一种同时检测对虾imnv、yhv和tsv的多重pcr检测引物及试剂盒的制作方法_4

文档序号:9804674阅读:来源:国知局
毒TSV作模板以及对虾肝胰腺细小病毒HPV(序列如SEQ ID NO: 10所示)、斑节对 虾杆状病毒MBV(序列如SEQ ID如:11所示)、传染性皮下及造血组织坏死病毒1冊附(序列 如SEQ ID N0:12所示)、纯水为阴性对照进行实验验证,实验结果表明,本发明试剂盒及检 测方法特异性较好,未出现假阳性或假阴性,实验结果见图5-图7。
[0107] HPV
[0108] CAATTAGAACGCATAGAAAACGCTAAGAAATACATAGAAGAAGTTATAGAAGAAACTAATCAAGAGTTAGAAAATCA AGAGAGACAAGAGGTAAGTGCGGCGGAGGCAGATACGATGAACACTGAAGCACCTGTCCCGATGGAAACTTCTGAAT CAGGGACTACCGCCGCACCGCAGCAGCGAGCTGCAGCGGGCGGTGGCGGTAGTGGAGGTGGAGGCGAATCAGCAGGG TACGGGAGAAACTCTAGCGATTCATTCCAGCGCCACCGCAACAAACCTATCGATCT SEQ ID NO:10
[0109] MBV
[0110] ACCATAAGCTAGCATACGTCCTTTTGAATTTTTATACTGTTCTATGCATTTTGCAAGACCCTCTACCGATATGGTAT CAATGTCTGGAGTTATATTATTTTTTATATAATTGAGTGTTTTTTGCTGACCTTTTGAAATTGCATTTTTATAGATA AATAAAGAATCATCGAGATCCTTCATTTATAATTGTCTTTATCTTTTTGTATAGCGTGTTAACGCTATAAAGATTTT CAAGATCTGCACTCCTT SEQ ID NO:11
[0111] IHHNV
[0112] TCACATTTACAGACACCCCATATTTAGAAATATTTAAGGATACTACTGGACTACATAATCAACTATCAACTAAGGAA GCCGACGTAACATTGGCAAAATGGATACAAAATCCCCAACTTGTGACCGTACAATCAACAGCAGCAAACTATGAAGA CCCAATCCAACAATTTGGATTCATGGAACAAATGCGAACCGGTGACAGAAAAGCCTATACAATCCATGGTGACACTA GAAATTGGTATGGCGGAGAAATACCAACAACCGGACCCACCTTCATCCCAAAATGGGGTGGTCAATTAAAATGGGAC AAACCATCCCTTGGAAACCTAGTCTACCCAGCAGACCACCATACAAACGACTGGCAACAGATCTTCATGAGAATGTC ACCAATCAAAGGACCAAATGGAGACGAACTTAAACTTGGCTGC SEQ ID NO:12
[0113] 图5为多重PCR体系中对虾传染性肌肉坏死病毒检测的特异性实验结果图,其中M 为Marker,1为頂NV阳性标准品,2为YHV模板,3为TSV模板,4为HPV模板(按照 所示序列人工合成DNA即可),5为MBV模板(按照所示序列人工合成DNA即可),6为IHHNV模板 (按照所示序列人工合成DNA即可),7为纯水。采用的引物是IMNV引物aMNV-F和頂NV-R),从 图中看出,对虾传染性肌肉坏死病毒为阳性,黄头病毒、桃拉病毒、对虾肝胰腺细小病毒、斑 节对虾杆状病毒、传染性皮下及造血组织坏死病毒、纯水均为阴性。说明特异性好。
[0114] 图6为多重PCR体系中黄头病毒检测的特异性实验结果图,其中Μ为7^/^i^DNA Marker,1为YHV阳性标准品,2为頂NV模板,3为TSV模板,4为HPV模板,5为MBV模板,6为IHHNV 模板,7为纯水。采用的引物是YHV引物(YHV-F和YHV-R),从图中看出,黄头病毒为阳性,对虾 传染性肌肉坏死病毒、桃拉病毒、对虾肝胰腺细小病毒、斑节对虾杆状病毒、传染性皮下及 造血组织坏死病毒、纯水均为阴性。说明特异性好。
