一种有效抑制小鼠pdk2表达的rna干扰序列及其应用_2

文档序号:9611742阅读:来源:国知局
施例1制备的慢病毒颗粒,M0I= 1,7化后检测慢病毒颗粒的转染效 率,然后分别适用qPCR及Western-blot分析PDK2的表达。其中转染效率结果如图2和图 3所示,结果显示慢病毒颗粒均能成功转染RAW264. 7细胞。
[0038] 一、Western-blot分析PDK2 的表达
[0039] 1)小鼠巨隧细胞RAW264. 7细胞蛋白质的提取:
[0040] (1)去除培养基,W 1ml PBS洗两次; 阳0川 似加入由900μ1RIPA和100μ1蛋白酶抑制剂组成的蛋白裂解液;
[0042] (3)每孔加入100μ1蛋白裂解液,用移液器吹打几下,使裂解液和细胞充分接触; 阳0创 (4)轻轻摇匀5-lOmin后置于冰上静置裂解比;
[0044] 巧)1400巧m、4°C离屯、15min,上清为蛋白质样品。 W45]。蛋白定量:
[0046] (1) W0. 8ml蛋白标准品稀释液稀释蛋白标准品(20mg BSA),使之终浓度为25mg/ ml;
[0047] 似取10μ1的25mg/ml蛋白标准品用490μ1PBS稀释至终浓度为0. 5mg/ml; W4引 做配置BCA工作液:取5mlBCA试剂A加100μ1BCA试剂B巧0:1),充分混匀;
[0049] (4)将0.5mg/ml的标准品按0μl,lμl,2μl,4μl,8μl,12μl,16μl,20μl依 次加入到96孔板的标准品孔中,用PBS补足体积至20μ1;
[0050] 妨将4μ1样品到96孔板的样品孔中,用PBS补足体积至20μ1 ;
[0051] (6)每孔加入200μ1BCA工作液,37 °C放置20-30分钟;
[0052] (7)用酶标仪在A562波长测定0D值,利用标准曲线求出样品的蛋白浓度。
[0053] 结果显示,蛋白质浓度为50mg/ml。可应用于western-blot的研究。
[0054] 3)SDS-PAGE电泳 阳05引 (1)取100μ1蛋白质样品加入25μ1的5XSDS上样缓冲液混匀,煮沸6min,冷却 至室溫;
[0056] 似加样:按15 μ g的蛋白上样,同时加6 μ 1的预染蛋白Marker ;
[0057] (3)在电泳槽中加入200ml的电泳缓冲液,100V电压电泳,待漠酪蓝到达底部时结 束;
[0058] (4)转膜(本实验用半干转法):电泳结束后,将胶切角标记,浸泡在转膜缓冲液 中,在室溫平衡15min;W100 %甲醇活化PVDF膜30s,转入纯水中浸润3min,最后置于转膜 缓冲液中平衡15min;组装转膜Ξ明治:从下到上依次放入2层滤纸、膜、凝胶、2层滤纸(膜 的面积要小于滤纸,大于胶);按膜面积的80%设置电流,恒流转移蛋白60min;
[0059] (5)封闭:转膜结束后,取下PVDF膜,TBS洗2次,每次5min,加入5 %脱脂奶粉,室 溫平缓摇动化(背景高则4°C封闭过夜);
[0060](6)抗体的解育:封闭结束后,WTBST清洗PVDF膜(慢速),每次lOmin,共3次; 然后加入一抗工作液:用5%封闭奶粉适当稀释一抗?01(2,1:500稀释,4°(:过夜,第二天^ TBST清洗PVDF膜,每次lOmin,共3次;加入二抗工作液:用TBST1:10000或1:20000稀释 二抗(大鼠抗小鼠IgG/辣根过氧化物酶标记),解育比后,WTBST清洗PVDF膜(快速), 每次lOmin,共3次;
