664 1.00 23.11BCATOM3688 O PHE B 69-13.414 30.6511.506 1.00 22.87BOATOM3689 N VAL B 70-14.371 29.1050.111 1.00 24.00BNATOM3690 CA VAL B 70-15.755 29.5780.289 1.00 25.82BCATOM3691 CB VAL B 70-16.442 29.958-1.054 1.00 25.72BCATOM3692 CG1 VAL B 70-15.686 31.063-1.756 1.00 26.70BCATOM3693 CG2 VAL B 70-16.599 28.756-1.958 1.00 26.63BCATOM3694 C VAL B 70-16.691 28.6020.996 1.00 26.63BCATOM3695 O VAL B 70-16.532 27.3800.899 1.00 27.14BOATOM3696 N ASP B 71-17.664 29.1551.714 1.00 27.52BNATOM3697 CA ASP B 71-18.686 28.3522.399 1.00 29.00BCATOM3698 CB ASP B 71-19.247 29.1323.591 1.00 28.91BCATOM3699 CG ASP B 71-20.019 30.3923.171 1.00 28.74BCATOM3700 OD1 ASP B 71-20.161 31.2904.018 1.00 29.94BOATOM3701 OD2 ASP B 71-20.509 30.5722.032 1.00 27.69BOATOM3702 C ASP B 71-19.796 27.9311.413 1.00 30.37BCATOM3703 O ASP B 71-19.646 28.0980.217 1.00 29.90BOATOM3704 N LYS B 72-20.898 27.3761.906 1.00 33.42BNATOM3705 CA LYS B 72-21.949 26.8221.022 1.00 34.98BCATOM3706 CB LYS B 72-22.951 26.0041.834 1.00 35.44BCATOM3707 CG LYS B 72-22.190 24.9252.916 0.00 40.00BCATOM3708 CD LYS B 72-22.489 23.4352.595 0.00 40.00BCATOM3709 CE LYS B 72-21.240 22.5282.667 0.00 40.00BCATOM3710 NZ LYS B 72-21.120 21.6621.456 0.00 40.00BNATOM3711 C LYS B 72-22.709 27.9040.261 1.00 36.38BCATOM3712 O LYS B 72-23.332 27.627-0.766 1.00 37.77BOATOM3713 N LEU B 73-22.640 29.1380.753 1.00 37.07BNATOM3714 CA LEU B 73-23.306 30.2860.114 1.00 37.22BCATOM3715 CB LEU B 73-23.759 31.2651.201 1.00 37.50BCATOM3716 CG LEU B 73-24.711 30.6782.254 1.00 40.20BCATOM3717 CD1 LEU B 73-25.387 31.7963.053 1.00 41.53BCATOM3718 CD2 LEU B 73-25.782 29.7751.612 1.00 41.89BCATOM3719 C LEU B 73-22.406 31.008-0.890 1.00 36.59BCATOM3720 O LEU B 73-22.781 32.029-1.482 1.00 36.18BOATOM3721 N ASP B 74-21.203 30.468-1.076 1.00 36.33BNATOM3722 CA ASP B 74-20.192 31.084-1.923 1.00 35.65BCATOM3723 CB ASP B 74-20.709 31.252-3.342 1.00 36.81BCATOM3724 CG ASP B 74-20.063 30.283-4.286 1.00 40.36BCATOM3725 OD1 ASP B 74-19.429 30.756-5.259 1.00 45.75BOATOM3726 OD2 ASP B 74-20.108 29.032-4.101 1.00 45.61BOATOM3727 C ASP B 74-19.646 32.399-1.381 1.00 33.94BCATOM3728 O ASP B 74-19.147 33.249-2.136 1.00 34.59BOATOM3729 N ASN B 75-19.696 32.546-0.066 1.00 31.85BNATOM3730 CA ASN B 75-19.000 33.6340.597 1.00 30.66BCATOM3731 CB ASN B 75-19.877 34.1851.714 1.00 30.45BCATOM3732 CG ASN B 75-21.170 34.7931.176 1.00 30.77BC
ATOM3733 OD1 ASN B 75-21.169 35.4010.102 1.00 30.57BOATOM3734 ND2 ASN B 75-22.275 34.6151.907 1.00 30.32BNATOM3735 C ASN B 75-17.628 33.2131.127 1.00 29.26BCATOM3736 O ASN B 75-17.433 32.0731.553 1.00 29.07BOATOM3737 N ILE B 76-16.685 34.1431.086 1.00 27.83BNATOM3738 CA ILE B 76-15.337 33.8931.540 1.00 26.88BCATOM3739 CB ILE B 76-14.511 35.1821.455 1.00 26.51BCATOM3740 CG1 ILE B 76-14.474 35.7370.020 1.00 26.61BCATOM3741 CD1 ILE B 76-14.130 