、7、8、9、10、15、20、25、30、35、40、45、50、60、70、80、90 或超过 100,优 选不超过10个缺失的、插入的、修饰的和/或置换的氨基酸或（ii)具有在全长上与SEQID NO: 15的氨基酸序列至少98%、99%或至少99. 9%，更优选至少99%和最优选至少99. 9% 相同的氨基酸序列。
[0153] 在本发明的第二个方面的优选实施方案中，分离的多核苷酸编码具有根据SEQID N0:21的氨基酸序列的腺病毒六邻体蛋白或其功能性衍生物，其中所述功能性衍生物（i) 不包含超过 1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、15、20、25、30、35、40、45、50、60、70、80、90 或超过 100， 优选不超过10个缺失的、插入的、修饰的和/或置换的氨基酸或（ii)具有在全长上与SEQ 10勵:21的氨基酸序列至少95%、98%、99%、99.5%、99.9%或至少99.95%，更优选至少 98 %相同的氨基酸序列。
[0154] 在本发明的第三个方面的优选实施方案中，分离的多核苷酸编码具有根据SEQID N0:27的氨基酸序列的腺病毒五邻体蛋白或其功能性衍生物，其中所述功能性衍生物（i) 不包含超过 1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、15、20、25、30、35、40、45、50、60、70、80、90 或超过 100， 优选不超过10个缺失的、插入的、修饰的和/或置换的氨基酸或（ii)具有在全长上与SEQ IDN0:27的氨基酸序列至少98%、99 %、99. 5%、99. 9%或至少99. 95%，更优选至少98% 和最优选至少99%相同的氨基酸序列。
[0155] 在另一个方面，本发明涉及包含第一、第二、第三、第一和第二、第一和第三、第二 和第三或第一、第二和第三个方面的多核苷酸。优选包含这个或这些多核苷酸的多核苷酸 包含其他在腺病毒基因组中（例如使用Ad5基因组作为参考）与六邻体、五邻体和/或纤 维基因邻近的腺病毒基因和核苷酸区段。优选所述多核苷酸也包含将多核苷酸包装进腺病 毒颗粒所需的序列。
[0156]腺病毒ChAd83
[0157] 在本发明的第一个方面的优选实施方案中，分离的多核苷酸编码具有根据SEQID N0:16的氨基酸序列的腺病毒纤维蛋白或其功能性衍生物，其中所述功能性衍生物（i)不 包含超过 1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、15、20、25、30、35、40、45、50、60、70、80、90 或超过 100,优 选不超过10个缺失的、插入的、修饰的和/或置换的氨基酸或（ii)具有SEQIDN0:16的 氨基酸序列。
[0158] 在本发明的第二个方面的优选实施方案中，分离的多核苷酸编码具有根据SEQID N0:22的氨基酸序列的腺病毒六邻体蛋白或其功能性衍生物，其中所述功能性衍生物（i) 不包含超过 1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、15、20、25、30、35、40、45、50、60、70、80、90 或超过 100， 优选不超过10个缺失的、插入的、修饰的和/或置换的氨基酸或（ii)具有在全长上与SEQ 10勵:22的氨基酸序列至少95%、98%、99%、99.5%、99.9%或至少99.95%，更优选至少 98 %相同的氨基酸序列。
[0159] 在本发明的第三个方面的优选实施方案中，分离的多核苷酸编码具有根据SEQID N0:28的氨基酸序列的腺病毒五邻体蛋白或其功能性衍生物，其中所述功能性衍生物（i) 不包含超过 1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、15、20、25、30、35、40、45、50、60、70、80、90 或超过 100， 优选不超过10个缺失的、插入的、修饰的和/或置换的氨基酸或（ii)具有在全长上与SEQ IDN0:28的氨基酸序列至少98%、99 %、99. 5%、99. 9%或至少99. 95%，更优选至少98% 和最优选至少99%相同的氨基酸序列。
[0160] 在最优选的实施方案中，本发明的多核苷酸由下述多核苷酸组成或包含下述多核 苷酸：其在全长上与由SEQIDN0:65组成的序列或与由SEQIDN0:65组成的但缺乏SEQ IDN0:65的基因组区域E1A、E1B、E2A、E2B、E3和/SE4中的任意区域，最优选缺乏SEQ IDN0:65 的基因组区域El、E3 和E4 的序列至少 90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、 97%、98%同一和最优选至少99%或100%同一。
