用于治疗癌症的单克隆抗体的制作方法_2

文档序号:8311979阅读:来源:国知局
9B-l、 78H111H6和44-3A-2生产的抗体和/或可得自它们的抗体,(ii)属于(i)所述抗体的嵌合 或人源化形式的抗体,和(iii)具有(i)所述抗体之特异性的抗体,尤其是包含(i)所述抗 体的抗原结合部分或抗原结合位点(尤其是可变区)的抗体。在这一方面中,尤其优选的 本发明抗体选自:(i)由杂交瘤35-488-1、48-38-1、51-认-1和56-44-2生产的抗体和/或 可得自它们的抗体,(ii)属于(i)所述抗体的嵌合或人源化形式的抗体,和(iii)具有(i) 所述抗体的特异性的抗体,尤其是包含(i)所述抗体的抗原结合部分或抗原结合位点(尤 其是可变区)的抗体。
[0031] 在一个尤其优选的实施方案中,本发明的抗体具有抑制或减少表达GT468和/ 或特征在于其细胞表面与GT468缔合之细胞(优选癌细胞如乳腺癌细胞)的集落形成的 活性。可以在克隆形成实验(clonogenic assay)中体外测量该活性。可以使用细胞系 BT-549、Caov-3、EF0-21、SK-BR-3、MCF-7、MDA-MB-468 和 MDA-MB-231 作为表达 GT-468 的 癌细胞。克隆形成实验是一种研究特定试剂对细胞存活和增殖的效力的微生物学技术。其 常常在癌症研究实验室中用于测定药物或辐射对正在增殖的肿瘤细胞的影响。该实验包括 三个主要的步骤:(i)对细胞(尤其是癌细胞)样品进行处理,(ii)将细胞置于组织培养 容器中,和(iii)允许细胞生长。将产生的集落固定、染色并计数。如果个体肿瘤细胞在器 官中定殖,则集落形成对转移的形成而言是重要的。抗体的抑制活性表明它们阻抑转移形 成的潜力。在克隆形成实验中具有抑制或减少集落形成之活性的抗体尤其适用于治疗或预 防癌细胞(尤其是本文提到的癌症类型)的转移和转移性传播。在这一方面中优选的本 发明抗体选自下组:(i)由杂交瘤 51G6 2H3 2B4、78H11 1H6、16-5B-1、22-1A-1、29-8B-1 和 51-1A-1产生的抗体和/或可得自它们的抗体,(ii)属于(i)所述抗体的嵌合或人源化形 式的抗体,和(iii)具有(i)所述抗体之特异性的抗体,尤其是包含(i)中抗体的抗原结合 部分或抗原结合位点(尤其是可变区)的抗体。在这一方面中,尤其优选的本发明的抗体 选自下组:(i)由杂交瘤51G6 2H3 2B4、29-8B-1和51-1A-1生产的抗体和/或可得自它们 的抗体,(ii)属于(i)所述抗体的嵌合或人源化形式的抗体,和(iii)具有(i)所述抗体 之特异性的抗体,尤其是包含(i)中抗体的抗原结合部分或抗原结合位点(尤其是可变区) 的抗体。
[0032] 在一个尤其优选的实施方案中,本发明的抗体具有抑制或减少表达GT468和/或 特征在于其细胞表面与GT468缔合之细胞的增殖的活性,并且具有抑制或减少表达GT468 和/或特征在于其细胞表面与GT468缔合之细胞的集落形成的活性。在这一方面中优选的 本发明抗体选自下组:(i)由杂交瘤51-1A-1产生的抗体和/或可得自它们的抗体,(ii)属 于(i)所述抗体的嵌合或人源化形式的抗体,和(iii)具有(i)所述抗体之特异性的抗体, 尤其是包含(i)所述抗体的抗原结合部分或抗原结合位点(尤其是可变区)的抗体。
[0033] 在一个实施方案中,本发明涉及下述抗体,所述抗体(i)结合表达GT468和/或特 征在于其细胞表面与GT468缔合之细胞,和(ii)不结合不表达GT468和/或特征不在于其 细胞表面与GT468缔合之细胞。本发明的抗体优选地(i)介导表达GT468和/或特征在于 其细胞表面与GT468缔合之细胞的杀死和/或抑制其增殖,和(ii)不介导不表达GT468和 /或特征不在于其细胞表面与GT468缔合之细胞的杀死和/或不抑制其增殖。
[0034] 本发明的抗体可以是单克隆、嵌合的、人的或人源化的抗体或抗体片段,其可选自 IgGl、IgG2(优选 IgG2a 和 IgG2b)、IgG3、IgG4、IgM、IgAl、IgA2、分泌型 IgA、IgD 和 IgE 抗 体。
[0035] 本发明的抗体包括全人抗体。此类抗体可以在下述非人转基因动物(例如转基因 小鼠)中生产,所述非人转基因动物能够通过发生V-D-J重组和同种型转换而生产GT468 的人单克隆抗体的多种同种型。此类转基因动物也可以是生产多克隆抗体的转基因兔,如 US 2003/0017534 所公开。