34.728-1.039 1.00 26.87BCATOM3742 CG2 ILE B 76-13.137 34.9271.993 1.00 25.62BCATOM3743 C ILE B 76-15.401 33.3822.993 1.00 26.59BCATOM3744 O ILE B 76-15.994 34.0173.838 1.00 26.12BOATOM3745 N ALA B 77-14.795 32.2373.263 1.00 26.58BNATOM3746 CA ALA B 77-14.899 31.5824.576 1.00 26.79BCATOM3747 CB ALA B 77-15.129 30.0884.386 1.00 26.56BCATOM3748 C ALA B 77-13.670 31.8155.467 1.00 26.89BCATOM3749 O ALA B 77-13.764 31.7516.677 1.00 27.73BOATOM3750 N GLU B 78-12.518 32.0724.871 1.00 26.32BNATOM3751 CA GLU B 78-11.355 32.4465.647 1.00 26.33BCATOM3752 CB GLU B 78-10.508 31.2166.041 1.00 26.80BCATOM3753 CG GLU B 78-10.106 30.2904.921 1.00 27.82BCATOM3754 CD GLU B 78-9.956 28.8275.352 1.00 28.92BCATOM3755 OE1 GLU B 78-9.785 28.4936.559 1.00 36.40BOATOM3756 OE2 GLU B 78-10.001 27.9774.472 1.00 28.50BOATOM3757 C GLU B 78-10.530 33.4784.895 1.00 25.94BCATOM3758 O GLU B 78-10.807 33.8053.712 1.00 25.71BOATOM3759 N VAL B 79-9.527 33.9965.594 1.00 24.85BNATOM3760 CA VAL B 79-8.712 35.0885.102 1.00 24.88BCATOM3761 CB VAL B 79-7.692 35.5786.167 1.00 25.77BCATOM3762 CG1 VAL B 79-6.814 36.6725.583 1.00 25.38BCATOM3763 CG2 VAL B 79-8.396 36.0737.456 1.00 26.10BCATOM3764 C VAL B 79-7.957 34.6523.835 1.00 24.07BCATOM3765 O VAL B 79-7.137 33.7423.883 1.00 23.32BOATOM3766 N PRO B 80-8.275 35.2712.699 1.00 23.27BNATOM3767 CA PRO B 80-7.533 35.0291.466 1.00 22.93BCATOM3768 CB PRO B 80-8.296 35.8560.426 1.00 23.15BCATOM3769 CG PRO B 80-9.645 36.0421.005 1.00 23.83BCATOM3770 CD PRO B 80-9.404 36.1942.480 1.00 23.67BCATOM3771 C PRO B 80-6.101 35.5121.601 1.00 22.05BCATOM3772 O PRO B 80-5.891 36.5882.136 1.00 20.76BOATOM3773 N ARG B 81-5.147 34.6911.190 1.00 21.54BNATOM3774 CA ARG B 81-3.765 35.1351.074 1.00 22.93BCATOM3775 CB BARG B 81-2.937 34.6832.298 0.40 22.99BCATOM3776 CB AARG B 81-2.865 34.7642.275 0.60 23.27BCATOM3777 CG BARG B 81-3.684 34.6723.645 0.40 24.27BCATOM3778 CG AARG B 81-3.278 33.6193.175 0.60 25.79BCATOM3779 CD BARG B 81-2.996 33.8184.744 0.40 26.79BCATOM3780 CD AARG B 81-2.615 33.7234.575 0.60 27.67BCATOM3781 NE BARG B 81-3.975 33.2345.664 0.40 28.96BNATOM3782 NE AARG B 81-3.283 32.9075.581 0.60 29.38BNATOM3783 CZ BARG B 81-4.567 32.0535.508 0.40 29.28BCATOM3784 CZ AARG B 81-3.934 33.3816.642 0.60 30.17BCATOM3785 NH1BARG B 81-4.284 31.2744.471 0.40 31.06BNATOM3786 NH1AARG B 81-4.020 34.6806.867 0.60 31.08BNATOM3787 NH2BARG B 81-5.448 31.6456.408 0.40 30.62BNATOM3788 NH2AARG B 81-4.510 32.5457.486 0.60 31.16BNATOM3789 C ARG B 81-3.115 34.616-0.178 1.00 21.97BCATOM3790 O ARG B 81-3.560 33.632-0.761 1.00 21.68BOATOM3791 N VAL B 82-2.029 35.286-0.559 1.00 20.91BN