[0161] 在另一个方面，本发明涉及包含第一、第二、第三、第一和第二、第一和第三、第二 和第三或第一、第二和第三个方面的多核苷酸。优选包含这个或这些多核苷酸的多核苷酸 包含其他在腺病毒基因组中（例如使用如SEQIDN0:65所示的ChAd83基因组）与六邻体、 五邻体和/或纤维基因邻近的腺病毒基因和核苷酸区段。优选所述多核苷酸也包含将多核 苷酸包装进腺病毒颗粒所需的序列。
[0162]腺病毒ChAdl46
[0163] 在本发明的第一个方面的优选实施方案中，分离的多核苷酸编码具有根据SEQID N0:17的氨基酸序列的腺病毒纤维蛋白或其功能性衍生物，其中所述功能性衍生物（i)不 包含超过 1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、15、20、25、30、35、40、45、50、60、70、80、90 或超过 100,优 选不超过10个缺失的、插入的、修饰的和/或置换的氨基酸或（ii)具有SEQIDN0:17的 氨基酸序列。
[0164] 在本发明的第二个方面的优选实施方案中，分离的多核苷酸编码具有根据SEQID N0:23的氨基酸序列的腺病毒六邻体蛋白或其功能性衍生物，其中所述功能性衍生物（i) 不包含超过 1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、15、20、25、30、35、40、45、50、60、70、80、90 或超过 100， 优选不超过10个缺失的、插入的、修饰的和/或置换的氨基酸或（ii)具有在全长上与SEQ 10勵:23的氨基酸序列至少95%、98%、99%、99.5%、99.9%或至少99.95%，更优选至少 98 %相同的氨基酸序列。
[0165] 在本发明的第三个方面的优选实施方案中，分离的多核苷酸编码具有根据SEQID N0:29的氨基酸序列的腺病毒五邻体蛋白或其功能性衍生物，其中所述功能性衍生物（i) 不包含超过 1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、15、20、25、30、35、40、45、50、60、70、80、90 或超过 100， 优选不超过10个缺失的、插入的、修饰的和/或置换的氨基酸或（ii)具有在全长上与SEQ IDN0:29的氨基酸序列至少98%、99 %、99. 5%、99. 9%或至少99. 95%，更优选至少98% 和最优选至少99%相同的氨基酸序列。
[0166] 在另一个方面，本发明涉及包含第一、第二、第三、第一和第二、第一和第三、第二 和第三或第一、第二和第三个方面的多核苷酸。优选包含这个或这些多核苷酸的多核苷酸 包含其他在腺病毒基因组中（例如使用Ad5基因组作为参考）与六邻体、五邻体和/或纤 维基因邻近的腺病毒基因和核苷酸区段。优选所述多核苷酸也包含将多核苷酸包装进腺病 毒颗粒所需的序列。
[0167]腺病毒ChAdl47
[0168] 在本发明的第一个方面的优选实施方案中，分离的多核苷酸编码具有根据SEQID N0:18的氨基酸序列的腺病毒纤维蛋白或其功能性衍生物，其中所述功能性衍生物（i)不 包含超过 1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、15、20、25、30、35、40、45、50、60、70、80、90 或超过 100,优 选不超过10个缺失的、插入的、修饰的和/或置换的氨基酸或（ii)具有在全长上与SEQID N0:18 的氨基酸序列至少 85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、 96 %、97 %、98 %或至少99 %，更优选至少85 %和最优选至少90 %相同的氨基酸序列。
[0169] 在本发明的第二个方面的优选实施方案中，分离的多核苷酸编码具有根据SEQID N0:24的氨基酸序列的腺病毒六邻体蛋白或其功能性衍生物，其中所述功能性衍生物（i) 不包含超过 1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、15、20、25、30、35、40、45、50、60、70、80、90 或超过 100， 优选不超过10个缺失的、插入的、修饰的和/或置换的氨基酸或（ii)具有在全长上与SEQ 10吣:24的氨基酸序列至少95%、98%、99%、99.5%、99.9%或至少99.95%，更优选至少 98 %相同的氨基酸序列。
