用于构建基因地形图的方法、装置及系统的制作方法

文档序号:8319275阅读:219来源:国知局
用于构建基因地形图的方法、装置及系统的制作方法
【技术领域】
[0001] 本发明涉及数据处理领域,具体而言,涉及一种用于构建基因地形图的方法、装置 及系统。
【背景技术】
[0002] 基因作为遗传因子是遗传变异的主要物质,支持着生命的基本构造和性能。生物 体的生、长、病、老、死等一切生命现象都与基因有着直接或间接的关联。基因作为决定生命 健康的内在因素,在生物学及遗传领域发挥着重大的这作用,因此,在相关的技术领域,往 往需要建立基因系统以实现对基因信息的表达。
[0003] 现有的用于基因信息表达的系统仅仅只是一些图表格式的表现形式,还有一些简 单的二维展现方式,但是这些图表或者二维的展现形式往往资料非常零散,每一个零散的 展现方式需要进一步人为分析才能够得到相关的基因作用信息,非常耗时耗力还不直观。
[0004] 针对现有技术中构建的基因系统的信息表达方式较为零散,需要进一步人为分析 才能得到相关的基因作用信息的问题,目前尚未提出有效的解决方案。

【发明内容】

[0005] 本发明提供了一种用于构建基因地形图的方法、装置及系统,以至少解决现有技 术中构建的基因系统的信息表达方式较为零散,需要进一步分析才能得到相关的基因作用 十目息的问题。
[0006] 根据本发明的一个方面,提供了用于构建基因地形图的方法,该方法包括:响应于 触发的构建基因地形图的指令,发送第一请求信息至后台服务器,其中,第一请求信息中携 带有用于标识所需构建地形图的基因的属性信息;接收后台服务器返回的基因数据信息, 并进行保存,其中,基因数据信息为后台服务器在数据库中获取的与基因的属性信息对应 的基因数据信息;调用预置的用于构建基因地形图的进程,对保存的基因数据信息进行处 理,生成所需的基因的地形图。
[0007] 进一步地,基因的属性信息包括基因的基因名和对应的差别基因表达信息,基因 数据信息包括:基因的基因名和对应的差别基因表达信息的位置信息、影响信息以及基因 组字段的数据信息。
[0008] 进一步地,调用预置的用于构建基因地形图的进程,对保存的基因数据信息进行 处理,生成所需的基因的地形图,包括:根据基因数据信息中的位置信息,获得基因的二维 坐标信息,其中,二维坐标信息包括横向坐标X tl和纵向坐标y。;根据基因数据信息中的影响 信息,确定基因的影响值σ ;根据如下公式,确定基因的影响总值f(X,y):
[0009]
【主权项】
1. 一种用于构建基因地形图的方法,其特征在于,包括: 响应于触发的构建基因地形图的指令,发送第一请求信息至后台服务器,其中,所述第 一请求信息中携带有用于标识所需构建地形图的基因的属性信息; 接收所述后台服务器返回的基因数据信息,并进行保存,其中,所述基因数据信息为所 述后台服务器在数据库中获取的与所述基因的属性信息对应的基因数据信息; 调用预置的用于构建基因地形图的进程,对保存的所述基因数据信息进行处理,生成 所需的基因的地形图。
2. 如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述基因的属性信息包括基因的基因名和 对应的差别基因表达信息,所述基因数据信息包括:所述基因的基因名和对应的差别基因 表达信息的位置信息、影响信息以及基因组字段的数据信息。
3. 如权利要求2所述的方法,其特征在于,所述调用预置的用于构建基因地形图的进 程,对保存的所述基因数据信息进行处理,生成所需的基因的地形图,包括: 根据所述基因数据信息中的所述位置信息,获得基因的二维坐标信息,其中,所述二维 坐标信息包括横向坐标χ〇和纵向坐标y 〇; 根据所述基因数据信息中的所述影响信息,确定基因的影响值σ ; 根据如下公式,确定基因的影响总值f(x,y):
其中,A表示基因对应的差别基因表达信息值,〇表示基因的影响值,1和7分别表示 用于基因地形图的横向坐标和纵向坐标; 根据确定的所述影响总值f(x,y),按照所述基因的二维坐标信息构建包含有基因标识 的图标在其二维坐标位置上,并根据所述基因的影响总值f(x,y)的大小在对应的横向坐 标X和纵向坐标y位置上进行颜色渲染,以便生成所需的基因的地形图。
