一种利用hrm法进行牛/羊肉鉴别的标记引物和方法_2

文档序号:9246009阅读:来源:国知局

[0097] 下面结合实施例对本发明做进一步说明,下列实施例中未注明具体条件的实验方 法,通常按照本领域的公知手段。
[0098] 实施例1
[0099] 1)检测位点的选取及引物的设计
[0100] 选取在牛基因中特异存在的标记基因片段,设计HRM法检测的引物。
[0101] 标记基因片段,分别为:
[0102] 牛肉基因标记1,序列如SEQIDNO. 1所示;
[0103] 牛肉基因标记2,序列如SEQIDNO. 2所示;
[0104] 牛肉基因标记3,序列如SEQIDNO. 3所示。
[0105] 本发明中所用的引物信息见表1,由生工生物(上海)有限公司合成。
[0106] 表1牛肉HRM法检测的引物
[0107]
[0108] (2)DNA样品制备
[0109] 采集任一牛肉、猪肉、鸡肉、鸭肉、鹅肉品种,每个品种7个样品。采用酚、氯仿法提 取肉样品的DNA,并经紫外分光光度计检测后,将每份样品中DNA的浓度稀释到30ng/ul左 右。
[0110](3)HRM法检测
[0111]HRM法反应体系见表2:
[0112] 表2HRM法反应体系
[0114] MeltDoctor?HRM Master Mix产自ABI公司,货号为4415440。
[0115]HRM法反应条件:
[0116]使用仪器为:ABI QuantStudio? 6 Flex实时荧光PCR仪。
[0117] 95°C热启动反应lOmin;95°C反应15s,60°C反应lmin,反应结束后收集荧光信 号,共进行40个循环;95°〇反应108,601:反应1111111,逐渐升温至951:,连续收集荧光信号 (0. 025°C/次),反应完成后降温至60°C。
[0118] (4)检测结果比对
[0119] 从图1、3、5中可以看出,牛肉的检测位点用于牛肉检测时可以形成单一的明显熔 解峰,说明引物在牛的DNA样品中可以进行特异性扩增,本实施例中所选用的3个牛肉位点 的熔解温度分别为:标记基因1 :76. 327°C,标记基因2 :84. 450°C,标记基因3 :85. 313°C。 而在用于猪肉、鸡肉、鸭肉、鹅肉检测时,检测出的熔解峰均较杂,无单一的熔解峰(如图2、 4、6),说明在这些品种肉的DNA样品中,该引物不能进行特异性扩增。在实际检测时,可以 明显看出牛肉的检测熔解峰与其他品种肉的区别,因此可以轻松分辨出检测样品是否为牛 肉。
[0120] 实施例2 :
[0121] (1)检测位点的选取及引物的设计
[0122] 选取在羊基因中特异存在的标记基因片段,设计HRM法检测的引物。本发明中所 用的引物信息见表3,由生工生物(上海)有限公司合成。
[0123] 标记基因片段,分别为
[0124] 羊肉基因标记1,序列如SEQIDN0. 4所示;
[0125] 羊肉基因标记2,序列如SEQIDNO. 5所示;
[0126] 羊肉基因标记3,序列如SEQIDNO. 6所示
[0127] 表3羊肉HRM法检测的引物
[0129] (2)DNA样品制备
[0130] 采集任一羊肉、猪肉、鸡肉、鸭肉、鹅肉品种,每个品种各7个样品。采用酚、氯仿法 提取肉样品的DNA,并经紫外分光光度计检测后,将每份样品中DNA的浓度稀释到30ng/ul 左右。
[0131] (3)HRM法检测
[0132]HRM法反应体系及反应条件同实施例1(3)中所述。
[0133] (4)检测结果比对
[0134] 从图7、9、11中可以看出,羊肉的检测位点用于羊肉检测时可以形成单一的明 显熔解峰,说明引物在羊的DNA样品中可以进行特异性扩增,本实施例中所选用的3个 羊肉位点的熔解温度分别为:标记基因1 :79.871°C,标记基因2 :84.047°C,标记基因3 : 78. 812°C。而在用于猪肉、鸡肉、鸭肉、鹅肉检测时,检测出的熔解峰均较杂,无单一的熔解 峰(如图8、10、12),说明在这些品种肉的0嫩样品中,该引物不能进行特异性扩增。在实际 检测时,可以明显看出羊肉的检测熔解峰与其他品种肉的区别,因此可以轻松分辨出检测 样品是否为羊肉。