ATOM3792 CA VAL B 82 -1.2243 4.884-1.679 1.00 21.03 BCATOM3793 CB VAL B 82 -0.12635.943 -1.952 1.00 21.89 BCATOM3794 CG1 VAL B 82 0.869 35.435 -2.906 1.00 22.93 BCATOM3795 CG2 VAL B 82 -0.73437.243 -2.483 1.00 21.44 BCATOM3796 C VAL B 82 -0.58333.532 -1.371 1.00 20.69 BCATOM3797 O VAL B 82 -0.23533.255 -0.221 1.00 19.36 BOATOM3798 N GLY B 83 -0.46932.694 -2.389 1.00 19.91 BNATOM3799 CA GLY B 83 0.382 31.525 -2.331 1.00 20.16 BCATOM3800 C GLY B 83 -0.23630.295 -2.955 1.00 20.11 BCATOM3801 O GLY B 83 -1.41630.328 -3.319 1.00 20.36 BOATOM3802 OXT GLY B 83 0.468 29.294 -3.104 1.00 18.79 BO
序列表<110>诺和酶股份有限公司<120>新的枯草杆菌酶<130>10321.204-WO<160>7<170>PatentIn版本3.2<210>1<211>433<212>PRT<213>芽孢杆菌JP170<220>
<221>肽<222>(1)..(433)<223>JP170枯草杆菌酶<400>1Asn Asp Val Ala Arg Gly Ile Val Lys Ala Asp Val Ala Gln Asn Asn1 5 10 15Phe Gly Leu Tyr Gly Gln Gly Gln Ile Val Ala Val Ala Asp Thr Gly20 25 30Leu Asp Thr Gly Arg Asn Asp Ser Ser Met His Glu Ala Phe Arg Gly35 40 45Lys Ile Thr Ala Leu Tyr Ala Leu Gly Arg Thr Asn Asn Ala Asn Asp50 55 60Pro Asn Gly His Gly Thr His Val Ala Gly Ser Val Leu Gly Asn Ala65 70 75 80
Thr Asn Lys Gly Met Ala Pro Gln Ala Asn Leu Val Phe Gln Ser Ile85 90 95Met Asp Ser Gly Gly Gly Leu Gly Gly Leu Pro Ala Asn Leu Gln Thr100 105 110Leu Phe Ser Gln Ala Tyr Ser Ala Gly Ala Arg Ile His Thr Asn Ser115 120 125Trp Gly Ala Pro Val Asn Gly Ala Tyr Thr Thr Asp Ser Arg Asn Val130 135 140Asp Asp Tyr Val Arg Lys Asn Asp Met Thr Ile Leu Phe Ala Ala Gly145 150 155 160Asn Glu Gly Pro Gly Ser Gly Thr Ile Ser Ala Pro Gly Thr Ala Lys165 170 175Asn Ala Ile Thr Val Gly Ala Thr Glu Asn Leu Arg Pro Ser Phe Gly180 185 190Ser Tyr Ala Asp Asn Ile Asn His Val Ala Gln Phe Ser Ser Arg Gly195 200 205Pro Thr Arg Asp Gly Arg Ile Lys Pro Asp Val Met Ala Pro Gly Thr210 215 220Tyr Ile Leu Ser Ala Arg Ser Ser Leu Ala Pro Asp Ser Ser Phe Trp225 230 235 240Ala Asn His Asp Ser Lys Tyr Ala Tyr Met Gly Gly Thr Ser Met Ala245 250 255
Thr Pro Ile Val Ala Gly Asn Val Ala Gln Leu Arg Glu His Phe Val260 265 270Lys Asn Arg Gly Val Thr Pro Lys Pro Ser Leu Leu Lys Ala Ala Leu275 280 285Ile Ala Gly Ala Ala Asp Val Gly Leu Gly Phe Pro Asn Gly Asn Gln290 295 300Gly Trp Gly Arg Val Thr Leu Asp Lys Ser Leu Asn Val Ala Phe Val305 310 315 320Asn Glu Thr Ser Pro Leu Ser Thr Ser Gln Lys Ala Thr Tyr Ser Phe325 330 335Thr Ala Gln Ala Gly Lys Pro Leu Lys Ile Ser Leu Val Trp Ser Asp340 345 350Ala Pro Gly Ser Thr Thr Ala Ser Leu Thr Leu Val Asn Asp Leu Asp355 360 365Leu Val Ile Thr Ala Pro Asn Gly Thr Lys Tyr Val Gly Asn Asp Phe370 375 380Thr Ala Pro Tyr Asp Asn Asn Trp Asp Gly Arg Asn Asn Val Glu Asn385 390 395 400Val Phe Ile Asn Ala Pro Gln Ser Gly Thr Tyr Thr Val Glu Val Gln405 410 415Ala Tyr Asn Val Pro Val Ser Pro Gln Thr Phe Ser Leu Ala Ile Val420 425 430
His<210>2<211>433<212>PRT<213>芽孢杆菌Y<220>
