一种影响猪饲料转化率性状的分子标记及应用
【技术领域】
[0001] 本发明涉及分子标记辅助选择技术及动物遗传育种技术领域，特别涉及一种影响 猪饲料转化率性状的分子标记及应用。
【背景技术】
[0002] 2014年，全球的猪肉总产量达1.10亿吨，而中国的猪肉产量排名第一，占世界总产 量的51.3%。另外，猪肉作为我国最主要的肉类来源，生猪养殖产业在我国畜牧业中占据着 举足轻重的地位。此外，自八十年代以来，猪肉一直是城乡居民餐桌上的主打肉类，城乡居 民猪肉消费始终占到肉类消费的60%以上，始终占据主导地位。猪肉消费具有不可替代性， 其安全性和有效供给既是关系到老百姓切身利益的大事，也是影响社会发展和稳定的大 事。
[0003] 养猪业是我国畜牧业中的主要产业，也是大多数农村地区发展经济的支柱产业。 在养猪行业中，饲料成本占养猪总成本的65-75%。因此，降低生猪养殖中的饲料转化率，提 高饲料利用效率，降低饲料成本关系到养猪企业发展，乃至生存。
[0004] 另一方面，随着规模化养猪的迅速兴起，养猪场普遍采用配合饲料，饲料的需求量 逐年上升，人猪争粮的矛盾日益突出。而预计到2030年，中国将有16亿人口，届时预计需要 7.43亿吨粮食，而根据目前产量推算，我国只能提供7.1亿吨粮食，另外在2010年，饲料粮已 经占我国粮食总量的40%，预计到2020及2030年，该比例更是将达45-50%，粮食已经不能 满足人类的需求。毫无疑问，未来数十年我国蛋白质饲料和能量饲料将长期处于供需紧平 衡状态，饲料原料的短缺将威胁到中国粮食安全。
[0005] 饲料转化效率是衡量畜禽对饲料利用效率高低的一项重要的经济技术指标。养猪 生产是否盈利更加取决于猪群饲料转化率的高低。假如饲料转化率提高〇. 1:1，我国养猪业 每年可节约饲料805万吨，相当于564万亩土地的粮食产量。按60 %的配方比例计，可节约玉 米483万吨，超过了目前我国一年300多万吨的玉米进口；按20%的配方比例和79%的出柏 率计，可节约大豆204万吨，相当于一年大豆进口量6338万吨的1/20。饲料转化率的提高对 于解决我国饲料用粮短缺问题、缓解人畜争粮矛盾意义重大。显然，饲料转化率无疑是种猪 遗传改良工作中的首要性状。因此，如何提高饲料利用率，减少饲料消耗是当前养猪业面临 的重要问题之一。
[0006] 然而，饲料转化率作为种猪遗传改良工作中的首要性状，却少有在杜洛克猪群体 中鉴定与饲料转化率相关的分子标记。
【发明内容】
[0007] 为克服上述现有技术中存在的缺点与不足，本发明的首要目的在于提供一种影响 猪饲料转化率性状的分子标记，所述分子标记的核苷酸序列如SEQ ID N0:1所示，其中序列 中的Μ是A或C，导致猪饲料转化率性状的不同。
[0008] 所述分子标记位于猪的12号染色体上的核苷酸序列上，所述分子标记的SNP位点 为SEQ IDNO: 1序列标注位置为690的C690-A690的核苷酸突变;所述的分子标记的SNP位点 对应于国际猪基因组10.2版本参考序列12号染色体上第17941131个核苷酸位点A>C突变。
[0009] 本发明的另一目的在于提供上述的分子标记在筛选优良饲料转化率性状的猪品 种的方法，具体为，检测猪12号染色体上权利要求1所述的分子标记，所述分子标记的5 '端 第690位单核苷酸是C还是A，淘汰C保留A。具体体现在所述种猪选自广东温氏食品集团股份 有限公司种猪分公司的纯种杜洛克及其合成系。