[0170] 在本发明的第三个方面的优选实施方案中，分离的多核苷酸编码具有根据SEQID N0:30的氨基酸序列的腺病毒五邻体蛋白或其功能性衍生物，其中所述功能性衍生物（i) 不包含超过 1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、15、20、25、30、35、40、45、50、60、70、80、90 或超过 100， 优选不超过10个缺失的、插入的、修饰的和/或置换的氨基酸或（ii)具有在全长上与SEQ IDN0:30的氨基酸序列至少98%、99 %、99. 5%、99. 9%或至少99. 95%，更优选至少98% 和最优选至少99%相同的氨基酸序列。
[0171] 在另一个方面，本发明涉及包含第一、第二、第三、第一和第二、第一和第三、第二 和第三或第一、第二和第三个方面的多核苷酸。优选包含这个或这些多核苷酸的多核苷酸 包含其他在腺病毒基因组中（例如使用Ad5基因组作为参考）与六邻体、五邻体和/或纤 维基因邻近的腺病毒基因和核苷酸区段。优选所述多核苷酸也包含将多核苷酸包装进腺病 毒颗粒所需的序列。
[0172]腺病毒PanAdl
[0173] 在本发明的第一个方面的优选实施方案中，分离的多核苷酸编码具有根据SEQID N0:19的氨基酸序列的腺病毒纤维蛋白或其功能性衍生物，其中所述功能性衍生物（i)不 包含超过 1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、15、20、25、30、35、40、45、50、60、70、80、90 或超过 100,优 选不超过10个缺失的、插入的、修饰的和/或置换的氨基酸或（ii)具有在全长上与SEQID NO:19 的氨基酸序列至少 85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、 96 %、97 %、98 %或至少99 %，更优选至少85 %和最优选至少99 %相同的氨基酸序列。
[0174] 在本发明的第二个方面的优选实施方案中，分离的多核苷酸编码具有根据SEQID N0:25的氨基酸序列的腺病毒六邻体蛋白或其功能性衍生物，其中所述功能性衍生物（i) 不包含超过 1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、15、20、25、30、35、40、45、50、60、70、80、90 或超过 100， 优选不超过10个缺失的、插入的、修饰的和/或置换的氨基酸或（ii)具有在全长上与SEQ 10勵:25的氨基酸序列至少95%、98%、99%、99.5%、99.9%或至少99.95%，更优选至少 98 %和最优选至少99 %相同的氨基酸序列。
[0175] 在本发明的第三个方面的优选实施方案中，分离的多核苷酸编码具有根据SEQID N0:31的氨基酸序列的腺病毒五邻体蛋白或其功能性衍生物，其中所述功能性衍生物（i) 不包含超过 1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、15、20、25、30、35、40、45、50、60、70、80、90 或超过 100， 优选不超过10个缺失的、插入的、修饰的和/或置换的氨基酸或（ii)具有在全长上与SEQ IDN0:31 的氨基酸序列至少 85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、 95 %、96 %、97 %、98 %或至少99 %，更优选至少85 %和最优选至少90 %相同的氨基酸序 列。
[0176] 在最优选的实施方案中，本发明的多核苷酸由下述多核苷酸组成或包含下述多核 苷酸：其在全长上与由SEQIDN0:13组成的序列或与由SEQIDN0:13组成的但缺乏SEQID 勵：13的基因组区域￡认41842六42843和/或￡4中任意区域，最优选缺乏3￡〇10勵 ：13 的基因组区域E1、E3 和E4 的序列至少 90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98% 同一和最优选至少99%或100%同一。
[0177] 在另一个方面，本发明涉及包含第一、第二、第三、第一和第二、第一和第三、第二 和第三或第一、第二和第三个方面的多核苷酸。优选包含这个或这些多核苷酸的多核苷酸 包含其他在腺病毒基因组中（例如使用如SEQIDN0:13所示的PanAdl基因组）与六邻体、 五邻体和/或纤维基因邻近的腺病毒基因和核苷酸区段。优选所述多核苷酸也包含将多核 苷酸包装进腺病毒颗粒所需的序列。
[0178]腺病毒PanAd2
[0179] 在本发明的第一个方面的优选实施方案中，分离的多核苷酸编码具有根据SEQID N0:50的氨基酸序列的腺病毒纤维蛋白或其功能性衍生物，其中所述功能性衍生物（i)不 包含超过 1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、15、20、25、30、35、40、45、50、60、70、80、90 或超过 100,优 选不超过10个缺失的、插入的、修饰的和/或置换的氨基酸或（ii)具有在全长上与SEQID N0:50 的氨基酸序列至少 85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、 96 %、97 %、98 %或至少99 %，更优选至少85 %和最优选至少99 %相同的氨基酸序列。