[0036] 本发明的抗体与GT468抗原的结合可以例如通过活化补体系统来介导表达GT468 和/或特征在于其细胞表面与GT468缔合之细胞(例如肿瘤细胞)的杀死,和/或可抑制 表达GT468和/或特征在于其细胞表面与GT468缔合之细胞(例如肿瘤细胞)的增殖。或 者或除介导表达GT468和/或特征在于其细胞表面与GT468缔合之细胞的杀死和/或抑制 表达GT468和/或特征在于其细胞表面与GT468缔合之细胞的增殖之外,本发明的抗体与 GT468抗原的结合可抑制表达GT468和/或特征在于其细胞表面与GT468缔合之细胞(例 如肿瘤细胞)的运动、迁移、集落形成和/或侵袭,并且因此可抑制肿瘤细胞的转移性传播。 表达GT468和/或特征在于其细胞表面与GT468缔合之细胞的杀死可以通过一种或多种以 下机制发生:表达GT468和/或特征在于其细胞表面与GT468缔合之细胞的补体依赖性细 胞毒性(⑶C);表达GT468和/或特征在于其细胞表面与GT468缔合之细胞的凋亡;表达 GT468和/或特征在于其细胞表面与GT468缔合之细胞的效应细胞吞噬作用;或表达GT468 和/或特征在于其细胞表面与GT468缔合之细胞的效应细胞抗体依赖性细胞毒性(ADCC)。
[0037] 根据本发明的所有方面,GT468优选为人GT468,优选地具有SEQIDN0:2的氨基 酸序列,更优选地具有SEQIDN0:2氨基酸序列之细胞外结构/或的氨基酸序列,特别是具 有涵盖SEQIDN0:2之23至212位氨基酸的氨基酸序列。
[0038] 在一些特别优选的实施方案中,本发明的抗体与活细胞表面上存在的GT468的天 然表位(例如SEQ ID N0 :3-10和35-82所示的)结合。在一些更优选的实施方案中,本发 明的抗体对癌细胞(优选乳腺癌细胞)具有特异性。优选地,本发明的抗体对表达GT-468 的癌细胞如细胞系 BT-549、Caov-3、EF0-21、SK-BR-3、MCF-7、MDA-MB-468 和 MDA-MB-231 是 特异性的,并且不结合不表达GT468的癌细胞如NUG-C4胃癌细胞。
[0039] 在本发明的一些实施方案中,GT468表达在细胞表面上和/或与细胞表面相关。
[0040] 可通过包括以下步骤的方法来获得本发明的抗体:用含有选自SEQ ID N0 :2-10 和35-82之氨基酸序列的蛋白质或肽或者其免疫原性片段或衍生物、或表达所述蛋白质或 肽或者其免疫原性片段或衍生物的核酸或宿主细胞来免疫动物。优选地,本发明的抗体对 以上提及的蛋白质、肽或其免疫原性片段或衍生物具有特异性。对于用于免疫的蛋白质或 肽来说,衍生物涉及这些蛋白质或肽的变体,所述变体具有与衍生出其的蛋白质或肽同样 的免疫原性。特别地,当用于免疫产生抗体(特别是单克隆抗体)时,蛋白质或肽的衍生物 提供了与使用蛋白质或肽进行免疫时所获得抗体具有同样特异性的抗体。例如,这样的衍 生物可包括一个或多个氨基酸的缺失、替换或添加。特别地,它可包括一个或多个氨基酸的 添加,例如在N-端或C-端或两者处添加半胱氨酸。
[0041] 在一个特别优选的实施方案中,本发明的抗体由具有如下登记号的克隆 产生:DSM ACC2822(4E9-1H9)、DSM ACC2826(9B6-2A9)、DSM ACC2824(59D6-2F2)、 DSM ACC2825 (61C11-2B5) , DSM ACC2823 (78H11-1H6), DSM ACC2895 (22-1A-1), DSM ACC2893 (22-2A-1)、DSM ACC2896 (22-9B-1)、DSM ACC2897 (23-33A-1)、DSM ACC2891 (23-19A-1),DSM ACC2894 (FI1#33F7D12),DSM ACC2892(4A12 2D4 1A10), DSM ACC2898(4E9 1D12 2D4)、DSM ACC2961 (42H11 1C11 2B2)、DSM ACC2962 (51G6 2H3 2B4)、DSM ACC2943(16-5B-1)、DSM ACC2956 (20-11A-I)、DSM ACC2947(29-1A_2)、 DSM ACC2964(29-8B-1)、DSM ACC2959(35-48B-1)、DSM ACC2963(35-50A-2a)、 DSM