化合物的用途的制作方法

文档序号:14760099发布日期:2018-06-22 23:20阅读:702来源:国知局
化合物的用途的制作方法
本发明涉及医药领域,特别涉及化合物的用途。
背景技术
:磷脂酰肌醇3-激酶(Phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate3-kinase,PI3K),是细胞内参与调控包括细胞增殖、存活、生长、转移、凋亡等重要生命活动的一类脂质激酶。PI3K主要可分为三类,其中研究最广泛的为Ⅰ类PI3K,该类PI3K由一个催化亚基(P110)和一个调节亚基(P85)组成.催化亚基又可分为四种亚型:PI3Kα、PI3Kβ、PI3Kδ和PI3Kγ,四者分别在肿瘤、血栓、免疫和炎症过程中起重要作用,设计合成以PI3K为靶点的抗血栓、抗肿瘤等药物已经成为药物化学领域的研究热点。有研究表明,PI3Kγ在免疫和炎症中发挥重要的作用,而且参与过敏症、心血管疾病、慢性炎症的发展以及自身免疫性疾病。所以PI3Kγ的抑制可以作为治疗炎症以及自身免疫性疾病的良好途径。发表在Nature杂志上的两项研究均证明了PI3Kγ在改善免疫疗法有效性上起到了关键作用。研究1(题目:OvercomingresistancetocheckpointblockadetherapybytargetingPI3Kγinmyeloidcells)提到,使用实验性药物阻断抑制性细胞中的PI3Kγ分子后,这类免疫抑制小细胞的平衡改变了,促进了抗肿瘤免疫的激活。研究2(来自加州大学圣地亚哥分校、Moores癌症中心)发现,巨噬细胞的PI3Kγ信号通过抑制抗肿瘤T细胞的激活促进免疫抑制。阻断PI3Kγ激活了免疫响应,显著抑制了移植瘤的生长。同时,阻断PI3Kγ还提高了某些肿瘤对已有抗癌药物的敏感性,协同增强了现有癌症免疫疗法根除肿瘤的能力。因此,提供高活性的PI3Kγ抑制剂分子,为以PI3Kγ的靶点药物设计提供参考,具有重要的现实意义。技术实现要素:有鉴于此,本发明提供一种化合物的用途。该化合物能够有效抑制PI3Kγ,为以PI3Kγ的靶点药物设计提供参考。为了实现上述发明目的,本发明提供以下技术方案:本发明提供了式Ⅰ所示化合物作为磷脂酰肌醇3-激酶的抑制剂中的应用。该化合物的SPECID为AK-968/15605213,smi:c12n(ncc1C(=O)N/N=C(/c1cc(NC(=O)C(C)C)ccc1)\C)c(cc(n2)c1ccccc1)C,Drug-likenessmodelscore:0.54。在本发明的一些具体实施方案中,所述磷脂酰肌醇3-激酶为PI3Kγ。在本发明的一些具体实施方案中,所述PI3Kγ包括PDBID如1e8w、2a5u、2chw、3dbs、3l16、3l17、3ml8、3prz、3qaq、3r7q、3s2a、4dk5、4ezk、4f1s、4fad、4fjy、4flh、4hle或4hvb的蛋白。在本发明的一些具体实施方案中,所述式Ⅰ所示化合物的对PI3Kγ的IC50值为2047.3±5nM。本发明还提供了一种磷脂酰肌醇3-激酶的配体的筛选方法,包括如下步骤:获得磷脂酰肌醇3-激酶的蛋白作为受体;取待测化合物与所述受体重对接;通过方根偏差(RMSD)值和/或富集因子(EF),获得所述待测化合物是否为磷脂酰肌醇3-激酶的配体的结果。在本发明的一些具体实施方案中,所述方根偏差≤2.0埃时,所述待测化合物为磷脂酰肌醇3-激酶的配体。在本发明的一些具体实施方案中,所述富集因子>1,所述待测化合物为磷脂酰肌醇3-激酶的配体。