一种长牡蛎engrailed2启动子及其重组表达载体及应用的制作方法

文档序号:14357049阅读:408来源:国知局
本发明涉及分子生物学技术,具体的说是一种长牡蛎engrailed2启动子及其重组表达载体及应用。
背景技术
:在软体动物早期发育研究中,目前尚无可用的启动子。软体动物engrailed为具有homedomain的转录因子,在神经系统及贝壳的发育过程中起重要作用。engrailed启动子可以在贝类幼虫中驱动报告基因的表达,为软体动物的发育研究提供便利。技术实现要素:本发明的目的在于提供一种长牡蛎engrailed2启动子及其重组表达载体及应用。为实现上述目的,本发明采用技术方案为:一种长牡蛎engrailed2启动子,启动子为seqidno.1所示的碱基序列。所述启动子为与seqidno.1所示的碱基序列具有80%或80%以上同源性的碱基序列,且具有启动子功能。一种长牡蛎engrailed2启动子的应用,所述启动子在制备重组表达载体中的应用。一种长牡蛎engrailed2启动子的应用,所述启动子在贝类幼虫中启动目的基因表达。所述目的基因为可在细胞中转录或翻译的功能基因或rna序列,如编码蛋白的各种功能基因(如egfp)、反义rna或其它具有调节功能的长rna序列(如lnrna),在本例应用中是egfp。含所述的长牡蛎engrailed2启动子的重组表达载体。一种含长牡蛎engrailed2启动子的重组表达载体的应用,所述重组表达载体在贝类幼虫中启动目的基因表达中的应用。本发明所具有的优点:通过注射重组表达载体,启动目的基因,实现目的基因在贝类幼虫中的表达。附图说明图1为本发明实施例提供的pegfp-1质粒示意图。图2为本发明实施例提供的pegfp-1质粒中的多克隆位点图。图3为本发明实施例提供的注射重组载体的笠贝早期幼虫中engrailed2启动子驱动gfp表达的结果图,其中,绿色荧光出现在幼虫中。具体实施方式下面结合附图和实施例对本发明做进一步解释说明。实施例1启动子扩增:使用海洋动物组织基因组dna提取试剂盒(tiangen,目录号:dp324)提取长牡蛎(crassostreagigas)基因组dna,根据长牡蛎基因组数据库(http://www.oysterdb.com)设计长牡蛎基因启动子特异性引物。(上游引物cgeng2pmf,加16碱基的载体pegfp-1同源末端1,下游引物cgeng2pmr,加16碱基的载体pegfp-1同源末端2)以上述提取的长牡蛎的gdna为模板,使用premixtaqtm(lataqtmversion2.0)(takara,目录号:rr900q)聚合酶进行pcr扩增。如表1所示。表1基因启动子扩增的pcr体系组成体积premixtaq(lataqversion2.0)25μldna模板2μl上游引物cgeng2pmf(10μm)2μl下游引物cgeng2pmr(10μm)2μl超纯水19μlpcr扩增程序为:98℃预变性2min;98℃变性20s,58℃退火20s,72℃延伸2min30s,进行35个反应循环;72℃延伸7min。上游引物cgeng2pmf:cgcgggcccgggatcccgtgtaaaaggttcggacg,其中下划线代表16碱基的载体pegfp-1同源末端1;下游引物cgeng2pmr:ggcgaccggtggatccgtattttaaagataaacaaagatttc,其中下划线代表16碱基的载体pegfp-1同源末端2。pcr扩增产物经1.0%琼脂糖凝胶电泳分离,得到大小为2000bp左右的条带,使用thermoscientific的genejetgelextractionkit(目录号:k0692)进行纯化回收,即得cgeng2启动子碱基序列如序列表1所示。实施例2cgeng2::gfp重组载体构建:将pegfp-1质粒(中国科学院海洋研究所张晓军提供,该质粒还可从优宝生物(http://www.youbio.cn/)订购,货号:vt1106,其碱基序列如序列2中所示)用bamhi酶切线性化,将如上述得到的pcr回收产物cgeng2启动与线性化的pegfp-1进行in-fusion连接(in-fusionhdcloningkit,takara,目录号:638909),转化大肠杆菌,挑取阳性转化子测序(如cgeng2启动子序列所示),证明准确,具体为:in-fusion连接体系:组成体积pcr回收产物(cgeng2启动子)1.5μl超纯水3.5μl线性化pegfp-13μlinfusionmix2μl总体积10μl将上述记载的两片段按照上述表中记载的连接体系混合,50℃水浴中连接15min,经过连接后用感受态细胞dh5α进行转化。取出-80℃保存感大肠杆菌受态,立即静置于冰中;将适量体积的待转化dna(每100μl感受态加入50ngdna,体积不要超过感受态细胞体积的5%)与感受态轻轻混匀,冰上静置20min;42℃热激90s,然后冰上放置2-3min。加入900μl的lb液体培养基(不含抗生素),37℃150rpm振荡培养1-1.5h;5000rpm离心3min,弃上清,用100μllb液体培养基重悬浮菌体。将重悬液涂于卡那霉素抗性lb平板上,37℃倒置培养12-20h。选取单菌落,进行菌落pcr鉴定。空载质粒的产物大小约为100bp,重组载体产物长度约为2100bp。鉴定用引物:pegfp-1-f,cgagctcaagcttcgaattctg;pegfp-1-r,cgccgtccagctcgaccag。获得含有pegfp-1+cgeng2表达载体的重组大肠杆菌,命名为cgeng2::gfp(参见图1)。对cgeng2::gfp表达载体中的cgeng2启动子进行测序,测序结果如cgeng2启动子所示。测序结果表明,获得的cgeng2::gfp重组表达载体中cgeng2启动子序列正确。用无内毒素质粒小提中量试剂盒(目录号:dp118-02)从大肠杆菌cgeng2::gfp中提取重组载体cgeng2::gfp。