4. 一种用于构建基因地形图的方法,其特征在于,包括: 接收前台终端发送的第一请求信息,其中,所述第一请求信息中携带有用于标识所需 构建地形图的基因的属性信息; 根据所述第一请求信息中携带的所述基因的属性信息,在数据库中获取与所述属性信 息对应的基因数据信息; 将获取的所述基因数据信息输出至所述前台终端。
5. 如权利要求4所述的方法,其特征在于,所述根据所述第一请求信息中携带的所述 基因的属性信息,在数据库中获取与所述属性信息对应的基因数据信息,包括: 解析所述第一请求信息,获得所述第一请求信息中携带的属性信息,其中,所述属性信 息包括基因的基因名和对应的差别基因表达信息; 根据获得的所述基因的基因名和对应的差别基因表达信息,在所述数据库中获取所述 基因的基因名和对应的差别基因表达信息的位置信息、影响信息以及基因组字段的数据信 息,作为所述基因数据信息。
6. 如权利要求4或5所述的方法,其特征在于,在所述接收前台终端发送的第一请求信 息之前,还包括: 预先从基因信息系统中获取基因信息,并分类存储至所述数据库中与所述基因信息对 应的位置。
7. 如权利要求6所述的方法,其特征在于,所述预先从基因信息系统中获取基因信息, 并分类存储至所述数据库中与所述基因信息对应的位置,包括: 响应于触发的基因信息获取指令,发送第二请求信息至所述基因信息系统; 接收所述基因信息系统返回的基因信息,所述基因信息包括:差别基因表达信息、基因 共表达网络信息以及基因的影响信息; 将接收的所述差别基因表达信息、所述基因共表达网络信息以及所述基因的影响信 息,分别存储至所述数据库中与其对应的字段当中。
8. -种用于构建基因地形图的装置,其特征在于,该装置位于前台终端,包括: 响应单元,用于响应于触发的构建基因地形图的指令,发送第一请求信息至后台服务 器,其中,所述第一请求信息中携带有用于标识所需构建地形图的基因的属性信息; 第一接收单元,用于接收所述后台服务器返回的基因数据信息,并进行保存,其中,所 述基因数据信息为所述后台服务器在数据库中获取的与所述基因的属性信息对应的基因 数据信息; 构建单元,用于调用预置的用于构建基因地形图的进程,对保存的所述基因数据信息 进行处理,生成所需的基因的地形图。
9. 一种用于构建基因地形图的装置,其特征在于,该装置位于后台服务器,包括: 第二接收单元,用于接收前台终端发送的第一请求信息,其中,所述第一请求信息中携 带有用于标识所需构建地形图的基因的属性信息; 第一获取单元,用于根据所述第一请求信息中携带的所述基因的属性信息,在数据库 中获取与所述属性信息对应的基因数据信息; 输出单元,用于将获取的所述基因数据信息输出至所述前台终端。
10. -种用于构建基因地形图的系统,其特征在于,包括如权利要求8所述的用于构建 基因地形图的装置,以及权利要求9所述的用于构建基因地形图的装置。
【专利摘要】本发明公开了一种用于构建基因地形图的方法、装置及系统,其中,该方法包括:响应于触发的构建基因地形图的指令,发送第一请求信息至后台服务器,其中,第一请求信息中携带有用于标识所需构建地形图的基因的属性信息;接收后台服务器返回的基因数据信息,并进行保存,其中,基因数据信息为后台服务器在数据库中获取的与基因的属性信息对应的基因数据信息;调用预置的用于构建基因地形图的进程,对保存的基因数据信息进行处理,生成所需的基因的地形图。本发明解决了现有技术中构建的基因系统的信息表达方式零散,需要进一步分析才能得到相关的基因作用信息的问题,直观的为用户展示相关的基因作用信息,效率高且视化效果好。
【IPC分类】G06T11-00, G06F17-30
【公开号】CN104636463
【申请号】CN201510067050
【发明人】陈越, 李濛
【申请人】南京美琳洛琦医药软件技术有限公司
【公开日】2015年5月20日
【申请日】2015年2月9日
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