专利名称：用于检测和鉴定分枝杆菌的寡聚核苷酸的制作方法
技术领域：
本发明所涉及的是用于检测和鉴定分枝杆菌的寡聚核苷酸。更具体地说，本发明用来鉴定非结核分枝杆菌的ITS(Internal Transcribed SpacerRegion，内转录间隔区)的核苷酸序列，这些非结核分枝杆菌包括偶发分枝杆菌(Mycobacterium fortuitum)，龟分枝杆菌(Mycobacteriumchelonae)，脓肿分枝杆菌(Mycobacterium abscessus)，牝牛分枝杆菌(Mycobacterium vaccae)，变黄分枝杆菌(Mycobacterium flavescens)，亚洲分枝杆菌(Mycobacterium asiaticum)，猪分枝杆菌(Mycobacteriumporcinum)，阿加普尔分枝杆菌(Mycobacterium acapulcensis)和迪氏分枝杆菌(Mycobacterium diernhoferi)。通过这些分枝杆菌的寡聚核苷酸引物或探针。
背景技术：
尽管结核病人数近年来稳步地减少，但每年仍有约8,000,000人患结核病，且有3,000,000患者死亡。在不发达国家，由于不适当的治疗和缺少用于治疗结核病的药物，使患耐药菌的慢性病人数增加。在20世纪80年代，甚至在发达国家，由于爱滋病的传播，也使患结核病的人数增加。因此在这种情况下，可以预测，在2001年将会有约12,000,000新结核病患者出现(《结核与肺病》J.P.Natain，M.C.Raviglione，和A.Kochi，73311-321，1992；《全球疾病负担》《全球疾病与损伤的负担系列从书》第一卷，Murray CJL.和Lopez AD著，剑桥，马萨诸塞，哈佛大学出版社，1996，P349-350；《世界结核病计划抗结核病药物的耐药性》世界卫生组织1997年报告)。
在20世纪50年代曾报道非结核病分枝杆菌(NTM)能使人致病。在1980年又有报道，鸟分枝杆菌(MAC)能引起爱滋病患者全身性疾病，从此，非结核分枝杆菌引起了人们的关注。非结核分枝杆菌所引起的疾病在临床症状和体症以及一般病理方面与结核病相似。非结核分枝杆菌广泛地分布于有生命的环境中，而且在临床实验样本中很难判断它们是否能致病。由于它们对于很多抗结核的药物具有耐药性，它们所引起的感染病很难治愈，复发率也高。非结核分枝杆菌所引起传染病应该用不同于结核病的方法治疗。因此需要建立准确而快速的检测和鉴定非结核分枝杆菌的方法。同时也需要建立准确而快速的检测和鉴别结核菌(TBcomplex)和NTM的方法以便于结核病的有效治疗。
到目前为止，已有很多用于诊断分枝杆菌感染和用于检测、鉴定分枝杆菌菌株的方法。其中，下面的方法目前仍在应用第一为微生物学方法，也就是，涂片、染色和培养试验。然而，这种方法不适于分枝杆菌，因为它们的繁殖周期长又需要很长的培养时间。象分枝杆菌这样的致病菌也能传染给培养室内的工作人员。
第二为PCR(聚合酶链式反应)方法。这种方法不仅对分枝杆菌有高敏感性和特异性，而且非常适用于需要长时间培养的分枝杆菌。特别是，这种方法不需要培养过程，但需要能用于放大的小量DNA，因此，只需要实验样品中的小量病原体DNA就足以检测和鉴定分枝杆菌。很多PCR实验需要彼此不同的靶DNA引导。IS6110和16S rRNA经常用作靶DNA(《spoligotyping(字典未收录)的用途，用于鉴别IS6110低拷贝量的结核分枝杆菌(丹麦培养)》Bauer J，Andersen AB，Kremer K和Miorner H，1999，《临床微生物学杂志》372602-2606；《以高密度DNA探针系列鉴定分枝杆菌和实验利福平抗药性》Troesch，A.，H.Nguyen，C.G.Miyada，S.Desvarenne，T.R.Gingeras，P.M.Kaplan，P.Cros and C.Mabilat，1999《临床微生物学杂志》3749-55)；第三为物理化学方法。在实验中用HPLC(高效液相色谱)，GC(气相色谱)或质谱来检测分枝杆菌的脂类成分。这种方法特异性好，但需要昂贵的设备。
第四为用血清学方法检测分枝杆菌成份。这种方法是基于带有抗体的胶乳颗粒或血细胞与分枝杆菌抗原的凝固反应或酶与抗体相连的酶联免疫反映。但这种方法只是在有限的位置上高度敏感，且很难区别是以前感染还是现在感染。
下一个检测分枝杆菌的方法是用插入了荧光素酶基因的分枝杆菌噬菌体L5感染分枝杆菌，然后检查介质中的荧光素所引起的发光现象(W.R.Jacobs，R.G.Barletta，R.Udani，J.Chan，G·Kalkut，G.Sosne，T.Kieser，G.J.Sarkis，G.F.Hatful，and B.R.Bloom.1993，《科学260》819-822)最后一个方法为通过寡聚核苷酸杂交来检测和鉴定分枝杆菌(A.Troesch，H.Nguyen，C.G.Miyada，S.Desvarenne，T.R.Gingeras，P.M.Kaplan，P·Cros和C.Mabilat.1999《临床微生物学杂志》3749-55除了上面提到的鸟分枝杆菌(MAC)外，偶发分枝杆菌，龟分枝杆菌，地分枝杆菌和牝牛分枝杆菌也称作非结核分枝杆菌。其中，龟分枝杆菌又分成龟分枝杆菌和脓肿分枝杆菌，目前还没有区分它们的方法。
发明内容
本发明的目的是为了解决上述分枝杆菌检测和鉴定方法中存在的问题，本发明意在提供作为PCR引物或探针的特异寡聚核苷酸。这些寡聚核苷酸用于检测分枝杆菌，鉴别结核菌(TB complex)和NTM以及准确而有效地鉴定分枝杆菌的种类。
为此本发明提供了一些分枝杆菌基因ITS(内转录间隔区)的DNA，列于SEQ ID NOs(序列辨认号码)1至9中。这些分枝杆菌包括，偶发分枝杆菌，龟分枝杆菌，脓肿分枝杆菌，牝牛分枝杆菌，变黄分枝杆菌，亚洲分枝杆菌，猪分枝杆菌，阿加普尔分枝杆菌和迪氏分枝杆菌。
本发明还提供了作为PCR引物或杂交探针的寡聚核苷酸，用来检测分枝杆菌的，列于SEQ ID NOs10至14中；用来鉴别结核菌和分枝杆菌中的NTB的，列于SEQ ID NOs15至23中；用于检测和鉴定MAC(鸟分枝杆菌)和胞内分枝杆菌的列于SEQ IDNOs24至27中；
用于检测和鉴定偶发分枝杆菌的，列于SEQ ID NOs28至38中；用于检测和鉴定龟分枝杆菌的，列于SEQ ID NOs39至46中；用于检测和鉴定脓肿分枝杆菌的，列于SEQ ID NOs47至52中；用于检测和鉴定牝牛分枝杆菌的，列于SEQ ID NOs53至64中；用于检测和鉴定变黄分枝杆菌的，列于SEQ ID NOs65至72中；用于检测和鉴定戈氏分枝杆菌的，列于SEQ ID NOs73至77中；用于检测和鉴定地分枝杆菌的，列于SEQ ID NOs78至100中；用于检测和鉴定瘰疬分枝杆菌的，列于SEQ ID NOs101至108中；用于检测和鉴定堪萨斯分枝杆菌的，列于SEQ ID NOs109至112中；用于检测和鉴定斯氏分枝杆菌的，列于SEQ ID NOs113至116中；用于检测和鉴定海分枝杆菌和溃疡分枝杆菌的，列于SEQ ID NOs117至119中用于检测和鉴定胃分枝杆菌的，列于SEQ ID NOs120至123中；用于检测和鉴定蟾分枝杆菌的，列于SEQ ID NOs124至133中；用于检测和鉴定日内瓦分枝杆菌的，列于SEQ ID NOs134至141中；用于检测和鉴定玛尔摩分枝杆菌的，列于SEO ID NOs142至146中用于检测和鉴定猿分枝杆菌的，列于SEQ ID NOs147至153中；用于检测和鉴定耻垢分枝杆菌的，列于SEQ ID NOs154至165中；用于检测和鉴定石氏分枝杆菌的，列于SEQ ID NOs166至172中；用于检测和鉴定哈瓦那分枝杆菌的，列于SEQ ID NOs173至180中；用于检测和鉴定鼻疽分枝杆菌的，列于SEQ ID NOs181至189中；用于检测和鉴定亚洲分枝杆菌的，列于SEQ ID NOs190至193中；用于检测和鉴定猪分枝杆菌的，列于SEO ID NOs194至205中；用于检测和鉴定阿加普尔分枝杆菌的，列于SEO ID NOs206至215中；用于检测和鉴定迪氏分枝杆菌的，列于SEQ ID NOs216至227中；