[0115] 图7为多重PCR体系中桃拉病毒检测的特异性实验结果图,其中Μ为DNA Marker,1为TSV阳性标准品,2为頂NV模板,3为YHV模板,4为HPV模板,5为MBV模板,6为IHHNV 模板,7为纯水。采用的引物是TSV引物(TSV-F和TSV-R),从图中看出,桃拉病毒为阳性,对虾 传染性肌肉坏死病毒、黄头病毒、对虾肝胰腺细小病毒、斑节对虾杆状病毒、传染性皮下及 造血组织坏死病毒、纯水均为阴性。说明特异性好。
[0116] 综上所述,可以得出采用本发明的引物及试剂盒具有较好的特异性。
[0117] 尽管上面已经示出和描述了本发明的实施例,可以理解的是,上述实施例是示例 性的,不能理解为对本发明的限制,本领域的普通技术人员在不脱离本发明的原理和宗旨 的情况下在本发明的范围内可以对上述实施例进行变化、修改、替换和变型。
【主权项】
1. 一种同时检测对虾传染性肌肉坏死病毒、黄头病毒、桃拉病毒的多重PCR引物对,其 特征在于,所述引物对分别为MNV-F和頂NV-R、YHV-F和YHV-R、TSV-F和TSV-R,序列依次如 SEQIDN0:1和2,SEQIDN0:3和4,SEQIDN0:5和6所示。2. -种同时检测对虾传染性肌肉坏死病毒、黄头病毒、桃拉病毒的多重PCR检测试剂 盒,其特征在于,含有权利要求1所述的引物对。3. -种用权利要求1所述多重PCR引物或权利要求2所述多重PCR检测试剂盒中的引物 检测对虾传染性肌肉坏死病毒、黄头病毒、桃拉病毒的用途。4. 一种用权利要求1所述多重PCR引物或权利要求2所述多重PCR检测试剂盒中的引物 检测对虾传染性肌肉坏死病毒、黄头病毒、桃拉病毒的方法。5. 权利要求4所述检测对虾传染性肌肉坏死病毒、黄头病毒、桃拉病毒的方法,其特征 在于,步骤为, 提取总RNA; 合成cDNA; PCR检测,采用权利要求1所述多重PCR引物或权利要求2所述多重PCR检测试剂盒中的 引物;阳性对照为SEQ ID N0:7,SEQ ID N0:8和SEQ ID N0:9的核酸序列混合作为模板,阴 性对照为:不含有对虾传染性肌肉坏死病毒、黄头病毒、桃拉病毒任一病毒的任意cDNA核酸 序列。 结果判定: 当检测样本和阳性对照的扩增条带大小接近,为120-130bp时,结果为对虾传染性肌肉 坏死病毒阳性;如果没有120-130bp条带,则为对虾传染性肌肉坏死病毒阴性; 当检测样本和阳性对照的扩增条带大小接近,为220-230bp时,结果为黄头病毒阳性; 如果没有220-230bp条带,则为黄头病毒阴性; 当检测样本和阳性对照的扩增条带大小接近,为325-335bp时,结果为桃拉病毒阳性; 如果没有325-335bp条带,则为桃拉病毒阴性; 当阴性对照出现条带时,表明操作过程中有试剂污染,检测结果无效; 当阳性对照无条带时,表明引物或者试剂盒中试剂降解,引物或试剂盒失效。6. 权利要求5所述检测对虾传染性肌肉坏死病毒、黄头病毒、桃拉病毒的方法,其特征 在于,所述PCR检测的PCR反应体系为:25yL反应体系中包含有10倍浓度的含镁离子的Taq DNA聚合酶缓冲液2.5yL,Taq DNA聚合酶0.5yL,各引物终浓度为0.4μΜ,合成好待检测的 cDNA 模板 100ng。7. 权利要求5所述检测对虾传染性肌肉坏死病毒、黄头病毒、桃拉病毒的方法,其特征 在于,所述PCR检测的PCR反应条件为:95°C3分钟,1个循环;95°C30秒,56°C30秒,72°C30秒, 35个循环;72°C 10分钟,1个循环;4°C保存。
【专利摘要】本发明公开了一种同时检测对虾IMNV、YHV和TSV的多重PCR检测引物及试剂盒。所述引物分别为IMNV-F和IMNV-R、YHV-F和YHV-R、TSV-F和TSV-R,序列如SEQ?ID?NO:1和2,SEQ?ID?NO:3和4,SEQ?ID?NO:5和6所示。本发明的引物彼此间无交叉,且不与其它病毒产生交叉,假阳性率低,能够特异性的检测出分布于世界各地不同地区的3种病毒的病毒株,具有广泛适用性,具有非常高的特异性和敏感性,检测限低。同时对检测的病毒基因片段无需再进行克隆、测序和序列比对。一次实验即可检测出待测样品中是否含有这三种病毒中的一种、两种或三种。
【IPC分类】C12Q1/70, C12Q1/68, C12N15/11
【公开号】CN105567875
【申请号】CN201610119826
【发明人】刘国胜, 陈明谅, 陈建明, 王蔚, 杨丽容
【申请人】国家海洋局第三海洋研究所
【公开日】2016年5月11日
【申请日】2016年3月3日
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