Scml4基因序列及表达改变检测及其在冠心病预测中的应用
【技术领域】
[0001] 本发明涉及生物技术领域，特别涉及与冠心病易感性相关的SCML4基因上的单核 苷酸多态性（singlenucleotidepolymorphism,SNP)位点，以及用于检测所述SNP位点的 相应的组合物及试剂盒，尤其涉及所述SNP位点的核酸亲和配体在制备用于检测、筛查或 预测汉族人群冠心病易感性的组合物中的应用。
【背景技术】
[0002] 冠心病，又称冠状动脉性心脏病，是由冠状动脉血管壁粥样硬化引起的以冠状动 脉狭窄甚至闭塞为形态学改变的缺血性心脏病。冠心病危害极大，根据世界卫生组织的数 据，在世界范围内，以冠心病为主的缺血性心脏病是威胁人类健康的头号杀手。数据显示： 在2008年，全球大约有多于730万人死于冠心病（WH0, 2011)。虽然从死亡率上看中国目前 并不是冠心病的重灾区，但是，由于人口基础大，我国的冠心病受累人数是十分惊人的。估 计中国每年超过100万人死于冠心病。另外，随着我国经济水平的发展和人民生活水平的 提高，发明人国家的冠心病发病率还在逐年升高。
[0003] 临床和流行病学研究证明，冠心病是常见的复杂多基因疾病，引起疾病的原因包 括遗传因素、环境因素以及两者的交互作用。冠心病有家族聚集性，研究表明，冠心病的遗 传度约为40%到60%。因此，冠心病易感基因和易感位点的鉴定将为发现新的冠心病分子 机制、发展新的药物靶点以及冠心病的早期基因诊断和个性化治疗提供新线索。遗传学上， 寻找多基因疾病的易感基因多利用关联分析。遗传关联分析分为两个策略：候选基因关联 分析和全基因组关联分析（genomewideassociationstudy,GWAS)。得益于人类基因组 计划和HapMap计划对人类遗传图谱的揭示，从全基因组水平寻找与疾病相关的变异成为 可能。在过去的六年里，全基因组关联分析发展成为研究复杂多基因疾病遗传基础的重要 方法之一，已有超过50个冠心病相关位点通过该方法被发现，其中绝大部分位点是在白种 人的研究中发现。然而，由于遗传的异质性，这些结果并不能为黄种人，尤其是发明人中国 汉族人群所用。另一方面，已发现的位点中仅有6个是基于中国汉族人群的研究所发现，这 远不足以解释中国汉族人群的冠心病遗传基础。此外，已有的研究多仅关注了相关位点，而 对于鉴定相关位点所指代的易感基因缺乏有效的方法。
[0004] 鉴于已知用来解释中国汉族人群的冠心病遗传基础的基因及位点的数量较少，为 了提高汉族人群冠心病易感性检测、筛查或预测的准确度，从而更容易、更直接、更灵敏且 更特异性地检测、筛查或预测汉族人群冠心病易感性，有必要寻找新的与冠心病易感性相 关的易感基因和SNP位点。
【发明内容】
[0005] 本发明发现了一种新的能够解释中国汉族人群的冠心病遗传基础的与冠心病易 感性相关的SCML4基因，同时确证了SCML4基因上与冠心病易感性密切相关的SNP位点 rs9486729以及与rs9486729连锁的SNP位点。本发明具体技术方案如下：
[0006] 第一方面，本发明提供了分离的核酸分子，其代表SCML4基因上的单核苷酸多态 性（SNP)位点rs9486729,DNA序列如SEQIDNO: 1所示，其中单核苷酸n为G的携带者患 诞心病的风险商于等位基因A。
[0007] 第二方面，本发明提供了分离的核酸分子，其代表SCML4基因上与SNP位点 rs9486729连锁的SNP位点，所述连锁的SNP位点选自以下任一项：
[0008] (l)rs4945789,其DNA序列如SEQID勵:2所示，其中单核苷酸11为(：的携带者患 诞心病的风险商于等位基因G;
[0009] (2)rs872548,其DNA序列如SEQIDN0:3所示，其中单核苷酸n为A的携带者患 诞心病的风险商于等位基因G;
[0010] (3)rs9320237,其DNA序列如SEQID勵:4所示，其中单核苷酸11为6的携带者患 诞心病的风险商于等位基因A;
[0011] (4)rs7773622,其DNA序列如SEQID勵:5所示，其中单核苷酸11为1'的携带者患 诞心病的风险商于等位基因C;
[0012] (5)rs6568503,其DNA序列如SEQIDNO:6所示，其中单核苷酸n为A的携带者患 诞心病的风险商于等位基因G;