用于检测和鉴定副结核分枝杆菌的，列于SEQ ID NOs228至240种；最后，用于检测酒精分枝杆菌的，列于SEQ ID NO241以往用PCR检测和鉴定分枝杆菌的方法，只能检测一或二个菌种。而本发明能检测和鉴定几乎所有的分枝杆菌，这是由于本发明的引物和探针是根据分枝杆菌的ITS的DNA序列设计的。ITS比16S rRNA有更多的多态区而且ITS也有保守区，因此作为一种靶DNA，它(ITS)能非常有效地鉴别基因型(Gurtler，V.，和V.A.Stanisich，1996，《一种用16S-23SrDNA间隔区分类和鉴定细菌的新方法》《微生物》1423-16)发明者对一些还没有对DNA测序的非结核分枝杆菌的ITS DNA序列进行测定，这些非结核分枝杆菌包括象偶发分枝杆菌，龟分枝杆菌，脓肿分枝杆菌，牝牛分枝杆菌，变黄分枝杆菌，亚洲分枝杆菌，猪分枝杆菌，阿家谱尔分枝杆菌和迪氏分枝杆菌。通过这些DNA序列设计引物或探针的寡聚核苷酸以检测和鉴定分枝杆菌。并且进一步参考基因库中的另一些分枝杆菌的DNA序列，并通过多序列对比和未成熟细胞检查(Multialignment and Blast)分析这些DNA序列，从而选择有特色的多态区，来设计用于检测和鉴定分枝杆菌的引物和探针的寡聚核苷酸。最后通过种特异性和属特异性PCR引物放大和特异杂交实验确证这些寡聚核苷酸对分枝杆菌的检测和鉴定效果。
也就是说，本发明的寡聚核苷酸探针(结合到固相基质中)，它们只能与特异的分枝杆菌中的ITS核苷酸序列进行杂交，因此它们能敏感地检测和鉴定特异的分枝杆菌。通过PCR放大，与上述探针有相同核苷酸序列的寡聚核苷酸引物也能检测和鉴定特异的分枝杆菌。应用这些依据分枝杆菌ITS制备的寡聚核苷酸引物或探针，便能够准确而有效地检测分枝杆菌，鉴别结核菌与NTM，和鉴定分枝杆菌的种类。
关于本发明的上述和其他方面的目的、其特点和优势是明显的，这可从下列的较实例和附图中得到详细阐述，其中，图1为图解，图中为分枝杆菌ITS和通过PCR放大ITS的引物；
图2为PCR后的电泳结果照片，PCR用了几个分枝杆菌种株和一对用于ITS放大的引物，包括分枝杆菌中16SrRNA和23SrRNA的一部分；图3为PCR后的电泳结果照片，PCR用了几个分枝杆菌种株和用于检测分枝杆菌的一对引物(ITSF和MYC2)；图4为多重PCR图解，多重PCR用于检测分枝杆菌，同时鉴别结核菌与NTM；图5为多重PCR后的电泳结果照片，多重PCR采用了一对检测分枝杆菌的引物(ITS和MYC2)以及一对鉴别结合菌和NTM的引物(MTB2和MYC2)；图6为PCR后的电泳结果照片，PCR用了每一种分枝杆菌和每一对种特异性引物，这些引物是依据每一种NTM的多态区核苷酸序列设计的。
图7为PCR后的电泳结果照片，PCR用了几种分枝杆菌和一对种特异性引物，这些引物是根据每种NTM的多态区核苷酸序列设计的。
具体实施例方式
下面将通过实施例介绍本发明的一些较好的例子和其参考附图。
例1.分枝杆菌培养和基因组DNA分离分枝杆菌标准菌种来源于KCTC(韩国模式菌种收藏)和ATCC(美国模式菌种收藏)，临床菌种来源于韩国国家结核协会，国家Masan结核病医院以及Pusan国立大学医院的临床微生物学专家管理菌种的储藏和培养。例中所用的分枝杆菌和病原体列于表8中。
分枝杆菌DNA的提取过程如下以Ogawa培养基培养分枝杆菌。然后将一铂环培养后的菌种置于微量离心管中，并与200μl的InstaGene基质(Bio-Rad Co.)混合，56℃孵育30分。再经过10分钟的涡流混合，混合物放于100℃，8分钟。再经过10分钟涡流混合后，将混合物于12,000rPM离心3分钟。取其上清放于另一试管中，并放于-20℃保存。在下面的PCR中，将用每个菌种的DNA溶液2μl。
例2.放大分枝杆菌ITS制造引物分枝杆菌ITS及通过PCR放大ITS所用的引物列于图1中。依据分枝杆菌16SrRNA和23SrRNA保守区的几个片断来构建用于放大分枝杆菌ITS地引物。并通过多序列对比和未成熟细胞检查分析基因库分枝杆菌16SrRNA和23SrRNA的DNA序列。然后，通过16SrRNA和23SrRNA的一部分DNA设计引物，从而能选择性地放大约500bp的ITS区，这些引物的DNA序列列于SEQ ID NOs242(IT SF)和243(ITSR)中。本例中所用的所有引物是通过Derkin-Elmer DNA合成仪(BioBasic，加拿大)制备，浓度达50nmol。
例3.PCR和产品鉴定在PCR中使用例1中的2μl DNA溶液。反应液包括500mM KCl，100mM Tris HCl(pH9.0)，1％Triton X-100，0.2mM dNTP(dATP，dGTP，dTTP和dCTP)，1.5mM MgCl2，1pmol引物，1μTag DNA聚合酶(Bio BasicInc.)。94℃变性5分钟后，溶液在94℃变性1分钟，60℃退火1分钟和72℃延长1分钟条件下循环30次。再进一步72℃延长10分钟，确保延长结束。反应完毕后，通过1.5％琼脂糖凝胶电泳鉴定PCR产物。象从GenBank(基因库)资料所预测的那样，通过16S rRNA和23S rRNA的保守区所制备的引物所放大的ITS为约500bP。
图2是PCR后的电泳结果照片。PCR采用了几个分枝杆菌种株和一对ITS放大引物，包括分枝杆菌16S rRNA和23S rRNA的一部分。图中，M是分子量标准，间隔100bP，C为对照组，泳道1至9分别是偶发分枝杆菌、龟分枝杆菌、胞内分枝杆菌、鸟分枝杆菌、结核分枝杆菌、田野分枝杆菌、堪萨斯分枝杆菌、戈氏分枝杆菌和结核分枝杆菌H37Rv。可以看到除对照C外，泳道1至9的所有分枝杆菌皆有ITS基因放大现象。
例4.分枝杆菌ITS DNA序列测定PCR产品鉴定后，分枝杆菌(其ITS的DNA没有测序)反应物将通过PCR放大，这些分枝杆菌包括偶发分枝杆菌、龟分枝杆菌、脓性分枝杆菌、牝牛分枝杆菌、变黄分枝杆菌、亚洲分枝杆菌、猪分枝杆菌、阿加普尔分枝杆菌和迪氏分枝杆菌。PCR产品则直接用于测定ITS的DNA序列。
DNA的测定浓度为200μmol。DNA序列测定采用染料终止法，同时应用通用引物M13和DNA自动测序仪(Perkin-Elmer，ABI prim 377sequencer)。
序列鉴别号码(SEQ ID Nos)1至9分别指下列分枝杆菌ITS的DNA序列偶发分枝杆菌、龟分枝杆菌、脓肿分枝杆菌、牝牛分枝杆菌、变黄分枝杆菌、亚洲分枝杆菌、猪分枝杆菌、阿加普尔分枝杆菌和迪氏分枝杆菌。
例5.寡聚核苷酸引物的设计及合成每一个引物，大约20bp，依据例4中分枝杆菌的ITS的DNA序列设计，这些分枝杆菌包括偶发分枝杆菌、龟分枝杆菌、脓肿分枝杆菌、牝牛分枝杆菌、变黄分枝杆菌、亚洲分枝杆菌、猪分枝杆菌、阿加普尔分枝杆菌和迪氏分枝杆菌。并且通过多序列对比和未成熟细胞检查，比GenBank(基因库)的其它分枝杆菌ITS的DNA序列比较。
根据需要，分枝杆菌ITS保守区DNA序列设计成检测分枝杆菌的引物或探针，而高多态区的DNA序列则设计成种特异性的引物或探针。表1至7描述了所设计的引物或探针以及它们的位置和序列鉴别号码。
表1
表2
表3
表4
表5