<221>肽<222>(1)..(433)<223>枯草杆菌酶Y<400>2Asn Asp Val Ala Arg Gly Ile Val Lys Ala Asp Val Ala Gln Asn Asn1 5 10 15Tyr Gly Leu Tyr Gly Gln Gly Gln Leu Val Ala Val Ala Asp Thr Gly20 25 30Leu Asp Thr Gly Arg Asn Asp Ser Ser Met His Glu Ala Phe Arg Gly35 40 45Lys Ile Thr Ala Leu Tyr Ala Leu Gly Arg Thr Asn Asn Ala Ser Asp50 55 60Pro Asn Gly His Gly Thr His Val Ala Gly Ser Val Leu Gly Asn Ala65 70 75 80Leu Asn Lys Gly Met Ala Pro Gln Ala Asn Leu Val Phe Gln Ser Ile85 90 95Met Asp Ser Ser Gly Gly Leu Gly Gly Leu Pro Ser Asn Leu Asn Thr
100 105 110Leu Phe Ser Gln Ala Trp Asn Ala Gly Ala Arg Ile His Thr Asn Ser115 120 125Trp Gly Ala Pro Val Asn Gly Ala Tyr Thr Ala Asn Ser Arg Gln Val130 135 140Asp Glu Tyr Val Arg Asn Asn Asp Met Thr Val Leu Phe Ala Ala Gly145 150 155 160Asn Glu Gly Pro Asn Ser Gly Thr Ile Ser Ala Pro Gly Thr Ala Lys165 170 175Asn Ala Ile Thr Val Gly Ala Thr Glu Asn Tyr Arg Pro Ser Phe Gly180 185 190Ser Ile Ala Asp Asn Pro Asn His Ile Ala Gln Phe Ser Ser Arg Gly195 200 205Ala Thr Arg Asp Gly Arg Ile Lys Pro Asp Val Thr Ala Pro Gly Thr210 215 220Phe Ile Leu Ser Ala Arg Ser Ser Leu Ala Pro Asp Ser Ser Phe Trp225 230 235 240Ala Asn Tyr Asn Ser Lys Tyr Ala Tyr Met Gly Gly Thr Ser Met Ala245 250 255Thr Pro Ile Val Ala Gly Asn Val Ala Gln Leu Arg Glu His Phe Ile260 265 270Lys Asn Arg Gly Ile Thr Pro Lys Pro Ser Leu Ile Lys Ala Ala Leu
275 280 285Ile Ala Gly Ala Thr Asp Val Gly Leu Gly Tyr Pro Ser Gly Asp Gln290 295 300Gly Trp Gly Arg Val Thr Leu Asp Lys Ser Leu Asn Val Ala Tyr Val305 310 315 320Asn Glu Ala Thr Ala Leu Ala Thr Gly Gln Lys Ala Thr Tyr Ser Phe325 330 335Gln Ala Gln Ala Gly Lys Pro Leu Lys Ile Ser Leu Val Trp Thr Asp340 345 350Ala Pro Gly Ser Thr Thr Ala Ser Tyr Thr Leu Val Asn Asp Leu Asp355 360 365Leu Val Ile Thr Ala Pro Asn Gly Gln Lys Tyr Val Gly Asn Asp Phe370 375 380Ser Tyr Pro Tyr Asp Asn Asn Trp Asp Gly Arg Asn Asn Val Glu Asn385 390 395 400Val Phe Ile Asn Ala Pro Gln Ser Gly Thr Tyr Ile Ile Glu Val Gln405 410 415Ala Tyr Asn Val Pro Ser Gly Pro Gln Arg Phe Ser Leu Ala Ile Val420 425 430His<210>3
<211>433<212>PRT<213>芽孢杆菌SD-521<220>
<221>肽<222>(1)..(433)<223>枯草杆菌酶SD-521<400>3Asn Asp Val Ala Arg Gly Ile Val Lys Ala Asp Val Ala Gln Asn Asn1 5 10 15Tyr Gly Leu Tyr Gly Gln Gly Gln Val Val Ala Val Ala Asp Thr Gly20 25 30Leu Asp Thr Gly Arg Asn Asp Ser Ser Met His Glu Ala Phe Arg Gly35 40 45Lys Ile Thr Ala Leu Tyr Ala Leu Gly Arg Thr Asn Asn Ala Asn Asp50 55 60Pro Asn Gly His Gly Thr His Val Ala Gly Ser Val Leu Gly Asn Ala65 70 75 80Leu Asn Lys Gly Met Ala Pro Gln Ala Asn Leu Val Phe Gln Ser Ile85 90 95Met Asp Ser Ser Gly Gly Leu Gly Gly Leu Pro Ser Asn Leu Asn Thr100 105 110Leu Phe Ser Gln Ala Trp Ash Ala Gly Ala Arg Ile His Thr Asn Ser115 120 125