[0061] (7)加入E化显色试剂,在凝胶成像仪上进行显色。结果如图4所示,结果显示 PDK2蛋白的分子量为分子量为50Kd,特异性好,并且转染慢病毒颗粒的RAW264. 7细胞 PDK2蛋白表达量显著低于未转染慢病毒颗粒的细胞,表明本发明合成的PDK2RNAi-l和 PDK2RNAi-2能够抑制PDK2的表达,并且PDK2RNAi-2的抑制效率高于PDK2RNAi-l。
[0062] 二、qPCR法检测RNAi对PDK2基因的抑制效果 W63] 1)总RNA抽提
[0064] (1)细胞培养皿中细胞样品用1冲BS洗两次后,用1ml枪将PBS吸干净,加入1ml Trizol(invitrogen)溶液,吹打混匀,并吸至1.5ml RNase化ee EP管中使细胞充分裂解, 室溫静置5min ; W65] 似加入200μ1氯仿,剧烈振荡混匀30s,使水相和有机相充分接触,室溫静置 3-5min;
[0066] (3) 4°C下,14,OOOg离屯、15min,可见分为Ξ层,RNA在上层水相,移至另一个新的 RNase free EP管;
[0067] (4)沉淀RNA:加入等体积异丙醇,轻柔地充分混匀(颠倒6-8次),室溫静置 lOmin;
[0068] 巧)4°C下,14,OOOg离屯、lOmin,收集RNA沉淀,去上清;
[0069](6)用75 %乙醇洗涂两次(12,OOOg离屯、5min),超净台风干;沉淀不能过干或过 湿,过干则不易溶解,过湿则乙醇残留。
[0070] (7)视沉淀量加入适量DEPC水(至少15μ1)溶解沉淀。
[0071] 将提取的总RNA取1μ1RNA样品50倍稀释,在核酸蛋白检测仪上测定0D值,结 果显示0D260/0D280的比值大于1. 8,说明制备的RNA较纯,无蛋白质污染;再取RNA样品 1μ1,1%琼脂糖凝胶电泳80VX20min,邸染色lOmin,用凝胶成像系统观察并拍照,结果显 示,提取的总RNA5SrRNA,18srRNA和28srRNA条带Ξ条条带完整,可W用于检测。 阳0巧 如逆转录 阳〇7引 (1)在RNase化ee的PCR管中配置下列溶液;
[0074]似将上述溶液吹打均匀,置85°C保溫5min,使RNA变性,随后立即冰上制冷,W防 止RNA复性; 阳〇7引 做在该PCR管中加入下列试剂(Promega)
[0076]
W77] (4)将上述20μ1反应溶液30°C保溫lOmin;然后42°C保溫50min;再85°C保溫 lOmin;最后-20°C保存。 阳〇7引 4)定量PCR检测
[0079] 然后W逆转录获得的cDNA为模板,W小鼠PDK2分子特异性引物P1 :5'-acagggag tgctggagtacaagg-3'(沈QIDNO. 7)及P2:5'-tg阱gatgcggctgaggtagaa-3'(沈QIDNO. 8) 为引物进行巧光定量PCR,同时WActin-β基因作为内参,内参引物为Pl:5'-tgctgtccct gtatgcctct-3'(沈QIDNO. 9) ;P2:5'-ttgatgtcacgcacgaattc-3'(沈QIDNO. 10),并根据 使用所获得的CT值,采用2 进行相对量计算,结果如图5所示。结果显示,转染慢病毒 颗粒的RAW264. 7细胞PDK2基因表达量显著低于未转染慢病毒颗粒的细胞,表明本发明合 成的表明本发明合成的PDK2RNAi-l和PDK2RNAi-2能够抑制PDK2的表达,并且PDK2RNAi-2 的抑制效率高于PDK2RNAi-l。
[0080] 实施例3、沉默RAW264. 7细胞PDK2表达后对细胞功能影响的分析及验证
