16种型别hpv病毒的检测引物、探针及试剂盒的制作方法_3

文档序号:9367952阅读:来源:国知局
比具有以下有益效果: 1.利用本发明的检测引物、探针和试剂盒可以快速、简便地对HPV病毒相关性疾病进 行筛查,能同时检测出常见的HPV高危型和低危型,共2种HPV低危型和14种HPV高危型, 且HPV高危型覆盖范围广,比目前市场上的试剂盒检测更为全面。
[0031] 2.本发明的检测方法敏感性高,最低检出可达到IXlO3拷贝/mL;同时,本发明 的检测方法的特异性很好,不和其他的病毒发生交叉反应,例如HPV42型、HPV43型、HPV53 型、HPV73型和HPV83型; 3.本发明的检测方法反应快速,一般1. 5到2小时即可得到反应结果,并且成本低、无 假阳性,适合于大规模临床开展。从而实现对HPV病毒的快速、有效且准确的定性检测,因 而能保证及时的病例诊治及治疗效果监测。
【附图说明】
[0032] 图1为采用荧光定量PCR仪检测HPV假病毒质控品得到的曲线; 图 2 是HPV6、HPV11、HPV16、HPV18、HPV31、HPV33、HPV35 和HPV39 的荧光定量PCR检测 曲线; 图 3 是HPV45、HPV51、HPV52、HPV56、HPV58、HPV59、HPV66 和HPV68 的荧光定量PCR检 测曲线; 图4是HPV42、HPV43、HPV53、HPV73和HPV83的荧光定量PCR检测曲线。
【具体实施方式】
[0033] 下面结合具体实施例,对本发明作进一步说明,以助于理解本发明的内容。
[0034] 实施例IHPV质控品的构建 (1)将16种型别的HPV病毒片段连接后制备成为假病毒。
[0035] 将16种型别的HPV病毒分别以各自相应的特异性引物扩增出片段(例如HPV6型 病毒模板,使用本发明设计的HPV6型上游引物HPV6-F和下游引物HPV6-R进行扩增,收集 产物),16种型别的HPV病毒扩增产物经基因测序确认正确后包装成假病毒,假病毒由北京 博恒科创生物科技有限公司进行制备并提供浓度。
[0036] (3)将HPV假病毒按照北京博恒科创生物科技有限公司提供的浓度进行稀释,分 别稀释至IXIO5拷贝/mL和5X10 3拷贝/mL,然后采用ABI7500荧光定量PCR仪进行检 测。
[0037] 结果如图1所示:左边是16种HPV型别引物探针检测到的IXIO5拷贝/mL的假 病毒,右边是16种HPV型别引物探针检测到的5XIO3拷贝/mL的假病毒的扩增曲线。
[0038] 将HPV假病毒稀释成IXlO5拷贝/mL、5X103拷贝/mL,分别作为试剂盒的阳性质 控品和弱阳性质控品。
[0039] 实施例2检测试剂盒组成及使用 1、试剂盒组成
其中,HPV6 型、HPV16 型、HPV31 型、HPV35 型、HPV39 型、HPV45 型、HPV58 型和HPV68 型 的Taqman荧光探针核苷酸序列5'端标记6-FAM,3'端标记BHQl; HPVll型、HPV18 型、HPV33 型、HPV51 型、HPV52 型、HPV56 型、HPV59 型和HPV66 型的Taqman荧光探针核苷酸序列5'端标记HEX;所述荧3'端标记BHQl。
[0040] 各组引物探针混合液由初始浓度10yM的每种引物序列0. 75yL,初始浓度10yM 的探针〇. 5yL,最后用无菌超纯水将反应体系补足至5. 5yL。
[0041] 2、试剂盒使用方法如下: (1)宫颈分泌物样本:取ImL样本至I. 5mL离心管中,12000rpm离心2分钟,弃上清; 沉淀中加入500yL灭菌生理盐水混匀,12000rpm离心2分钟;再用灭菌生理盐水重复洗涤 一次;去尽上清,沉淀中加入50yLHPV裂解液充分混匀,95°C作用10分钟,12000rpm离心 10分钟,上清即为纯化的病毒核酸,作为待检模板。(待检模板的提取可以使用现有技术中 任意方法,只要能获得样本DNA核酸即可,也可以直接使用市售商品DNA提取试剂盒,不限 于上述方法)。
[0042] (2)取PCR反应液14. 5yL分别置于8个反应管内,分别加入8组引物探针混合液 5. 5yL(1个单位)配制成反应体系,然后分别加入5. 0yL待检模板。
