一种人乳腺癌特异性基因1mRNA实时荧光定量RT-PCR检测试剂盒的制作方法

文档序号:14590161发布日期:2018-06-02 06:31阅读:261来源:国知局

本发明属于生物医学技术领域,涉及一种人乳腺癌特异性基因1mRNA实时荧光定量RT-PCR检测试剂盒。



背景技术:

乳腺癌作为一种常见的恶性肿瘤,严重威胁女性的生命和健康。近年来我国乳腺癌的发病率明显增高,

目前,我国乳腺癌发病率为42.55 /10万,居女性恶性肿瘤的第一位。目前,乳腺癌的治疗方法有多种,如手术、放疗、化疗及生物治疗等,其中以乳腺癌手术切除为主要治疗措施,但术后复发和转移已成为阻碍患者生存期提高的主要原因。血行播散是肿瘤转移的主要途径之一,由于自然或侵袭性医源性因素,癌细胞可从原发灶脱落形成循环肿瘤细胞,但是目前的检测方法灵敏度及特异性较低,不能检测到微量的癌细胞,这些癌细胞随血液到达外周组织并处于休眠状态,当患者机体免疫功能下降时,休眠的癌细胞就有可能被激活,从而导致了乳腺癌的复发和转移,循环肿瘤细胞的数量与乳腺癌的进展及患者生存期等密切相关。随着分子生物学技术的飞速发展及其在医学研究中的广泛应用,通过RT-PCR技术检测外周血中微量肿瘤细胞已成为可能并被尝试。实时荧光定量PCR技术是一种能够准确定量mRNA的检测方法,通过检测人乳腺癌特异性基因1(BCSG1)mRNA的表达以判断循环乳腺肿瘤细胞的存在。

人乳腺癌特异性基因1(BCSG1)是一种特异性的在乳腺癌中选择性表达的基因,其定位于人类染色体10q23,DNA长度约5kb。BCSG1基因编码合成1条含127个氨基酸的蛋白,其在乳腺癌组织中特异性表达,在正常乳腺或良性乳腺病变中几乎不表达,是一种与乳腺癌进展有关的肿瘤标记物。BCSG1基因的表达与肿瘤分期、淋巴结浸润、肿瘤体积及转移等密切相关,在III / IV期乳腺癌中BCSG1的阳性率为71. 4% 或81% ,I / II患者中阳性率为26.8%或15%,BCSG1阳性的乳腺癌患者其生存期较BCSG1阴性患者明显缩短。正常人外周血BCSG1 mRNA呈阴性;游离于细胞外的mRNA很不稳定,极易被RNA酶解,故在外周血中若测得BCSG1 mRNA,则提示血循环中存在有完整的乳腺癌细胞,但目前尚没有合适的阳性率高的检测技术。

由于目前通过实时荧光定量PCR技术检测人乳腺癌特异性基因1(BCSG1)mRNA的表达以判断循环乳腺肿瘤细胞的阳性率低,不具有临床应用价值,因此,研制一种较高的特异性、灵敏性、准确性及质量控制的BCSG1 mRNA实时荧光定量RT-PCR检测试剂盒是非常必要的。



技术实现要素:

针对现有技术存在的问题,本发明的目的在于提供一种人乳腺癌特异性基因1mRNA实时荧光定量RT-PCR检测试剂盒。本发明人乳腺癌特异性基因1mRNA实时荧光定量RT-PCR检测试剂盒具有较高的特异性、灵敏性、准确性及质量控制等优点。

为解决上述技术问题,本发明采用的技术方案为。

一种人乳腺癌特异性基因1mRNA实时荧光定量RT-PCR检测试剂盒,包括红细胞裂解液、无RNA 酶水、RNA提取液、dNTP 混合物、逆转录酶储存液、反转录缓冲液、PCR反应缓冲液、UNG酶储存液、引物对、探针、标准品、阳性质控品、阴性质控品。

所述红细胞裂解液是由pH7.6 0.01 mol/L Tris-HCl、0.01mol/L NaCl和0.005 mol / L MgCl2组成。

所述引物为包含BCSG1基因的上游引物和正常的下游引物,序列分别如下:

上游引物:5’- GGGTGAGGCATCCAA AGAGA -3 ’;

下游引物:5’- TGGGCAGCCGCATGTC-3’。

所述探针由通常的核苷酸引物合成仪合成,序列如下:扩增BCSG1基因的引物序列如下:5’-FAM-AGA GGA AGTGGCAGA GGAGGCCCA-TAMRA-3’。

所述阳性质控品为含有 BCSG1 mRNA的总RNA。

所述阴性质控品为不含 BCSG1 mRNA的总RNA。

所述标准品采用BCSG1质粒使用 TE溶液溶解,浓度为 2 × 107拷贝数/μL。

本发明的有益效果:

(1)本发明优化了试剂盒中的引物、探针、定值标准品、设立阳性、阴性质控品提高了试剂盒的特异性、灵敏性、准确性及质量控制等性能,本发明试剂盒的特异度及准确性均为 95% 以上,灵敏度为100拷贝/m L(全血),稳定性较好,在-20℃中保存12个月其性能未发生变化。