本发明还提供了一种磷脂酰肌醇3-激酶的抑制剂的筛选方法,包括如下步骤:获得磷脂酰肌醇3-激酶的蛋白作为受体;取待测化合物与所述受体重对接;通过方根偏差(RMSD)值和/或富集因子(EF),获得所述待测化合物是否为磷脂酰肌醇3-激酶的配体的结果;取获得的配体,与磷脂酰肌醇3-激酶的蛋白结合,获得抑制率,当抑制率不大于10μM时,所述配体为磷脂酰肌醇3-激酶的抑制剂。本发明提供了式Ⅰ所示化合物作为磷脂酰肌醇3-激酶的抑制剂中的应用。该化合物能够有效抑制PI3Kγ,为以PI3Kγ的靶点药物设计提供参考。此外,本发明提供的磷脂酰肌醇3-激酶的抑制剂的筛选方法,具有富集活性分子的能力,实用性强,可以应用于快速发现具有活性的药物分子。附图说明为了更清楚地说明本发明实施例或现有技术中的技术方案,下面将对实施例或现有技术描述中所需要使用的附图作简单地介绍。图1(A)示测试板1中PI103对PI3Kγ的剂量-效应曲线;图1(B)示测试板1中化合物1对PI3Kγ的剂量-效应曲线;图1(C)示测试板1中化合物2对PI3Kγ的剂量-效应曲线;图1(D)示测试板1中化合物3对PI3Kγ的剂量-效应曲线;图1(E)示测试板1中化合物4对PI3Kγ的剂量-效应曲线;图1(F)示测试板1中化合物5对PI3Kγ的剂量-效应曲线;图1(G)示测试板1中化合物6对PI3Kγ的剂量-效应曲线;图1(H)示测试板1中化合物7对PI3Kγ的剂量-效应曲线;图1(I)示测试板1中化合物8对PI3Kγ的剂量-效应曲线;图1(J)示测试板1中化合物9对PI3Kγ的剂量-效应曲线;图1(K)示测试板1中化合物10对PI3Kγ的剂量-效应曲线;图1(L)示测试板1中化合物11对PI3Kγ的剂量-效应曲线;图1(M)示测试板1中化合物12对PI3Kγ的剂量-效应曲线;图1(N)示测试板1中化合物13对PI3Kγ的剂量-效应曲线;图1(O)示测试板1中化合物14对PI3Kγ的剂量-效应曲线;图1(P)示测试板1中化合物15对PI3Kγ的剂量-效应曲线;图2(A)示测试板2中PI103对PI3Kγ的剂量-效应曲线;图2(B)示测试板2中化合物16对PI3Kγ的剂量-效应曲线;图2(C)示测试板2中化合物17对PI3Kγ的剂量-效应曲线;图2(D)示测试板2中化合物18对PI3Kγ的剂量-效应曲线;图2(E)示测试板2中化合物19对PI3Kγ的剂量-效应曲线;图2(F)示测试板2中化合物20对PI3Kγ的剂量-效应曲线;图2(G)示测试板2中化合物21对PI3Kγ的剂量-效应曲线;图2(H)示测试板2中化合物22对PI3Kγ的剂量-效应曲线;图2(I)示测试板2中化合物23对PI3Kγ的剂量-效应曲线;图2(J)示测试板2中化合物24对PI3Kγ的剂量-效应曲线;图2(K)示测试板2中化合物25对PI3Kγ的剂量-效应曲线;图2(L)示测试板2中化合物26对PI3Kγ的剂量-效应曲线;图2(M)示测试板2中化合物27对PI3Kγ的剂量-效应曲线;图2(N)示测试板2中化合物28对PI3Kγ的剂量-效应曲线;图2(O)示测试板2中化合物29对PI3Kγ的剂量-效应曲线;图3示PI3Kγ包含的64个蛋白。具体实施方式本发明公开了一种化合物的用途,本领域技术人员可以借鉴本文内容,适当改进工艺参数实现。特别需要指出的是,所有类似的替换和改动对本领域技术人员来说是显而易见的,它们都被视为包括在本发明。本发明的方法及应用已经通过较佳实施例进行了描述,相关人员明显能在不脱离本