[0010] 本发明的另一目的在于提供一种用于鉴定上述影响猪饲料转化率性状的分子标 记的引物对，所述引物对的核酸序列如下所示：
[0011] 正向引物序列如SEQ ID N0:2所示；
[0012] 反向引物序列如SEQ ID N0:3所示。
[0013] 上述的引物对在鉴定影响猪饲料转化率性状中的应用。
[0014] 上述的引物对在猪分子标记辅助育种中的应用。
[0015] 上述的引物对在调节猪饲料转化率中的应用。
[0016] 本发明的再一目的在于提供一种猪的遗传改良的方法，所述方法包括:确定种猪 核心群中的种猪的上述的影响猪饲料转化率性状的分子标记的位点，并根据所述分子标记 做出相应的选择:在所述种猪核心群中选择在所述第17941131位点为AA、AC基因型的种猪 个体，淘汰在该位点为CC基因型的种猪个体，以逐代提尚该位点的等位基因 A的频率，从而 降低后代猪的饲料转化率。
[0017] 本发明相对于现有技术具有如下的优点及效果：
[0018] 本发明研究并确定影响饲料转化率相关的分子标记，验证其对饲料转化率性状的 影响效应，最终建立高效准确的分子标记辅助育种技术，将其应用于种猪饲料转化率性状 遗传改良中，从而降低猪的饲料转化率，进而节约粮食，降低企业生产成本，提高企业利润， 增加核心竞争力。
【附图说明】
[0019] 图1为杜洛克猪在12号染色体上关于饲料转化率性状的全基因组关联(GWAS)分析 图；其中：横坐标表示猪的染色体编号;纵坐标表示-l〇gP值。
[0020] 图2为有关杜洛克猪饲料转换率性状主效突变位点g.690C>A不同基因型的测序结 果峰图；
[0021 ]其中(a)表示基因型为AC型的测序结果峰图；
[0022] (b)表示基因型为AA型的测序结果峰图；
[0023] (c)表示基因型为CC型的测序结果峰图。
【具体实施方式】
[0024]下面结合实施例及附图对本发明作进一步详细的描述，但本发明的实施方式不限 于此。
[0025] 本发明的上述发明目的具体是这样实现的：
[0026] 实施例1
[0027] 1、实验动物
[0028]本发明所使用的实验猪群群体为广东温氏食品集团股份有限公司种猪分公司的 纯种杜洛克及其合成系群体，为种猪分公司核心群。
[0029]本实验共选取该资源群体中324头杜洛克种公猪，每个个体在30kg到100kg体重之 间时用奥饲本种猪生产性能测定系统进行数据收集。
[0030] 杜洛克猪产仔数较少，大群平均仅为9~10头，但生长快，饲料转化率高，胴体瘦肉 率高，肌内脂肪含量较高，抗逆性强。国内商品猪生产已建立起较为成熟的杂交配套体系。 其中杜长大的杂交组合在我国的内销和外销市场中持续保持绝对优势地位，作为终端父本 的杜洛克种猪，对商品猪的遗传贡献率占50%。因此，提尚杜洛克种公猪的生广性能的研究 显得尤为重要。
[0031] 2、实验方法
[0032] 本实验所有猪全部采用圈养方式进行饲养，在生长育肥阶段每栏圈养10-12头猪 (每头猪占用面积为2m2)，只有采食饮水，并按照统一饲养标准。每千克日粮营养水平为:粗 蛋白16%，消化能13.1MJ，赖氨酸0.78 %，钙0.6%，磷0.5 %。每个圈安装有奥饲本种猪生产 性能测定系统，能够检测每头猪的每日体重、每日采食次数和每日采食量。我们对奥饲本种 猪生产性能测定系统自动生成的数据进行数据处理，剔除异常值，同时用R软件使用前后4 天平均值的方法来补齐饲料转化率缺失或者异常的数据。
[0033] 3、猪全基因组60K SNP判型
[0034]从上述资源群体中选取的324头杜洛克种公猪中的每个个体采集