Trp Gly Ala Pro Val Asn Gly Ala Tyr Thr Ala Asn Ser Arg Gln Val130 135 140Asp Glu Tyr Val Arg Asn Asn Asp Met Thr Val Leu Phe Ala Ala Gly145 150 155 160Asn Glu Gly Pro Asn Ser Gly Thr Ile Ser Ala Pro Gly Thr Ala Lys165 170 175Asn Ala Ile Thr Val Gly Ala Thr Glu Asn Tyr Arg Pro Ser Phe Gly180 185 190Ser Leu Ala Asp Asn Pro Asn His Ile Ala Gln Phe Ser Ser Arg Gly195 200 205Ala Thr Arg Asp Gly Arg Ile Lys Pro Asp Val Thr Ala Pro Gly Thr210 215 220Phe Ile Leu Ser Ala Arg Ser Ser Leu Ala Pro Asp Ser Ser Phe Trp225 230 235 240Ala Asn Tyr Asn Ser Lys Tyr Ala Tyr Met Gly Gly Thr Ser Met Ala245 250 255Thr Pro Ile Val Ala Gly Asn Val Ala Gln Leu Arg Glu His Phe Ile260 265 270Lys Asn Arg Gly Ile Thr Pro Lys Pro Ser Leu Ile Lys Ala Ala Leu275 280 285Ile Ala Gly Ala Thr Asp Val Gly Leu Gly Tyr Pro Ser Gly Asp Gln290 295 300
Gly Trp Gly Arg Val Thr Leu Asp Lys Ser Leu Asn Val Ala Tyr Val305 310 315 320Asn Glu Ala Thr Ala Leu Ala Thr Gly Gln Lys Ala Thr Tyr Ser Phe325 330 335Gln Ala Gln Ala Gly Lys Pro Leu Lys Ile Ser Leu Val Trp Thr Asp340 345 350Ala Pro Gly Ser Thr Thr Ala Ser Tyr Thr Leu Val Asn Asp Leu Asp355 360 365Leu Val Ile Thr Ala Pro Asn Gly Gln Lys Tyr Val Gly Asn Asp Phe370 375 380Ser Tyr Pro Tyr Asp Asn Asn Trp Asp Gly Arg Asn Asn Val Glu Asn385 390 395 400Val Phe Ile Asn Ala Pro Gln Ser Gly Thr Tyr Thr Ile Glu Val Gln405 410 415Ala Tyr Asn Val Pro Ser Gly Pro Gln Arg Phe Ser Leu Ala Ile Val420 425 430His<210>4<211>275<212>PRT<213>解淀粉芽孢杆菌<220>
<221>肽
<222>(1)..(275)<220>
<221>肽<222>(1)..(275)<223>枯草杆菌酶BPN’<400>4Ala Gln Ser Val Pro Tyr Gly Val Ser Gln Ile Lys Ala Pro Ala Leu1 5 10 15His Ser Gln Gly Tyr Thr Gly Ser Asn Val Lys Val Ala Val Ile Asp20 25 30Ser Gly Ile Asp Ser Ser His Pro Asp Leu Lys Val Ala Gly Gly Ala35 40 45Ser Met Val Pro Ser Glu Thr Asn Pro Phe Gln Asp Asn Asn Ser His50 55 60Gly Thr His Val Ala Gly Thr Val Ala Ala Leu Asn Asn Ser Ile Gly65 70 75 80Val Leu Gly Val Ala Pro Ser Ala Ser Leu Tyr Ala Val Lys Val Leu85 90 95Gly Ala Asp Gly Ser Gly Gln Tyr Ser Trp Ile Ile Asn Gly Ile Glu100 105 110Trp Ala Ile Ala Asn Asn Met Asp Val Ile Asn Met Ser Leu Gly Gly115 120 125Pro Ser Gly Ser Ala Ala Leu Lys Ala Ala Val Asp Lys Ala Val Ala130 135 140
Ser Gly Val Val Val Val Ala Ala Ala Gly Asn Glu Gly Thr Ser Gly145 150 155 160Ser Ser Ser Thr Val Gly Tyr Pro Gly Lys Tyr Pro Ser Val Ile Ala165 170 175Val Gly Ala Val Asp Ser Ser Asn Gln Arg Ala Ser Phe Ser Ser Val180 185 190Gly Pro Glu Leu Asp Val Met Ala Pro Gly Val Ser Ile Gln Ser Thr195 200 205Leu Pro Gly Asn Lys Tyr Gly Ala Tyr Asn Gly Thr Ser Met Ala Ser210 215 220Pro His Val Ala Gly Ala Ala Ala Leu Ile Leu Ser Lys His Pro Asn225 230 235 240Trp Thr Asn Thr Gln Val Arg Ser Ser Leu Glu Asn Thr Thr Thr Lys245 250 255Leu Gly Asp Ser Phe Tyr Tyr Gly Lys Gly Leu Ile Asn Val Gln Ala260 265 270Ala Ala Gln275<210>5<211>7<212>PRT<213>部分序列<220>
<221>肽<222>(1)..(7)<400>5Leu Asn Asn Ser Ile Gly Val1 5<210>6<211>3<212>PRT<213>部分序列<220>
<221>肽<222>(1)..(3)<400>6Ser Ser Asn1<210>7<211>311<212>PRT<213>芽孢杆菌TY145<220>
<221>肽<222>(1)..(311)<400>7Ala Val Pro Ser Thr Gln Thr Pro Trp Gly Ile Lys Ser Ile Tyr Asn1 5 10 15Asp Gln Ser Ile Thr Lys Thr Thr Gly Gly Ser Gly Ile Lys Val Ala20 25 30
