利用dfna5基因调控区两个甲基化位点作为乳腺癌早期分子筛查的标记物的制作方法
【专利摘要】本发明提供了一种利用DFNA5基因调控区两个甲基化位点作为乳腺癌早期分子筛查的方法。在我们对两个乳腺癌细胞系的甲基化芯片数据分析过程中，我们发现DFNA5基因调控区中两个CpG的甲基化明显低于其它基因，我们推测该基因的去甲基化是乳腺癌发病的一个重要特征，这两个甲基化位点可用于乳腺癌早期筛查的一个标记。本发明有可能成为廉价乳腺癌早期分子筛查的标记物。
【专利说明】利用DFNA5基因调控区两个甲基化位点作为乳腺癌早期分 子筛查的标记物 所属【技术领域】
[0001] 本发明涉及一种乳腺癌早期分子筛查的标记物。DFNA5基因调控区两个甲基化位 点可用于乳腺癌早期筛查的一个预警标记。
【背景技术】
[0002] 乳腺癌是全球妇女最常见的恶性肿瘤，定期的乳腺X线检查可以降低40岁以上妇 女乳腺癌的死亡率，因此是迄今为止唯一证实有效的乳腺普查措施。尽管乳腺X线检查在 乳腺癌的早期发现中具有较高的应用价值，但它可能存在漏诊，而且在判断异常病灶的良 恶性方面的应用价值也十分有限，目前对于乳腺X线普查间歇期内发生乳腺癌是漏诊还是 新发生的病例尚无有效的区分方法。所以，一种简单、迅速、廉价的乳腺癌早期筛查方法将 会为中国数以亿计的妇女造福。
[0003] DNA甲基化是一种表观遗传修饰，它是由DNA甲基转移酶（DNA methyl-transferase，Dnmt)催化S-腺苷甲硫氨酸作为甲基供体，将胞啼陡转变为5-甲基 胞嘧啶（mC)的一种反应，在真核生物DNA中，5-甲基胞嘧啶是唯一存在的化学性修饰碱基。 CG二核苷酸是最主要的甲基化位点，它在基因组中呈不均匀分布，存在高甲基化、低甲基化 和非甲基化的区域，在哺乳动物中mC约占 C总量的2-7%。一般说来，DNA的甲基化会抑制 基因的表达。甲基化的模式是当前研究的重要课题。在正常组织内，基因的甲基化主要分 布在缺少CpG位点的编码区。
[0004] 肿瘤的特征是不平衡的甲基化。在肿瘤中，伴随基因组的低甲基化是区域性的高 甲基化，及DNA甲基化转移酶的基因表现上升。有证据显示基因组的低甲基化可以导致染 色体的不稳定及增加突变机会，在细胞中的整体甲基化状态可能是引发癌症的促进因素。 某些基因的甲基化状态会是肿瘤生成的生物标志，比如说，谷胱甘肽S转移酶Pi基因的甲 基化已被建议作为前列腺癌的诊断指标。环境因素（厨房油烟，汽车尾气等）会改变表观 遗传形状（CpG甲基化或去甲基化），造成基因不正常的表达或沉默。普遍认为，这种变化可 能与癌症的起因有直接的关系。
[0005] 我们认为，DFNA5基因调控区CpG的甲基化程度与乳腺癌的发病有直接关系，可能 成为早期乳腺癌分子筛查的分子标记物。
【发明内容】
[0006] 本发明利用Illumina芯片对人全基因组27332个CpG位点的甲基化状况进行探 测，用两个乳腺癌细胞系进行扫描得出结果。如下表所示，数据显示DFNA5基因调控区CpG 的甲基化程度明显低于其它基因调控区的CpG岛。我们认为，这种低甲基化与乳腺癌细胞 的快速生长有密切关系。因此，我们可能通过检测此CpG岛的甲基化程度，预警乳腺癌的发 病。
[0007]
【权利要求】
1. DFNA5基因调控区CpG的甲基化水平作为乳腺癌早期分子筛查的标记。 2. DFNA5基因调控区CpG的甲基化水平作为癌症早期分子筛查的标记物。
3. 文献中，DFNA5基因也被认为与耳聋有关，因此，DFNA5基因调控区CpG的甲基化程 度，也可能用作耳聋筛查。
【文档编号】C12Q1/68GK104152539SQ201310178184
【公开日】2014年11月19日 申请日期:2013年5月15日 优先权日:2013年5月15日
【发明者】李艾斯 申请人:南京迈达医药科技有限公司