表6
表7
例6.用于检测分枝杆菌的引物的PCR结果通过分枝杆菌保守区DNA序列所设计的属特异性引物，可用于检测分枝杆菌。依据270-350bp所组成的ITS序列所制备的引物当中，一对引物，ITSF(序列鉴别号242)和MYC2(序列鉴别号11)被用于PCR。结果得到时了分枝杆菌的约350bp的放大了的核苷酸，同时在金黄色葡萄球菌、尿肠球菌和粘质沙雷氏菌中没有放大现象。因此说明这种引物可用于检测分枝杆菌。
表3是PCR后电泳结果的照片，PCR采用了几个分枝杆菌种株和一对用于检测分枝杆菌的引物(ITSF和MYC2)。图中M为100bp梯度分子量标准；C为阴性对照；泳道1为脓肿分枝杆菌ATCC19977；泳道2为田野分枝杆菌ATCC27406；泳道3为亚洲分枝杆菌ATCC25276；泳道4为南非分枝杆菌ATCC33464；泳道5为鸟分枝杆菌ATCC25291；泳道6为牛分枝杆菌ATCC19210；泳道7为龟分枝杆菌ATCC35752；泳道8为变黄分枝杆菌ATCC14474；泳道9为偶发分枝杆菌ATCC6841；泳道10为戈氏分枝杆菌ATCC14470；泳道11为胞内分枝杆菌ATCC13950；泳道12为堪萨斯分枝杆菌ATCC12478；泳道13为草分枝杆菌ATCC354；泳道14为瘰疬分枝杆菌ATCC19981；泳道15为耻垢分枝杆菌ATCC21701；泳道16为斯氏分枝杆菌ATCC35799；泳道17为地分枝杆菌ATCC15755；泳道18为次要分枝杆菌ATCC23292；泳道19为结核分枝杆菌H37Rv；以及泳道20为牝牛分枝杆菌ATCC15483。从图中可见，除阴性对照外，从泳道1至20的所有分枝杆菌皆呈ITS放大现象。
表8为通过一对检测分枝杆菌的引物(ITSF和MYC2)的PCR结果。表中，+表示放大出现；-表示没有放大现象。可见，除分枝杆菌外的其它菌种皆无放大现象出现。
表8
例7.用于结核菌的引物的PCR结果前面例子中制备的寡聚核苷酸引物，被用来鉴定每一个菌种，并且通过PCR放大实验证实了这些实验的可靠性。为了鉴定结核菌(TBCOMPLEX)，采用了多重PCR，应用一对检测分枝杆菌的引物(ITSF和MYC2)和一对鉴别结核菌(TB COMPLEX)和NTM的引物(MTB2和MYC2，序列鉴别号16和11)图4为多重PCR图解，多重PCR用于检测分枝杆菌，同时也用于鉴别结核菌(TB COMPLEX)和NTM。
图5为多重PCR后的电泳结果照片。多重PCR用一对引物(ITSF和MYC2)检测分枝杆菌，另一对引物(MTB2和MYC2)鉴别结核菌(TBCOMPLEX)和NTM。图中，M为100bp梯度的分子量标准；C为阴性对照；泳道1和2分别为结核菌(TB COMPLEX)，结核分枝杆菌H37Rv和牛分枝杆菌；泳道3至10分别为鸟分枝杆菌、胞内分枝杆菌、偶发分枝杆菌、龟分枝杆菌、戈氏分枝杆菌、斯氏分枝杆菌、地分枝杆菌和瘰疬分枝杆菌ATCC19981。泳道1和2的结核菌，由于2次放大而形成2条带，这2次放大分别是由检测分枝杆菌的引物和鉴别结核菌引物引发。而在其它泳道的NTM菌株只形成一条带，这说明只有一次放大。
例8.用于鉴定NTM种株的引物的PCR结果应用鉴定NTM种株的种特异性的引物进行PCR，这种引物依据每一菌株的多态区DNA序列制备。
每一个分枝杆菌应用一对引物进行PCR，其中第一个为有义链，第二个为反义链。具体如下选用序列鉴别号16和21鉴定结核分枝杆菌H37Rv和牛分枝杆菌；序列鉴别号24和27鉴别鸟分枝杆菌和胞内分枝杆菌；序列鉴别号29和39鉴别偶发分枝杆菌；序列鉴别号41和44鉴别龟分枝杆菌；序列鉴别号48和49鉴别脓肿分枝杆菌；序列鉴别号55和63鉴别牝牛分枝杆菌；序列鉴别号66和72鉴别变黄分枝杆菌；序列鉴别号73和75鉴别戈氏分枝杆菌；序列鉴别号88和96鉴别地分枝杆菌；序列鉴别号102和103鉴别瘰疬分枝杆菌；序列鉴别号109和110鉴别堪萨斯分枝杆菌；序列鉴别号113和114鉴别斯氏分枝杆菌；序列鉴别号117和119鉴别海分枝杆菌和溃疡分枝杆菌；序列鉴别号120和123鉴别胃分枝杆菌；序列鉴别号128和132鉴别蟾分枝杆菌；序列鉴别号135和141鉴别日内瓦分枝杆菌；序列鉴别号143和145鉴别玛尔摩分枝杆菌；序列鉴别号147和149鉴别猿分枝杆菌以及序列鉴别号154和159鉴别耻垢分枝杆菌。PCR完成后，指每一个反应产物进行电泳分析。
图6为PCR后的电泳结果照片。PCR采用每一种分枝杆菌和每一对种特异的引物，这种引物依照每一个NTM的多态区核苷酸序列设计的。图中，M为100bp梯度分子量标准；C为阴性对照，泳道1和2分别为结核菌，结核分枝杆菌H37Rv和牛分枝杆菌ATCC19210；泳道3和4分别为鸟分枝杆菌ATCC25291和胞内分枝杆菌ATCC13950；泳道5为偶发性分枝杆菌ATCC6841；泳道6为龟分枝杆菌ATCC35752；泳道7为脓肿分枝杆菌ATCC19977；泳道8为牝牛分枝杆菌ATCC15483；泳道9为变黄分枝杆菌ATCC14474；泳道10为戈氏分枝杆菌ATCC14470；泳道11为地分枝杆菌ATCC15755；泳道12为瘰疬分枝杆菌ATCC19981；泳道13为堪萨斯分枝杆菌ATCC12478；泳道14为斯氏分枝杆菌ATCC35799；泳道15为海分枝杆菌ATCC927；泳道16为溃疡分枝杆菌ATCC19423；泳道17为胃分枝杆菌ATCC15754；泳道18为蟾分枝杆菌ATCC19250；泳道19为日内瓦分枝杆菌ATCC1233；泳道20为玛尔摩分枝杆菌ATCC29571；泳道21为猿分枝杆菌ATCC25275；以及泳道22为耻垢分枝杆菌ATCC21701。种特异放大现象可见于泳道1至22。
图7为PCR后的电泳结果照片。PCR采用几种分枝杆菌和一对依每一种NTM多态区核苷酸序列所设计的种特异性引物。图中，第一张照片采用一对对结核菌特异的引物(ITSF和MYC2)，泳道1和2的结核分枝杆菌H37Rv和牛分枝杆菌呈放大现象；第二张照片采用一对对鸟分枝杆菌和胞内分枝杆菌特异的引物(MAC1和MAC4)，泳道3和4的鸟分枝杆菌和胞内分枝杆菌呈放大现象；第三张照片采用一对对偶发分枝杆菌特异的引物(FOR2和FOR10)，泳道5的偶发分枝杆菌呈放大现四张采用一对对龟分枝杆菌特异的引物(CHE3和CHE6)，泳道6的龟分枝杆菌呈放大现象；第五张采用一对对戈氏分枝杆菌特异的引物(GOR1和GOR2)，泳道7的戈氏分枝杆菌呈放大现象；第六张采用一对对斯氏分枝杆菌特异的引物(SZU1和SZU2)，泳道8的斯氏分枝杆菌呈放大现象；第七张采用一对对瘰疬分枝杆菌特异的引物(SC01和SC02)，泳道10的瘰疬分枝杆菌呈放大现象。泳道9为地分枝杆菌，与上述的种特异引物比较，无放大现象出现。
因此，采用每一对种特异性引物时，PCR可以检测和特异性地鉴定每一种株的分枝杆菌。
如上所述，首先测定非结核分枝杆菌的ITS(内转录间隔区)的DNA序列，然后在通过这些DNA序列，设计寡聚核苷酸引物或探针，来检测和鉴定分枝杆菌，这些非结核分枝杆菌包括偶发分枝杆菌、龟分枝杆菌、脓肿分枝杆菌、牝牛分枝杆菌、变黄分杆枝菌、亚洲分枝杆菌、猪分枝杆菌、阿加普尔分枝杆菌和迪氏分枝杆菌。所以应用PCR引物或杂交探针，可以检测分枝杆菌，鉴别结核菌和NTM以及快速而有效地鉴定分枝杆菌种株。这种检测和鉴别方法能有效地诊断复杂的感染，因此能够准确地治疗分枝杆菌感染，包括结核病。
通过这些目前被认为是最实用和有效的例子来阐述本发明时，应该注意到本发明的权力要求不限于这些例子。恰恰相反，本发明不仅覆盖附加权力要求的范围和宗旨，还覆盖对它们的各种修改和相同的构思。
序列表<110>KIM，Jeong Joon；SJ HIGHTECH Co.，Ltd.
