Btrc基因的应用方法_2

文档序号:9501959阅读:来源:国知局
,相反,人为降低BTRC的 表达后,能穿过基质胶膜的鼻咽癌细胞数目显著增加,表明细胞侵袭能力增强,NC为阴性对 貝胥(negativecontrol)。
[0040] 图10为在鼻咽癌细胞Η肥2、5-8F和C666-1中导入BTRC过表达载体度TRCOE) 和RNA干扰序列(siBTRC)后,细胞划痕实验证实,人为促进BTRC的表达后,鼻咽癌细胞从 划痕两边往划痕中央迁移速度明显减慢,划痕愈合的时间延长,表明细胞运动迁移能力降 低,相反,人为降低BTRC的表达后,鼻咽癌细胞从划痕两边往划痕中央迁移速度明显提高, 划痕愈合的时间缩短,表明细胞运动迁移能力提高,NC为阴性对照(negativecontrol)。
[0041] 图11为在鼻咽癌细胞Η肥2和5-8F中导入BTRC过表达载体度TRC0E)和RNA干 扰序列(SiBTRC)后我们检测BTRC基因编码的β化CP蛋白及底物β-catenin和Snail的 表达情况,人为促进BTRC的表达后加速了β-catenin和Snail的降解,细胞中β-catenin 和Snail的表达量减少,反之人为降低BTRC的表达后β-catenin和Snail的降解减少, 细胞中β-catenin和Snail的表达量增强;与上皮-间质转换(epithelial-mesenchymal transition,EMT)相关蛋白的表达也发生了相应的变化,人为促进BTRC的表达后上皮 细胞的标志物Z0-1、E-ca化erin和Claudin-1的表达升高,而间质细胞的标志物ZEB1、 N-ca化eriruVimentin及Slug的表达降低,表明BTRC可W抑制上皮-间质转换;反之人为 降低BTRC的表达后,上皮细胞标志物表达降低,而间质细胞的标志物表达升高,表明BTRC 低表达后,细胞由上皮向间质样细胞转换,侵袭转移能力增强。
[0042] 图12为BTRC基因在鼻咽癌发生发展过程中的作用机制图,BTRC基因可调控上 皮-间质转换过程中关键分子β-catenin和Snail的表达,BTRC高表达时β-catenin 和Snail容易降解,细胞维持在上皮样状态,不容易发生侵袭转移,当BTRC表达下调时, 0-catenin和Snail不容易降解,细胞由上皮样向间质样转换,容易发生侵袭转移,导致患 者较快死亡。
【具体实施方式】
[0043] W下结合【具体实施方式】进一步说明本发明,而非限制本发明。
[0044] 实施例1,利用基因忍片技术筛选发现BTRC基因在鼻咽癌中表达下调
[004引 1.材料与方法:
[004引 1)基因忍片:
[0047]所用基因忍片为Agilent公司SurePrintG3HumanGeneExpressionv3 8χ60Κ Microarray(货号:G4851C),包含人类27, 958个已知基因的探针。
[004引。主要试剂:
[0049]
[0050] 如总RNA的纯化
[0051] 收集6例正常鼻咽上皮组织和10例鼻咽癌组织,用Trizol(invitrogen公司产 品)抽提总RNA,如果总RNA的纯度不高,会影响探针的标记效率和忍片杂交结果。所W使 用QIAGENRNcasy?Kit纯化总RNA,详细操作原理和方法见RNeasyMiniProtocol。
[0052]①取总RNA《100μg溶解于 100μ1RNase free水中,加入 350μ1Buffer RLT 并充分混匀。
[005引②加入250μ1无水乙醇,Tip头充分混匀。
[0054] ③将共计700 μ1含总RNA的溶液转入套在2ml离屯、管内的RNeasy柱子内, >8000g离屯、30秒,弃去滤过液。
[00巧]④吸取500μ1BufferR阳到RNeasymini柱子内,> 8000g离屯、洗涂30秒,弃 去滤过液,再用500μ1BufferRPE在> 8000g离屯、洗涂2min,弃去滤过液和2ml的套管, 将RNeasymini柱子转入一新的1. 5mlEppendo;rf管中。
[0056]⑥吸取 40μ1RNase free的水,> 8000g离心洗脱Imin。
[0057] ⑧重复步骤⑥一次。
[0058] 4)cDNA第一链和第二链一步法合成
[005引①取0. 2 μgRNA于0. 2ml离屯、管中,如下配置反应溶液:
[0060]
[0061] ②65°C保溫10分钟,冰浴5分钟,注意:提前把5XFirstStrandBμffer在80°C 预热3-4分钟
[0062] ③配置如下cDNA合成体系:
[0063]
[0064] ④将上述4. 7μ1mix加入变性后冰浴的RNA中。
[0065] ⑥用枪头混匀,之后离屯、。
[0066]⑧PCR仪上:
[0067] 40°C 化our
[0068] 70°C 15min
[0069] move to ice 5min
[0070]W巧光标记cRNA合成
[0071]①如下配置Transcriptionmix:
[0072]
[0073]②加入6μ1Transcriptionmix并混匀
