专利名称：用于治疗病毒感染的化合物和药物组合物的制作方法
技术领域：
本发明提供了用于对有需要的宿主治疗病毒感染(包括丙型肝炎病毒感染和乙型肝炎病毒感染)的化合物、方法和药物组合物。
背景技术：
黄病毒科病毒病毒的黄病毒科包含至少三个不同的属瘟病毒属，其在牛和猪中引起疾病；黄病毒属，其是疾病例如登革热和黄热病的主要起因；和丙肝病毒属，它的唯一成员是HCV。 黄病毒属包括超过68个成员，根据血清学相关性分成若干组(Calisher等，J. Gen. Virol, 1993，70，37-43)。临床症状多变，包括发热、脑炎和出血热(Fields Virology，编辑 Fields,B. N. >Knipe,D. Μ.禾口Howley,P. Μ· ,Lippincott-Raven Publishers,Philadelphia, PA, 1996，第31章，931-959)。与人类疾病相关的全球关注的黄病毒包括登革出血热病毒 (DHF)、黄热病病毒、休克综合症和日本脑炎病毒(Halstead，S. B. ,Rev. Infect. Dis.，1984， 6，251-264；Halstead, S. B.，Science,239 :476_481，1988 ；Monath,T.P.，New Eng.J. Med.， 1988，319，641-643)。瘟病毒属包括牛病毒性腹泻病毒(BVDV)、典型性猪瘟病毒(CSFV，也叫猪霍乱病毒)和绵羊的边界病病毒(BDV) (Moennig V.等，Adv. Vir. Res. 1992，41，53-98)。驯化家畜 (牛、猪和绵羊)的瘟病毒感染，在世界范围内引起重大的经济损失。BVDV在牛中引起黏膜疾病，而且对畜牧业具有重大的经济重要性(Meyers G.和Thiel H. J. ,Advances in Virus Research，1996，47，53-118 ；Moennig V.等，Adv. Vir. Res. 1992，41，53-98)。人的瘟病毒还没有像动物瘟病毒那样被广泛表征。但是，血清学鉴定显示了人体内相当多的瘟病毒暴露。瘟病毒属和丙肝病毒属是黄病毒科内紧密相关的病毒群组。这 个科中其它紧密相关的病毒包括GB病毒A、类GB病毒A物质、GB病毒-B和GB病毒_C(也叫肝炎G病毒， HGV)。丙肝病毒群组(丙肝病毒；HCV)由许多紧密相关但基因型上可区分的感染人类的病毒组成。有大约6种HCV基因型和超过50种亚型。由于瘟病毒和丙肝病毒之间的相似性， 以及丙肝病毒在细胞培养中有效生长的低劣能力，牛病毒性腹泻病毒(BVDV)经常被用作研究HCV病毒的替代物。瘟病毒和丙肝病毒的遗传组成非常类似。这些正链RNA病毒具有单个大开放读码框(ORF)，该ORF编码病毒复制所必需的所有病毒蛋白。这些蛋白被表达为多聚蛋白，该多聚蛋白在翻译中和翻译后被细胞蛋白酶和病毒编码蛋白酶处理，产生成熟的病毒蛋白。负责病毒基因组RNA复制的病毒蛋白位于大约羧基末端内。ORF的三分之二被称作非结构(NS)蛋白。瘟病毒和丙肝病毒的ORF的非结构蛋白部分的遗传组成和多聚蛋白处理非常类似。对瘟病毒和丙肝病毒两者，成熟的非结构(NS)蛋白按照从非结构蛋白编码区的氨基末端到ORF的羧基末端的顺序由p7、NS2、NS3、NS4A、NS4B、NS5A和NS5B组成。瘟病毒和丙肝病毒的NS蛋白均具有特定蛋白功能所特有的序列域。举例来说，两个群组中病毒的NS3蛋白均具有丝氨酸蛋白酶和解螺旋酶所特有的氨基酸序列基序(Gorbalenya 等(1988)Nature 333 22 ；Bazan 和 Fletterick(1989)Virology 171 637-639 ;Gorbalenya 等(1989)Nucleic Acid Res. 17. 3889-3897)。类似地，癌病毒和丙肝病毒的NS5B蛋白具有RNA指导的RNA聚合酶所特有的基序(Koonin，Ε. V.