ACC2957(38-10B-1)、DSM ACC2958(38-1A-1)、DSM ACC2948(44-3A-2)、 DSM ACC2949 (45-2A-1)、DSM ACC2950 (45-8A-2)、DSM ACC2951 (48-3B-1)、 DSM ACC2952(48-4A-1)、 DSM ACC2946(49-3A-1)、 DSM ACC2945(49-8A-1)、 DSM ACC2944(51-1A-I)、DSM ACC2953 (53-13A-2)、DSM ACC2955 (53-29A-1)、DSM ACC2960(54-4B-2)、DSM ACC2954(56-4A-2)或DSM ACC3001(62-9B-1)。
[0042] 在一个实施方案中,本发明的抗体与治疗剂(如毒素、放射性同位素、药物或细胞 毒剂)偶联。
[0043]另一方面,本发明涉及能产生本发明抗体的杂交瘤。优选的杂交瘤具有如下 登记号:DSM ACC2822(4E9-1H9)、DSM ACC2826(9B6-2A9)、DSM ACC2824(59D6-2F2)、 DSM ACC2825 (61C11-2B5),DSM ACC2823 (78H11-1H6),DSM ACC2895 (22-1A-1), DSM ACC2893 (22-2A-1)、DSM ACC2896 (22-9B-1)、DSM ACC2897 (23-33A-1)、DSM ACC2891 (23-19A-1), DSM ACC2894 (FI1#33F7D12), DSM ACC2892(4A12 2D4 1A10), DSM ACC2898(4E9 1D12 2D4)、DSM ACC2961 (42H11 1C11 2B2)、DSM ACC2962 (51G6 2H3 2B4)、DSM ACC2943(16-5B-1)、DSM ACC2956 (20-11A-I)、DSM ACC2947(29-1A_2)、 DSM ACC2964 (29-8B-1)、DSMACC2959 (35-48B-1)、DSMACC2963 (35-50A-2a)、 DSM ACC2957(38-10B-1)、DSM ACC2958(38-1A-1)、DSM ACC2948(44-3A-2)、 DSM ACC2949 (45-2A-1)、DSM ACC2950 (45-8A-2)、DSM ACC2951 (48-3B-1)、 DSM ACC2952 (48-4A-1)、DSM ACC2946 (49-3A-1)、DSM ACC2945 (49-8A-1)、 DSM ACC2944(51-1A-I)、DSM ACC2953 (53-13A-2)、DSM ACC2955 (53-29A-1)、DSM ACC2960(54-4B-2)、DSM ACC2954(56-4A-2)或DSM ACC3001(62-9B-1)。
[0044] 本文通过引用抗体名称和/或引用产生该抗体的克隆(如4E9-1H9)来指明本发 明的抗体。
[0045] 优选地,本发明的抗体能够区分由不同细胞类型(包括癌细胞和非恶性细胞)表 达的GT468变体。
[0046] 本发明的抗体优选地介导杀死表达GT468和/或特征在于其细胞表面通过与 GT468结合而与GT468缔合的细胞。优选地,GT468在所述细胞表面上表达。在一个实施 方案中,本发明的抗体诱导补体依赖性细胞毒作用(CDC),例如表达GT468和/或特征在于 其细胞表面与GT468缔合之细胞至少约20~40 %的⑶C介导之裂解,优选地约40~50% 的CDC介导之裂解,更优选地大于50%的CDC介导之裂解。作为诱导CDC的替代或补充, 本发明的抗体可在效应细胞(例如单核细胞、单个核细胞、NK细胞和PMN)存在下诱导表达 GT468和/或特征在于其细胞表面与GT468缔合之细胞的抗体依赖性细胞毒作用(ADCC)。 本发明的抗体可具有诱导表达GT468和/或特征在于其细胞表面与GT468缔合之细胞发生 凋亡的能力,诱导表达GT468和/或特征在于其细胞表面与GT468缔合之细胞同质性粘附 的能力,和/或在巨噬细胞存在下诱导表达GT468和/或特征在于其细胞表面与GT468缔 合之细胞的吞噬。本发明的抗体可具有一种或多种上述功能特性。优选地,本发明的抗体 诱导表达GT468和/或特征在于其细胞表面与GT468缔合之细胞的⑶C介导之裂解和ADCC 介导之裂解,更优选地诱导表达GT468和/或特征在于其细胞表面与GT468缔合之细胞的 ADCC介导之裂解而不诱导所述细胞的CDC介导之裂解。