一种鸭黄病毒rt-lamp检测试剂盒的制作方法_2

文档序号:9575291阅读:来源:国知局
TG-3' 1)引物及探针的浓度优化:将外引物:内引物:环引物分别按照1:1:1、1:2:1、 1 : 2 : 2、1 : 4 : 2、1 : 4 : 4、1 :6: 4、1 :8: 4进行组合。其他条件按照表1所 列进行优化 表1RT-LAMP反应体系
采用上述配比对所提取的核酸进行扩增,63Γ水浴1小时,每组均采用复管进行实验。
[0021]2)优化结果:从多次重复试验中发现,优化后外引物:内引物:环引物的最佳比例 为1:8:4,其中外引物浓度为5nM,内引物浓度为40nM,环引物浓度为20nM。
[002引 3、酶混合物:浓度均为抓/μL的AMV反转录酶与8U/μL的BstDNA聚合酶按1 : 1比例混匀分装; 4、目视巧光染料。
[002引 5、DEPC水:内含浓度为1%。的焦炭酸二乙醋。
[0024] 6、阴性对照:d地20。
[002引 7、阳性对照:利用鸭黄病毒E基因构建的假病毒颗粒。
[0026] 实施例2.本发明的检测鸭黄病毒的方法 一、样品处理 样品按照QIAgenRNeasyMiniKit的说明书进行提取,或者采用等效的RNA提取试剂。 提取的RNA于-80°C保存,备用。
[0027] 二、RT-PCR扩增反应 (一)扩增试剂准备:从试剂盒中取出RT-LAMP反应液、酶混合物、引物混合液及目视巧 光染料在室溫下融化后,20(K)r/min离屯、5s。设所需PCR管数为η(n=样品数+1管阴性对 照+1管阳性对照)。每个测试反应体系配置如下表2: 表2.配置体系
计算好各试剂的使用量,加入一适当体积EP管中,充分混合均匀,向每个PCR管中各分 装20化。
[002引 仁)加处理后的样品 在各设定的PCR管中,分别加入上述样品处理步骤中制备的RNA溶液各5化,盖紧管盖, 于4000r/min离屯、5s。将PCR管排好,放入水浴锅或PCR仪内。
[0029] (S)RT-LAMP反应 条件为:63°C解育1小时。
[0030] 三结果判定 (一)质控标准 1、目视检测方法(图1) 阴性对照目视呈浅橘红色。
[0031] 阳性对照目视呈巧光绿色。
[0032] 2、浊度检测方法(图1) 阴性对照离屯、后,管底无沉淀。
[0033] 阳性对照离屯、后,管底有白色沉淀。
[0034] 3、凝胶电泳检测方法姻2) 阴性对照电泳无条带 阳性对照电泳可见从点样孔的拖尾现象W及很多不同扩增长度的条带。
[0035] (二)结果描述及判定 在阴阳性对照成立的前提下,选择一种检测方法进行判定。
[003引 1、目视检测方法 目视呈浅橘红色为阴性,目视呈巧光绿色为阳性。
[0037] 2、浊度检测方法 离屯、后,管底无沉淀的为阴性,管底有白色沉淀为阳性。
[003引 3、凝胶电泳检测方法 电泳后,无条带的为阴性,可见从点样孔的拖尾现象W及很多不同扩增长度条带的为 阳性。
[0039] 实施例3、本发明的RT-LAMP方法检测鸭黄病毒的特异性试验和灵敏性试验 将建立的RT-LAMP检测方法检测不同稀释度的鸭黄病毒鸭胚尿囊液并与RT-PCR方法 比较,评估该方法的灵敏度;用RT-LAMP检测方法检测常见禽类病毒,W评估该方法的特异 性。
[0040] -、材料 1. 鸭黄病毒RT-LAMP检测试剂盒镇施例1) 2. 禽流感病毒册N1亚型(AIV)、鸭病毒性肠炎病毒(DEV)、鸭病毒性肝炎病毒(DVH)等 均由山东出入境检验检疫局动检科保存。
