NO :1 至 916, 209 或 916, 626 至 934, 931列出的核苷酸序列。这些序列在此通过前面加上"B"的序列标识符来提及。因 此，通过引用从国际专利申请PCT/US 2011/65939结合的核苷酸序列组被称为"序列Bl至 B916,209 或 B916, 626 至 B934, 931"。
[0030] 在一些实施例中，该PRC2相关区具有选自序列Al至A193, 049, Bl至B916, 209以 及B916, 626至B934, 931的核苷酸序列。
[0031] 在一些实施例中，该PRC2相关区具有选自SEQ ID NO :1至1212的核苷酸序列。
[0032] 该寡核苷酸可以为任何长度。在一些实施例中，该寡核苷酸的长度高达100、50、 40、30或20个核苷酸。在其他实施例中，该寡核苷酸的长度为8至30个核苷酸。在仍然 其他实施例中，该寡核苷酸的长度为8至10个核苷酸，并且该PRC2相关区的互补序列中除 1、2或3个核苷酸之外的所有都为胞嘧啶或鸟苷核苷酸。
[0033] 在一些实施例中，该PRC2相关区的该至少8个连续核苷酸处在包含该靶基因的反 义链的染色体的链上，并且在其他实施例中处在包含该靶基因的有义链的染色体的链上。
[0034] 在一些实施例中，该PRC2相关区处在该靶基因的5'端的上游，并且在其他实施 例中，该PRC2相关区处在该靶基因的3'端的下游。任选地，该PRC2相关区可以在该靶 基因的内含子或外显子内，或者该PRC2相关区可以横跨该靶基因的内含子-外显子接点、 5' -UTR-外显子接点或3' -UTR-外显子接点。
[0035] 该PRC2相关区可以编码形成包含至少两个单链环的二级结构的RNA。任选地，该 二级结构包含该至少两个单链环之间的双链茎。在一些实施例中，该PRC2相关区的该至少 8个连续核苷酸编码至少一个环或至少两个环的至少一部分或该双链茎的至少一部分。
[0036] 在一些实施例中，与不具有至少一个核苷酸类似物的寡核苷酸相比较，该至少一 个核苷酸类似物导致该寡核苷酸的^在1°C至5°C的范围内的升高。
[0037] 在一些实施例中，该寡核苷酸的至少一个核苷酸包含核苷酸类似物。在其他实施 例中，该寡核苷酸的每个核苷酸包含核苷酸类似物。例如，该核苷酸类似物可以为2' O-甲 基或桥连核苷酸。在其他实施例中，该寡核苷酸包含至少一个核糖核苷酸、至少一个脱氧核 糖核苷酸或至少一个桥连核苷酸。该桥连核苷酸可以为例如LNA核苷酸、cEt核苷酸或ENA 核苷酸类似物。任选地，该寡核苷酸的每个核苷酸为LNA核苷酸。
[0038] 在一些实施例中，该寡核苷酸的核苷酸包含交替的核苷酸类型。例如，在一些实施 例中，该寡核苷酸包含脱氧核糖核苷酸以及2 ' -氟-脱氧核糖核苷酸。在其他实施例中，该 寡核苷酸的核苷酸包含交替的脱氧核糖核苷酸与2' -0-甲基核苷酸。在仍然其他实施例 中，该寡核苷酸的核苷酸包含交替的脱氧核糖核苷酸与ENA核苷酸类似物或者该寡核苷酸 的核苷酸包含交替的脱氧核糖核苷酸与LNA核苷酸。在仍然其他实施例中，该寡核苷酸的 核苷酸包含交替的LNA核苷酸与2' -0-甲基核苷酸。
[0039] 该寡核苷酸的5'核苷酸可以具有不同的特性。例如，在一些实施例中，该寡核苷 酸的5'核苷酸为脱氧核糖核苷酸或LNA核苷酸。
[0040] 在一些实施例中，该寡核苷酸的核苷酸包含通过脱氧核糖核苷酸的5'端和3'端 中的每一个上的至少一个LNA核苷酸侧接的脱氧核糖核苷酸。
[0041] 该单链寡核苷酸还可以包括至少两个核苷酸之间或所有核苷酸之间的硫代磷酸 酯核苷酸间键。
[0042] 在一些实施例中，该寡核苷酸的3'位置处的核苷酸具有3'羟基。在其他实施例 中，该寡核苷酸的3'位置处的核苷酸具有3'硫代磷酸酯。
[0043] 任选地，该单链寡核苷酸具有缀合至5'或3'核苷酸的生物素部分。在一些实施 例中，该单链寡核苷酸具有5'核苷酸或3'核苷酸或两者上的以下缀合物中的一种或多种： 胆固醇、维生素 A、叶酸、〇受体配体、适体、肽、如CPP、疏水性分子如脂质、ASGPR或动态多 聚缀合物以及其变体。
[0044] 在另一个方面提供了组合物。该组合物为在此描述的单链寡核苷酸以及载体、缓 冲溶液和/或药学上可接受的载体。
[0045] 在一些方面，本发明为长度为8至20个核苷酸的单链RNA寡核苷酸在药学上可 接受的载体中配制的组合物，该单链RNA寡核苷酸具有与调控靶基因的表达的长的非编码 RNA(IncRNA)的至少5个连续核苷酸互补的互补区，其中该寡核苷酸的2至19个核苷酸为 核苷酸类似物，其中互补的RNA寡核苷酸不存在于该组合物中。