和Dol ja， V. V. (1993) Crit. Rev. Biochem. Molec. Biol. 28 :375-430)。瘟病毒和丙肝病毒的NS蛋白在病毒生命周期中的实际作用和功能是直接类似的。在两种情况下，NS3丝氨酸蛋白酶负责ORF中在其位置下游的多聚蛋白前体的所有蛋白水解处理(Wiskerchen 和 Collett (1991) Virology 184 :341-350 ；Bartenschlager 等(1993)J. Virol. 67 :3835-3844 ；Eckart 等(1993)Biochem. Biophys. Res. Comm. 192 399-406 ；Grakoui 等(1993)J. Virol. 67 :2832-2843 ；Grakoui 等(1993)Proc. Natl. Acad. Sci.USA 90 :10583-10587 ；Hijikata 等(1993)J. Virol. 67 :4665-4675 ；Tome 等(1993) J. Virol. 67 :4017-4026)。NS4A蛋白在两种情况下都作为NS3丝氨酸蛋白酶的辅因子(Bartenschlager 等(1994)J. Virol. 68 :5045-5055 ；Failla ^ (1994)J. Virol. 68 3753-3760 ；Lin 等(1994) 68 :8147-8157 ；Xu 等(1997) J. Virol. 71 :5312-5322)。两种病毒的 NS3 蛋白也起解螺旋酶作用(Kim 等(1995) Biochem. Biophys. Res. Comm. 215 :160-166 ； Jin 禾口 Peterson(1995)Arch. Biochem. Biophys.，323 :47-53 ；Warrener 禾口 Collett(1995) J. Virol. 69 :1720-1726)。最后，瘟病毒和丙肝病毒的NS5B蛋白具有预期的RNA指导的 RNA 聚合酶活性(Behrens 等(1996) EMBO J. 15 12-22 ；Lchmann 等(1997) J. Virol. 71 8416-8428 ；Yuan 等(1997)Biochem. Biophys. Res. Comm.232 :231-235 ；Hagedorn, PCT WO 97/12033 ；美国专利号 5，981，247 ；6，248，589 和 6，461，845 Zhong 等(1998) J. Virol. 72. 9365-9369)。丙型肝炎病毒丙肝病毒(HCV)是世界范围内慢性肝脏疾病的主要病因。(Boyer，N.等 J. Hepatol. 32 =98-112,2000)。HCV引起缓慢增长的病毒感染，而且是肝硬化和肝细胞癌的主要病因(Di Besceglie, A.M.和 Bacon，B. R.，Scientific American, 10 月80_85， (1999) ；Boyer, N.等J. H印atol. 32 :98_112，2000)。估计世界范围内有一亿七千万人感染 7 HCV0 (Boyer, N.等J. H印atol. 32 :98_112，2000)。由慢性丙肝感染引起的肝硬化每年在美国导致了 8，000-12，000例死亡，而且HCV感染是肝脏移植的首要病症。已知HCV引起了至少80%的输液后肝炎和主要比例的偶发性急性肝炎。初步证据还暗示在“特发性”慢性肝炎、“隐源性”肝硬化以及可能与其它肝炎病毒例如乙肝病毒 (HBV)不相关的肝细胞癌中涉及HCV。一小部分健康人群显示为慢性HCV携带者，随地理和其它流行病学因素而变化。尽管信息仍然是初步的，但HCV携带者的人数可能远远超出HBV携带者的人数；还不清楚这些人中有多少患有亚临床的慢性肝脏疾病。(The Merck Manual，第 18 版，Q006))。