Val Leu Asp Thr Gly Val Tyr Thr Ser His Leu Asp Leu Ala Gly Ser35 40 45Ala Glu Gln Cys Lys Asp Phe Thr Gln Ser Asn Pro Leu Val Asp Gly50 55 60Ser Cys Thr Asp Arg Gln Gly His Gly Thr His Val Ala Gly Thr Val65 70 75 80Leu Ala His Gly Gly Ser Asn Gly Gln Gly Val Tyr Gly Val Ala Pro85 90 95Gln Ala Lys Leu Trp Ala Tyr Lys Val Leu Gly Asp Asn Gly Ser Gly100 105 110Tyr Ser Asp Asp Ile Ala Ala Ala Ile Arg His Val Ala Asp Glu Ala115 120 125Ser Arg Thr Gly Ser Lys Val Val Ile Asn Met Ser Leu Gly Ser Ser130 135 140Ala Lys Asp Ser Leu Ile Ala Ser Ala Val Asp Tyr Ala Tyr Gly Lys145 150 155 160Gly Val Leu Ile Val Ala Ala Ala Gly Asn Ser Gly Ser Gly Ser Asn165 170 175Thr Ile Gly Phe Pro Gly Gly Leu Val Asn Ala Val Ala Val Ala Ala180 185 190Leu Glu Asn Val Gln Gln Asn Gly Thr Tyr Arg Val Ala Asp Phe Ser195 200 205
Ser Arg Gly Asn Pro Ala Thr Ala Gly Asp Tyr Ile Ile Gln Glu Arg210 215 220Asp Ile Glu Val Ser Ala Pro Gly Ala Ser Val Glu Ser Thr Trp Tyr225 230 235 240Thr Gly Gly Tyr Asn Thr Ile Ser Gly Thr Ser Met Ala Thr Pro His245 250 255Val Ala Gly Leu Ala Ala Lys Ile Trp Ser Ala Asn Thr Ser Leu Ser260 265 270His Ser Gln Leu Arg Thr Glu Leu Gln Asn Arg Ala Lys Val Tyr Asp275 280 285Ile Lys Gly Gly Ile Gly Ala Gly Thr Gly Asp Asp Tyr Ala Ser Gly290 295 300Phe Gly Tyr Pro Arg Val Lys305 310
权利要求
1.构建亲本枯草杆菌酶变体的方法，其中变体与所述亲本枯草杆菌酶相比具有至少一项改变的特性，其方法包括a)在评估与JP170三维结构相关的结构因素的基础上分析亲本枯草杆菌酶的三维结构，以鉴定出该枯草杆菌酶中与改变所述特性相关的至少一个氨基酸残基或至少一个结构区域；b)修饰编码该亲本的多核苷酸DNA，以构建编码变体枯草杆菌酶的多核苷酸，其变体与亲本枯草杆菌酶相比通过缺失、替换或插入修饰了a)中鉴定的氨基酸残基或结构部分以改变所述特性；c)在适当的宿主中表达变体枯草杆菌酶；并d)测试枯草杆菌酶变体的所述特性。
2.产生枯草杆菌酶变体的方法，其中变体与亲本枯草杆菌酶相比具有至少一项改变的特性，其方法包括a)在BPN’、TY145或JP170三维结构上产生亲本枯草杆菌酶的模型结构，或产生亲本枯草杆菌酶实际测定出的三维结构；b)通过使活性位点的CA、CB、C、O和N原子匹配的结构叠合，将亲本枯草杆菌酶的模型或实际三维结构与JP170结构进行比较；c)基于步骤b)的比较鉴定出亲本枯草杆菌酶的至少一个结构部分，其中预计该结构部分的改变将导致改变的特性；d)修饰编码亲本枯草杆菌酶的核酸序列以产生编码在相应于所述结构部分的位置至少一处缺失或替换一个或多个氨基酸或在相应于该结构部分位置编码至少一处插入一个或多个氨基酸残基的核酸序列；e)反复进行步骤c)和d)N次，其中N是值为1或更大的整数；f)制备从步骤a)-e)产生的变体；g)测试所述变体的特性；并h)任选地循环重复a)-g)；并i)选择与亲本枯草杆菌酶相比具有至少一项改变特性的枯草杆菌酶变体；j)在宿主细胞中表达修饰的核酸序列以产生变体枯草杆菌酶；k)分离产生的枯草杆菌酶变体；l)纯化分离的枯草杆菌酶变体；并m)回收纯化的枯草杆菌酶变体。
3.权利要求1或2的方法，其中亲本枯草杆菌酶属于I-S1亚组，优选选自ABSS168、BASBPN、BSSDY和BLSCAR，或它们保留了I-S1亚组特性的功能变体。
4.权利要求1或2的方法，其中亲本枯草杆菌酶属于I-S2亚组，优选选自BLS147、BLS309、BAPB92和BYSYAB，或它们保留了I-S2亚组特性的功能变体。
5.权利要求1或2的方法，其中亲本枯草杆菌酶属于TY145型亚组，优选选自TY145、S39和S41。
6.权利要求1或2的方法，其中亲本枯草杆菌酶属于JP170型亚组，优选选自JP170、蛋白酶KP43、KP1790、KP9860、蛋白酶Ya、蛋白酶E-1和SD-521。
7.权利要求6的方法，其中建模的亲本JP170枯草杆菌酶与SEQ IDNO1有至少58％的同源性，优选与SEQ ID NO1序列至少有60％的同源性，更优选至少65％、更优选至少70％、更优选至少75％、更优选至少80％、更优选至少85％、更优选至少90％、更优选至少91％、更优选至少92％、更优选至少93％、更优选至少94％、更优选至少95％、更优选至少96％、更优选至少97％、更优选至少98％或甚至更优选至少99％的同源性。
