Btrc基因的应用方法_3

文档序号:9501959阅读:来源:国知局
抗体购自CellSi即aling公司;S-P二步法即用型抗鼠或抗兔(Two-StepTM Anti-MouseorRabbitDetectionReagent,HRP)免疫组化检测试剂盒(Novocastra L油oratories,Ltd.);正常非免疫兔和羊血清购于北京中山生物技术公司。PBS缓冲液 (pH7. 2 - 7. 4,化C1 137mmol/L,KC1 2. 7mmol/L,胞2册044. 3mmol/L,KH2PO4I. 4mmol/L); 0.Olmol/L巧樣酸盐缓冲液;0. 1%膜蛋白酶液;3%甲醇-H2O2溶液;组织微阵列切片专用 封片胶。RPMI1640,DMEM,Lipofectamine,T;rizol,ssDNA(Invit;rogen) ;DEPC;Taq酶,蛋 白酶Κ,RNase值化se化ee),膜酶(北京华美)。
[0122] 1. 2免疫组化检测βTrCP蛋白在组织微阵列中的蛋白表达
[0123] 1)组织石蜡切片经实验前处理后,脱蜡、水化。
[0124] 2)PBS洗,5minX3。
[012引如切片入3% &化中,阻断内源性过氧化物酶,室溫30min。
[0126] 4)PBS洗,5minX3。
[0127] 5)抗原修复:根据所检测蛋白的部位和抗体说明书推荐修复方法,使用微波或酶 消化抗原修复。微波抗原修复时,TMAs切片置于O.Olmol/L巧樣酸盐缓冲液中,缓冲液沸 腾后,调节至低火档,修复切片20min。酶消化抗原修复时,滴加0.1%膜蛋白酶液于切片, 37°C下消化 25min。
[012引 6)PBS洗,5minX3。
[0129] 7)滴加300μ1/TMAs片的正常山羊或兔血清封闭,室溫30min,甩去多余液体。滴 加即用型或浓缩一抗(按抗体说明书按1:50或1:100、1:200不等的比例稀释)300μ1/ TMs,保持切片在密封的湿盒中,4°C冰箱内解育过夜。
[0130]8)PBS洗,5minX3。
[0131] 9)滴加即用型二抗,300μ1/TMAs片,室溫(25°CW上)比。
[0132] 10)PBS洗,5minX3。
[0133] 11)DAB显色5~20min,显微镜下控制染色程度。
[0134]入双蒸水中止反应,双蒸水冲洗lOmin。
[0135] 13)苏木素染复染2min,溫水分化。
[0136] 14)双蒸水冲洗10~15min。
[0137] 15)脱水、透明、封片胶封片。
[013引1. 3结果观察和检测结果数据库的建立
[0139] 光学显微镜下对每一例组织标本中的PTrCP蛋白表达进行观察。两位病理学专 家分别按W下一种判断标准进行结果计分:(1)根据阳性染色强度判断:细胞无染色为0 分;细胞呈浅栋色,记1分;细胞染成栋色,并无背景染色,或深栋色,但背景呈浅栋色,为中 等阳性,记2分;细胞呈深栋色,无背景着色,为强阳性,记3分。(2)根据细胞阳性表达数 计分:无阳性细胞表达,计0分;阳性表达细胞《25%,计1分;25%<阳性细胞数《50%, 计2分;阳性表达细胞数50 %W上,为强阳性,计3分。最终计分两者计分结果乘积得分。 结果为0~3分定义为低表达,最终计分为4~9分,为高表达。
[0140] 2 结果
[0141] 正常鼻咽上皮(Non-tumorNP巧中BTRC编码的βTrCP蛋白表达水平较高 (positive),而在106例鼻咽癌(NPC)中有48例检测到βTrCP的低表达化OW),其余58例 为高表达化i曲)。βTrCP蛋白在正常鼻咽上皮和鼻咽癌中的表达有显著差异(P<0. 05,图 4)。
[0142] 实施例4,原位杂交方法检测证实BTRC基因在鼻咽癌中表达下调且与鼻咽癌患者 不良预后相关
[0143] 1.材料方法
[0144] 1.1设计并合成杂交探针
[0145] 为了采用原位杂交方法检测BTRC基因的表达情况,我们设计了针对原位杂交检 测BTRC表达的寡核巧酸探针及阳性对照(GAPDH)的原位杂交寡核巧酸探针,序列如下:
[0146] BTRC探针 1 :5' -GTCTAAGTGAATTCTTCTCTGGTATTATCT-3'
[0147] BTRC探针 2 :5' -GTACTTGTGTTCCATACCTTTATAGTTCTA-3'
[0148] BTRC探针 3 :5' -ATCTCCAATTAGATTCTATTGTCTCAATGT-3'
[0149] GAP畑探针 1 :5' -CCACTTTACCAGAGTTAAAAGCAGCCCTGG-3'
[0150] GAP畑探针 2 :5' -CAGTAGAGGCAGGGATGATGTTCTGGAGAG-3'
[0151] GAP畑探针 3 :5' -GTCAGAGGAGACCACCTGGTGCTCAGTGTA-3'
[0152] 采用化学合成方法合成上述设计的各基因特异性寡核巧酸探针序列,合成过程中 探针序列中尿喀晚已标记生物素化io-U)。
[0153] 1. 2寡核巧酸探针标记试剂盒和原位杂交检测试剂