[0135] 可以知道,上述实施例仅为了说明发明原理而采用的示例性实施方式,然而本发 明不仅限于此,本领域技术人员在不脱离本发明实质情况下,可以做出各种改进和变更,这 些改进和变更也属于本发明的保护范围。
【主权项】
1. 一种牛肉鉴别标记,其特征在于:标记为3个,分别为: 牛肉基因标记1,序列如SEQ ID NO. 1所示; 牛肉基因标记2,序列如SEQ ID NO. 2所示; 牛肉基因标记3,序列如SEQ ID NO. 3所示。2. -种利用HRM法进行牛肉鉴别的标记引物,其特征在于:根据牛肉基因标记1,设计 标记引物对1 ;其中, 牛肉标记引物 IF :GITTGACCTGCTCCTAACTCCATCCC, 牛肉标记引物 IR :GGAGGCAGTCGTCAGGCTAITCAA ; 根据牛肉基因标记2,设计标记引物对2 ;其中, 牛肉标记引物 2F :GCAGTGAGATGACCCCGTGGA, 牛肉标记引物 2R :GCCATAAGGGAGGAACACTCTGAC ; 根据牛肉基因标记3,设计标记引物对3 ;其中, 牛肉标记引物 3F :ACAGTGGGAACAITTCAAAGGAGGC, 牛肉标记引物 3R :GGTGTCAGAGGACCTGTCAGTGGAGT。3. -种羊肉鉴别标记,其特征在于:标记为3个,分别为: 羊肉基因标记1,序列如SEQ ID NO. 4所示; 羊肉基因标记2,序列如SEQ ID NO. 5所示; 羊肉基因标记3,序列如SEQ ID NO. 6所示。4. 一种利用HRM法进行羊肉鉴别的标记引物,其特征在于:根据羊肉基因标记1,设计 标记引物1 ;其中, 羊肉标记引物 IF :GGTGCTGAATGAGAAATG, 羊肉标记引物 IR :CTAAATGGGTCAGAAACC ; 根据羊肉基因标记2,设计标记引物2 ;其中, 羊肉标记引物 2F :CGAITCAGATGCCAAGAG, 羊肉标记引物 2R :TGAGAAGGGATACAAGCA ; 根据羊肉基因标记3,设计标记引物3 ;其中, 羊肉标记引物 3F :CITTGCCACAITCATTAC, 羊肉标记引物 3R :TCAGTGTACGCTCAACTC。5. -种利用HRM法进行牛肉鉴别的方法,其特征在于,该方法包括如下步骤,包括如下 步骤: 1) 选取特异存在于牛基因中的位点,并根据选取位点,设计相应引物; 2) 取牛肉、猪肉、鸡肉、鸭肉、鹅肉品种,每个品种7个样品,每份样品150mg-250mg,分 别提取DNA ; 3) 利用HRM法对每个样品进行检测:样品DNA在实时荧光PCR仪中进行PCR扩增过 程,扩增结束后,在此仪器中测试每个样品的熔解温度,仪器通过收集到的荧光信号绘制相 应的熔解曲线; 4) 分析不同品种检测得到的溶解曲线图,可以发现牛肉标记引物1、2、3用于牛肉检 测时可以形成单一的明显熔解峰,而在用于猪肉、鸡肉、鸭肉、鹅肉检测时,均无单一的熔解 峰,因此可以确定通过牛肉标记引物1、2、3可以特异性地检测出牛肉存在; 5)后期,提取待检测肉样品的DNA,用HRM法对DNA样品进行检测后,与真牛肉的检测 结果进行比对,验证所分析的待检测肉样品是牛肉。6. 