检测人aeg-1基因表达量和相对表达量的引物对的制作方法

文档序号:9745128阅读:705来源:国知局
检测人aeg-1基因表达量和相对表达量的引物对的制作方法
【技术领域】
[0001] 本发明设及生物技术领域中检测人AEG-1基因表达量和相对表达量的引物对。
【背景技术】
[0002] 肝癌是病死率很高的消化系统肿瘤,其中9 0 %为肝细胞肝癌 化epatocellula;rca;rcinoma,HCC)。在世界范围内,其发病率呈现上升的趋势。我国是肝癌 大国,也是全球肝癌发病率最高的国家。据统计,目前我国肝癌发病人数占全球的55%,而 死亡人数约占全世界肝癌死亡人数的45%,素有"癌中之王"的称号,对我国人民健康构成 严重威胁。目前临床上主要使用AFP作为肝癌诊断的标志物,但是由于肝炎、肝硬化等影响 很容易造成误诊。因此,寻找新的肝癌诊断标志物至关重要。
[0003] 星形细胞上调基因-1 (astro巧te elevated gene-1,AEG-1)是近期发现的新型促 癌基因。AEG-1基因编码人类AEG-1蛋白,是含有582个氨基酸,分子量为64kd的蛋白。它是 RAS,C-MYC基因的下游,其过度表达可W导致下游PI3K/AKT激活NF-κΒ和WNT信号通路。AEG-1被确定参与调控肿瘤转移过程,并且其表达水平在大多数肿瘤组织偏高,主要包括结肠 癌,卵巢癌,乳腺癌,肝癌等。尤其在肝癌当中,与癌旁组织相比,AEG-1的表达明显升高。因 此,AEG-1有希望成为潜在的肝癌诊断标志物。

