一种早发糖尿病基因突变体及应用_2

文档序号:9501859阅读:来源:国知局
和减少病人长期的经济负担都具有重要的现实意义。

【发明内容】

[0013] 本发明的目的是提供一种早发糖尿病基因突变体,解决了现有技术中存在的问 题。
[0014] 本发明的另一目的是提供一种早发糖尿病基因突变体编码蛋白。
[0015] 本发明的另一目的是提供一种早发糖尿病的检测方法。
[0016] 本发明所采用的第一技术方案是,一种早发糖尿病基因突变体,其核巧酸序列如 沈QIDNO. 1所示。
[0017] 本发明所采用的第二技术方案是,一种早发糖尿病基因突变体编码蛋白,其氨基 酸序列如SEQIDNO. 2所示。
[0018] 本发明所采用的第Ξ技术方案是,一种筛选易患早发糖尿病的生物样品的系统, 包括:
[0019] 核酸提取装置,所述核酸提取装置用于从所述生物样品提取核酸样本;
[0020] 核酸序列确定装置,所述核酸序列确定装置与所述核酸提取装置相连,用于对所 述核酸样本进行分析,W便确定所述核酸样本的核酸序列;
[0021] 判断装置,所述判断装置与所述核酸序列确定装置相连,W便基于所述核酸样本 的核酸序列与现有野生型早发糖尿病基因的序列相比,是否具有C. 10006A〉G突变,判断所 述生物样品是否易患早发糖尿病。
[0022] 进一步地,核酸提取装置进一步包括:RNA提取单元,所述RNA提取单元用于从所 述生物样品提取RNA样本;W及反转录单元,所述反转录单元与所述RNA提取单元相连,用 于对所述RNA样本进行反转录反应,W便获得cDNA样本,所述cDNA样本构成所述核酸样 本。
[0023] 进一步地,核酸序列确定装置进一步包括:文库构建单元,所述文库构建单元用于 针对所述核酸样本,构建核酸测序文库;W及测序单元,所述测序单元与所述文库构建单元 相连,用于对所述核酸测序文库进行测序,W便获得由多个测序数据构成的测序结果。
[0024] 进一步地,文库构建单元进一步包括:PCR扩增模块,所述PCR扩增模块中设置有 早发糖尿病基因特异性引物,W便利用所述特异性引物,对所述核酸样本进行PCR扩增,所 述早发糖尿病基因特异性引物包括正向引物和反向引物,正向引物的序列如SeqID. 3所 示;反向引物的序列如Seq1化4所示。
[00巧]本发明所采用的第四技术方案是,一种用于筛选易患早发糖尿病的生物样品的试 剂盒,包括适于检测早发糖尿病基因突变体的试剂;所述试剂为核酸探针或者引物;所述 核酸探针或者引物具有SEQIDNO. 3和SEQIDNO. 4所示的核巧酸序列。
[00%] 本发明所采用的第五技术方案是,一种构建体包含上述的早发糖尿病基因突变 体。
[0027] 本发明所采用的第六技术方案是,一种重组细胞,所述重组细胞是通过表达上述 的构建体转化受体细胞而获得的。
[0028] 本发明所采用的第屯技术方案是,一种构建药物筛选模型的方法,包括:使动物的 至少一部分细胞表达上述的早发糖尿病基因突变体。
[0029] 本发明的有益效果是:本发明发现早发性糖尿病(mody)的一个新的致病基因。W 此为基础,可用于早期筛查早发性糖尿病(mody)致病突变基因携带者,进而在携带者发病 之前进行早期干预治疗;也可用于早发性糖尿病(mody)患者的分子诊断及与相关疾病的 的鉴别诊断。该技术具有快速、准确、高效、简便、早期诊断率高等优点,检测结果可W为早 发性糖尿病(mody)的早期诊断、鉴别诊断及开发早发性糖尿病(mody)治疗药物提供科学 依据。
【附图说明】
[0030] 图1是本发明sanger验证峰图,其中,在第201个碱基处具有杂合突变; 阳031] 图2是本发明sanger验证峰图,其中,在第201个碱基处无突变;
[0032] 图3是本发明家系图;
[0033] 图4是本发明筛选易患早发糖尿病的生物样品的系统的结构示意图;
[0034] 图5是本发明核酸提取装置的结构示意图;
[0035] 图6是本发明文库构建单元的结构示意图。
【具体实施方式】
[0036] 下面结合【具体实施方式】对本发明进行详细说明。
[0037] 实施例1早发糖尿病基因突变体
[0038] 根据本发明的第一方面,本发明提出了一种早发糖尿病基因突变体核酸。根据本 发明的实施例,所述核酸与现有野生型早发糖尿病基因的序列相比,具有C.10006A〉G突 变。且与现有野生型早发糖尿病蛋白质的序列相比,PCR扩增产物的编码蛋白在第3336位 的丝氨酸S突变为甘氨酸G,PCR扩增产物的编码蛋白的核巧酸序列如SEQIDNO. 2所示, 即存在P.S3336G突变。
[0039] 实施例2早发糖尿病的检测方法
[0040] 1、样本制备 阳04U 采集家系中成员外周血,提外周血白细胞中的基因组DM,利用Nano化opSOOO测 定DNA的0D值,抽取1~2μ1样品于NanoDrop8000上检测,记录样品浓度、0〇2日。/28。及 〇〇26〇/23〇比值等信息。所得的每个标本基因组DNA的0D洗〇/0〇28〇均位于1.S-2. 0之间,浓度 在50-200ng/ul,总量不少于3μ邑。
[0042] 2、疾病突变基因检测
[0043] 分别对家族中的成员,包括6名患者及其7名正常家属的MDN1基因进行检测,针 对MDN1的序列设计引物,通过PCR扩增,产物纯化,测序的方法获得MDN1有关序列,根据序 列测定结果属于突变型还是野生型,验证MDN1与早发性糖尿病(mody)之间相关性。具体 方法步骤如下:
[0044] 1)DNA提取:
[0045]分别将10名患者及其13名正常家属的外周静脉血按照技术方案中的方法提取基 因组DNA,Nano化opSOOO测定DNA含量。
[0046] 2)引物设计及PCR反应
[0047] 引物设计参考人类基因组序列数据库hgl9/build36. 3,具体见下。 阳〇4引a)引物序列: W49] 表1引物序列 阳化0]
阳051]b)反应体系:25μL
[0052]
[005引C)反应条件:
[0054]表2 PCR反应条件 阳化引
[0056
[0057] 3)将步骤2中获得PCR扩增产物直接进行sanger测序。
[0058] 在患者家族成员中MDN1基因该突变位点进行突变排查,患者均为携带相应的杂 合突变,其正常家属不携带该致病突变。因此我们认为MDN1基因是早发性糖尿病的致病基 因。
[0059] 与现有野生型早发糖尿病基因的序列(MDN1-005ENST00000369393,(http:// Rrch37.ensembl.org/Homosapiens/Transcript/Se日uencecDNA?db=core;r=ΕΝ5600000η2159;r= 6:90352218-90529442;t=ENST00000369393))相比,若PCR扩 增产物的核巧酸序列在第10006位碱基发生T〉C的突变,即存在突变点cl0006T〉C,PCR 扩增产物的核巧酸序列如SEQIDNO. 1所示;且与现有野生型早发糖尿病蛋白质的序列 (MDN1-005ENST00000369393(http://Rrch37.ensembl.org/Homosaplens/Transcript/ SequenceProtein?db=core;r=ENSG00000112159;r= 6:90352218-90529442;t= ENST00000369393))
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