树干毕赤酵母基因表达系统及其构建与应用_5

文档序号:8277626阅读:来源:国知局
PSpXYLT:引物P29和P31下划线部分由5'到3'端分别为SalI 和NotI的识别位点,引物P30和P32下划线部分为BamHI的识别位点。
[0206] P29 :5, ACGCGTCGACATAAGAATGCGGCCGCGCTAACTTCAATTAGAA T3,
[0207] P30 :5, CGGGATCCCATCACTATAAGCGAAATCGGGTTTC 3'
[0208] P31 :5' ACGCGTCGACATAAGAATGCGGCCGCGTTTGATTCTAGTTTATA T3'
[0209] P32 :5, GCGCGGATCCATAGTTAACTATGTCACTTGAACTC 3,
[0210] (2)以Spathasporapassalidarum基因组DNA为模板,以引物P29 和P30 进行PCR 扩增,获得片段SpCYClT。扩增条件为95°C预变性5min,94°C变性30s,63°C退火30s,72°C 延伸30s,30个循环,72°C延伸5min。
[0211] (3)以Spathasporapassalidarum基因组DNA为模板,以引物P31 和P32 进行PCR 扩增,获得片段SpXYLT。扩增条件为95°C预变性5min,94°C变性30s,61°C退火30s,72°C延 伸30s,30个循环,72°C延伸5min。
[0212] (4)将纯化的片段SpCYClT和重组质粒PRATH分别用SalI和BamHI双酶切,将 酶切产物分别纯化后过夜连接,转化E.coliJM109感受态细胞,涂布于LB(100yg/ml氨 苄青霉素)平板上,挑选单菌落,提取质粒后SalI和BamHI双酶切验证,获得重组质粒 PAACTH〇
[0213] (5)将纯化的片段SpCYClT和重组质粒PRXTH分别用Sal I和BamH I双酶切,将 酶切产物分别纯化后过夜连接,转化E. coli JM109感受态细胞,涂布于LB (100 y g/ml氨 苄青霉素)平板上,挑选单菌落,提取质粒后Sal I和BamH I双酶切验证,获得重组质粒 PAXCTHo
[0214] (6)将纯化的片段SpXYLT和重组质粒PRATH分别用Sal I和BamH I双酶切,将酶 切产物分别纯化后过夜连接,转化E. coli JM109感受态细胞,涂布于LB (100 y g/ml氨苄青 霉素)平板上,挑选单菌落,提取质粒后Sal I和BamH I双酶切验证,获得重组质粒PMXTH。
[0215] (7)将纯化的片段SpXYLT和重组质粒PRXTH分别用Sal I和BamH I双酶切,将酶 切产物分别纯化后过夜连接,转化E. coli JM109感受态细胞,涂布于LB (100 y g/ml氨苄青 霉素)平板上,挑选单菌落,提取质粒后Sal I和BamH I双酶切验证,获得重组质粒PAXXTH。
[0216] 实施例3 :PEG/LiAc介导的树干毕赤酵母转化方法的建立。
[0217]以Scheffersomyces stipitis NRRLY-7124 作为宿主菌,米用PEG/LiAc介导转 化酵母的方法实施如下:
[0218] 一、Scheffersomyces stipitisNRRLY-7124 感受态的制备
[0219] (1)将冻存管保藏的Scheffersomyces stipitis NRRL Y-7124接种于YH)培养 基,摇瓶活化培养48h。
[0220] (2)将活化好的菌液在YPD平板上划线培养,并4°C保存。
[0221] (3)于YPD平板中挑取Scheffersomyces stipitisNRRLY-7124单菌落,接种于 20ml YPD培养基中,于100ml摇瓶中30°C过夜培养。
[0222] (4)将过夜培养的新鲜菌液接种于50mlYPD培养基中,于250ml摇瓶中30°C, 200rpm培养,至菌液0D600到1. 2左右。
[0223] (5) 5000rpm室温离心5min,收集菌体细胞。