[0081] 经PDK2RNAi-2处理稳定抑制PDK2表达的小鼠巨隧细胞系RAW264. 7细胞(在此 称为RAW264. 7-PDK2RNAi-2)及其对照细胞(在此称为RAW264. 7-RNAi-control)培养于6 孔板内,待细胞70 %长满孔底:
[0082] 一、LI^刺激
[0083] 使用浓度为2μg/ml的脂多糖LPS(Sigma公司产品,货号:L2630)分别刺激细胞, 于0、15及60分钟后收集细胞进行活性氧的流式细胞术(FACs)分析。
[0084] 二、流式细胞术(FACs)分析
[0085] 取培养的小鼠巨隧细胞系RAW264. 7细胞,采用流式细胞术(FACs)分析,结果如图 6所示。结果显示,抑制PDK2表达可促进RAW264.7细胞线粒体活性氧(mtRO巧的分泌,表 明抑制PDK2表达可W表达PDK2基因的细胞,如巨隧细胞,提高免疫力,对于肿瘤治疗具有 重要意义。
[0086] 最后说明的是,W上优选实施例仅用W说明本发明的技术方案而非限制,尽管通 过上述优选实施例已经对本发明进行了详细的描述,但本领域技术人员应当理解,可W在 形式上和细节上对其作出各种各样的改变,而不偏离本发明权利要求书所限定的范围。
【主权项】
1. 一种有效抑制小鼠roK2表达的RNA干扰序列,其特征在于:所述RNA干扰序列如SEQ IDNO. 3的第5~52位所示或如SEQIDNO. 5的第5~52位所示。2. 含有权利要求1所述RNA干扰序列的慢病毒表达载体。3. 根据权利要求2所述的慢病毒表达载体,其特征在于:所述慢病毒载体由SEQID NO. 3 与SEQIDNO. 4,或SEQIDNO. 5 与SEQIDNO. 6 退火形成双链,然后经EcoRI和PacI 酶切位点连入GV115慢病毒表达质粒而得。4. 权利要求1所述RNA干扰序列的制备方法,其特征在于,包括如下步骤:将SEQID NO. 3 与SEQIDNO. 4,或SEQIDNO. 5 与SEQIDNO. 6 退火形成双链,然后经EcoRI和PacI 酶切位点连入GV115慢病毒表达质粒,包装,转染,获得慢病毒颗粒,然后将慢病毒颗粒转 染至宿主细胞中表达获得RNA干扰序列。5. 根据权利要求4所述的制备方法,其特征在于:所述宿主细胞为巨噬细胞。6. 根据权利要求5所述的制备方法,其特征在于:所述宿主细胞为小鼠巨噬细胞 RAW264. 7〇7. 权利要求1所述RNA干扰序列或权利要求2或3所述慢病毒载体在抑制小鼠TOK2 表达中的应用。8. 权利要求1所述RNA干扰序列或权利要求2或3所述慢病毒载体在促进表达TOK2 细胞的线粒体活性氧分泌中的应用。9. 根据权利要求8所述的应用,其特征在于:所述表达TOK2细胞为巨噬细胞。
【专利摘要】本发明公开了一种有效抑制小鼠PDK2表达的RNA干扰序列及其应用,RNA干扰序列如SEQ?ID?NO.3的第5~52位所示或如SEQ?ID?NO.5的第5~52位所示,该序列能够显著抑制小鼠PDK2表达,抑制表达后能够促进表达PDK2细胞的线粒体活性氧分泌,活化细胞,为肿瘤、I型糖尿病及肝炎等疾病的治疗提供了新的思路。
【IPC分类】C12N15/113, A61P3/10, C12N15/867, A61P35/00, A61P1/16
【公开号】CN105368839
【申请号】CN201510975321
【发明人】陈永文, 吴玉章, 杨承英
【申请人】中国人民解放军第三军医大学
【公开日】2016年3月2日
【申请日】2015年12月22日
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