(2)本发明试剂盒对外周血标本中 BCSG1 mRNA的检测结果表明,12 例临床确诊已转移的乳腺癌患者检测结果均为阳性,21 例临床未确诊转移的乳腺癌患者中 12 例为阳性,其余9例为阴性; 15 例乳腺良性疾病患者、10例正常人均为阴性,未检测到BCSG1 mRNA的表达,临床确诊已转移的乳腺癌患者外周血中BCSG1 mRNA表达量和阳性率明显高于未确诊转移的乳腺癌患者、乳腺良性疾病患者及正常人。由此可推测外周血样品中BCSG1 mRNA的表达量与患者的临床分期等密切相关,是一项较好的血源性乳腺癌细胞的监测指标,可作为乳腺癌患者诊疗过程中的重要监测指标。本发明试剂盒检测乳腺癌患者血中的BCSG1 mRNA的表达量,对判断乳腺癌的发生、转移、复发,治疗效果评价及病情的动态观察具有重要意义。

附图说明

图1本发明试剂盒检测外周血BCSG1 mRNA的定量检测结果。

具体实施方式

为了进一步理解本发明,下面结合实施例对本发明优选实施方案进行描述,但是应当理解,这些描述只是为进一步说明本发明的特征和优点,而不是对本发明权利要求的限制。

1、本发明人乳腺癌特异性基因1mRNA实时荧光定量RT-PCR检测试剂盒

本发明试剂盒包括红细胞裂解液(由pH7.6 0.01 mol/L Tris-HCl、0.01mol/L NaCl和0.005 mol / L MgCl2组成)、无RNA 酶水、RNA提取液、dNTP 混合物、逆转录酶储存液、反转录缓冲液、PCR反应缓冲液、UNG酶储存液、引物对、探针、标准品(采用BCSG1质粒使用 TE溶液溶解,浓度为 2 × 107拷贝数/μL)、阳性质控品(含有 BCSG1 mRNA的总RNA)、阴性质控品(不含 BCSG1 mRNA的总RNA)。

所述引物为包含BCSG1基因的上游引物和正常的下游引物,序列分别如下:

上游引物:5’- GGGTGAGGCATCCAA AGAGA -3 ’;

下游引物:5’- TGGGCAGCCGCATGTC-3’。

所述探针由通常的核苷酸引物合成仪合成,序列如下:扩增BCSG1基因的引物序列如下:5’-FAM-AGA GGA AGTGGCAGA GGAGGCCCA-TAMRA-3’。

2、本发明人乳腺癌特异性基因1mRNA实时荧光定量RT-PCR检测试剂盒实验步骤如下:

第一步外周血有核细胞分离

采静脉血 3 m L 于5 m L EDTA抗凝管中,使用红细胞裂解液裂解红细胞,4℃,450 g,离心10 min,收集有核细胞,备用。

第二步总RNA提取

外周血有核细胞、K562 细胞( 阴性对照) 和 SK-BR-3 细胞( 阳性对照) 的总RNA均按Trizol试剂盒方法提取。

第三步实时荧光定量RT-PCR

(1)RT反应:总体积为10μL,包括反转录反应液3.5μL、总RNA溶液5.0μL、无RNA酶的水1.5μL。反应条件为:37℃,20 min:95℃,5 min。反应结束后,将反应产物取出置于冰盒上,备用。

(2)标准品的处理:将标准品储存液(2 × 107拷贝数/μL)梯度稀释为 2 × 106,2 × 105,2 × 104,2 × 103,2 × 102,2 × 101拷贝数/μL,备用。

(3)荧光定量PCR反应:在ABI公司7000型定量PCR仪上进行PCR扩增;反应体系为:模板5.0μL、PCR反应液15.0μL、水 5.0μL,其中,模板分别为实验组样品反转录产物、对照组样品反转录产

物、阳性及阴性质控品反转录产物和标准品;反应条件为:37℃,10 min→95℃,15 min→( 95℃,15 s→60℃,1 min) 。括号内条件共重复45个循环。

3、本发明试剂盒的临床研究

收集乳腺癌患者外周血标本33份(由安徽省立医院、安徽医科大学第一附属医院及合肥市第一人民医院提供,患者知情,经临床诊断结果如图1),其中12份为临床上已确诊远端转移的标本;乳腺增生及乳腺炎患者外周血标本15份;正常人外周血标本10份。用实施例2中的人乳腺癌特异性基因1mRNA实时荧光定量RT-PCR检测试剂盒及其检测方法对以上乳腺癌患者外周血标本进行检测。

可以理解的是,以上关于本发明的具体描述,仅用于说明本发明而并非受限于本发明实施例所描述的技术方案,本领域的普通技术人员应当理解,仍然可以对本发明进行修改或等同替换,以达到相同的技术效果;只要满足使用需要,都在本发明的保护范围之内。

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