实施例3软体动物面盘幼虫中gfp的表达将提取的重组载体cgeng2::gfp配置成注射液:重组载体50ng/ul,酚红0.05%。将性成熟的笠贝放入70ml新鲜海水的培养杯中(每杯一只),待其产卵排精后,分别收集精子和卵细胞。将收集的卵细胞转入盛有5ml新鲜海水的培养皿中,放置于解剖镜下。将显微注射仪(warner,目录号:pli-100a)输入气压维持在200pa。用microloader(eppendorf,目录号:5242956003)吸取0.5ul注射液注入注射针femtotipii(eppendorf,目录号:5242957000),将注射针连接于注射仪。设置注射参数:输入气压200pa,平衡气压3pa,注射压力15pa,注射时间0.08s。注射体积依据酚红颜色指示,不超过卵体积的5%。将注射后的卵转移至12孔培养板,加入5ml新鲜海水,按体积5%的比例加入备好的精子,室温受精一小时后将精子洗脱,重新加入5ml新鲜海水。培养20hpf后检测重组载体的的表达情况,拍照记录(参见图3)。由图3可见注射重组载体的笠贝早期幼虫gfp表达(绿色荧光),证明该重组载体可以在贝类幼虫中启动目的基因表达。engrailed2启动子序列:该启动子名称cgiengrailed2,或简称cgeng2启动子cgtgtaaaaggttcggacgctcttgttattaattatttactaatcaacaaaactttaatgaaaggttaattttatgctttgtataacatgccgttaaaaacagatacgggcattgtttacaacatatcacgcattgctatctaaacaaaggtctcgtgtcaacatgtggcaaagatggaatatagattttatcttaaatgtttgtttaaacacttttgatatcctacggtaatagtaaacagttaggtaatcctttaacatcttgttaattttggcagattgttccggaaggtgtgaaaaggattttcgttaaattttaatgctcccctaatttttttggttagttttttgttagttttttttttctcttcacaactttaatgctcatacacggaggaaacatgcacatgcatccattggtttgaattaatttcatcgtaatatattacaatgggattggaacaagttctaaatcttatgtagctctctcctcatacaataactgacatcaaaaatgttcgcatgtaaatgagatatattcactattaaagctttcttaaaaaatgtaaattaattacattaaagattcaaaatgaaatattctatattcttaaaaatagaacataaaaacttctgaattaatgtaaggaaaaaatgtaacaactttataaaatcaggttatattcacttgcatctgacaacatacaaacagaatatgtccatgtgtggtagcattatgtttggtatgagtatatgattgataaaaacgagagaagtcaaagaagtgggtctaaaaattcaaagacatgggcaagtatattgtttcccctttgctaaatacttgatgtgttgcaaacaaaaatgacattgacttttcccacacaagatttgtgcaagttaattgccatagctttagatggaatatgatattgcaaaatattataattgatatttctctgcgcgtggctcagtttacaaaatttaaaaaaaaaataaagtgcaaccttgtttagataacagggaggtcgacggaatctctttttgacaactaatattttgcgagagtgttaatttaaattggatttcaatgtcattaatcatgatctgccagttttatgaaatgaaaatacaagtacttcagttctatttgtaaattaacgtattaattttgatatccattaagggtattcattggaagttaatataaagctattcatcgctaatacagagttattagcaaaatactgacgatatgagaatcttttgtgaacacatgagaaaaattttagtcaaagccgcagattatttaaagtctttgatatttagttaatatgaccaatgcccatgtcatatttccattttacatacaaagtaaaagttcttatataatttgtttatctcacttttttctctccatttgtcaaagtcataaataaataaatcaaagaagcctgaaattgcactgttttaatgttaggtgaggtaacggaacccataaaacttccagtttgtattttcttcctacttccgcataatggcgattacccgggatattgtaccgggctaatatctagcgtaatgatgtgaagtgatcaatcaaatgtgtgccaaacacgaatcgatgattgtttacaaagtgttaacaccattgtcattacaactcgctacggacccaatgccatcttctcttcctgcgggcatgcttcatcaacagagtcttttggacgcttcaagtcccgcccactttcttgttaaaccccgcctttatctcacttggtttccataagaacgtacgaatttcgagtacatctttataccacttgaatgctaattcaaggtcaatagaatagcattgtgaacaagcttttaaaattttttaattcatttctaacagaaatctttgtttatctttaaaatacpegfp-1载体序列:tagttattactagcgctaccggactcagatctcgagctcaagcttcgaattctgcagtcgacggtaccgcgggcccgggatccaccggtcgccaccatggtgagcaagggcgaggagctgttcaccggggtggtgcccatcctggtcgagctggacggcgacgtaaacggccacaagttcagcgtgtccggcgagggcgagggcgatgccacctacggcaagctgaccctgaagttcatctgcaccaccggcaagctgcccgtgccctggcccaccctcgtgaccaccctgacctacggcgtgcagtgcttcagccgctaccccgaccacatgaagcagcacgacttcttcaagtccgccatgcccgaaggctacgtccaggagcgcaccatcttcttcaaggacgacggcaactacaagacccgcgccgaggtgaagttcgagggcgacaccctggtgaaccgcatcgagctgaagggcatcgacttcaaggaggacggcaacatcctggggcacaagctggagtacaactacaacagccacaacgtctatatcatggccgacaagcagaagaacggcatcaaggtgaacttcaagatccgccacaacatcgaggacggcagcgtgcagctcgccgaccactaccagcagaacacccccatcggcgacggccccgtgctgctgcccgacaaccactacctgagcacccagtccgccctgagcaaagaccccaacgagaagcgcgatcacatggtcctgctggagttcgtgaccgccgccgggatcactctcggcatggacgagctgtacaagtaaagcggccgcgactctagatcataatcagccataccacatttgtagaggttttacttgctttaaaaaacctcccacacctccccctgaacctgaaacataaaatgaatgcaattgttgttgttaacttgtttattgcagcttataatggttacaaataaagcaatagcatcacaaatttcacaaataaagcatttttttcactgcattctagttgtggtttgtccaaactcatcaatgtatcttaaggcgtaaattgtaagcgttaatattttgttaaaattcgcgttaaatttttgttaaatcagctcattttttaaccaataggccgaaatcggcaaaatcccttataaatcaaaagaatagaccgagatagggttgagtgttgttccagtttggaacaagagtccactattaaagaacgtggactccaacgtcaaagggcgaaaaaccgtctatcagggcgatggcccactacgtgaaccatcaccctaatcaagttttttggggtcgaggtgccgtaaagcactaaatcggaaccctaaagggagcccccgatttagagcttgacggggaaagccggcgaacgtggcgagaaaggaagggaagaaagcgaaaggagcgggcgctagggcgctggcaagtgtagcggtcacgctgcgcgtaaccaccacacccgccgcgcttaatgcgccgctacagggcgcgtcaggtggcacttttcggggaaatgtgcgcggaacccctatttgtttatttttctaaatacattcaaatatgtatccgctcatgagacaataaccctgataaatgcttcaataatattgaaaaaggaagagtcctgaggcggaaagaaccagctgtggaatgtgtgtcagttagggtgtggaaagtccccaggctccccagcaggcagaagtatgcaaagcatgcatctcaattagtcagcaaccaggtgtggaaagtccccaggctccccagcaggcagaagtatgcaaagcatgcatctcaattagtcagcaaccatagtcccgcccctaactccgcccatcccgcccctaactccgcccagttccgcccattctccgccccatggctgactaattttttttatttatgcagaggccgaggccgcctcggcctctgagctattccagaagtagtgaggaggcttttttggaggcctaggcttttgcaaagatcgatcaagagacaggatgaggatcgtttcgcatgattgaacaagatggattgcacgcaggttctccggccgcttgggtggagaggctattcggctatgactgggcacaacagacaatcggctgctctgatgccgccgtgttccggctgtcagcgcaggggcgcccggttctttttgtcaagaccgacctgtccggtgccctgaatgaactgcaagacgaggcagcgcggctatcgtggctggccacgacgggcgttccttgcgcagctgtgctcgacgttgtcactgaagcgggaagggactggctgctattgggcgaagtgccggggcaggatctcctgtcatctcaccttgctcctgccgagaaagtatccatcatggctgatgcaatgcggcggctgcatacgcttgatccggctacctgcccattcgaccaccaagcgaaacatcgcatcgagcgagcacgtactcggatggaagccggtcttgtcgatcaggatgatctggacgaagagcatcaggggctcgcgccagccgaactgttcgccaggctcaaggcgagcatgcccgacggcgaggatctcgtcgtgacccatggcgatgcctgcttgccgaatatcatggtggaaaatggccgcttttctggattcatcgactgtggccggctgggtgtggcggaccgctatcaggacatagcgttggctacccgtgatattgctgaagagcttggcggcgaatgggctgaccgcttcctcgtgctttacggtatcgccgctcccgattcgcagcgcatcgccttctatcgccttcttgacgagttcttctgagcgggactctggggttcgaaatgaccgaccaagcgacgcccaacctgccatcacgagatttcgattccaccgccgccttctatgaaaggttgggcttcggaatcgttttccgggacgccggctggatgatcctccagcgcggggatctcatgctggagttcttcgcccaccctagggggaggctaactgaaacacggaaggagacaataccggaaggaacccgcgctatgacggcaataaaaagacagaataaaacgcacggtgttgggtcgtttgttcataaacgcggggttcggtcccagggctggcactctgtcgataccccaccgagaccccattggggccaatacgcccgcgtttcttccttttccccaccccaccccccaagttcgggtgaaggcccagggctcgcagccaacgtcggggcggcaggccctgccatagcctcaggttactcatatatactttagattgatttaaaacttcatttttaatttaaaaggatctaggtgaagatcctttttgataatctcatgaccaaaatcccttaacgtgagttttcgttccactgagcgtcagaccccgtagaaaagatcaaaggatcttcttgagatcctttttttctgcgcgtaatctgctgcttgcaaacaaaaaaaccaccgctaccagcggtggtttgtttgccggatcaagagctaccaactctttttccgaaggtaactggcttcagcagagcgcagataccaaatactgtccttctagtgtagccgtagttaggccaccacttcaagaactctgtagcaccgcctacatacctcgctctgctaatcctgttaccagtggctgctgccagtggcgataagtcgtgtcttaccgggttggactcaagacgatagttaccggataaggcgcagcggtcgggctgaacggggggttcgtgcacacagcccagcttggagcgaacgacctacaccgaactgagatacctacagcgtgagctatgagaaagcgccacgcttcccgaagggagaaaggcggacaggtatccggtaagcggcagggtcggaacaggagagcgcacgagggagcttccagggggaaacgcctggtatctttatagtcctgtcgggtttcgccacctctgacttgagcgtcgatttttgtgatgctcgtcaggggggcggagcctatggaaaaacgccagcaacgcggcctttttacggttcctggccttttgctggccttttgctcacatgttctttcctgcgttatcccctgattctgtggataaccgtattaccgccatgcat。序列表<110>中国科学院海洋研究所<120>一种长牡蛎engrailed2启动子及其重组表达载体及应用<160>2<170>siposequencelisting1.0<210>1<211>1919<212>dna<213>cgeng2启动子(cgiengrailed2)<400>1cgtgtaaaaggttcggacgctcttgttattaattatttactaatcaacaaaactttaatg60aaaggttaattttatgctttgtataacatgccgttaaaaacagatacgggcattgtttac120aacatatcacgcattgctatctaaacaaaggtctcgtgtcaacatgtggcaaagatggaa180tatagattttatcttaaatgtttgtttaaacacttttgatatcctacggtaatagtaaac240agttaggtaatcctttaacatcttgttaattttggcagattgttccggaaggtgtgaaaa300ggattttcgttaaattttaatgctcccctaatttttttggttagttttttgttagttttt360tttttctcttcacaactttaatgctcatacacggaggaaacatgcacatgcatccattgg420tttgaattaatttcatcgtaatatattacaatgggattggaacaagttctaaatcttatg480tagctctctcctcatacaataactgacatcaaaaatgttcgcatgtaaatgagatatatt540cactattaaagctttcttaaaaaatgtaaattaattacattaaagattcaaaatgaaata600ttctatattcttaaaaatagaacataaaaacttctgaattaatgtaaggaaaaaatgtaa660caactttataaaatcaggttatattcacttgcatctgacaacatacaaacagaatatgtc720catgtgtggtagcattatgtttggtatgagtatatg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