KIM，Cheol MinPARK，Hee Kyung<120>(Oligonucleotide for detection and identification of Mycobacteria)用于检测和检定分枝杆菌的寡聚核苷酸<130>PP05020/PCT<150>KR 10-1999-0019631<151>1999-05-29<150>KR 10-1999-0019632<151>1999-05-29<150>KR 10-1999-0019633<151>1999-05-29<150>KR 10-1999-0019634<151>1999-05-29<150>KR 10-1999-0019635<151>1999-05-29<150>KR 10-2000-0018189<151>2000-04-07<160>243<170>KopatentIn 1.71<210>1<211>386<212>DNA<213>(Mycobacterium fortuitum)偶发分枝杆菌<400>1aggagcacca cgaaaagggt tgagacactg ggtcttaccc gagccgtgag gaaccggttg 60cctgtagtgg gcacggtttg gtgcacaaca aacttttttg actgccagac acactattgg120gctttgagac aacaggcccg tgcccctttt ggggggtggc atccggttgc gggtgtcggc180gtgttgttgc ctcactttgg tggtggggtg tggtgtttga tttgtggata gtggttgcga240gcatctagca cgcagaatcg tgtggtctca ctccttgtgg gtggggctgg ttttgtgtgt300tgatgtgcaa tttcttttga aactcatttt tggtttttgt gttgtaagtg tttaagggcg360catggtggat gccttggcag gatcca 386<210>2
<211>338<212>DNA<213>(Mycobacterium chelonae)龟分枝杆菌<400>2aggagcacca tttcccagcc gaatgagctt gggaacataa agcgagtttc tgtagtggtt 60actcgcttgg tgaatatgtt ttataaatcc tgtccacccc gtggataggt agtcggcaaa120acgtcggact gtcaatagaa ttgaaacgct ggcacactgt tgggtcctga ggcaacacat180tgtgttgtca ccctgcttgg tggtggggtg tggtctttga cttatggata gtggttgcga240gcatctaaca aacctcgctc gtttacgagt gaggttagtt tttgcaattt attagctaag300ttcttaaggg cacatggtgg atgccttggc aggatcca338<210>3<211>317<212>DNA<213>(Mycobacterium abscesslus)脓肿分枝杆菌<400>3aaggagcacc atttcccagt cgaatgaact agggaacata aagtaggcat ctgtagtgga 60tatctacttg gtgaatatgt tttgtaaatc ctgtccaccc cgtggatggg tagtcggcaa120aacgtcggac tgtcataaga attgaaacgc tggcacactg ttgggtcccg aggcaacacg180ttgtgttgtc accctgcttg gtggtggggt gtggactttg acttctgaat agtggttgcg240agcatctaaa catagcctcg ctcgttttcg agtggggctg gtttttgcaa ttttattagc300taagttctta agggcgc 317<210>4<211>429<212>DNA<213>(Mycobacterium vaccae)牝牛分枝杆菌<400>4aaggagcacc acgagaatca ggcccgccca catcgtgtgg gggttcggtg atctgatcga 60ttcgttggat ggcctttcat ctgtagtgga tgggggtctg gtgcacatga caaacttggc120cgagccggta gggaatgccg gcgagggaaa tcatcagaca cactattggg ctttgagaca180acaagcccgt gccccttttt ttgggggtgg ctctgcgttg gcagggtcgg cgtgttgttg240ccccgctttg gtggtggggt gtggtgtttg attogtggat agtggttgcg agcatctgaa300tgcacagcgc ttgtggtgtt gtgtgttcgg tgtaatgcaa atttttctga tactcgcatg360cagtcccttt ttgggggtgt gtgtgggtga ctcatttttt ggttttgtgt tgtaagtgtt420taagggcgc429<210>5<211>379<212>DNA<213>(Mycobacterium flavescens)变黄分枝杆菌<400>5aaggagcacc atttattgtt cccccgtccc cacgtgtgtg ggatcagtgc ggttgggaga 60tcagtgccgg gcctgtagtg ggtttccggt gggtgcacaa caaacgtgag aagtggtgtg120ggaacactgc tttgaggaat catcagacac actattgggc tttgaggcaa caggcccgtt180gtttccctgg ccactgtgtg tggtgggggg tctggtgtcg ccctgtcttt ggtggtgggg240tgtggtgttt gattcggtgga tagtggttgc gagcatctga acaggtggct cccttttggg 300
ggttgcttgt tttgataatg caatttttta ttcttccgag aatatttttc tgttttgtgt360tgtaagtgtt taagggcgc 379<210>6<211>364<212>DNA<213>(Mycobacterium asiaticum)亚洲分枝杆菌<400>6tggatccgac gaagtcgtaa caaggtagcc gtaccggaag gtgcggctgg atcacctcct 60ttctaaggag caocacgaga gcatcccaat tggtgggatg caggccgtgt ggagttctcg120tctgtagtgg acgagggctg ggtgcacaac aacaagcaag ccagacacac tattgggtcc180tgagacaaca ctcgggcgct agcacgaagt gttgtccctc catcttggtg gtggggtgtg240gtgtttgaga actggatagt ggttgcgagc atcaactgat cgcgtcgccg ttcgcggtgg300cgtgttcttt tgtgcaattt taaattcttt ggtttttgta gtgtttgtaa gtgtctaagg360gcgc 364<210>7<211>402<212>DNA<213>(Mycobacterium porcinum)猪分枝杆菌<400>7aaggagcacc gattcgattc ccccgccgtc cgcgtagtcg tgggcagtag tgcggttggg 60atatttcagc caggacctgt agtgggtgtc tggtgggtgc aaatgacaaa cgttgagccg120gcgcgggaaa gcgttggtga tggaaotgct gaacacacta ttgggctttg agacaacagg180cccgtgcccc tttcgggggg tggcattccg ttgggagtgt cggcgtgttg ttgctccgct240ttggtggtgg ggtgtggtgt ttgatttgtg gatagtggtt gcgagcatct agcacgcagt300gtggctgggg gccttcgggt ttccggtctt gttgtgtgtt gatgtgcaat ttcttttgaa360actcattttt ggtttttgtg ttgtaagtgt ttaagggcgc at 402<210>8<211>459<212>DNA<213>(Hycobacterium acapulcensis)阿加普尔分枝杆菌<400>8aaggagcacc agttattttc ccccgccccc acgcctgtgg gatcagttgc ggttgggata 60tttagtgcca gcacctgtag tgggtgtttc ggccggtgca cagcaaacgt tgatcgtctg120gtggggaaag ccgggcgtga aagattgcca gacacactat tgggctttga gacaacaagc180ccgtcgcctc tttgtcccga gtgtgggata tcggagaagg agcaccacga gacctgttgc240ccgcccacat cgtgtgggag ttcggtgact caggcgattc gggggttggt tgtggttgtc300gccctgcttt ggtggtgggg tgtggtgttt gatttgtgga tagtggttgc gagcatctga360acgcagagac ctgtgtgggt ttttgtgttc tgataatgca atttttattc ttccgagaat420attttttgat ctgttttgtg tgtaagtgtt taagggcgc 459<210>9<211>418<212>DNA<213>(Mycobacterium diernhoferi)迪氏分枝杆菌
<400>9aaggagcacc acgagacctg ttgcccgccc acatcgtgtg ggagttcggt gactcaggcg 60attcgttgga tggcctcaca cetgtagtgg gtgggggtct ggtgcacaac aaactttgag120aaactgccag acacactatt gggctttgag acaacaggcc ctgcggtgcc ggactcgttg180gagtcctggt tgccggccgc gagtcccgga agcgattctg gttcggaegg tgtctgttgt240tgctccatct ttggtggtgg ggtgtggtgt ttgatttgtg gatagtggtt gcgagcatct300agcacgcaag aggagtctgg gtttccttcg ggagcccggg tttttgttgt gtgtgtttga360tgtgcaattt ttttcttcta tttggtttta tctgtgttgt aagtgtttaa gggcgcat 418<210>10<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>sequence of probe or primer for detecting Mycobacteria<400>10tggtggggtg tggtgtttga20<210>11<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
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<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacteria)用于检测分枝杆菌的探针或引物序列<400>14aaggagcacc 10<210>15<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting TB complex)用于检测结核菌的探针或引物序列<400>15cactcggact tgttccaggt20<210>16<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting TB complex)用于检测结核菌的探针或引物序列<400>16tggtggggcg taggccgtga20<210>17<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
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<400>17ccccaactgg tggggcgtag20<210>18<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
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<223>(sequence of probe or primer for detecting TB complex)用于检测结核菌的探针或引物序列<400>19gtagtgggcg agagccgggt20<210>20<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting TB complex)用于检测结核菌的探针或引物序列<400>20catgacaaca aagttggcca20<210>21<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting TB complex)用于检测结核菌的探针或引物序列<400>21caacactcgg acttgttcca20
<210>22<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
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<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium avium complex(MAC))用于检测鸟分枝杆菌的探针或引物序列<400>26aaatgattgc cagacacact20<210>27<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Hycobacterium avium complex(MAC))用于检测鸟分枝杆菌的探针或引物序列<400>27ccctgagaca acactcggtc20<210>28<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Hycobacteritm fortuitum)用于检测偶发分枝杆菌的探针或引物序列<400>28cgagccgtga ggaaccggtt20<210>29<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium fortuitum)用于检测偶发分枝杆菌的探针或引物序列<400>29ccgtgaggaa ccggttgcct20<210>30<211>20