8.根据权利要求6或7的方法，其中亲本JP170枯草杆菌酶为与SEQID NO1序列具有至少58％同源性的JP170样枯草杆菌酶，其含有全部的枯草菌素折叠方式和如下结构特征a)具有7条链的扭曲的β片层，b)6个α螺旋，c)至少3个离子结合位点，并且不合有BPN’样枯草杆菌酶的强和弱离子结合位点，其中所述3个离子结合位点在枯草杆菌酶三维结构中的位置通过与枯草杆菌酶三个活性位点的氨基酸残基，即丝氨酸、组氨酸和天冬氨酸残基的c-α原子以及紧靠活性位点丝氨酸残基(紧靠丝氨酸)的氨基酸残基c-α原子之间的距离限定，其中a)离子结合位点1与i)天冬氨酸c-α原子间的距离为26.70-28.70_，ii)组氨酸c-α原子间的距离为22.10-24.10_，iii)丝氨酸c-α原子间的距离为16.95-18.95_，iv)紧靠丝氨酸c-α原子间的距离为15.30-17.30_，b)离子结合位点2与i)天冬氨酸c-α原子间的距离为33.50-35.50_，ii)组氨酸c-α原子间的距离为37-39_，iii)丝氨酸c-α原子间的距离为29.40-31.40_，iv)紧靠丝氨酸c-α原子间的距离为30.70-32.70_，c)离子结合位点3与i)天冬氨酸c-α原子间的距离为41.50-43.50_，ii)组氨酸c-α原子间的距离为42.90-44.90_，iii)丝氨酸c-α原子间的距离为34.50-36.50_，iv)紧靠丝氨酸c-α原子间的距离为35-37_。
9.权利要求1或2的用于产生JP170型枯草杆菌酶变体的方法，其中变体与亲本枯草杆菌酶相比具有至少一项改变的特性，其方法包括a)在JP170三维结构上产生亲本JP170型枯草杆菌酶的模型结构，或产生该亲本枯草杆菌酶实际测定出的三维结构；b)通过使活性位点的CA、CB、C、O和N原子匹配的结构叠合，将该亲本JP170型枯草杆菌酶的模型或实际三维结构与BPN’或TY145结构进行比较；c)基于步骤b)的比较鉴定出亲本JP170型枯草杆菌酶的至少一个结构部分，其中预计该结构部分的改变将导致改变的特性；d)修饰编码亲本JP170型枯草杆菌酶的核酸序列以产生编码相应于在所述结构部分的位置至少一处缺失或替换一个或多个氨基酸或在相应于该结构部分的位置至少一处插入一个或多个氨基酸残基的核酸序列；e)反复进行步骤c)和d)N次，其中N是值为1或更大的整数；f)制备从步骤a)-e)产生的JP170型枯草杆菌酶变体；g)测试所述变体的特性；并h)任选地循环重复a)-g)；并i)选择与亲本枯草杆菌酶相比具有至少一项改变特性的JP170型枯草杆菌酶变体；j)在宿主细胞中表达修饰的核酸序列以产生变体枯草杆菌酶；k)分离产生的JP170型枯草杆菌酶变体；l)纯化分离的枯草杆菌酶变体；并m)回收纯化的枯草杆菌酶变体。
10.权利要求9的方法，其中步骤(c)鉴定出位于JP170型亲本的离子结合位点10_或更短距离内的氨基酸残基位置，优选位于6_或更短距离内的位置。
11.权利要求9的方法，其中步骤(c)鉴定出JP170型亲本中的氨基酸残基位置，通过修饰至少一个鉴定出的位置而去除离子结合位点。
12.权利要求9的方法，其中步骤(c)鉴定出JP170型亲本高活动区中的氨基酸残基位置。
13.权利要求9的方法，其中步骤(c)鉴定出JP170型亲本活动区中的氨基酸残基位置。
14.权利要求9的方法，其中步骤(c)鉴定出JP170型亲本中的氨基酸残基位置，通过至少一个半胱氨酸的插入或替代，该位置的修饰可产生至少一个二硫键。
15.权利要求9的方法，其中步骤(c)和(d)提供具有修饰的表面电荷分布的亲本JP170型变体的构建，其修饰通过c’)在亲本JP170型的表面鉴定出至少一个带电荷的氨基酸残基；d’)通过缺失或用不带电荷的氨基酸残基替换而修饰步骤(a)鉴定出的带电荷的氨基酸残基。
16.权利要求9的方法，其中步骤(c)和(d)提供具有修饰的表面电荷分布的亲本JP170型变体的构建，其修饰通过c”)在亲本JP170型的表面鉴定出至少一个被不带电荷的氨基酸残基占据的位置；d”)通过用带电荷的氨基酸残基替代不带电荷的氨基酸残基或在该位置插入带电荷的氨基酸残基而修饰该位置的电荷。
17.权利要求9的方法，其中步骤(c)和(d)提供具有修饰的表面电荷分布的亲本JP170型变体的构建，其修饰通过c_)在亲本JP170型的表面鉴定出至少一个带电荷的氨基酸残基；d_)用带相反电荷的氨基酸残基替代步骤(a)鉴定出的带电荷的氨基酸残基。
18.权利要求9的方法，其中步骤(c)鉴定出亲本JP170型中的氨基酸残基位置，将该位置修饰为脯氨酸可以产生表现出提高的稳定性的JP170型变体。
19.权利要求9的方法，其中步骤(c)鉴定出亲本JP170型中与活性位点距离小于10_的氨基酸残基位置。
20.权利要求9-19中一项或多项的方法，其中步骤(e)中的N为1与50、45、40、35、30、25、20、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3或2之间的整数。
21.含有至少一个氨基酸残基的修饰的JP170型枯草杆菌酶变体，所述残基位于离子结合位点10_或更短距离内的位置上，优选位于6_或更短距离内的位置。
22.权利要求21的变体，其中修饰发生在至少一个以下位置a)离子结合位点1183、184、185、186、187、188、189、191、193、195、196、197、198、199、200、201、202、203、224和225，b)离子结合位点2378、379、380、381、382、383、384、385、386、387、388、389、390、391、392和393，c)离子结合位点3348、350、352、363、364、365、366、367、369、370、380、381、382、383、391、392、393、394、395、396、397、398、399、400、414、415、416、417、418、419、420，优选的修饰为S193Q、Y；H200D、N；H200D、N+D196N；N390D；N391D；G394N、Q、F、Y、S和W392S、N、Q。
23.JP170型枯草杆菌酶变体，其被引入相应于BPN’样家族枯草杆菌酶强离子结合位点的离子结合位点，该变体部分或全部缺失了SEQ IDNO1的区域N79-N82，并随后插入了一个或多个氨基酸残基，优选插入序列LNNSIQV(SEQ ID NO5)并随之进行A45D、N替换和任选地E44P、T和/或R47Q替换。
24.去除了一个或多个离子结合位点的JP170型枯草杆菌酶变体，其中所述变体部分或全部缺失了SEQ ID NO1的区域N186-N199，并随后插入了一个或多个氨基酸，优选插入序列SSN(SEQ ID NO6)，并优选另外含有I7Q和V3Y替换中的一个或二者。