发明内容、精神和范围内对本文所述的方法和应用进行改动或适当变更与组合,来实现和应用本发明技术。本发明提供的化合物的应用中所用试剂及原料均可由市场购得。下面结合实施例,进一步阐述本发明:实施例1受体蛋白的获得与处理登录sc-PDB数据库(http://bioinfo-pharma.u-strasbg.fr/scPDB/),搜索PI3Kγ,发现PI3Kγ共包含64个蛋白(如图3所示),选取其中的一半作为研究对象,其PDBID见表1。表1本实验研究的PI3Kγ蛋白实施例2精度验证:以sc-PDB提供的结合位点中心坐标为初始对接参数,Gridbox设定为25x25x25,exhaustiveness设定为20。采用PyRx软件将PI3Kγ的32个靶点蛋白与对应的共晶配体进行重对接;利用Pymol软件观察其结合模式,并计算其均方根偏差(RMSD)值。一般认为当RMSD≤2.0埃时,可认为受体与配体的重对接能较好的重现实验的结合模式。初次重对接结果显示,有19个蛋白(PDBID:1e8w、2a5u、2chw、3dbs、3l16、3l17、3ml8、3prz、3qaq、3r7q、3s2a、4dk5、4ezk、4f1s、4fad、4fjy、4flh、4hle或4hvb)可进行下一步工作。实用性验证:PI3K-gamma亚型涉及到的蛋白质编号及理论计算所用的参数,(见表2~表5)。大部分蛋白计算的EF值大于1,说明筛选方法具有活性分子的富集能力。表2PI3Kγ对接计算的EF值表3PI3Kγ对接计算的EF值表4PI3Kγ对接计算的EF值表5PI3Kγ对接计算的EF值实施例3检测化合物对PI3K激酶(gamma亚型)活性的抑制分析方法:使用Promega公司的ADP-GLoTM技术,进行化合物对于PI3K激酶的IC50测定。化合物检测说明:见表6。表6化合物稀释:待测化合物3倍进行稀释,共10个浓度,最终体系浓度从10μM至0.5nM。每块测试板都设置了阳性对照孔和阴性对照孔。参考化合物:PI-103作为PI3K的阳性抑制剂对照;数据分析和报告:运用XLFIT5软件对实验结果进行分析,计算出IC50结果。实验材料:实验步骤:化合物稀释:待测化合物3倍进行稀释,共10个浓度,最终体系浓度从10μM至0.5nM。10×反应缓冲液中含有500mMHEPES,500mMNaCl和9mMMgCl2。在1×反应缓冲液中含0.01%BSA,临用时加入。在5μl反应体系中,包括0.4nMPI3Kgamma,50μMPIP2:3PS,25μMATP,在23℃孵育120分钟。加入5μl含有10mMMgCl2的ADP-Gloreagent,在23℃孵育60分钟。最后加入10μl的Detectionreagent,在23℃孵育60分钟,Envision读数;将仪器读取的数据计算出化合物的抑制率,然后运用IDBS的XLFIT5中mode205计算出IC50值。浓度为10μM的PI3Kgamma参与测试。PI103作为对照组的结果见表7、表8:表7PI3KisoformsFinal[Enzyme]ATP(uM)PIP2:3PS(uM)Reactiontime(min)PI3Kgamma0.4nM2550120表8实验组结果见表8。表928个待测化合物对PI3Kgamma的IC50值见表10:表10实验结果表明,化合物1对PI3Kgamma的IC50值为2047.3nM,化合物1为PI3Kgamma的抑制剂。综上可知,基于虚拟筛选和生物活性测试技术的综合运用,可以发现全新的PI3Kgamma抑制剂,并表现出μM水平的抑制活性。以上所述仅是本发明的优选实施方式,应当指出,对于本
技术领域
的普通技术人员来说,在不脱离本发明原理的前提下,还可以做出若干改进和润饰,这些改进和润饰也应视为本发明的保护范围。当前第1页1 2 3 
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