一种疟原虫检测试剂盒的制作方法_2

文档序号:8442331阅读:来源:国知局
GGATGAAAGTGT-3' ;
[0022] 下游引物 PT-R : 5 ' -CCAGAACCCAAAGACTTTGATTTC-3 ' ;
[0023] 探针 PT-P :5' -TTCGAGGTGACTTTTAGATTGCTTCCTTC-3' ;
[0024] 优选地,探针羧基端用FAM标记,羟基端用BHQ1猝灭基团修饰。在本发明的其他 实施方式中,还可以选用TET、JOE、HEX等荧光素标记,配合选用DABCYL、TAMRA、BHQ2、BHQ3 等猝灭基团。
[0025] 2)10XPCR反应缓冲液:包括pH7. 5的200mmol/L三羟甲基氨基甲烷盐酸盐, 30mmol/L氯化镁,500mmol/L氯化钾,0. 2ml/100ml曲拉通和10ml/100ml甲酰胺(各组分购 自Sigma公司);
[0026] 3)脱氧核糖核苷三磷酸:为dATP、dCTP、dGTP和dTTP (均购自Promega公司);
[0027] 4) dUTP :购自Promega公司,它与尿嘧啶DNA糖基化酶配合用于预防PCR产物污 染。
[0028] 上述组分1)~4)可混合构成PCR反应液。
[0029] 5) R0X参比染料:R0X参比染料购自Roche公司,或使用其他适用于荧光定量PCR 的参比染料。加入R0X参比染料起到明显的归一化效果,对实验结果的重复性和稳定性有 明显改善。
[0030] 6)酶混合液:购自Promega公司,其中酶混合液包含浓度为1~5U/ y 1的耐热DNA 聚合酶(Taq酶)和浓度为0. 05~0. 2U/ y 1的尿嘧啶DNA糖基化酶(UNG酶);其中UNG 酶具有降解含有dU的PCR产物的功能,利用UNG酶和PCR反应液中的dUTP可以起到预防 PCR产物污染的作用。
[0031] 7)疟原虫阴性对照:不含有疟原虫各型别中任意一种的灭活阴性外周血。
[0032] 实施例2
[0033] 本实施例为使用实施例1的试剂盒进行疟原虫荧光定量PCR检测。
[0034] 1 ?试剂准备:
[0035] 1)提取待测样本中核酸:
[0036] ①根据样本数取相应量的1. 5ml离心管,做好标记。
[0037] ②取血液样品200ml,加入2-2. 5倍体积的灭菌生理盐水,颠倒混匀,振荡至彻底 混匀。
[0038] ③加入200ul裂解液,混匀,振荡至彻底混匀。
[0039] ④将上一步得到的溶液,99度放置lOmin,其间颠倒混匀数次。
[0040] ⑤将上一步得到的溶液,12000rpm离心5min,将上清收集到离心管中。
[0041] ⑥在PCR管盖上做好标记,低速离心数秒,而后分别加入已提取的待测样品3~ 5 y 1,使反应总体系为50 y 1,低速离心数秒。每次实验可设置一个阴性质控,作为产品使用 的质量控制。
[0042] 2)PCR反应液:包含10XPCR反应缓冲液,0. 2mmol/L脱氧核糖核苷三磷酸, 40mmol/L~200mmol/LR0X参比染料,0. 2ymol/L~0. 4ymol/L用于革巴多核昔酸扩增的 上游引物PT-F以及下游引物PT-R,0? 2ymol/L~0? 4ymol/L用于检测靶多核苷酸的探针 PT-P;
[0043] 3)PCR-mix :根据待测样本和阴性对照的量,按比例(PCR反应液42~43 y 1/人份 +酶混合液1~2 y 1/人份)取相应量的PCR反应液及酶混合液,充分混匀成PCR-mix,瞬 时离心后备用。
[0044] 2?荧光PCR反应
[0045] 1)将PCR反应管放入荧光定量PCR扩增仪,按对应顺序设置待测样本名称;
[0046] 2)焚光检测通道选择:选择FAM通道(Reportere:FAM, Quencher:None)检测疱原 虫有无;参比焚光(Passive Reference)设置为R0X ;