权利要求5所述的牛肉鉴别的方法,其特征在于,所述牛基因中的位点为: 牛肉基因标记1,序列如SEQ ID NO. 1所示; 牛肉基因标记2,序列如SEQ ID NO. 2所示; 牛肉基因标记3,序列如SEQ ID NO. 3所示; 所述引物为: 标记引物对1;其中, 牛肉标记引物 IF :GITTGACCTGCTCCTAACTCCATCCC, 牛肉标记引物 IR :GGAGGCAGTCGTCAGGCTAITCAA ; 标记引物对2;其中, 牛肉标记引物 2F :GCAGTGAGATGACCCCGTGGA, 牛肉标记引物 2R :GCCATAAGGGAGGAACACTCTGAC ; 标记引物对3;其中, 牛肉标记引物 3F :ACAGTGGGAACAITTCAAAGGAGGC, 牛肉标记引物 3R :GGTGTCAGAGGACCTGTCAGTGGAGT。7. -种利用HRM法进行羊肉鉴别的方法,其特征在于,该方法包括如下步骤: 1) 选取特异存在于羊基因中的位点,并根据选取位点,设计相应引物; 2) 取羊肉、猪肉、鸡肉、鸭肉、鹅肉品种,每个品种7个样品,每份样品150mg-250mg,提 取其DNA ; 3) 利用HRM法对每个样品进行检测:样品DNA在ABI QuantStudio? 6 Flex实时荧光 PCR仪中进行PCR扩增过程,扩增结束后,在此仪器中测试每个样品的熔解温度,仪器通过 收集到的荧光信号绘制相应的熔解曲线; 4) 分析不同肉的检测得到的溶解曲线图,可以发现羊肉标记引物1、2、3用于羊肉检 测时可以形成单一的明显熔解峰,而在用于猪肉、鸡肉、鸭肉、鹅肉检测时,均无单一的熔解 峰,因此可以确定通过羊肉标记引物1、2、3可以特异性地检测出羊肉存在; 5) 后期,提取待检测肉样品的DNA,用HRM法对DNA样品进行检测后,与真羊肉的检测 结果进行比对,验证所分析的待检测肉样品是羊肉。8. 权利要求7所述的羊肉鉴别的方法,其特征在于: 所述羊基因中的位点, 羊肉基因标记1,序列如SEQ ID NO. 4所示; 羊肉基因标记2,序列如SEQ ID NO. 5所示; 羊肉基因标记3,序列如SEQ ID NO. 6所示; 所述引物为: 标记引物1 ;其中, 羊肉标记引物 IF :GGTGCTGAATGAGAAATG, 羊肉标记引物 IR :CTAAATGGGTCAGAAACC ; 标记引物2;其中, 羊肉标记引物 2F :CGAITCAGATGCCAAGAG, 羊肉标记引物 2R :TGAGAAGGGATACAAGCA ; 标记引物3;其中, 羊肉标记引物 3F :CITTGCCACAITCATTAC, 羊肉标记引物 3R :TCAGTGTACGCTCAACTC。9.权利要求5-8任一项所述的方法,其特征在于: 反应体系:以IOyL计量,5yL的MeltDoctor?HRM Master Mix,10yM上下游引物各 0? 3 y L,3. 4 y L 的水,30ng/ y L 样品 DNAl y L。 反应条件:95°C热启动反应10min ;95°C反应15s,60°C反应lmin,反应结束后收集荧光 信号,共进行40个循环;95°C反应10s,60°C反应lmin,逐渐升温至95°C,连续收集荧光信 号(0. 025°C /次),反应完成后降温至60°C。
【专利摘要】本发明属于食品技术领域,提供一种利用HRM法进行牛肉、羊肉鉴别的标记引物以方法。牛肉鉴别的标记,分别为:牛肉基因标记1,序列如SEQ ID NO.1所示;牛肉基因标记2,序列如SEQ ID NO.2所示;牛肉基因标记3,序列如SEQ ID NO.3所示。羊肉鉴别标记,分别为:羊肉基因标记1,序列如SEQ ID NO.4所示;羊肉基因标记2,序列如SEQ ID NO.5所示;羊肉基因标记3,序列如SEQ ID NO.6所示。本发明通过HRM法鉴别牛、羊肉,具有快速、简便的特点,整个过程仅需2个小时完成。
【IPC分类】C12Q1/68, C12N15/11
【公开号】CN104962618
【申请号】CN201510309901
【发明人】李春保, 吴洽宇, 周光宏
【申请人】南京农业大学
【公开日】2015年10月7日
【申请日】2015年6月8日
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