[0154] 地高辛寡核巧酸加尾试剂值igOligonucleitideTailingKit2"dGeneration, Roche公司),抗地高辛-辣根过氧化物酶复合物检测试剂盒(Anti-Digoxigenin-POD, F油化agments,Roche公司),增强原位表达检测信号的TSA信号放大系统(TSA?Biotin System,肥L700试剂盒,Perki址Imer公司),DAB染色试剂盒(北京中山公司),20x巧樣 酸钢缓冲溶液(salinesodiumcitrate,SSC),硫酸葡聚糖值extransulphate),去离子 甲酯胺值eionizedF'ormamide),多聚腺巧酸(polyadenylicacid,PolyA),多聚脱氧腺 巧酸(polydeox;yaden5dicacid,化lydA),变性剪切的蛙精DNA(denaturedandsheared salmonspermDM,ssDNA),酵母转运RNA(yeastt-RNA,tRNA),二硫苏糖醇值ΤΤ),50χ邓 罕氏缓冲液值enhar化s'ssolution),憐酸缓冲液(PBSbuffer),胃蛋白酶Κ,牛血清白蛋 白度SA),S乙醇胺灯ΕΑ),ΤΝΒBuffeHO. 1ΜTris-HCl,抑7. 5,0. 15ΜNaCL,0. 5%Blocking Reagent),TNTBuffer(0.IMTris-肥 1,抑7.5,0. 15M化化,0.05%Tween20),醋酸酢,阻 断子式齐ll(Blockin邑rea邑enta邑ent,Roche公司)。
[0155] 1. 3其他主要试剂和材料
[0156] 无水乙醇、90%酒精、70%酒精、50%酒精、松节油、双蒸水、PBS缓冲液(pH7. 2~ 7. 4,化C1 137mmol/L,KC1 2. 7mmol/L,胞2册〇44. 3mmol/L,KH2PO4I. 4mmol/L) ;3 % 甲 醇-双氧水溶液(80%甲醇和30%双氧水配置);0.Olmol/L巧樣酸盐缓冲液(citrate buffer,CB,p册.0±0.1,9ml0.1M巧樣酸溶液和41ml0.1M巧樣酸钢溶液加入450ml蒸馈 水中临时配置后再校正工作液抑值);〇.1%膜蛋白酶;苏木素;1%盐酸酒精(1ml浓盐酸 +99ml70%酒精配置);封片胶(PTSQlreMountII);专用盖玻片(480X240mm2)定制于 郑州玻璃仪器厂。Leica低烙点(58°C)石蜡,国产蜂蜡,无水酒精,二甲苯,10%中性多聚 甲醒0).Olmol/l,抑7. 4,DEPC双蒸水和PBS缓冲液配制),苏木素,伊红,中性封片树胶,盖 玻片,载玻片。1.4标记探针
[0157] 利用3-tailingDIGOli即ucleutideKit进行寡核巧酸探针标记,反应体系如 下。
[0158] lOOpmololigonucleotide+ddHzO= 9μ1(control:controloligonucleutide 5μ1+(1地2〇 4μ1)
[0159]
[0160]
[0161] 混匀,稍离屯、。37°C水浴反应30min,加2μ1邸TA(0. 2M,PH8. 0)中止反应。
[0162]1. 5寡核巧酸探针标记后纯化
[0163] 为了增加标记探针的纯度,需对已标记的探针进行纯化,具体操作如下:
[0164] l)探针反应混合物(22μl)+2.5μl4MLiCl+75μll00%冷乙醇(-20°C).
[01巧]2)-70。(:沉淀6〇111111,〇尸20。(:化。
[0166] 3) 13.OOOXg4°C离屯、15min。
[0167] 4)弃上清,用50μ1冰冷的70% (V/V)乙醇洗涂。
[016引 5) 13.OOOxg4°C,离屯、5min。
[0169]6)弃上清,真空4°C干燥。
[0170] 7)用无菌双蒸水重溶探针。
[017。 1.6原位杂交检测存档石蜡切片中EBV-miR-BARTlO的表达
[0172] 石蜡切片杂交前处理
[0173] 1)4°C保存的石蜡切片置于58°C烤片30min,烙化表面石蜡。
[0174] 2)二甲苯依次脱蜡3X5min。
[0175] 3)梯级酒精洗涂,100 %酒精2X2min- 95 %酒精1X5min- 70 %酒精 1X5min一 50 % 酒精 1X5min一DEPC水洗涂 2X3min一DEPC-PBS洗涂 2X5min。
[017引 4)滴加300μ1胃蛋白酶K(l0yg/na)于切片上,37°C消化20min。
[0177] 5)切片入PBS(0. 1MPBS巧mg/ml谷氨酸)洗涂Imin,中止反应。
[0178] 6)切片入0. 2N肥以于37°C反应20-30min,增加组织的通透性。
[0179] 7)切片用4%多聚甲醒(0. 1MPBS溶解)后固定lOmin,室溫。
[0180] 8)为了增加组织阳性杂交强度,对切片进行乙酷处理。切片入0.25%乙酸酢 BufferI(0. 1MΞ乙醇胺),室溫lOmin。
[0181] 9) 1MPBS洗涂 2X5min。
[0182] 预杂交和杂交
[0183] 预杂交:-20°C保存的预杂交液,先置于37°C解育60mi
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