[0180] 在本发明的第二个方面的优选实施方案中，分离的多核苷酸编码具有根据SEQID N0:51的氨基酸序列的腺病毒六邻体蛋白或其功能性衍生物，其中所述功能性衍生物（i) 不包含超过 1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、15、20、25、30、35、40、45、50、60、70、80、90 或超过 100， 优选不超过10个缺失的、插入的、修饰的和/或置换的氨基酸或（ii)具有在全长上与SEQ 10勵:51的氨基酸序列至少95%、98%、99%、99.5%、99.9%或至少99.95%，更优选至少 98 %和最优选至少99 %相同的氨基酸序列。
[0181] 在本发明的第三个方面的优选实施方案中，分离的多核苷酸编码具有根据SEQID N0:52的氨基酸序列的腺病毒五邻体蛋白或其功能性衍生物，其中所述功能性衍生物（i) 不包含超过 1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、15、20、25、30、35、40、45、50、60、70、80、90 或超过 100， 优选不超过10个缺失的、插入的、修饰的和/或置换的氨基酸或（ii)具有在全长上与SEQ IDN0:52 的氨基酸序列至少 85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、 95 %、96 %、97 %、98 %或至少99 %，更优选至少85 %和最优选至少90 %相同的氨基酸序 列。
[0182] 在最优选的实施方案中，本发明的多核苷酸由下述多核苷酸组成或包含下述多核 苷酸：其在全长上与由SEQIDN0:62组成的序列或与由SEQIDN0:62组成的但缺乏SEQID N0:62的基因组区域￡认41842六42843和/或￡4中任意区域，最优选缺乏5￡〇10勵:62 的基因组区域E1、E3 和E4 的序列至少 90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98% 同一和最优选至少99%或100%同一。
[0183] 在另一个方面，本发明涉及包含第一、第二、第三、第一和第二、第一和第三、第二 和第三或第一、第二和第三个方面的多核苷酸。优选包含这个或这些多核苷酸的多核苷酸 包含其他在腺病毒基因组中（例如使用如SEQIDN0:62所示的PanAdl基因组）与六邻体、 五邻体和/或纤维基因邻近的腺病毒基因和核苷酸区段。优选所述多核苷酸也包含将多核 苷酸包装进腺病毒颗粒所需的序列。
[0184]腺病毒PanAd3
[0185] 在本发明的第一个方面的优选实施方案中，分离的多核苷酸编码具有根据SEQID N0:53的氨基酸序列的腺病毒纤维蛋白或其功能性衍生物，其中所述功能性衍生物（i)不 包含超过 1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、15、20、25、30、35、40、45、50、60、70、80、90 或超过 100,优 选不超过10个缺失的、插入的、修饰的和/或置换的氨基酸或（ii)具有在全长上与SEQID N0:53 的氨基酸序列至少 85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、 96 %、97 %、98 %或至少99 %，更优选至少85 %和最优选至少99 %相同的氨基酸序列。
[0186] 在本发明的第二个方面的优选实施方案中，分离的多核苷酸编码具有根据SEQID N0:54的氨基酸序列的腺病毒六邻体蛋白或其功能性衍生物，其中所述功能性衍生物（i) 不包含超过 1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、15、20、25、30、35、40、45、50、60、70、80、90 或超过 100， 优选不超过10个缺失的、插入的、修饰的和/或置换的氨基酸或（ii)具有在全长上与SEQ 10吣:54的氨基酸序列至少95%、98%、99%、99.5%、99.9%或至少99.95%，更优选至少 98 %和最优选至少99 %相同的氨基酸序列。
