一株重组大肠杆菌及其在发酵生产2[4Fe4S]铁氧还蛋白中的应用
【技术领域】
[0001] 本发明涉及基因重组工程菌及其应用，尤其涉及一株含有2[4Fe4S]铁氧还蛋白 基因的重组大肠杆菌及其在发酵生产2 [4Fe4S]铁氧还蛋白中的应用。
【背景技术】
[0002] 铁氧还蛋白是一类含铁硫簇的酸性蛋白，其中的铁硫簇又主要分为[4Fe4S]、 [2Fe2S]、[3Fe4S]等类型。铁氧还蛋白作为一种常见的电子载体，参与呼吸作用、光合作用、 发酵等重要代谢过程。目前，商业上出售的只有来自菠菜的[2Fe2S]型铁氧还蛋白，然而因 物种差异，该铁氧还蛋白在分析来自其他物种的酶的时候表现出不同的效率，且该蛋白价 格非常昂贵，这在很大程度上限制了铁氧化还原蛋白的应用和科学家对铁氧还蛋白相关的 酶和代谢过程的研究。
[0003] 在已有的文献报道中，大部分铁氧还蛋白是从野生细菌等生物体中纯化获得的， 也有通过异源表达来制备，但这些方法具有很多不足，比如消耗大量的时间，纯化步骤繁 琐，表达量低，铁氧还蛋白的铁硫簇组装不完整而活力较低，最终产量和纯度较低等。基于 此，研究和开发能够高效表达2 [4Fe4S]铁氧还蛋白的方法成为目前亟待解决的课题，经检 索，有关能够高效表达2[4Fe4S]铁氧还蛋白的重组大肠杆菌及其在发酵生产2[4Fe4S]铁 氧还蛋白中的应用还未见报道。
【发明内容】
[0004] 针对现有技术的不足，本发明的目的是提供一株重组大肠杆菌及其在发酵生产 2[4Fe4S]铁氧还蛋白中的应用。
[0005] 本发明所述的重组大肠杆菌，其特征在于，该重组大肠杆菌命名为大肠杆菌 (Escherichiacoli)pCodonPlus/pRKISC/pET51b_2[4Fe4S]Fd，该菌株含有 2[4Fe4S]铁氧 还蛋白基因，其核苷酸序列如SEQIDNO. 1所示；所述重组大肠杆菌是将2[4Fe4S]铁氧还 蛋白基因连接入pET51b-l载体，制得重组质粒命名为pET51b-2 [4Fe4S]，并将制得的重组 质粒转入含有pCodonPlus和pRKISC质粒的E.coliC41(DE3)中获得。
[0006] 上述的重组大肠杆菌中，所述2[4Fe4S]铁氧还蛋白基因优选来源于巴斯德梭菌 (Clostridiumpasteurianum)DSM525〇
[0007] 本发明所述重组大肠杆菌在发酵生产2[4Fe4S]铁氧还蛋白中的应用。
[0008] 其中，所述重组大肠杆菌发酵生产2 [4Fe4S]铁氧还蛋白的方法是：
[0009] (1)将重组大肠杆菌菌株以体积比1~5%的接种量接种到含有抗生素和铁硫源 的TB培养基中，在37± 1°C和180± 10rpm转速条件下培养2~3小时至0D62(]nni为0. 4~ 0.6,获得菌液；
[0010] 其中，上述TB培养基的配方及组分终浓度是：Tryptone12g/L，Yeastextract 24g/L，Glycerol4ml/L，ΚΗ2Ρ04 2. 3g/L，Κ2ΗΡ04 12. 5g/L;
[0011] 上述抗生素分别是终浓度为25μg/ml的氯霉素，终浓度为10μg/ml的四环素，终 浓度为25μg/ml的羧苄西林；
[0012] 上述铁硫源配方及组分终浓度是：柠檬酸铁铵0.2-0. 3g/L，L-半胱氨酸 0· 1-0. 2g/L，柠檬酸铁 0· 18-0. 3g/L，FeS04 · 7H20 0· 25-0. 4g/L;
[0013] (2)向制得的菌液中加入终浓度为0· 5mM的IPTG，在16~37°C和180±10rpm转 速下诱导2. 5~24小时，收集培养液离心，获得含2 [4Fe4S]铁氧还蛋白的重组大肠杆菌细 胞；
[0014] (3)破碎细胞，分离纯化制备2 [4Fe4S]铁氧还蛋白。
[0015] 上述的应用中，步骤（2)所述IPTG优选在35~37°C和180rpm转速下诱导10~ 20小时。
[0016] 步骤（3)中破碎细胞的方法是：将离心后获得的含2 [4Fe4S]铁氧还蛋白的重组大 肠杆菌细胞用含10%甘油的缓冲液A重悬后，采用超声波破碎仪器进行细胞破碎，12, 000 转/分钟离心30min，取上清液用0. 22um孔径滤膜过滤，即获得含有Str印标签的2 [4Fe4S] 铁氧还蛋白粗酶液。
[0017] 步骤（3)中分离纯化制备2 [4Fe4S]铁氧还蛋白的方法是：
[0018] Strep柱纯化：将制得含有Strep标签的2 [4Fe4S]铁氧还蛋白粗酶液，经过上样 柱进入Strep柱中，上样速度为2ml/min。上样结束，用缓冲液A冲洗镍柱，去除杂蛋白。再 用缓冲液B进行洗脱，收集目的蛋白。纯化完成后将Strep柱进行再生。
[0019] 洗脱出来的蛋白用浓缩管进行浓缩，并用洗涤缓冲液洗涤蛋白，SDS-PAGE观察蛋 白的大小及纯度，用考马斯亮蓝法测蛋白含量，用分光光度计对蛋白进行全波长扫描。
[0020] 最后得到纯化好的蛋白在厌氧条件下低温储存。