针对本发明抗体之靶细胞的实例包 括但不限于表达GT468和/或特征在于其细胞表面与GT468缔合的癌细胞。在一个特别优 选的实施方案中,由本发明抗体所介导的杀死细胞是GT468特异性的,即本发明的抗体优 选以CDC和/或ADCC介导之裂解的方式介导杀死表达GT468和/或特征在于其细胞表面 与GT468缔合的细胞,但不介导杀死不表达GT468和/或特征在于其细胞表面与GT468不 发生缔合的细胞。上述抗体可用于在治疗或预防癌症中介导杀死肿瘤细胞,所述癌症例如 乳腺癌、肺癌、胃癌、卵巢癌、肝细胞癌、结肠癌、胰腺癌、食道癌、头颈癌、肾癌(尤其是肾细 胞癌)、前列腺癌、肝癌、黑素瘤、肉瘤、骨髓瘤、神经母细胞瘤、胎盘绒毛膜癌、宫颈癌和甲状 腺癌,及其转移形式。在一个实施方案中,所述癌症疾病是肺中的转移癌。
[0047] 本发明的抗体可源自不同的物种,其包括但不限于小鼠、大鼠、兔、豚鼠和人。本发 明的抗体还包括嵌合分子,其中源自某一物种(优选人)的抗体恒定区与源自另一物种的 抗原结合位点相组合。此外,本发明的抗体包括人源化分子,其中源自非人物种之抗体的抗 原结合位点与人源的恒定区和框架区相组合。
[0048] 本发明的抗体包括多克隆抗体和单克隆抗体,其中包括IgG2a(如IgG2a,k,入)、 IgG2b (如IgG2b,k,A)、IgG3(如IgG3, k,X)和IgM抗体。然而,本发明还涵盖了另一 些抗体同种型(isotype),包括IgGl、IgAl、IgA2、分泌型IgA、IgD和IgE抗体。所述抗体 可以是完整抗体或其抗原结合片段,包括例如Fab、F(ab') 2、Fv、单链Fv片段或双特异性抗 体。此外,所述抗原结合片段包括结合结构域免疫球蛋白融合蛋白,其包含(i)与免疫球蛋 白铰链区多肽融合的结合结构域多肽(例如重链可变区或轻链可变区),(ii)与所述铰链 区融合的免疫球蛋白重链CH2恒定区,以及(iii)与所述CH2恒定区融合的免疫球蛋白重 链CH3恒定区。这样的结合结构域免疫球蛋白融合蛋白还进一步公开于US2003/0118592 和 US 2003/0133939 中。
[0049] 优选地,本发明的抗体与GT468解离的解离平衡常数(kD)约为1~100nM或更低。 优选地,本发明的抗体不与相关细胞表面抗原发生交叉反应,并因此不抑制其功能。
[0050] 在一些优选的实施方案中,本发明的抗体可通过如下一个或多个属性来表征:
[0051] a)对GT468具有特异性;
[0052] b)与GT468的结合亲合力约为100nM或更低,优选地约5~10nM或更低,更优选 地约1~3nM或更低;
[0053] c)能够对⑶55/59阴性细胞或⑶55/59阳性细胞介导高水平的⑶C;
[0054] d)能够抑制表达GT468和/或特征在于其细胞表面与GT468缔合之细胞的生长;
[0055] e)能够诱导表达GT468和/或特征在于其细胞表面与GT468缔合之细胞发生细胞 凋亡;
[0056] f)能够诱导表达GT468和/或特征在于其细胞表面与GT468缔合之细胞发生同质 性粘附;
[0057] g)能够在效应细胞存在下诱导表达GT468和/或特征在于其细胞表面与GT468缔 合之细胞发生ADCC;
[0058] h)能够延长具有表达GT468和/或特征在于其细胞表面与GT468缔合之细胞的肿 瘤细胞的患者存活;
[0059] i)能够清除表达GT468和/或特征在于其细胞表面与GT468缔合的细胞;j)能够 清除低水平表达GT468和/或特征在于其细胞表面与GT468缔合的细胞;和/或
[0060] k)能够使GT468聚集在活细胞表面上。
[0061]本发明的抗GT468抗体可以衍生成、连接至或共表达有另一些结合特异性。在一 个具体的实施方案中,本发明提供了双特异性或多特异性分子,其包含至少一种针对GT468 的第一结合特异性(例如,抗GT468抗体或其模拟物)以及针对效应细胞的第二结合特异 性(例如针对Fc受体(如Fc- Y受体,例如Fc- y RI,或任何其它Fc受体)或T细胞受体 (如CD3)的结合特异性)。
[0062] 因此,本发明包含与GT468以及Fc受体或T细
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