[0187] 在本发明的第三个方面的优选实施方案中，分离的多核苷酸编码具有根据SEQID N0:55的氨基酸序列的腺病毒五邻体蛋白或其功能性衍生物，其中所述功能性衍生物（i) 不包含超过 1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、15、20、25、30、35、40、45、50、60、70、80、90 或超过 100， 优选不超过10个缺失的、插入的、修饰的和/或置换的氨基酸或（ii)具有在全长上与SEQ IDN0:55 的氨基酸序列至少 85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、 95 %、96 %、97 %、98 %或至少99 %，更优选至少85 %和最优选至少90 %相同的氨基酸序 列。
[0188] 在最优选的实施方案中，本发明的多核苷酸由下述多核苷酸组成或包含下述多核 苷酸：其在全长上与由SEQIDN0:63组成的序列或与由SEQIDN0:63组成的但缺乏SEQID N0:63的基因组区域￡认41842六42843和/或￡4中任意区域，最优选缺乏5￡〇10勵:63 的基因组区域E1、E3 和E4 的序列至少 90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98% 同一和最优选至少99%或100%同一。
[0189] 在另一个方面，本发明涉及包含第一、第二、第三、第一和第二、第一和第三、第二 和第三或第一、第二和第三个方面的多核苷酸。优选包含这个或这些多核苷酸的多核苷酸 包含其他在腺病毒基因组中（例如使用如SEQIDN0:63所示的PanAdl基因组）与六邻体、 五邻体和/或纤维基因邻近的腺病毒基因和核苷酸区段。优选所述多核苷酸也包含将多核 苷酸包装进腺病毒颗粒所需的序列。
[0190] 在重组腺病毒中，根据本发明的第一、第二和第三个方面和根据本文公开的各个 优选的实施方案的纤维、六邻体和五邻体蛋白各自单独地作用于降低所述重组腺病毒与人 和/或啮齿类中和抗体的相互作用。由此，编码本发明的所述纤维、六邻体和/或五邻体蛋 白的多核苷酸可用于构建增强的重组腺病毒。因此，本发明的另一个即第四个方面提供了 包含至少一种、优选至少2种和最优选3种分离的多核苷酸的多核苷酸，所述分离的多核苷 酸选自由根据本发明的第一个方面、本发明的第二个方面和本发明的第三个方面的多核苷 酸组成的多核苷酸组。因此，最优选地，第四个方面是包含本发明的第一、第二和第三个方 面的分离的多核苷酸。在优选的实施方案中，根据本发明的第四个方面的多核苷酸是选自 下述的多核苷酸：
[0191] (i)包含根据本发明的第一、第二或第三个方面的一种多核苷酸的多核苷酸；
[0192] (ii)包含根据本发明的第一个方面的多核苷酸和根据本发明的第二个方面的多 核苷酸的多核苷酸；
[0193] (iii)包含根据本发明的第一个方面的多核苷酸和根据本发明的第三个方面的多 核苷酸的多核苷酸；
[0194] (iv)包含根据本发明的第二个方面的多核苷酸和根据本发明的第三个方面的多 核苷酸的多核苷酸；
[0195] (V)包含根据本发明的第一、第二和第三个方面的多核苷酸的多核苷酸；
[0196] 其中优选地包含在根据（i)至（V)的多核苷酸中的所述多核苷酸选自相同的腺病 毒分离株，例如分别编码纤维、六邻体和五邻体或其功能性衍生物的所有3种多核苷酸仅 来自以下腺病毒中的一种：ChAd55、ChAd73、ChAd83、ChAdl46、ChAdl47PanAdl、PanAd2 或 PanAd3。此外，优选地在本发明的第四个方面或其优选的实施方案中，例如如上概述的，每 种"功能性衍生物"不包含超过10个、超过5个或超过3个氨基酸改变（即缺失、插入、修 饰和/或置换的氨基酸）。
[0197] 下表2列出了如上概述的本发明的第四个方面的多核苷酸的大量特别优选的实 施方案。优选的多核苷酸选自表2所示的多核苷酸A1至AF1，其中所述多核苷酸包含根据 本发明的第一、第二和第三个方面的可选项（c)的3种多核苷酸，每种多核苷酸分别编码腺 病毒的纤维、六邻体和五邻体蛋白或其功能性衍生物。下表2显示了所述3种编码的蛋白 质中的每一个在其全长上必须具有的与根据表2也显示的SEQIDN0的氨基酸序列的最小 序列同一性（即至少是指示的序列同一性）：
[0198]
O.
[0199] 例如，如上表1中所示的优选多核苷酸A1包含：
[0200] ⑴编码具有在全长上与SEQIDN0:14至少85%相同的氨基酸序列的多肽的多 核苷酸；
[0201] (ii)编码具有在全长上与SEQIDN0:20至少95%相同的氨基酸序列的多肽的多 核苷酸；
[0202] (iii)编码具有在全长上与SEQIDN0:26至少98%相同的氨基酸序列的多肽的 多核苷酸；
[0203] 如上所述最优选地在表2中所列的多核苷酸的所述"功能性衍生物"不包含超过 10个氨基酸改变（即缺失、插入、修饰和/或置换的氨基酸）。
[0204] 下表3列出了本发明的第四个方面的多核苷酸的进一步优选的实施方案。优选 的多核苷酸选自从表3选择的多核苷酸A2至J2,其中所述多核苷酸包含命名为"多核苷酸 1"、"多核苷酸2"和"多核苷酸3"的3种多核苷酸，其中每种多核苷酸在全长上分