[0046] 在一些实施例中，这些核苷酸类似物选自由桥连核苷酸、2'氟以及2'0-甲基核苷 酸组成的组。在其他实施例中，该桥连核苷酸为LNA、ENA或cEt核苷酸。
[0047] 该IncRNA可以转录自含有该靶基因的基因组区中与该靶基因相反的链。
[0048] 在一些实施例中，该寡核苷酸与IncRNA在IncRNA的转录自该靶基因的非编码部 分的区域中具有互补性。在其他实施例中，该寡核苷酸与IncRNA在IncRNA的处于该革巴基 因的转录区之外的区域中具有互补性。
[0049] 还提供了一种包括容纳任何组合物的容器的试剂盒。
[0050] 在其他方面，本发明为通过将在此描述的单链寡核苷酸递送到细胞中来提高细胞 内靶基因的表达的方法。
[0051] 在本发明的其他方面，提供了通过向受试者给予在此描述的单链寡核苷酸来提高 受试者体内靶基因的水平的方法。
[0052] 在本发明的仍然其他方面，提供了通过向受试者给予在此描述的单链寡核苷酸来 治疗与受试者体内靶基因的降低的水平相关联的病症的方法。
[0053] 在其他方面，提供了上调基因表达的方法。该方法包括使细胞与长度为8至30个 核苷酸的单链RNA寡核苷酸相接触，该单链RNA寡核苷酸具有与抑制靶基因的表达的长的 非编码RNA(IncRNA)的至少5个连续核苷酸互补的互补区。
[0054] 以下申请通过引用以其全部内容结合在此：2011年12月19日提交、2012年6 月28日公开为W0/2012/087983且名称为多梳相关非编码RNA (POLYCOMB-ASSOCIATED NON-CODING RNAS)的国际专利申请PCT/US 2011/65939 以及 2011 年 11 月 12 日提交、2012 年5月18日公开为W0/2012/065143且名称为多梳相关非编码RNA (POLYCOMB-ASSOCIATED NON-CODING RNAS)的国际专利申请 PCT/US 2011/060493。
[0055] 本发明的各个限制性方案可以涵盖本发明的不同的实施例。因此预期的是，涉及 任何一个要素或多个要素的组合的本发明的各个限制性方案可以被包括在本发明的各个 方面中。本发明并未将其应用局限于以下说明中所陈述或附图中所示的组分的构建和安排 的细节。本发明能够进行其他实施例并且能以不同的方式实践或进行。同样，在此所使用 的措辞和术语是用于描述的目的，而不应当被视为是限制性的。在此使用的"包括"、"包含" 或"具有"、"含有"、"涉及"及其变化形式意图涵盖其后所列的项目和其等效形式，以及其他 项目。
[0056] 表1 :序列表简要说明
[0057]
【主权项】
1. 一种选择用于激活靶基因的表达的候选寡核苷酸的方法，该方法包括： 在第一核苷酸序列内选择PRC2相关区，其中该第一核苷酸序列定位至第一染色体中 该靶基因的5'端上游的50千碱基与该靶基因的3'端下游的50千碱基之间的位置； 确定与该PRC2相关区的至少8个连续核苷酸互补的第二核苷酸序列；并且 将包含该第二核苷酸序列的单链寡核苷酸选择为该候选寡核苷酸，其中该寡核苷酸具 有以下特征中的至少一种： a) 序列：5' -X-Y-Z，其中X为任何核苷酸，Y为非为人微小RNA的种子序列的、长度为 6个核苷酸的核苷酸序列，并且Z为长度为1至23个核苷酸的核苷酸序列，其中X锚定在该 寡核苷酸的5'端上； b) 不包含三个或更多个连续鸟苷核苷酸的序列； c) 与长度等于该第二核苷酸序列的每个核苷酸序列具有阈值水平以下的序列一致性 的序列，这些核苷酸序列处在脱靶基因的5'端上游的50千碱基与该脱靶基因的3'端下游 的50千碱基之间； d) 与编码RNA的PRC2相关区互补的序列，该RNA形成包含至少两个单链环的二级结 构；或 e) 具有60 %以上G-C含量的序列。
2. 如权利要求1所述的方法，其中该单链寡核苷酸的长度高达50个核苷酸。
3. 如权利要求1所述的方法，其中该单链寡核苷酸的长度为8至30个核苷酸。
4. 如权利要求1所述的方法，其中该寡核苷酸具有特征a)、b)、c)、d)以及e)中的至 少两种。
5. 如权利要求1所述的方法，其中该寡核苷酸具有特征a)、b)、c)、d)以及e)中的至 少三种。
6. 如权利要求1所述的方法，其中该寡核苷酸具有特征a)、b)、c)、d)以及e)中的至 少四种。
7. 如权利要求1所述的方法，其中该寡核苷酸具有特征a)、b)、c)、d)以及e)中的每 一种。
8. -种选择富集了激活靶基因的表达的寡核苷酸的一组寡核苷酸的方法，该方法包 括： 在第一核苷酸序列内选择PRC2相关区，该第一核苷酸序列