专利名称：一种sult1a1基因多态性检测特异性引物和液相芯片的制作方法
技术领域：
本发明属于分子生物学领域，涉及医学和生物技术，具体的是涉及一种SULT1A1基因多态性检测特异性引物和液相芯片。
背景技术：
近年来分子生物学及酶化学研究表明，与激素、药物和外源性致癌物在人体代谢相关的酶及其基因多态性可能与癌症的发生发展有关，通过研究这些酶基因的多态性，阐明激素依赖性肿瘤发生的分子遗传学基础，逐渐成为肿瘤病因学研究的新方向。硫酸基转移酶(Sulfotransferases, SULTs)是调节雌激素合成与代谢的重要的酶之一，SULTs主要催化人体内硫酸化反应，在外源性化合物(药物、食品添加剂、致癌物等)的生物代谢和化学防御过程中起着关键的作用，在调节各种内源性化合物的生物学活性方面也发挥着重要的作用。这种硫酸化作用在许多激素(包括可作用于子宫内膜的雌激素)，药物和外源性复合物的生物代谢和化学防御过程中是一种重要的代谢反应。国内外目前研究表明，SULTs编码基因SULT1A1的多态性与癌症的发生发展密切相关。本发明目标检测的SULT1A1基因突变位点，如表所示
权利要求
1.一种SULT1A1基因多态性检测液相芯片，其特征是，包括有(A).针对SULT1A1基因不同多态性位点分别设计的野生型和突变型的ASPE引物每种ASPE引物由5’端的tag序列和3’端针对目的基因多态性位点的特异性引物序列组成,所述特异性引物序列为针对G89A位点的SEQ ID NO. 5和SEQ ID NO. 6 ;和/或针对G118A位点的 SEQ ID NO. 7 和 SEQ ID NO. 8 ;所述 tag 序列选自 SEQ ID NO. I SEQ ID NO. 4 ；(B).有anti-tag序列包被的、具有不同颜色编码的微球,所述anti-tag序列与微球连接中间还设有间隔臂序列；所述anti-tag序列选自SEQ ID NO. 9 SEQ ID NO. 12，且所述anti-tag序列能相应地与(A)中所选的tag序列互补配对； (C).用于扩增出需要检测的、具有相应多态性位点的目标序列的引物。
2.根据权利要求I所述的SULT1A1基因多态性检测液相芯片，其特征是，所述扩增引物为针对 G89A、G118A 位点的 SEQ ID NO. 13 和 SEQ ID NO. 14。
3.根据权利要求I所述的SULT1A1基因多态性检测液相芯片，其特征是，所述ASPE引物为针对G89A位点的由SEQ ID NO. I和SEQ ID NO. 5组成的序列及由SEQ ID NO. 2和SEQ ID N06组成的序列；和/或针对G118A位点的由SEQ ID NO. 3和SEQ ID NO. 7组成的序列及由SEQ IDN0. 4和SEQ ID NO. 8组成的序列。
4.根据权利要求I所述的SULT1A1基因多态性检测液相芯片，其特征是，(A).所述ASPE引物为针对G89A位点的由SEQID NO. I和SEQ ID NO. 5组成的序列及由SEQ ID NO. 2和SEQ ID NO. 6组成的序列；和针对G118A位点的由SEQ ID NO. 3和SEQID NO. 7组成的序列及由SEQ ID NO. 4和SEQ ID NO. 8组成的序列；(B).有anti-tag序列包被的、具有不同颜色编码的微球,所述anti-tag序列与微球连接中间还设有间隔臂序列；所述anti-tag序列选自SEQ ID NO. 9 SEQ ID NO. 12，且所述anti-tag序列能相应地与(A)中所选的tag序列互补配对；(C).所述扩增引物为针对G89A、G118A位点的SEQID NO. 13和SEQ ID NO. 14。
5.根据权利要求1-4任一项所述的SULT1A1基因多态性检测液相芯片，其特征是，所述间隔臂为5-10个T。
6.用于SULT1A1基因多态性检测的特异性引物，其特征是，所述特异性引物序列为针对 G89A 位点的 SEQ ID NO. 5 和 SEQ ID NO. 6 ;和 / 或针对 Gl 18A 位点的 SEQ ID NO. 7 和 SEQIDN0. 8。
全文摘要
本发明公开了一种SULT1A1基因多态性检测特异性引物和液相芯片，该液相芯片主要包括有每种由5’端的tag序列和3’端针对目的基因多态性位点的特异性引物序列组成的ASPE引物，所述特异性引物序列为针对G89A位点的SEQ ID NO.5和SEQ ID NO.6；和/或针对G118A位点的SEQ ID NO.7和SEQ ID NO.8；所述tag序列选自SEQ ID NO.1～SEQ ID NO.4；有anti-tag序列包被的微球；扩增引物。本发明所提供的检测液相芯片的检测结果与测序法的吻合率高达100％，实现多个突变位点的野生型和突变型并行检测。
文档编号C12Q1/68GK102952871SQ20111025166
公开日2013年3月6日 申请日期2011年8月29日 优先权日2011年8月29日
发明者许嘉森, 何嘉英 申请人:广州益善生物技术有限公司