<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium fortuitum)用于检测偶发分枝杆菌的探针或引物序列<400>30gtagtgggca cggtttggtg20<210>31<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium fortuitum)用于检测偶发分枝杆菌的探针或引物序列<400>31ttggtgcaca acaaactttt20<210>32<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium fortuitum)用于检测偶发分枝杆菌的探针或引物序列<400>32caaacttttt tgactgccag20<210>33<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacteriutm fortuitum)用于检测偶发分枝杆菌的探针或引物序列<400>33acacactatt gggctttgag20<210>34<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列
<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacteriutm fortuitum)用于检测偶发分枝杆菌的探针或引物序列<400>34ctattgggct ttgagacaac20<210>35<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacteriutm fortuitum)用于检测偶发分枝杆菌的探针或引物序列<400>35aggcccgtgc cccttttggg20<210>36<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacteriutm fortuitum)用于检测偶发分枝杆菌的探针或引物序列<400>36tggcatccgg ttgcgggtgt20<210>37<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacteriutm fortuitum)用于检测偶发分枝杆菌的探针或引物序列<400>37tagcacgcag aatcgtgtgg20<210>38<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacteriutm fortuitum)
用于检测偶发分枝杆菌的探针或引物序列<400>38ggttttgtgt gttgatgtgc20<210>39<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
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<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium chelonae)用于检测龟分枝杆菌的探针或引物序列<400>44tcaatagaat tgaaacgctg20<210>45<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium chelonae)用于检测龟分枝杆菌的探针或引物序列<400>45ggcaacacat tgtgttgtca20<210>46<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium chelonae)用于检测龟分枝杆菌的探针或引物序列<400>46
taacaaacct cgctcgttta20<210>47<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium abscessus)用于检测脓肿分枝杆菌的探针或引物序列<400>47cataaagtag gcatctgtag20<210>48<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
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<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium abscessus)用于检测脓肿分枝杆菌的探针或引物序列<400>50cgttttcgag tggggctggt20
<210>51<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
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<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium abscessus)用于检测脓肿分枝杆菌的探针或引物序列<400>52ctcgttttcg agtggggctg20<210>53<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacteriutm vaccae)用于检测牝牛分枝杆菌的探针或引物序列<400>53tcaggcccgc ccacatcgtg20<210>54<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
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<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacteriutm vaccae)用于检测脓肿分枝杆菌的探针或引物序列<400>58acacactatt gggctttgag20<210>59<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列
<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacteriutm vaccae)用于检测脓肿分枝杆菌的探针或引物序列<400>59acaacaagcc cgtgcccctt20<210>60<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacteriutm vaccae)用于检测脓肿分枝杆菌的探针或引物序列<400>60ttttgggggt ggctctgcgt20<210>61<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
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<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacteriutm vaccae)用于检测脓肿分枝杆菌的探针或引物序列<400>62tgtttgattc gtggatagtg20<210>63<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacteriutm vaccae)用于检测脓肿分枝杆菌的探针或引物序列<400>63gaatgcacag cgcttgtggt20<210>54<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacteriutm vaccae)用于检测脓肿分枝杆菌的探针或引物序列<400>64gtgtgttcgg tgtaatgcaa20<210>65<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium flavescens(用于检测变黄分枝杆菌的探针或引物序列)<400>65tttattgttc ccccgtcccc20<210>66<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium flaveseens(用于检测变黄分枝杆菌的探针或引物序列)<400>66acgtgtgtgg gatcagtgcg20<210>67<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium flavescens(用于检测变黄分枝杆菌的探针或引物序列)
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<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium flavescens)用于检测变黄分枝杆菌的探针或引物序列<400>70cactgctttg aggaatcatc20<210>71<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
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<223>sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium flavescens(用于检测变黄分枝杆菌的探针或引物序列)<400>72tgaacaggtg gctccctttt20<210>73<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium gordonae(用于检测戈氏分枝杆菌的探针或引物序列)<400>73cgacaacaag ctaagccaga20<210>74<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium gordonae)用于检测戈氏分枝杆菌的探针或引物序列<400>74tgttcttttt gtgcaatttt20<210>75<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium gordonae)用于检测戈氏分枝杆菌的探针或引物序列<400>75gcatcaaaat gtatgcgttg20<210>76
<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium gordonae)用于检测戈氏分枝杆菌的探针或引物序列<400>76aaaatgtatg cgttgtcgtt20<210>77<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium gordonae)用于检测戈氏分枝杆菌的探针或引物序列<400>77cggcaacgtg ttctttttgt20<210>78<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacteriutm terrae)用于检测地分枝杆菌的探针或引物序列<400>78ttgagttgtg gatagtggtt20<210>79<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacteriutm terrae)用于检测地分枝杆菌的探针或引物序列<400>79gtcgagtgtt tagagagtaa20<210>80<211>20<212>DNA
<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacteriutm terrae)用于检测地分枝杆菌的探针或引物序列<400>80cgcactgggc gcattccgag20<210>81<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacteriutm terrae)用于检测地分枝杆菌的探针或引物序列<400>81gtgggggctg ggtgcacaac20<210>82<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacteriutm terrae)用于检测地分枝杆菌的探针或引物序列<400>82caacgttgaa aacaagatcg20<210>83<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacteriutm terrae)用于检测地分枝杆菌的探针或引物序列<400>83aattacgaac aacaacaagc20<210>84<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列
<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacteriutm terrae)用于检测地分枝杆菌的探针或引物序列<400>84ttgcgagatc atcaactgcc20<210>85<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacteriutm terrae)用于检测地分枝杆菌的探针或引物序列<400>85aggagtcctt gggggtttct20<210>86<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacteriutm terrae)用于检测地分枝杆菌的探针或引物序列<400>86ggtggccggc ttttgtgctg20<210>87<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacteriutm terrae)用于检测地分枝杆菌的探针或引物序列<400>87ggcacactgt tgggtcctga20<210>88<211>20<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium terrae)用于检测地分枝杆菌的探针或引物序列
<400>88ggcaacaggc ccgtttgtgc20<210>89<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacteriutm terrae)用于检测地分枝杆菌的探针或引物序列<400>89ccccgggtgg gggtgggtgt20<210>90<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacteriutm terrae)用于检测地分枝杆菌的探针或引物序列<400>90gtgttgttgt cgcctcacac20<210>91<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacteriutm terrae)用于检测地分枝杆菌的探针或引物序列<400>91taacaagcag atttttggtc20<210>92<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacteriutm terrae)用于检测地分枝杆菌的探针或引物序列<400>92
