一种水稻抗稻瘟病基因Pi2的功能分子标记Pi2‑1及应用的制作方法

技术特征：

1.一种水稻抗稻瘟病基因Pi2的功能分子标记Pi2-1，其特征在于，所述功能分子标记所扩增的DNA片段包含水稻抗稻瘟病基因Pi2基因组序列的第1543-1545位核苷酸，某些水稻感稻瘟病品种在该位点存在ACA 3个碱基缺失，由引物对SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2从水稻基因组中扩增出抗稻瘟病基因Pi2的DNA片段，经电泳检测DNA片段大小，从而确定水稻抗稻瘟病基因Pi2的完整性，进而确定其稻瘟病抗性。

2.一种水稻抗稻瘟病基因Pi2的功能分子标记Pi2-1的引物对，其特征在于，所述引物对的正向引物如SEQ ID NO.1所示，所述引物对的反向引物如SEQ ID NO.2所示。

3.一种鉴定水稻抗稻瘟病基因Pi2的方法，其特征在于，包括以下步骤：

1)通过常规PCR法扩增及测序，获得水稻抗稻瘟病基因Pi2的1个抗病等位基因与1个感病等位基因序列；

2)将步骤1)所获得的序列进行比对，得到水稻抗稻瘟病基因Pi2的第1543-1545位点处存在ACA 3个碱基缺失，该差异位于该基因的外显子；

3)对不同水稻的总DNA进行PCR扩增反应，所得扩增产物进行电泳检测验证，获得与水稻抗稻瘟病基因Pi2呈特异性带型的核苷酸片段；

4)对步骤3)所获得的分子标记在不同的水稻品种中进行带型显色和基因型分型，从而确定水稻抗稻瘟病基因Pi2的完整性，进而确定其稻瘟病抗性。

4.根据权利要求3所述的鉴定水稻抗稻瘟病基因Pi2的方法，其特征在于，所述步骤3)中的PCR反应体系如下：

5.根据权利要求3所述的鉴定水稻抗稻瘟病基因Pi2的方法，其特征在于，所述电泳检测中的8％聚丙烯酰胺凝胶的组成如下：

6.根据权利要求3所述的鉴定水稻抗稻瘟病基因Pi2的方法，其特征在于，所述显色中的聚丙烯酰胺凝胶显色液100ml的组成如下：

7.权利要求1所述的水稻抗稻瘟病基因Pi2的功能分子标记Pi2-1在筛选和鉴定水稻稻瘟病抗性品种中的应用。