[0224] (6)将细胞重新悬浮于500y1 0.lmol/L的LiAc中,离心,弃上清,获得感受态细 胞。
[0225] 二、线性化重组质粒的制备
[0226] (1)将含有重组表达质粒的E.coli接种于LB培养基,过夜培养。
[0227] (2)收集E.coli菌体细胞,采用碱裂法提取重组质粒,具体方法参照博大泰克质 粒提取试剂盒。
[0228] (3)采用限制性内切酶StuI单酶切重组质粒,酶切反应体系(50yL) :40yL DNA,5yLbuffer,1. 5yL限制性内切酶StuI,用双蒸水补足50yL,混匀后置于37°C恒温 箱中酶切2h。
[0229] (4)纯化酶切产物,获得线性化重组质粒。
[0230]三、PEG/LiAc法转化ScheffersomycesstipitisNRRLY-7124
[0231] (1)在感受态细胞中顺序加入下列转化混合液:240yLPEG3350,36yLI.Omol/L LiAc,25yL鲑鱼精DNA,50yL待转化线性DNA,其中鲑鱼精DNA沸水浴lOmin后立即冰浴;
[0232] (2)剧烈振荡每个反应管直至细胞完全混匀;
[0233] (3)置于 30°C温育lh;
[0234] (4)置于42°C金属浴热击22min;
[0235] (5)待降至室温后,5000rpm离心5min,弃上清;
[0236] (6)加入1ml YPD培养基,于30°C后培养2h ;
[0237] (7) 5000rpm离心5min,弃掉800y1上清,混勾菌体并涂布潮霉素B(250mg/mL)抗 性平板,30°C培养3-4d,获得转化子。
[0238] 实施例4:电穿孔法介导的酵母树干毕赤酵母转化方法的建立
[0239] 以ScheffersomycesstipitisNRRLY-7124作为宿主菌,采用电穿孔法介导转化 酵母的实施如下:
[0240] 一、ScheffersomycesstipitisNRRLY-7124 电转感受态细胞的制备
[0241] (1)将冻存管保藏的ScheffersomycesstipitisNRRLY-7124接种于YH)培养 基,摇瓶活化培养48h;
[0242] (2)将活化好的菌液在YPD平板上划线培养,并4°C保存;
[0243](3)于YPD平板中挑取ScheffersomycesstipitisNRRLY-7124单菌落,接种于 20mlYPD培养基中,于100ml摇瓶中30°C过夜培养;
[0244] (4)将过夜培养的新鲜菌液接种于50mlYH)培养基中,于250ml摇瓶中30°C, 200rpm培养,至菌液0D600到1. 2左右;
[0245] (5)将菌液置于冰上30min,5000rpm,4°C离心5min,收集菌体细胞;
[0246] (6)加入预冷的20ml双蒸水洗绦菌体2次,5000rpm,4°C离心5min,收集菌体细 胞;
[0247] (7)加入20ml预冷的1. 0mol/L山梨醇洗绦菌体2次,5000rpm,4°C离心5min,收 集菌体细胞;
[0248] (8)加入200y1预冷的1. 0m〇l/L山梨醇混匀菌体细胞,获得感受态细胞。
[0249]二、线性化重组质粒的制备
[0250](1)将含有重组表达质粒的E. coli接种于LB培养基,过夜培养。
[0251] (2)收集E.coli菌体细胞,采用碱裂法提取重组质粒,具体方法参照博大泰克质 粒提取试剂盒。
[0252] (3)采用限制性内切酶StuI单酶切重组质粒,酶切反应体系(50yL) :40yL DNA,5yLbuffer,1. 5yL限制性内切酶StuI,用双蒸水补足50yL,混匀后置于37°C恒温 箱中酶切2h。
[0253] (4)纯化酶切产物,获得线性化重组质粒。
[0254]三、ScheffersomycesstipitisNRRLY-7124 的电转化
[0255] (1)取100y1电转化感受态细胞和10y1DNA混合,加入到0? 2cm电转杯中;
[0256] (2)电转杯冰浴5min,设定条件1500v,电击5s,进行电转化;
[0257] (3)立即向电转杯中加入1ml预冷的1.Omol/L山梨醇,转移至培养箱30°C温育 lh;
