用于检测肿瘤FFPE样本中基因变异的试剂盒的制作方法

文档序号:12413042阅读:来源:国知局

技术特征:

1.一种用于检测肿瘤FFPE样本中基因变异的试剂盒,其包括用于基因捕获的探针,所述基因捕获的探针包括:针对SNV区域设计的探针、针对CNV区域设计的探针、针对FUSION区域设计的探针,公共引物如SEQ ID NO:1所示核苷酸序列引物,以及标签引物如SEQ ID NO:2~SEQ ID NO:5所示核苷酸序列引物。

2.根据权利要求1所述的试剂盒,其特征在于,所述肿瘤为胃癌、肺癌、乳腺癌、结直肠癌、肝癌及卵巢癌中的一种或两种以上。

3.根据权利要求1所述的试剂盒,其特征在于,所述基因捕获的探针是生物素化的。

4.根据权利要求1~3任一项所述的试剂盒,其特征在于,所述基因捕获试剂盒还包括链霉亲和素标记的磁珠。

5.根据权利要求1所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包括用于提供杂交捕获反应的离子环境的缓冲液。

6.根据权利要求1所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包括用于洗脱物理吸附或非特异性杂交的清洗液。

7.根据权利要求1所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒用于在肿瘤相关基因的基因捕获测序中进行基因捕获;优选地,所述基因捕获测序用于检测肿瘤相关基因的SNV、CNV、以及FUSION。

8.一种肿瘤FFPE样本中基因变异的检测方法,其特征在于,使用权利要求1~7中任一项所述试剂盒进行基因检测。

9.一种用于检测肿瘤FFPE样本中基因变异的二代测序DNA文库的构建方法,其特征在于,包括对构建的文库进行基因捕获的步骤,其中所述基因捕获使用权利要求1~7中任一项所述的试剂盒进行。

10.一种捕获探针,其特征在于,所述基因捕获的探针包括针对SNV区域设计的探针、针对CNV区域设计的探针、和/或针对FUSION区域设计的探针。

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