[0047] 3)荧光定量PCR反应条件为:
【主权项】
1. 一种疟原虫检测试剂盒,所述试剂盒中包括用于荧光定量PCR检测的PCR反应液。
2. 根据权利要求1所述的试剂盒,其特征在于,所述PCR反应液中包含用于靶多核苷酸 扩增的上游引物和下游引物序列,且 所述上游引物的序列为:5' -CGACTAGGTGITGGATGAAAGTGT-3' ; 所述下游引物的序列为:5' -CCAGAACCCAAAGACTTTGATTTC-3'。
3. 根据权利要求1或2所述的试剂盒,其特征在于,所述PCR反应液中包含用于靶多核 苷酸检测的探针序列, 且所述探针序列为:5' -ITCGAGGTGACTITTAGAITGCTTCCTTC-3'。
4. 根据权利要求3所述的试剂盒,其特征在于,所述探针的羧基端用荧光素标记,并 对羟基端用猝灭基团修饰,其中所述荧光素选自FAM、TET、JOE和HEX,所述猝灭基团选自 BHQl、DABCYL、TAMRA、BHQ2 和BHQ3。
5. 根据权利要求4所述的试剂盒,其特征在于,所述荧光素为FAM,所述猝灭基团为 BHQl0
6. 根据权利要求1~5中任意一项所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒中还含有 40~200mmol/L的参比染料。
7. 根据权利要求1~6中任意一项所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒中还包括酶 混合液和疟原虫阴性对照,且所述酶混合液包含浓度为1~5U/y1的耐热DNA聚合酶和浓 度为0. 05~0. 2U/y1的尿嘧啶DNA糖基化酶。
8. -种使用如权利要求1~7中任意一项所述的试剂盒进行疟原虫荧光定量PCR检测 的方法,其包括: 步骤K,将PCR反应液与酶混合液混合后制成PCR混合液; 步骤L,将PCR混合液离心处理,然后将经过离心处理的PCR混合液加入多个反应管,并 向含有PCR混合液的反应管中分别加入阴性对照或待测样本核酸,制成PCR反应样品,盖好 管盖; 步骤M,在荧光定量PCR扩增仪上进行荧光PCR反应,检测并记录样品的扩增曲线与阈 值线; 步骤N,根据样品的扩增曲线形状、扩增曲线与阈值线是否存在交点Ct,以及Ct值大小 进行疟原虫分析; 其中,在步骤K中,PCR反应液的加入量为42~43y1/人份,酶混合液的加入量为1~ 2y1/人份。
9. 根据权利要求8所述的方法,其特征在于,在步骤L中,每个反应管中阴性对照或待 测样本核酸的加入量为3~5y1。
【专利摘要】本发明提供一种疟原虫检测试剂盒,所述试剂盒中包括用于荧光定量PCR检测的PCR反应液。具体地,所述PCR反应液中包含用于靶多核苷酸扩增的上游引物和下游引物序列,且上游引物:5’-CGACTAGGTGTTGGATGAAAGTGT-3’;下游引物:5’-CCAGAACCCAAAGACTTTGATTTC-3’。在一种【具体实施方式】中,所述PCR反应液中包含用于靶多核苷酸检测的探针序列,且探针序列为:5’-TTCGAGGTGACTTTTAGATTGCTTCCTTC-3’。本发明提供的试剂盒操作简便,灵敏度高,并可预防PCR产物污染,具有很好的特异性、重复性和稳定性,利用该试剂盒进行疟原虫荧光定量PCR检测,可以确定血液样本中疟原虫的有无,可为灵敏、早期诊断是否被疟原虫感染提供可靠的实验证据。
【IPC分类】C12Q1-68, C12Q1-04, C12R1-90
【公开号】CN104762379
【申请号】CN201510141779
【发明人】戴立忠, 邓中平, 付亚成
【申请人】湖南圣湘生物科技有限公司
【公开日】2015年7月8日
【申请日】2015年3月30日
当前第2页1 2 
网友询问留言 已有0条留言
  • 还没有人留言评论。精彩留言会获得点赞!
1