HCV是包膜病毒，包含大约9. 4kb的正义单链RNA基因组。病毒基因组由5'非翻译区(UTR)、编码具有大约3011个氨基酸的多聚蛋白前体的长开放读码框和短的3' UTR 组成。5' UTR是HCV基因组中最高度保守的部分而且对多聚蛋白翻译的起始和控制是重要的。HCV基因组的翻译通过被称作内部核糖体进入的帽(cap)依赖性机制起始。这一机制包括核糖体与被称作内部核糖体进入位点(IRES)的RNA序列的结合。RNA假结体结构最近被确定为HCVIRES的基本结构元件。病毒的结构蛋白包括核壳体核心蛋白(C)和两种包膜糖蛋白El和E2。HCV也编码两种蛋白酶，由NS2-NS3区域编码的锌依赖性金属蛋白酶和在NS3区域中编码的丝氨酸蛋白酶。需要这些蛋白酶将前体多聚蛋白的特定区域裂解为成熟的肽。非结构蛋白5的羧基一半NS5B，包含RNA依赖性RNA聚合酶。剩下的非结构蛋白 NS4A和NS4B以及NS5A(非结构蛋白5的氨基末端一半)的功能仍然是未知的。目前抗病毒研究的重大焦点针对治疗人体中慢性HCV感染的改良方法的开发(Di Besceglie, Α. M.和 Bacon，B. R.，Scientific American,10 月80_85，(1999))。由于HCV感染已经在世界范围内达到了流行病等级且对受感染的患者具有悲剧性的影响的事实，对提供治疗丙肝的对宿主具有低毒性的新有效药剂，仍然存在强烈需求。此外，考虑到其它黄病毒科感染日益增加的威胁，对提供对宿主具有低毒性的新有效药剂仍然存在强烈需求。发明概述在一些实施方案中，本发明提供具有式I的化合物
权利要求
1.一种具有下式的非对映异构体纯的化合物
2. 一种具有下式的非对映异构体纯的化合物
3. 一种具有下式的纯化的化合物
4.权利要求3所述的其具有式II纯化的化合物
5.权利要求3所述的具有式III的纯化的化合物
6.权利要求3所述的具有式IV的纯化的化合物
7.权利要求3所述的具有式V的纯化的化合物
8.权利要求3所述的纯化的化合物，选自
9.权利要求3所述的纯化的化合物，选自
10. 一种化合物的纯化的代谢物，所述化合物具有式
11. 一种化合物的纯化的代谢物，所述化合物具有式
12. 一种化合物的纯化的代谢物，所述化合物具有式
13. 一种具有式I的同位素富集的化合物
14.权利要求13所述的同位素富集的化合物，其中所述化合物是同位素富集的化合物 2、同位素富集的化合物2a、同位素富集的化合物2b、同位素富集的化合物3、同位素富集的化合物3a、同位素富集的化合物3b、同位素富集的化合物4、同位素富集的化合物5、同位素富集的化合物6、同位素富集的化合物7、同位素富集的化合物8、同位素富集的化合物8a、 同位素富集的化合物8b、同位素富集的化合物9、同位素富集的化合物9a、同位素富集的化合物％、同位素富集的化合物10、同位素富集的化合物10a、同位素富集的化合物10b、同位素富集的化合物11、同位素富集的化合物11a、和同位素富集的化合物lib。
15.一种同位素富集的化合物，其选自同位素富集的化合物1、同位素富集的化合物 la、和同位素富集的化合物lb。
16.一种治疗感染了黄病毒科病毒的宿主的方法，包括施用治疗有效量的权利要求 1-15任一项的化合物。
17.权利要求16所述的方法，其中所述病毒是丙型肝炎病毒。
18.权利要求17所述的方法，其中所述宿主是人。
19.权利要求16所述的方法，其中所述施用指向所述宿主的肝脏施用大量所述化合物或其药学上可接受的盐或立体异构体。
20.权利要求16所述的方法，其中所述化合物或其药学上可接受的盐或立体异构体与第二抗病毒剂组合或交替施用，所述第二抗病毒剂选自干扰素、利巴韦林、白细胞介素、 NS3蛋白酶抑制剂、半胱氨酸蛋白酶抑制剂、菲醌、噻唑烷衍生物、噻唑烷、苯甲酰苯胺、解旋酶抑制剂、聚合酶抑制剂、核苷酸类似物、胶霉毒素、浅蓝菌素、反义硫代磷酸寡聚脱氧核苷酸、IRES依赖性翻译抑制剂、和核酶。