tggtctgttt gttttgcaat20<210>93<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacteriutm terrae)用于检测地分枝杆菌的探针或引物序列<400>93ttttgtttct tggtttttgt20<210>94<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacteriutm terrae)用于检测地分枝杆菌的探针或引物序列<400>94gtttgtaagt gtttaagggc20<210>95<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacteriutm terrae)用于检测地分枝杆菌的探针或引物序列<400>95gcatggtgga tgccttggca20<210>96<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacteriutm terrae)用于检测地分枝杆菌的探针或引物序列<400>96ctttttcccc cgtgcctcac20
<210>97<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacteriutm terrae)用于检测地分枝杆菌的探针或引物序列<400>97atgggtgagg gtttttgcgg20<210>98<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacteriutm terrae)用于检测地分枝杆菌的探针或引物序列<400>98ttgggacagt gtttgccggt20<210>99<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacteriutm terrae)用于检测地分枝杆菌的探针或引物序列<400>99gcctgtagtg ggtggccggt20<210>100<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacteriutm terrae)用于检测地分枝杆菌的探针或引物序列<400>100ggtggccggt ggtgcagagg20<210>101<211>20
<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium scrofluceum(用于检测瘰疬分枝杆菌的探针或引物序列)<400>101cctgaggcaa cactcggctc20<210>102<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium scrofluceum(用于检测瘰疬分枝杆菌的探针或引物序列)<400>102tcggctcgtt ctgagtggtg20<210>103<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium scrofluceum(用于检测瘰疬分枝杆菌的探针或引物序列)<400>103taaacggatg cgtggccgaa20<210>104<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium scrofluceum(用于检测瘰疬分枝杆菌的探针或引物序列)<400>104caacagcaaa tgattgccag20<210>105<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列
<220>
<223>sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium scrofluceum(用于检测瘰疬分枝杆菌的探针或引物序列)<400>105ccctccatct tggtggtggg20<210>106<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium scrofluceum(用于检测瘰疬分枝杆菌的探针或引物序列)<400>106tgcgagcatc taaacggatg20<210>107<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium scrofluceum(用于检测瘰疬分枝杆菌的探针或引物序列)<400>107gtggccgaac ggtggcgtgt20<210>108<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium kansasii)用于检测堪萨斯分枝杆菌的探针或引物序列<400>108tcgttgaaat gtgtaatttc20<210>109<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium kansasii)用于检测堪萨斯分枝杆菌的探针或引物序列<400>109gtggggtgca agccgtgagg20<210>110<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium kansasii)用于检测堪萨斯分枝杆菌的探针或引物序列<400>110gcgtgttctt ttgtgcaatt20<210>111<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium kansasii)用于检测堪萨斯分枝杆菌的探针或引物序列<400>111gcaactgtaa atgaatcacc20<210>112<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium szulgai)用于检测斯氏分枝杆菌的探针或引物序列<400>112ctggatgcgc tgccgttcgt20<210>113<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium szulgai)用于检测斯氏分枝杆菌的探针或引物序列
<400>113aacactcagg cttggccaga20<210>114<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium szulgai)用于检测斯氏分枝杆菌的探针或引物序列<400>114caattggatg cgctgccctc20<210>115<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium szulgai)用于检测斯氏分枝杆菌的探针或引物序列<400>115tcgtggtggc gtgttctttt20<210>116<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium szulgai)用于检测斯氏分枝杆菌的探针或引物序列<400>116gtgcaatttt aattctttgg20<210>117<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium marinum andMycobacterium ulcerans(用于检测海分枝杆菌和溃疡分枝杆菌的探针或引物序列)
<400>117aacaacaagc aagccagaca20<210>118<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium marinum andMycobacterium ulcerans(用于检测海分枝杆菌和溃疡分枝杆菌的探针或引物序列)<400>118atctctgttg gtttcgggat20<210>119<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium marinum andMycobacterium ulcerans(用于检测海分枝杆菌和溃疡分枝杆菌的探针或引物序列)<400>119ccttttggtg gcgtgttctg20<210>120<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium gastri)用于检测胃分枝杆菌的探针或引物序列<400>120aacagcaagc aagccagaca20<210>121<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium gastri)用于检测胃分枝杆菌的探针或引物序列
<400>121ctcgtccaag agtgttgtcc20<210>122<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium gastri)用于检测胃分枝杆菌的探针或引物序列<400>122gcttgtcttg gactcgtcca20<210>123<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium gastri)用于检测胃分枝杆菌的探针或引物序列<400>123cagggtagcg tgttcttttg20<210>124<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium xenopi)用于检测蟾分枝杆菌的探针或引物序列<400>124catctggcaa agactgtggt20<210>125<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium xenopi)用于检测蟾分枝杆菌的探针或引物序列<400>125agggagcacc gtaaacgcat20
<210>126<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium xenopi)用于检测蟾分枝杆菌的探针或引物序列<400>126cccgcgtggg gtggggtgtg20<210>127<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium xenopi)用于检测蟾分枝杆菌的探针或引物序列<400>127ggttcggcgt gttgtggcgt20<210>128<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium xenopi)用于检测蟾分枝杆菌的探针或引物序列<400>128cgggccgagg tgttgggcag20<210>129<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium xenopi)用于检测蟾分枝杆菌的探针或引物序<400>129caggcagtaa ccgccggcac20<210>130
<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium xenopi)用于检测蟾分枝杆菌的探针或引物序列<400>130caggcagtaa ccgccggcac20<210>131<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium xenopi)用于检测蟾分枝杆菌的探针或引物序列<400>131tccgcgtggt ggcggggtgt20<210>132<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium xenopi)用于检测蟾分枝杆菌的探针或引物序列<400>132agactgtggt aagcggtttt20<210>133<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium xenopi)用于检测蟾分枝杆菌的探针或引物序列<400>133tgttgagtgt tttctggtgt20<211>134<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列
<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacteritm genavense)用于检测日内瓦分枝杆菌的探针或引物序列<400>134cattgaatag tggttgcgag20<211>135<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacteritn genavense)用于检测日内瓦分枝杆菌的探针或引物序列<400>135aacaacaggc aatcgccgga20<211>136<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacteritm genavense)用于检测日内瓦分枝杆菌的探针或引物序列<400>136tcggccgact gaggtcgacg20<211>137<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacteritm genavense)用于检测日内瓦分枝杆菌的探针或引物序列<400>137gacgtggtgt ccctccatct20<211>138<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacteritm genavense)用于检测日内瓦分枝杆菌的探针或引物序列<400>138
ttgagcattg aatagtggtt20<211>139<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacteritm genavense)用于检测日内瓦分枝杆菌的探针或引物序列<400>139gcgagcatct agacggatgc20<211>140<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacteritm genavense)用于检测日内瓦分枝杆菌的探针或引物序列<400>140gttccccagt ggtgcgcgtt20<211>141<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacteritm genavense)用于检测日内瓦分枝杆菌的探针或引物序列<400>141cgtcaaaaat gtgtaatttt20<211>142<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium almoense)用于检测玛尔摩分枝杆菌的探针或引物序列<400>142agcatctaaa cggatgcgct20<210>143<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列