[0258] (4) 5000rpm离心 5min,弃上清;
[0259] (5)加入1mlYPD培养基,混匀菌体细胞,于培养箱30°C后培养2h;
[0260] (6) 5000rpm离心5min,弃掉800y1上清,混勾菌体并涂布潮霉素B(250mg/mL)抗 性平板,30°C培养3-4d,获得转化子。
[0261] 实施例5:PR系列整合型表达载体的应用。
[0262] 一、构建绿色荧光蛋白重组表达载体
[0263] (1)根据绿色荧光蛋白的基因序列,设计引物:引物P35下划线部分为SalI的识 另IJ位点,引物P36下划线部分为NotI的识别位点。
[0264] P35 :5,ACGCGTCGACATGGGTAAGGGAGAAGAACTTTTCAC3,
[0265] P36 :5'ATAAGAATGCGGCCGCTTATTTGTATAGTTCATCCATGCCATG3'
[0266] (2)以绿色荧光蛋白基因的DNA为模板,以引物P35和P36进行PCR扩增,获得基 因gfp。扩增条件为95°C预变性5min,94°C变性30s,62°C退火30s,72°C延伸45s,30个循 环,72°C延伸 5min。
[0267](3)将纯化对gfp片段克隆至pMD19_Tsimple载体,转化E.coliJM109感受态细 胞,涂布于LB(100yg/ml氨苄青霉素)平板上,挑选单菌落,提取质粒后SalI和NotI双 酶切验证,获得重组质粒pMD-gfp。
[0268] (4)由于gfp基因序列开放阅读框中存在密码子CUG,而树干毕赤酵母使用特殊的 编码系统,即密码子CUG编码丝氨酸而非亮氨酸。因此有必要对gfp基因进行定点突变,将 密码子CUG突变为密码子UUG。
[0269] (5)以gfp基因序列开放阅读框中601位的碱基C作为突变位点,设计单点突变引 物:引物P37和P38下划线部分为突变位点。
[0270] P37 :5,GGCAGATTGTGTGGACAAGTAATGGTTGTCTGGTA3'
[0271] p38 :5'TACCAGACAACCATTACTTGTCCACACAATCTGCC3'
[0272] (6)以重组质粒pMD-gfp为模板,采用高保真聚合酶Primerstar,以引物P37和 P38进行PCR扩增,获得环状PCR产物。扩增条件为:98°C预变性2min,98°C变性10s,60°C 退火20s,72°C延伸90s,30个循环,72°C延伸5min。
[0273] (7)将上述PCR产物纯化后用内切酶DpnI于37°C消化30min,于65°C反应 15min以失活内切酶DpnI。将酶切产物纯化后,转化E.coliJM109感受态细胞,涂布于 LB(100yg/ml氨苄青霉素)平板上,挑选单菌落,提取质粒后送至生工生物工程(上海)股 份有限公司进行测序,挑选突变位点正确的质粒,命名为pMD-gfpm。gfp基因定点突变后序 列如图2所示。
[0274] (8)将重组质粒pMD-gfpjPPRACTH分别用SalI和NotI双酶切。gfp片段酶 切纯化后与质粒PRACTH的酶切产物过夜连接,转化E.coliJM109菌株,涂布于LB(100yg/ ml氨苄青霉素)平板上,挑选单菌落,提取质粒后SalI和NotI双酶切验证,获得绿色荧 光蛋白重组表达载体PRACTH-gfpm,质粒图谱如图3所示。
[0275] 二、构建树干毕赤酵母重组菌
[0276] 将经StuI线性化的质粒实施例2或实施例3中所述方法,转化 到ScheffersomycesstipitisNRRLY-7124中,获得转化子。
[0277] 三、转化子筛选与验证
[0278] (1)通过高浓度潮霉素B抗性平板筛选转化子。将绿色荧光蛋白重组表达载体 转化ScheffersomycesstipitisNRRLY-7124后获得的转化子转接于更高浓度潮霉素 B(350yg/mL)抗性平板上,30°C培养2-3d,采用相同的方法连续转接3次,获得纯培养转化 子菌株。
[02
当前第5页1 2 3 4 5 6 
网友询问留言 已有0条留言
  • 还没有人留言评论。精彩留言会获得点赞!
1