[0013] (6)rsl878780,其DNA序列如SEQID勵:7所示，其中单核苷酸11为六的携带者患 诞心病的风险商于等位基因G;
[0014] (7)rsl2194084,其DNA序列如SEQIDN0:8所示，其中单核苷酸n为G的携带者 患诞心病的风险商于等位基因C;
[0015] (8)rs6568505,其DNA序列如SEQIDN0:9所示，其中单核苷酸n为A的携带者患 诞心病的风险商于等位基因G;
[0016] (9)rsl2214724,其DNA序列如SEQIDN0:10所示，其中单核苷酸n为C的携带者 患诞心病的风险商于等位基因G;
[0017] (10)rsl2214852,其DNA序列如SEQIDN0:11所示，其中单核苷酸n为A的携带 者患诞心病的风险商于等位基因C;
[0018] (ll)rsl0457173,其DNA序列如SEQIDN0:12所示，其中单核苷酸n为T的携带 者患诞心病的风险商于等位基因A;
[0019] (12)^6568508，其0嫩序列如5￡〇10勵：13所示，其中单核苷酸11为(：的携带者 患诞心病的风险商于等位基因T;
[0020] (13)rs7771956,其DNA序列如SEQID勵:14所示，其中单核苷酸11为6的携带者 患诞心病的风险商于等位基因C;
[0021] (14)rs9400150,其DNA序列如SEQIDN0:15所示，其中单核苷酸n为A的携带者 患诞心病的风险商于等位基因T;
[0022] (15)rs4946871，其DNA序列如SEQIDN0:16所示，其中单核苷酸n为G的携带者 患诞心病的风险商于等位基因A;
[0023] (16)rs4946872,其DNA序列如SEQIDNO: 17所示，其中单核苷酸n为A的携带者 患诞心病的风险商于等位基因G;
[0024] (17)rsl2211874,其DNA序列如SEQIDN0:18所示，其中单核苷酸n为G的携带 者患诞心病的风险商于等位基因A;
[0025] (18)rs9400152,其DNA序列如SEQID勵：19所示，其中单核苷酸11为6的携带者 患诞心病的风险商于等位基因A;
[0026] (19)rs9480807,其DNA序列如SEQIDN0:20所示，其中单核苷酸n为T的携带者 患诞心病的风险商于等位基因G;
[0027] (20)rs6915611，其DNA序列如SEQIDN0:21所示，其中单核苷酸n为G的携带者 患诞心病的风险商于等位基因C;
[0028] (21)rs7767848,其DNA序列如SEQID勵:22所示，其中单核苷酸11为六的携带者 患诞心病的风险商于等位基因G;
[0029] (22)rsl0782157,其DNA序列如SEQIDN0:23所示，其中单核苷酸n为G的携带 者患诞心病的风险商于等位基因A;
[0030] (23)rs9384663,其DNA序列如SEQID勵:24所示，其中单核苷酸11为1'的携带者 患诞心病的风险商于等位基因G;
[0031] (24)rsl7530298,其DNA序列如SEQIDN0:25所示，其中单核苷酸n为C的携带 者患诞心病的风险商于等位基因T;
[0032] (25)rs9386677,其DNA序列如SEQID勵:26所示，其中单核苷酸11为6的携带者 患诞心病的风险商于等位基因A;
[0033] (26)rs9398150,其DNA序列如SEQID勵:27所示，其中单核苷酸11为6的携带者 患诞心病的风险商于等位基因A;
[0034] (27)rsl7596103,其DNA序列如SEQIDN0:28所示，其中单核苷酸n为G的携带 者患诞心病的风险商于等位基因A;
[0035] (28)rs6931026,其DNA序列如SEQID勵:29所示，其中单核苷酸11为1'的携带者 患诞心病的风险商于等位基因C。
[0036] 序列SEQIDNO: 1-29构成新的与冠心病易感性相关的单核苷酸多态性（SNP)。它 们允许灵敏、特异性、有效和简单的对冠心病易感性的检测、筛查或预测方法，例如通过采 用广为流传且易于使用的技术如PCR或核酸杂交，其具有高适用性和利用率，特别是在世 界的欠发达地区。由于上述SNP是在中国汉族人群中鉴定的，因此认为新的SNP可特别适 用于中国汉族人群冠心病易感性检测、筛查或预测。<