[0041] 3SPF鸭胚:购自山东省农科院家禽研究所 二、检测鸭黄病毒特异性试验和灵敏性试验的方法 1.灵敏性试验 将鸭黄病毒的感染尿囊液做1〇1、1〇2、1〇3、1〇4、1〇5、1〇6、1〇7、1〇8、1〇9倍稀释,提取RNA, 分成两份,一份做用试剂盒做RT-LAMP,一份做普通RT-PCR。
[004引 2.特异性试验 利用本研究建立的RT-LAMP检测方法,对所有鸭黄病毒及实验室保存的AIV、DEV、DVH进行检测,确定RT-LAMP方法的特异性。
[004引三结果 1.运用优化的RT-LAMP检测方法与RT-PCR的方法对10倍梯度稀释的病毒尿囊液RNA同时进行检测,结果显示,RT-LAMP方法的灵敏度比RT-PCR方法高10倍,见图3。
[0044] 2.为验证所建立的RT-LAMP检测方法的特异性,分别W鸭黄病毒、禽流感册N1亚 型、鸭病毒性肠炎病毒(DEV)、鸭病毒性肝炎病毒(DVH)的核酸为模板进行检测,结果显示 仅鸭黄病毒可扩增出条带并见到绿色巧光,方法的特异性良好(图4)。
【主权项】
1. 一种鸭黄病毒RT-LAMP检测试剂盒,其特征在于,该试剂盒包括以下组分: RT-LAMP反应液:内含浓度为 8mmol/LMgS04, 5. 6mmol/LdNTPMixture; 2 )引物混合液;检测鸭黄病毒的引物组按照F3:B3:FIP:BIP:LF:LB为5nM: 5nM: 40nM: 40nM: 20nM: 20nM的比例混合; 其中所涉及的检测引物序列为: 上游内引物FIP序列: 5' -GCGGCATGTTTCAGCGACTGCATGGTTCCACGGAAGCG-3' ; 下游内引物BIP序列: 5'-AACGCCCAAAAGTCCCGTCTACGGGGTTCACATTCGAGTGTG-3' ; 上游外引物F3序列: 5'-GCAGAAGGAAAACGTCCAGT-3' ; 下游外引物B3序列: 5'-CCCATGTCAACCCCAGATC-3' ; 上游环引物LF序列: 5'-GGCTGAATAATTGTGGTAGGTGCT-3' ; 下游环引物LB序列: 5'-ACCGCTGAGATGGAGGATTATG-3' ; 3) 酶混合物:浓度均为5U/μL的AMV反转录酶与8000U/mL的BstDNA聚合酶按1 :1 比例混匀分装; 4) 目视荧光染料; 5. DEPC水:内含浓度为1%。的焦炭酸二乙酯; 6) 阴性对照:ddH20 ; 7) 阳性对照:利用鸭黄病毒E基因构建的假病毒颗粒。
【专利摘要】本发明公开了一种鸭黄病毒RT-LAMP检测试剂盒,试剂盒包括以下组分:1)RT-LAMP反应液;2)引物混合液;3)酶混合物;4)目视荧光染料;5)DEPC水;6)阴性对照;7)阳性对照。检测方法具体步骤是:采集样品后提取核酸RNA,利用试剂盒进行PCR扩增,反应结束后进行结果检测。本发明的有益效果为:1)快速:从样品处理到出结果仅需2小时左右;2)实现了一步法RT-LAMP检测鸭黄病毒的目的;3)灵敏:使用该方法比传统PCR方法灵敏度高10~100倍;4)特异:与常见禽类其他病毒不发生交叉反应;5)操作简单,具有良好重复性。
【IPC分类】C12Q1/68, C12Q1/70, C12R1/93
【公开号】CN105331746
【申请号】CN201510915939
【发明人】王群, 徐彪, 张晓文, 郑小龙, 孙涛, 姜帆
【申请人】山东出入境检验检疫局检验检疫技术中心
【公开日】2016年2月17日
【申请日】2015年12月10日
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