【发明内容】

[0004 ]本发明所要解决的技术问题是如何检测人AEG-1基因表达量或相对表达量。
[000引为解决上述技术问题,本发明首先提供了检测或辅助检测人AEG-1基因表达量或 相对表达量的引物对。
[0006] 本发明所提供的检测或辅助检测人AEG-1基因表达量或相对表达量的引物对,为 名称为AEG-1-P的由序列表中序列1所示的单链DNA和序列2所示的单链DNA组成的引物对。
[0007] 为解决上述技术问题,本发明还提供了检测或辅助检测人类AEG-1基因表达量或 相对表达量的成套试剂。
[0008] 本发明所提供的检测或辅助检测人类AEG-1基因表达量或相对表达量的成套试 剂,由所述AEG-1-P与名称为GAPDH-P的与人的GAPDH基因特异结合的引物对组成。
[0009] 上述成套试剂中,所述GAP畑-P由序列表中序列3所示的单链DNA和序列4所示的单 链DNA组成。
[0010] 为解决上述技术问题,本发明还提供了检测或辅助检测人AEG-1基因表达量或相 对表达量的试剂或试剂盒。
[0011] 本发明所提供的检测或辅助检测人AEG-1基因表达量或相对表达量的试剂或试剂 盒,由所述AEG-1-P或所述成套试剂与XI组成,所述XI为进行定量PCR扩增所需试剂。
[0012] 上述试剂或试剂盒中,所述进行定量PCR扩增所需试剂可为qPCR MIXdqPCR MIX可 为北京全式金生物技术(TransGen Biotech)有限公司产品。
[0013] 上述试剂或试剂盒中,所述定量PCR扩增可为实时巧光定量PCR扩增。
[0014] 为解决上述技术问题,本发明还提供了检测或辅助检测人AEG-1基因表达量或相 对表达量的系统。
[0015] 本发明所提供的检测或辅助检测人AEG-1基因表达量或相对表达量的系统,由所 述AEG-1-P、所述成套试剂或所述试剂或试剂盒与Y1组成,所述Y1为进行RNA提取所需的试 剂、进行反转录所需的试剂和/或进行定量PCR扩增所需仪器。
[0016] 上述系统中,所述进行RNA提取所需的试剂可为TRIzol、氯仿、异丙醇和/或乙醇。 TRIzol可为上海捷瑞生物工程有限公司产品。
[0017] 所述进行反转录所需的试剂可为ReveWranscript qPCR RT Kit中的试剂。 ReverTranscript qPCR RT Kit为Takara公司产品。
[0018] 所述进行定量PCR扩增所需仪器可为实时巧光定量per仪(如AB 口 300或AB 口 500 (美国Applied Biosystems公司))。
[0019] 为解决上述技术问题,本发明还提供了鉴定或辅助鉴定肿瘤组织和/或细胞的系 统。
[0020] 本发明所提供的鉴定或辅助鉴定肿瘤组织和/或细胞的系统,包括所述AEG-1-P、 所述成套试剂、所述试剂或试剂盒或所述检测或辅助检测人AEG-1基因表达量或相对表达 量的系统与基因定量数据处理系统;所述基因定量数据处理系统用于计算将来自待鉴定组 织和/或细胞的AEG-1基因的表达量或相对表达量,根据所述待鉴定组织和/或细胞的AEG-1 基因的表达量或相对表达量确定待鉴定组织和/或细胞是否为肿瘤组织和/或细胞。
[0021] 为解决上述技术问题,本发明还提供了检测AEG-1基因的表达量或相对表达量的 方法。
[0022] 本发明所提供的检测AEG-1基因的表达量或相对表达量的方法,包括W离体的待 鉴定组织和/或细胞的cDNA或RNA为模板,用所述AEG-1-P进行PCR扩增,所述PCR扩增中的退 火条件可为58°C35sec。反应条件具体可为:95°C预变性Imin; 95°C 15s,58°C35sec,40个循 环。
[0023] 所述PCR扩增时的反应体系可为25化反应体系,具体如下:2化cDNA溶液,12.化L qPCR Mix(2X),AEG-1-F(AEG-1-F在该反应体系中的浓度为0.2μM),AEG-1-R(AEG-1-R在该 反应体系中的浓度为0.2μΜ),用无菌蒸馈水补至2如L。
[0024] 为解决上述技术问题,本发明还提供了鉴定或辅助鉴定肿瘤组织和/或细胞的方 法。
[0025] 本发明所提供的鉴定或辅助鉴定肿瘤组织和/或细胞的方法,包括:检测来自待鉴 定组织和/或细胞的AEG-1基因的表达量或相对表达量;如果所述待鉴定组织和/或细胞的 AEG-1基因的表达量或相对表达量越高,所述待鉴定组织和/或细胞为或候选为肿瘤组织 和/或细胞的风险越大,如果所述待鉴定组织和/或细胞的AEG-1基因的表达量或相对表达 量越低,所述待鉴定组织和/或细胞为或候选为肿瘤组织和/或细胞的风险越小。
[0026] 上述方法中,所述待鉴定组织和/或细胞可为肝脏组织和/或肝脏细胞。
[0027] 为解决上述技术问题,本发明还提供了所述AEG-1-P、所述成套试剂、所述试剂或 试剂盒或所述系统在下述1 )-5)中任一种中的应用:
[0028] 1)检测或辅助检测人AEG-1基因表达量或相对表达量;
[0029] 2)制备检测或辅助检测人AEG-1基因表达量或相对表达量产品;
[0030] 3)鉴定或辅助鉴定肿瘤组织和/或细胞;
[0031] 4)制备鉴定或辅助鉴定肿瘤组织和/或细胞产品。
[0032] 上述应用中,所述肿瘤组织和/或细胞可为肝癌、结肠癌、卵巢癌或乳腺癌组织和/ 或细胞。
[0033] 实验证明,本发明的引物对能够检测AEG-1在肝癌组织中的表达含量,操作相对简 单,结果准确。
[0034] 本发明鉴于现有技术中检测肝癌样品标志物的不足,本发明设计了检测内参/目 的基因用引物,用巧光定量PCR技术检测人融合基因相对表达量。通过调整两个基因的引物 探针浓度及比例,优化PCR的反应体系和反应条件,开发了一种用于检测AEG-1基因相对表 达量的试剂盒。
[003引使用本发明的试剂盒,将实时巧光PCR技术对AEG-1基因的表达水平进行检测,检 测精度高,而且操作简单,可降低检测成本,节约检测时间。采用双标准曲线法,通过构建 AEG-1和内参基因 GAPDH的标准定量曲线,精确定量样本的内参基因拷贝数和AEG-1拷贝数, 相比于W往的免疫组化方法,该试剂盒具有精度高,结果便于判读等优点。加之该试剂盒将 反应体系所需的引物、探针进行合理配比和优化,使实验条件达到最佳,从而省去了繁琐的 条件摸索环节,大大提升了实验效率。该试剂盒经测试特异性好,灵敏度高,操作简便。有助 于临床样品的辅助性检测。
【附图说明】
[0036] 图1为AEG-1烙解曲线。
[0037] 图2为GAPDH烙解曲线。
[003引图3为AEG-1和GAPDH的扩增曲线。其中。左侧为GAPDH扩增曲线,右侧为AEG-1扩增 曲线。
[0039] 图4为8位临床肝癌患者AEG-1的相对表达量。
【具体实施方式】
[0040] 下面结合【具体实施方式】对本发明进行进一步的详细描述,给出的实施例仅为了阐 明本发明,而不是为了限制本发明的范围。
[0041 ]下述实施例中的实验方法,如
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