[0043] 荧光定量PCR反应条件:37°C,2分钟;95°C,3分钟;94°C,15秒;60°C,45秒,40个 循环。
[0044] 采用ABI7500荧光定量PCR仪,荧光信号收集时设定为FAM和VIC(HEX)荧光素, 荧光信号收集设在60 °C。
[0045] 每批次反应均设置阴性质控品(灭菌生理盐水)、阳性质控品和弱阳性质控品(HPV 假病毒)。
[0046] (3)结果判断:检测通道没有出现S型扩增曲线,判定为HPV病毒阴性。
[0048] 3、临床检测 利用上述方法对1例HPV6型宫颈分泌物样本、1例HPVll型宫颈分泌物样本、1例HPV16 型宫颈分泌物样本、1例HPV18型宫颈分泌物样本、1例HPV31型宫颈分泌物样本、1例HPV33 型宫颈分泌物样本、1例HPV35型宫颈分泌物样本、1例HPV39型宫颈分泌物样本、1例HPV45 型宫颈分泌物样本、1例HPV51型宫颈分泌物样本、1例HPV52型宫颈分泌物样本、1例HPV56 型宫颈分泌物样本、1例HPV58型宫颈分泌物样本、1例HPV59型宫颈分泌物样本、1例HPV66 型宫颈分泌物样本、1例HPV68型宫颈分泌物样本、1例HPV42型国家参考品、1例HPV43型 国家参考品、1例HPV53型国家参考品、1例HPV73型国家参考品和1例HPV83型国家参考 品,共计21份样本进行检测。国家参考品是由中国食品药品检定研究院制备的国家标准物 质,包含HPV各种型别的质粒,是由北京鑫诺美迪基因检测技术有限公司研发的标准品。
[0049]结果如图 2~ 图 4 所示,图 2 是HPV6、HPV11、HPV16、HPV18、HPV31、HPV33、HPV35 和 HPV39 的检测曲线;图 3 是HPV45、HPV51、HPV52、HPV56、HPV58、HPV59、HPV66 和HPV68 的检 测曲线;图4是HPV42、HPV43、HPV53、HPV73和HPV83的检测曲线: 其中 16 例宫颈分泌物样本(HPV6、HPV11、HPV16、HPV18、HPV31、HPV33、HPV35、HPV39、HPV45、HPV51、HPV52、HPV56、HPV58、HPV59、HPV66 和HPV68)检测均为阳性,有S型扩增曲 线(图2和图3) ;5例国家参考品(HPV42、HPV43、HPV53、HPV73和HPV83)检测均为阴性,无 S型扩增曲线(图4)。
[0050] 结果验证:将检测阳性的扩增产物进行基因测序,测序结果经BLAST比对后证实 为16种型别的HPV病毒基因序列。
[0051] 以上所述仅是本发明的优选实施方式,应当指出,对于本技术领域的普通技术人 员来说,在不脱离本发明原理的前提下,还可以做出若干改进和润饰,这些改进和润饰也应 视为本发明的保护范围。
【主权项】
I. 16种型别HPV病毒的检测引物和探针,其特征在于,包括16种型别基因的特异性扩 增引物序列以及与该引物相应的Taqman荧光探针序列,探针序列的5'端标记有荧光报告 基团,3'端标记有荧光淬灭基团,各型别检测引物及探针序列如下: HPV6 型: 上游引物HPV6-F :核苷酸序列如SEQ ID NO: 1, 下游引物HPV6-R:核苷酸序列如SEQ ID NO:2, Taqman荧光探针HPV6-P :核苷酸序列如SEQ ID NO: 3 ; HPVll 型: 上游引物HPVll-F :核苷酸序列如SEQ ID N0:4, 下游引物HPVll-R :核苷酸序列如SEQ ID N0:5, Taqman荧光探针HPVll-P :核苷酸序列如SEQ ID N0:6 ; HPV16 型: 上游引物HPV16-F :核苷酸序列如SEQ ID N0:7, 下游引物HPV16-R:核苷酸序列如SEQ ID N0:8, Taqman荧光探针HPV16-P :核苷酸序列如SEQ ID N0:9 ; HPV18 型: 上游引物HPV18-F :核苷酸序列如SEQ ID NO: 10, 下游引物HPV18-R:核苷酸序列如SEQ ID N0:11, Taqman荧光探针HPV18-P :核苷酸序列如SEQ ID NO: 12 ; HPV31 型:
当前第3页1 2 3 4 
网友询问留言 已有0条留言
  • 还没有人留言评论。精彩留言会获得点赞!
1