21.权利要求20所述的方法，其中所述第二抗病毒剂选自聚乙二醇化的干扰素ah、 复合α干扰素、天然干扰素、albuferon、干扰素β _la、ω干扰素、干扰素α、干扰素Υ、干扰素τ、干扰素δ和干扰素Y-lb。
22.权利要求20所述的方法，其中所述第二抗病毒剂是利巴韦林。
23.权利要求16所述的方法，其中所述宿主是人。
24.一种药物组合物，其包含权利要求1-15任一项所述的化合物以及药学上可接受的赋形剂、载体或稀释剂。
25.权利要求18所述的组合物，其中所述组合物是口服剂型。
26.一种制备权利要3-9任一项所述纯化的化合物的方法，该方法包括(a)将具有下式的前体化合物1
27.权利要求24所述的方法，其中所述分离包括从含介质的反相柱中洗脱所述化合物。
28.具有式VI的化合物
29.权利要求28所述的化合物，其中Ra和Rb选自i)Ra是氢；和Rb是异丙基、叔丁基、环己基、乙氧基羰基甲基、叔丁氧基羰基甲基、羧甲基或二甲基氨基乙基；或Rb与它们取代的氮原子一起形成4-甲基哌嗪或吗啉环。
30.权利要求28所述的化合物，该化合物选自
31.权利要求观所述的化合物，其中该化合物是
32.权利要求28所述的化合物，其中该化合物是
33.一种治疗感染了黄病毒科病毒的宿主的方法，该方法包括施用治疗有效量的权利要求观-32任一项的化合物。
34.一种治疗感染了黄病毒科病毒的宿主的方法，该方法包括以约Img/天至约150mg/ 天施用化合物1。
35.权利要求34所述的方法，其中所述量是约5mg/天至约IOOmg/天。
36.权利要求34所述的方法，其中所述量是约5、10、25、50、75或IOOmg/天。
37.权利要求33-36任一项所述的方法，该方法进一步包括施用第二抗病毒剂，所述第二抗病毒剂选自干扰素、利巴韦林、白细胞介素、NS3蛋白酶抑制剂、半胱氨酸蛋白酶抑制剂、菲醌、噻唑烷衍生物、噻唑烷、苯甲酰苯胺、解旋酶抑制剂、聚合酶抑制剂、核苷酸类似物、胶霉毒素、浅蓝菌素、反义硫代磷酸寡聚脱氧核苷酸、IRES依赖性翻译抑制剂、和核酶。
38.权利要求37所述的方法，其中所述第二抗病毒剂选自聚乙二醇化的干扰素ah、 复合α干扰素、天然干扰素、albuferon、干扰素β _la、ω干扰素、干扰素α、干扰素Υ、干扰素τ、干扰素δ和干扰素Y-lb。
39.权利要求38所述的方法，其中所述第二抗病毒剂是利巴韦林。
40.权利要求39所述的方法，其中化合物1以约Img/天至约150mg/天的量施用，利巴韦林以800mg至约1400mg的量施用。
41.权利要求40所述的方法，其中利巴韦林的施用量是约800mg、1000mg、1200mg或 1400mgo
42.权利要求33-41任一项所述的方法，其中所述病毒是丙型肝炎病毒。
43.权利要求33-42任一项所述的方法，其中所述宿主是人。
44.一种药物组合物，该组合物包含权利要求28-32任一项所述的化合物和药学上可接受的赋形剂、载体或稀释剂。
45.权利要求34所述的组合物，其中所述组合物是口服剂型。
46.一种药物组合物，其包含约Img至约150mg量的化合物1。
47.权利要求46所述的药物组合物，其中所述量是约5mg或25mg。
48.权利要求47所述的组合物，其中该组合物是口服胶囊。
49.一种制备化合物1的方法，该方法包括i)使2’ -C-甲基鸟苷与硫酸钠和苯硼酸反应，获得式10-2化合物
全文摘要
本发明提供了用于治疗肝脏病症包括HCV感染的化合物、组合物和方法。具体地，本发明公开了核苷酸衍生物化合物和组合物，它们可以单独施用或与其它抗病毒剂组合施用。
文档编号A61P31/12GK102177172SQ200980134342
公开日2011年9月7日 申请日期2009年7月1日 优先权日2008年7月2日
发明者布兰达·赫尔南德斯-圣地亚哥, 库苏姆·古普塔, 艾丽卡·克里顿-斯科特, 马里塔·拉尔森 申请人:埃迪尼克斯医药公司