<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium almoense)用于检测玛尔摩分枝杆菌的探针或引物序列<400>143tggtggggtg caagccgtga20<210>144<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium almoense)用于检测玛尔摩分枝杆菌的探针或引物序列<400>144ccagtccgcg tggtgtcccc20<210>145<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium almoense)用于检测玛尔摩分枝杆菌的探针或引物序列<400>145tgcccgtaga cgcgtattcg20<210>146<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium almoense)用于检测玛尔摩分枝杆菌的探针或引物序列<400>146tttgtgtaat ttcttctttg20<210>147<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium simiae)用于检测猿分枝杆菌的探针或引物序列<400>147acaacaacag gcaatcgcca20<210>148<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium simiae)用于检测猿分枝杆菌的探针或引物序列<400>148actcggccga cttcggttga20<210>149<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium simiae)用于检测猿分枝杆菌的探针或引物序列<400>149gagcatctaa atgaacgcgt20<210>150<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium simiae)用于检测猿分枝杆菌的探针或引物序列<400>150tccaattggt ggggtgtgag20<210>151<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium simiae)用于检测猿分枝杆菌的探针或引物序列
<400>151tgcacaacaa caggcaatcg20<210>152<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium simiae)用于检测猿分枝杆菌的探针或引物序列<400>152cgacttcggt tgaagtggtg20<210>153<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium simiae)用于检测猿分枝杆菌的探针或引物序列<400>153tacgtgttcg ttttgtgtaa20<210>154<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium smegmatis)用于检测耻垢分枝杆菌的探针或引物序列<400>154gacactctcc gttggggagg20<210>155<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium smegmatis)用于检测耻垢分枝杆菌的探针或引物序列<400>155
gtgtgagccg tgaggagctg20<210>156<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium smegmatis)用于检测耻垢分枝杆菌的探针或引物序列<400>156gagcgctgta gtggcgccgg20<210>157<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium smegmatis)用于检测耻垢分枝杆菌的探针或引物序列<400>157cttggtgcac agcaaacgtt20<210>158<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium smegmatis)用于检测耻垢分枝杆菌的探针或引物序列<400>158gagatgcggt gtgggaaacg20<210>159<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium smegmatis)用于检测耻垢分枝杆菌的探针或引物序列<400>159ctgtttcgat ggactgccag20<210>160<211>20
<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium smegmatis)用于检测耻垢分枝杆菌的探针或引物序列<400>160acacactatt gggccctgag20<210>161<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium smegmatis)用于检测耻垢分枝杆菌的探针或引物序列<400>161acaacaggcc cgcgttcccg20<210>162<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium smegmatis)用于检测耻垢分枝杆菌的探针或引物序列<400>162tcccgttggg ggcggggggt20<210>163<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium smegmatis)用于检测耻垢分枝杆菌的探针或引物序列<400>163gggtgtgttg ttgccctgct20<210>164<211>20<212>DNA<213>(Anificial Sequence)人工序列
<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium smegmatis)用于检测耻垢分枝杆菌的探针或引物序列<400>164gctgtagtgg cgccggcttg20<210>165<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium smegmatis)用于检测耻垢分枝杆菌的探针或引物序列<400>165aaacgctgtt tcgatggact20<210>166<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacteritm shimoidei)用于检测石氏分枝杆菌的探针或引物序列<400>166aacaacaagc gagaagccga20<210>167<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacteritm shimoidei)用于检测石氏分枝杆菌的探针或引物序列<400>167ggcttccgca gtgggcggaa20<210>168<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacteritm shimoidei)
用于检测石氏分枝杆菌的探针或引物序列<400>168gggcgcgggc tgggtgcaca20<210>169<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacteritm shimoidei)用于检测石氏分枝杆菌的探针或引物序列<400>169gcgagaagcc gagcacactg20<210>170<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacteritm shimoidei)用于检测石氏分枝杆菌的探针或引物序列<400>170cccgggccct ttggggttgg20<210>171<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacteritm shimoidei)用于检测石氏分枝杆菌的探针或引物序列<400>171aagcaaaact tggttgtttt20<210>172<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacteritm shimoidei)用于检测石氏分枝杆菌的探针或引物序列
<400>172gtttgtcgag ttgttttctt20<210>173<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium habana)用于检测哈瓦那分枝杆菌的探针或引物序列<400>173aacaacaggc aatcgccaga20<210>174<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium habana)用于检测哈瓦那分枝杆菌的探针或引物序列<400>174aacactccaa ttgggtgggg20<210>175<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium habana)用于检测哈瓦那分枝杆菌的探针或引物序列<400>175ggttctcgtc tgtagtggac20<210>176<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium habana)用于检测哈瓦那分枝杆菌的探针或引物序列<400>176tgcacaacaa caggcaatcg20
<210>177<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium habana)用于检测哈瓦那分枝杆菌的探针或引物序列<400>177ggccgacttc ggttgaagtg20<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<210>178<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium habana)用于检测哈瓦那分枝杆菌的探针或引物序列<400>178ggggtgtggt gtttgagtat20<210>179<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium habana)用于检测哈瓦那分枝杆菌的探针或引物序列<400>179gagcatctaa atgaacgcgt20<210>180<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium habana)用于检测哈瓦那分枝杆菌的探针或引物序列<400>180
tacgtgttcg ttttgtgtaa20<210>181<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium farcinogen(用于检测产鼻疽分枝杆菌的探针或引物序列)<400>181gttggtgatg gactgccaga20<210>182<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium farcinogen(用于检测产鼻疽分枝杆菌的探针或引物序列)<400>182cgcgggaaag cgttggtgat20<210>183<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium farcinogen(用于检测产鼻疽分枝杆菌的探针或引物序列)<400>183cgatgtcgtg ggcagtagtg20<210>184<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium farcinogen(用于检测产鼻疽分枝杆菌的探针或引物序列)<400>184ggatatttca gccagcatct20
<210>185<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium farcinogen(用于检测产鼻疽分枝杆菌的探针或引物序列)<400>185tgtctggtgg gtgcaaatga20<210>186<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium farcinogen(用于检测产鼻疽分枝杆菌的探针或引物序列)<400>186cggcgcggga aagcgttggt20<210>187<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium farcinogen(用于检测产鼻疽分枝杆菌的探针或引物序列)<400>187gggaaagcgt tggtgatgga20<210>188<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium farcinogen(用于检测产鼻疽分枝杆菌的探针或引物序列)<400>188tctagcacgc agagtgtggc20<210>189<211>20
<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium farcinogen(用于检测产鼻疽分枝杆菌的探针或引物序列)<400>189tgggggcctt cgggtttctt20<210>190<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium asiaticum)用于检测亚洲分枝杆菌的探针或引物序列<400>190catcccaatt ggtgggatgc20<210>191<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium asiaticum)用于检测亚洲分枝杆菌的探针或引物序列<400>191cacaacaaca agcaagccag20<210>192<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium asiaticum)用于检测亚洲分枝杆菌的探针或引物序列<400>192cactcgggcg ctagcacgaa20<210>193<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列
<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium asiaticum)用于检测亚洲分枝杆菌的探针或引物序列<400>193aactgatcgc gtcgccgttc20<210>194<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium porcinum)用于检测猪分枝杆菌的探针或引物序列<400>194cagtagtgcg gttgggatat20<210>195<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium porcinum)用于检测猪分枝杆菌的探针或引物序列<400>195ttcgattccc ccgccgtccg20<210>196<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium porcinum)用于检测猪分枝杆菌的探针或引物序列<400>196cagccaggac ctgtagtggg20<210>197<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium porcinum)用于检测猪分枝杆菌的探针或引物序列<400>197tggtgggtgc aaatgacaaa20<210>198<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium porcinum)用于检测猪分枝杆菌的探针或引物序列<400>198gagccggcgc gggaaagcgt20<210>199<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium porcinum)用于检测猪分枝杆菌的探针或引物序列<400>199gtgatggaac tgctgaacac20<210>200<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium porcinum)用于检测猪分枝杆菌的探针或引物序列<400>200ggctttgaga caacaggccc20<210>201<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium porcinum)用于检测猪分枝杆菌的探针或引物序列