[0021] 活性测定：分别用氢化酶和NfnAB两种酶测定纯化出来的铁氧还蛋白的活性。
[0022] 上述缓冲液A的配方是：Tris-HCllOOmM，NaCl150mM，DTT2mM，pH7. 5。
[0023]上述缓冲液B的配方是：Tris-HCllOOmM，NaCl150mM，DTT2mM，desthiobiotin 2. 5mM?pH7. 5〇
[0024] 上述步骤所有操作过程均在厌氧操作箱中进行，所有溶液均进行煮沸后脱气厌氧 处理。
[0025] 本发明成功构建了能够表达带有Strep标签的2 [4Fe4S]铁氧还蛋白的重组大肠 杆菌，它的应用就是大家熟悉的大肠杆菌中异源表达的方法，不需要大量培养产铁氧还蛋 白的野生菌，节省了大量的时间，节约了成本。本发明的重组大肠杆菌种含有的pCodonPlus 与pRKISC质粒和诱导时加入的铁硫源促进了蛋白上铁硫簇的合成，活力强表达量高，使 2[4Fe4S]铁氧还蛋白最终产量显著提升。实验证实：通过SDS-PAGE观察蛋白纯度较好， 大小与预期的相符；每升培养物最终可以获得3. 5mg纯化后的2 [4Fe4S]铁氧还蛋白，远大 于从野生菌中纯化出来的0. 5mg的产量；蛋白进行全波长扫描后在390nm处有特征吸收峰 (见图1)，其A390/A280比值为0. 71，与野生菌中纯化出来蛋白的0. 76比值接近，说明铁硫 簇构建比较完整，获得的融合标签的铁氧还蛋白具有与野生蛋白相同的活性。活性检测中 分别测得氢化酶的比活为24. 1±2. 5U/mg，NfnAB的比活为18. 2±0. 7U/mg与文献中报道的 接近。预示本发明提供的重组大肠杆菌在工业化生产中具有很好的应用前景。
【附图说明】
[0026] 图1 :为本发明所述重组大肠杆菌表达的带有Strep标签的2 [4Fe4S]铁氧还蛋白 全波长扫描图。
[0027] 其中：在390nm处显示有特征吸收峰。
[0028] 图2 :为本发明所述重组大肠杆菌表达的带有Strep标签的2 [4Fe4S]铁氧还蛋白 SDS-PAGE电泳图。
[0029] 其中，Μ表示蛋白marker，1表示异源表达的纯化后的2[4Fe4S]铁氧还蛋白，2表 示来自野生菌的2[4Fe4S]铁氧还蛋白。
【具体实施方式】
[0030] 下面结合实施例对本
【发明内容】
作进一步阐述。
[0031] 本发明中所用菌株、材料及来源说明：
[0032]含pCodonPlus和pRKISC质粒的E.coliC41 (DE3)细胞由Dr.Yasuhiro Takahashi(大阪大学）构建和提供，其中pCodonPlus和E.coliC41 (DE3)分别来自 Stratagene公司和Lucigen公司。巴斯德梭菌（C.pasteurianum)DSM525购自德国微生物 菌种保藏中心。
[0033] 质粒小提试剂盒、DNA纯化回收试剂盒、细菌基因组DNA提取试剂盒购自天根生化 科技（北京）有限公司。QIAampDNAMini试剂盒、MinElutePCR纯化试剂盒购自Qiagen公 司。Wizard基因组DNA纯化试剂盒购自Promega公司。K0D热启动DNA聚合酶、pET-51b(+) Ek/LIC载体试剂盒购自Merck公司。内切酶、T4DNA连接酶购自Thermo公司。采用的镍柱 为HisTrapHPColumn，购自GEHealthcare公司。
[0034] 实施例1 :高效表达C.pasteurianumDSM525中的2[4Fe4S]型铁氧还蛋白的重 组大肠杆菌的构建
[0035] 取C.pasteurianumDSM525细胞，按照细菌基因组DNA提取试剂盒推荐 方法，从C.pasteurianumDSM525细胞中提取基因组DNA。根据已知的巴斯德梭菌 (C.pasteurianum)DSM525基因组中2[4Fe4S]型铁氧还蛋白基因序列如SEQIDN0.1所 示，设计引物如下：
[0036]F引物：5,GACGACGACAAGATGGCATATAAAATCGCTGATTCATGTG3'
[0037]R引物：5,GAGGAGAAGCCCGGTTATTCTTGTACTGGTGCTCCAACTGGA3'
[0038] 以提取的C.pasteurianumDSM525基因组DNA为模板，采用K0D热启动DNA聚合 酶进行PCR扩增，获得2[4Fe4S]型铁氧还蛋白基因。PCR反应体系如下：
[0039]
[0040]PCR反应条件为：
[0041] 95°C5min
[0042] 95°C30s，55°C30s，72°C30s30 个循环
[0043] 72°ClOmin
[0044] 4。。保温
[0045]PCR产物经琼脂糖凝胶电泳初步确认正确后，用MinElutePCR纯化试剂盒纯化。 纯化的PCR产物在dATP存在的条件下用T4DNA聚合酶处理，然后连接到pET-51b(+)Ek/LIC 载体上。将连接液加入NovaBlueGigaSing