25.去除了离子结合位点的BPN’型枯草杆菌酶变体，其中所述变体a)部分或全部缺失了区域A194-L196(BPN’中的Savinase编号)或另一BPN’样枯草杆菌酶中的相应区域并插入三个或更多氨基酸残基，优选插入来自JP170的P209-P217或另一JP170样枯草杆菌酶中的相应区域，并部分或全部缺失了区域L75-L82(BPN’中的Savinase编号)或所述其它BPN’样枯草杆菌酶中的相应区域并插入一个或多个氨基酸残基，优选插入来自TY145的H83-Y92或另一TY145样枯草杆菌酶中的相应区域，或b)部分或全部缺失了区域A194-L196(BPN’中的Savinase编号)或另一BPN’样枯草杆菌酶中的相应区域并插入三个或更多氨基酸残基，优选插入来自JP170的P209-P217或另一JP170样枯草杆菌酶中的相应区域，并部分或全部缺失了L75-L82(BPN’中的Savinase编号)或所述其它BPN’样枯草杆菌酶中的相应区域并插入一个或多个氨基酸残基，优选插入来自JP170的N79-K83或另一TY145样枯草杆菌酶中的相应位置。
26.含有选自以下位置的至少一个修饰的JP170型枯草杆菌酶变体13、14、15、16、17、18、37、38、39、40、41、42、43、47、48、49、50、58、59、60、67、96、97、98、99、107、108、109、110、111、131、132、133、134、152、153、163、164、165、166、188、189、190、191、193、195、210、234、235、236、237、238、239、240、241、242、243、244、245、326、327、328、329、330、331、332、337、338、339、340、342、355、356、357、359、360、372、373、374、375、376、377、378、384、385、387、388、389、390、391、392、404、405、406、407、408、409、410、411和419。
27.根据权利要求26的枯草杆菌酶变体，所述变体含有一个或多个以下修饰W240H、Y；G355A、S；S356T、N；T357N、Q、D、E、P；A359S、T、N、Q或S360T、N。
28.在一个或多个位置含有改变的变体枯草杆菌酶，所述位置与结合到JP170活性位点的C12抑制剂距离为10_以内，其中如SEQ ID NO1中指出的位置为
29.30、31、32、64、67、68、69、70、71、72、93、96、97、98、107、108、109、110、113、114、127、128、129、130、131、132、133、134、136、138、139、140、141、144、157、174、180、181、182、183、191、193、202、203、205、206、207、211、223、224、225、226、234、235、236、237、238、239、240、241、249、250、251、252、253、254、257、258，优选含有替换W129L。
29.JP170样枯草杆菌酶变体，其含有通过一个或多个以下修饰引入的一个或多个二硫键G21C+A86C、V26C+A265C、G57C+G105C、G74C+A229C、Q111C+N143C、G160C+S170C、A286C+V349C、A27C+A122C、A45C+G78C、V72C+P258C、G78C+A229C、D98C+G104C、Q111C+Y147C、G135C+G167C、R142C+P354C、V144C+A178C、G182C+P217C、A183C+G223C、A195C+Y225C、F271C+P279C、A287C+A430C、A293C+T310C、E322C+S428C、S324C+A332C、S327C+P424C、D352C+N397C、G355C+T362C、G291C+S314C，优选一个或多个以下替换G21C+A86C、V26C+A265C、G57C+G105C、G74C+A229C、Q111C+Y143C、G160C+S170C、A286C+V349C、A4C+P222C和A27C+A117C，其中位置对应于SEQ ID NO1中的位置。
30.JP170型枯草杆菌酶变体，其含有N79、N316、L381、K9和K313中一个或多个位置上的改变，优选含有SEQ ID NO1的替换N79D、N316D、L381D、K9R和K313R中的一个或多个。
31.JP170型枯草杆菌酶变体，其含有22、44、110、139、140、166、198、201、203、231、282、356、357和378中一个或多个位置上的改变，优选含有替换Q22P、E44P、L110P、T139P、D140P、S166P、I198P、V201P、Q203P、S231P、S282P、S356P、T357P和K378P中的一个或多个。
32.含有区域311-433中的缺失的JP170样枯草杆菌酶变体，优选缺失位置317-433或315-433，另外含有替换L283N、Q；A290S、N和W306H、Y、K中的一个或多个。
33.分离的核酸序列，其含有编码权利要求21-32中任一项定义或产生的枯草杆菌酶变体的核酸序列。
34.权利要求33的分离的核酸序列，其中核酸序列选自a)编码与SEQ ID NO1所示氨基酸序列具有至少58％同源性的酶的核酸序列，和b)和编码与SEQ ID NO1所示氨基酸序列具有至少58％同源性的酶的核酸序列的互补链在低严格条件下、优选在中度严格条件下、特别是在高严格条件下杂交的核酸序列，或c)a)或b)任一项的至少100个核苷酸的亚序列。
35.分离的核酸构建体，其含有如权利要求33或34中任一项所定义的核酸序列，所述核酸序列与一个或多个能指导多肽在合适的表达宿主中表达的控制序列有效连接。
36.含有权利要求35的核酸构建体的重组宿主细胞。
37.产生权利要求21-32中任一项所定义的变体的方法，该方法包括a)在有助于枯草杆菌酶变体产生的条件下培养权利要求36的重组宿主细胞；并b)回收变体。
38.洗涤剂组合物，其含有权利要求21-32中任一项的JP170型枯草杆菌酶变体或BPN’型枯草杆菌酶变体。
39.权利要求21-32中任一项的JP170型枯草杆菌酶变体或BPN’型枯草杆菌酶变体在清洁或洗涤应用中的用途。
全文摘要
本发明涉及产生亲本JP170枯草杆菌酶变体和亲本BPN’枯草杆菌酶变体的方法，并涉及与亲本JP170/BPN’枯草杆菌酶相比具有改变的特性的JP170和BPN’变体。
文档编号C12N15/57GK1791672SQ200480013516
公开日2006年6月21日 申请日期2004年3月22日 优先权日2003年3月21日
发明者A·斯文森, S·米宁 申请人:诺和酶股份有限公司