<400>201cggggggtgg cattccgttg20<210>194<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium porcinum)用于检测猪分枝杆菌的探针或引物序列<400>202cggcgtgttg ttgctccgct20<210>203<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium porcinum)用于检测猪分枝杆菌的探针或引物序列<400>203tagtggttge gagcatctag20<210>204<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium porcinum)用于检测猪分枝杆菌的探针或引物序列<400>204agtgtggctg ggggccttcg20<210>205<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>(sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium porcinum)用于检测猪分枝杆菌的探针或引物序列<400>205
ggtcttgttg tgtgttgatg20<210>206<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium acapulcensis(用于检测阿加普尔分枝杆菌的探针或引物序列)<400>206tgccagcacc tgtagtgggt20<210>207<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium acapulcensis(用于检测阿加普尔分枝杆菌的探针或引物序列)<400>207gatcgtctgg tggggaaagc20<210>206<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium acapulcensis(用于检测阿加普尔分枝杆菌的探针或引物序列)<400>208cgggcgtgaa agattgccag20<210>209<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium acapulcensis(用于检测阿加普尔分枝杆菌的探针或引物序列)<400>209agcccgtcgc ctctttgtcc20
<210>210<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium acapulcensis(用于检测阿加普尔分枝杆菌的探针或引物序列)<400>210cgagtgtggg atatcggaga20<210>211<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium acapulcensis(用于检测阿加普尔分枝杆菌的探针或引物序列)<400>211ggagcaccac gagacctgtt20<210>212<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium acapulcensis(用于检测阿加普尔分枝杆菌的探针或引物序列)<400>212cgcccacatc gtgtgggagt20<210>213<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium acapulcensis(用于检测阿加普尔分枝杆菌的探针或引物序列)<400>213tcggtgactc aggcgattcg20<210>214<211>20<212>DNA
<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium acapulcensis(用于检测阿加普尔分枝杆菌的探针或引物序列)<400>214gggtgtggtg tttgatttgt20<210>215<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium acapulcensis(用于检测阿加普尔分枝杆菌的探针或引物序列)<400>215cgagcatctg aacgcagaga20<210>216<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium diernhoferi(用于检测迪氏分枝杆菌的探针或引物序列)<400>216acctgttgcc cgcccacatc20<210>217<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium diernhoferi(用于检测迪氏分枝杆菌的探针或引物序列)<400>217gtgtgggagt tcggtgactc20<210>218<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium diernhoferi(用于检测迪氏分枝杆菌的探针或引物序列)<400>218ttcgttggat ggcctcacac20<210>219<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium diernhoferi(用于检测迪氏分枝杆菌的探针或引物序列)<400>219tgcacaacaa actttgagaa20<210>220<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium diernhoferi(用于检测迪氏分枝杆菌的探针或引物序列)<400>220acaggccctg cggtgccgga20<210>221<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium diernhoferi(用于检测迪氏分枝杆菌的探针或引物序列)<400>221tcgttggagt cctggttgcc20<210>222<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium diernhoferi
(用于检测迪氏分枝杆菌的探针或引物序列)<400>222ggccgcgagt cccggaagcg20<210>223<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium diernhoferi(用于检测迪氏分枝杆菌的探针或引物序列)<400>223gtctgttgtt gctccatctt20<210>224<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium diernhoferi(用于检测迪氏分枝杆菌的探针或引物序列)<400>224ggtgtggtgt ttgatttgtg20<210>225<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium diernhoferi(用于检测迪氏分枝杆菌的探针或引物序列)<400>225atagtggttg cgagcatcta20<210>226<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium diernhoferi(用于检测迪氏分枝杆菌的探针或引物序列)
<400>226acgcaagagg agtctgggtt20<210>227<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium diernhoferi(用于检测迪氏分枝杆菌的探针或引物序列)<400>227ttgttgtgtg tgtttgatgt20<210>228<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium paratuberculosis(用于检测副结核分枝杆菌的探针或引物序列)<400>228gagcaccacg aaaagcaccc20<210>228<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium paratuberculosis(用于检测副结核分枝杆菌的探针或引物序列)<400>229ctggtggggt gcgagccgtg20<210>230<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium paratuberculosis(用于检测副结核分枝杆菌的探针或引物序列)<400>230gcgagccgtg aggggttccc20
<210>231<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium paratuberculosis(用于检测副结核分枝杆菌的探针或引物序列)<400>231aggggttccc gtctgtagtg20<210>232<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium paratuberculosis(用于检测副结核分枝杆菌的探针或引物序列)<400>232acgggggccg ggtgcgcaac20<210>233<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium paratuberculosis(用于检测副结核分枝杆菌的探针或引物序列)<400>233caaatgattg ccagacacac20<210>234<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium paratuberculosis(用于检测副结核分枝杆菌的探针或引物序列)<400>234tattgggcct gagacaacac20<210>235<211>20
<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium paratuberculosis(用于检测副结核分枝杆菌的探针或引物序列)<400>235cggtccgtcc gtgtggagtc20<210>236<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium paratuberculosis(用于检测副结核分枝杆菌的探针或引物序列)<400>236tccatcttgg tggtggggtg20<210>237<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium paratuberculosis(用于检测副结核分枝杆菌的探针或引物序列)<400>237ggtgtttgag tattggatag20<210>238<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium paratuberculosis(用于检测副结核分枝杆菌的探针或引物序列)<400>238tggttgcgag catctagatg20<210>239<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列
<220>
<223>sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium paratuberculosis(用于检测副结核分枝杆菌的探针或引物序列)<400>239gcgcatggtc tccgtggccg20<210>240<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>sequence of probe or primer for detecting Mycobacterium paratuberculosis(用于检测副结核分枝杆菌的探针或引物序列)<400>240gttcatcgaa atgtgtaatt20<210>241<211>20<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>sequence of probe or primer for detecting Mcobacteria sp.
(用于检测酒精分枝杆菌的探针或引物序列)<400>241aaaagctgtt gtttgacggt20<210>242<211>25<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列<220>
<223>sequence of primer for amplifying Mycobacteria ITS selected from the sequence of16S rRNA in Mycobacteria(用于放大从分枝杆菌16S rRNA序列中选择出来的分枝杆菌ITS的引物序列)<400>242tggatccgac gaagtcgtaa caagg25<210>243<211>25<212>DNA<213>(Artificial Sequence)人工序列
<220>
<223>sequence of primer for amplifying Mycobacteria ITS selected from the sequence of23S rRNA in Mycobacteria(用于放大从分枝杆菌23S rRNA序列中选择出来的分枝杆菌ITS的引物序列)<400>243tggatcctgc caaggcatcc accat2权利要求
1.一种用于检测和鉴定分枝杆菌的寡聚核苷酸，其特征是内转录间隔区的偶发分枝杆菌基因ITS的DNA列于序列鉴别号1中。
2.一种用于检测和鉴定分枝杆菌的寡聚核苷酸，其特征是检测和鉴定偶发分枝杆菌的寡聚核苷酸序列列于序列鉴别号28至38中的任一序列鉴别号中。
全文摘要
本发明是用于检测和鉴定分枝杆菌的寡聚核苷酸。更具体地说，是用来鉴定非结核分枝杆菌的ITS(内转录间隔区)的核苷酸序列，这些非结核分枝杆菌包括偶发分枝杆菌，龟分枝杆菌，脓肿分枝杆菌，牝牛分枝杆菌，变黄分枝杆菌，亚洲分枝杆菌，猪分枝杆菌，阿加普尔分枝杆菌和迪氏分枝杆菌。通过这些分枝杆菌的寡聚核苷酸引物或探针。本发明的寡聚核苷酸探针(结合到固相基质中)，它们只能与特异的分枝杆菌中的ITS核苷酸序列进行杂交，因此它们能敏感地检测和鉴定特异的分枝杆菌。通过PCR放大，与上述探针有相同核苷酸序列的寡聚核苷酸引物也能检测和鉴定特异的分枝杆菌。应用这些依据分枝杆菌ITS制备的寡聚核苷酸引物或探针，便能够准确而有效地检测分枝杆菌，鉴别结核菌与NTM，和鉴定分枝杆菌的种类。
文档编号C07K14/35GK1542142SQ20041000630
公开日2004年11月3日 申请日期2000年5月16日 优先权日1999年5月29日
发明者金哲民, 朴希卿, 张贤贞 申请人:Sj高技术株式会社, 金哲民, 朴希卿