[0074]③PCR仪上:40°C化ours。
[00巧]6)cRNA纯化(QIAGENRNca巧寬Mini Kit)
[0076] 用QIAGENRNeasyMinikit纯化cRNA,具体方法步骤如下:
[0077] ①加入84μ1RNase free水,加入350μ1Buffer化Τ并充分混匀。
[0078] ②加入250μ1无水乙醇,Tip头充分混匀。
[0079] ③将共计700μ1含总RNA的溶液转入套在2ml离屯、管内的RNeasy柱子内, > 8000g离屯、15-30sec,弃去滤过液。
[0080]④吸取500μ1BufferR阳到RNeasymini柱子内,>8000g离屯、洗涂 15-30sec, 弃去滤过液,再用500μ1BufferRPE在> 8000g离屯、洗涂2min,弃去滤过液和2ml的套 管,将RNeasymini柱子转入一新的1. 5mlEppendo;rf管中。
[0081]⑥吸取 30μ1RNasefree的水,静置Imin, > 8000g离屯、洗脱Imin。
[0082] ⑧重复步骤5-次。
[008引 7)cRNA浓度测定
[0084] ①cRNA质控:用分光光度计分析RNA浓度。需要在260和280nm测定吸光度来确 定样品的浓度和纯度,A260/A280应接近2. 0 (1. 9-2. 1之间)
[0085] ②计算并调整cRNA的含量:
[0086]8)巧光分子浓度及渗入率计算:
[0087]切3-浓度(pmol/μ1) =A552/0. 15
[008引 切3-渗入率(pmol/μg)=切3-浓度/cRNA浓度(μg/μ1)
[0089] 9)cRNA样品片段化和忍片杂交
[0090] ①按下表配制片段化混合液,然后在60°C溫浴30min进行片段化,冰浴Imin
[0091]
[0092]②加入 2XGExHybridizationBuffer混匀
[0093]
[0094] ③上忍片,65°C 17小时,1化pm滚动杂交
[0095] 10)忍片洗涂
[0096] ①取出忍片于洗液1中洗涂1分钟
[0097] ②再将忍片放入洗液2中洗涂1分钟(37°C)
[009引 11)忍片扫描:Agilent扫描仪中扫描,分辨率为3μπι/5μπι,扫描仪自动W 100% 扫描一次。
[0099] 12)数据分析:用基因忍片中的内参基因对基因忍片原始数据进行归一化 (Normalize)处理后,用SAM软件(Si即ificanceAnalysisofMicroarrays)筛选正常鼻 咽上皮与鼻咽癌组织中的差异表达基因,用Genesis软件绘制差异表达基因的表达图谱。
[0100] 2.结果
[0101] 利用基因忍片技术,共筛选得到鼻咽癌和正常鼻咽上皮间差异表达基因2461个, 其中在鼻咽癌中表达上调的基因与1677个,在鼻咽癌中下调的基因有784个(图1)。
[0102] 其中BTRC基因在鼻咽癌组织中表达显著下调(P= 0. 001,图2)。
[0103] 实施例2,实时巧光定量PCR法检测证实BTRC基因在鼻咽癌中表达下调
[0104] 1.材料与方法:
[0105] 收集9例正常鼻咽上皮组织和28例鼻咽癌组织,用Trizol(invitrogen公司产 品)抽提总RNA,2JigRNA用SuperscriptFirst-StrandSynthesisSystem逆转录试剂盒 (Invitrogen公司产品)逆转录成cDNA后,用如antiTectSYBRGreenPCR试剂盒(Qiagen 公司产品)进行实时巧光定量PCR检测BTRC及内参基因GAPDH的表达。BTRC及GAPDH基 因引物均由Invitrogen公司合成,序列如下:
[0106]BTRCforward, 5' -CCCCTTCTCGAACATACACCT-3',
[0107]BTRCreverse, 5'-AGTCTCAAAGCCCTGCTCCT-3'
[0108]GAP畑forward, 5> -AACGGATTTGGTCGTATTGG-3>,
[0109]GAPDHreverse, 5' -TTGATTTTGGAGGGATCTCG-3'
[0110] 实时巧光定量PCR反应体系
[0111]
[0112] 实时巧光定量PCR反应步骤 「01131
[0115] 反应结束后确认实时巧光定量PCR的扩增曲线和烙解曲线,各样本BTRC基因的 表达强度根据CT值(t虹esholdcyclevalues)、内参基因(GAPDH)标化后,采用group t-test检验计算P值。
[011引 2.结果
[0117]BTRC基因在正常对照组织中表达较高,而在大部分鼻咽癌组织中表达下调 P<0. 05(图 3)。
[0118] 实施例3,免疫组织化学方法检测BTRC编码的βTrCP蛋白在鼻咽癌中的表达
[0119] 1.材料与方法
[0120] 1.1免疫组化检测试剂盒及其他主要试剂
[012。 BTRC
当前第2页1 2 3 4 5 
网友询问留言 已有0条留言
  • 还没有人留言评论。精彩留言会获得点赞!
1